MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chloroherpeton thalassium ATCC 35110 chromosome

Total Repeats: 4190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011026	TAA	2	6	3074	3079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011026	TAA	2	6	3375	3380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011026	ATA	2	6	4165	4170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011026	ATT	2	6	4220	4225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011026	TAA	2	6	4269	4274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011026	ATA	2	6	4386	4391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011026	TAA	2	6	4448	4453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011026	CGT	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011026	AGA	2	6	4472	4477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011026	GAT	2	6	4484	4489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011026	AAC	2	6	10840	10845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011026	TTC	2	6	10939	10944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011026	GTT	2	6	10972	10977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011026	CAT	2	6	11033	11038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011026	ACA	2	6	11059	11064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011026	ATT	2	6	11071	11076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011026	TTG	2	6	13758	13763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011026	CAG	2	6	14723	14728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011026	ATT	2	6	14755	14760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011026	GCC	2	6	17011	17016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_011026	GCA	2	6	19725	19730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011026	AAT	2	6	19837	19842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011026	CAA	2	6	19950	19955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011026	ATG	2	6	19984	19989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011026	GAA	2	6	20030	20035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011026	TCA	2	6	20040	20045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011026	AAC	2	6	20076	20081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011026	CAA	2	6	20090	20095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011026	AAC	2	6	20132	20137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011026	AAG	2	6	22680	22685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011026	CGG	3	9	25418	25426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011026	AAC	2	6	25442	25447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011026	GCT	2	6	25450	25455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011026	TCA	2	6	27871	27876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011026	CTT	2	6	27923	27928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011026	ACT	2	6	32545	32550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011026	GAA	2	6	32628	32633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011026	AAT	2	6	32738	32743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011026	ACA	2	6	35315	35320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011026	CAC	2	6	36945	36950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_011026	GAT	2	6	37013	37018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011026	TAG	2	6	37065	37070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011026	AAT	2	6	38848	38853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011026	GTT	2	6	38887	38892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011026	TGC	2	6	38982	38987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011026	AGT	2	6	39008	39013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011026	AGC	2	6	39037	39042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011026	AGC	2	6	39069	39074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011026	TAT	2	6	39112	39117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011026	GCA	2	6	39897	39902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011026	AAG	2	6	39936	39941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011026	CCG	2	6	41165	41170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_011026	TTC	2	6	42507	42512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011026	TGT	2	6	42524	42529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011026	CGT	2	6	44360	44365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011026	CTA	2	6	47920	47925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011026	GCG	2	6	47931	47936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011026	AGA	2	6	50807	50812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011026	GAG	2	6	50819	50824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011026	CGC	2	6	50840	50845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_011026	CAA	2	6	50888	50893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011026	ATA	2	6	52547	52552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011026	GAT	2	6	52600	52605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011026	GCG	2	6	52631	52636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011026	TGC	2	6	52643	52648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011026	TTG	2	6	52669	52674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011026	AAT	2	6	54106	54111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011026	TTA	2	6	56406	56411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011026	TGA	2	6	57051	57056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011026	CAA	2	6	57673	57678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011026	TAT	2	6	57759	57764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011026	GTT	2	6	57765	57770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011026	CAA	2	6	58271	58276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011026	GCC	2	6	59345	59350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_011026	GGC	2	6	59361	59366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011026	CGC	3	9	59379	59387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_011026	GCG	2	6	59401	59406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011026	CTG	2	6	61660	61665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011026	ATA	2	6	61719	61724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011026	AAG	2	6	61760	61765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011026	CAA	2	6	61770	61775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011026	CTC	2	6	63321	63326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_011026	ATA	2	6	63356	63361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011026	CGC	2	6	65294	65299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_011026	ATC	2	6	65337	65342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011026	TTC	2	6	69441	69446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011026	AAG	2	6	69450	69455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011026	AAT	2	6	69473	69478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011026	CAT	2	6	69493	69498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011026	AAT	2	6	70091	70096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011026	TAT	2	6	71566	71571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011026	TCG	3	9	72670	72678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011026	GAT	2	6	73363	73368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011026	GAA	2	6	73371	73376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011026	TCA	2	6	76993	76998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011026	TGA	2	6	77014	77019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011026	ATT	2	6	77078	77083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011026	ATA	2	6	77654	77659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011026	GAA	2	6	77670	77675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011026	CAT	2	6	78887	78892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011026	TAA	2	6	81530	81535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011026	TTG	2	6	81572	81577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011026	AGA	2	6	81602	81607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011026	ATG	2	6	84179	84184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011026	ATT	2	6	84210	84215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011026	GCA	2	6	84216	84221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011026	TGA	2	6	84250	84255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011026	TAT	2	6	90043	90048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011026	AAG	2	6	92756	92761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011026	TTC	2	6	92805	92810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011026	CAA	2	6	94875	94880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011026	CTT	2	6	95719	95724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011026	TAG	2	6	97485	97490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011026	GCG	2	6	98884	98889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011026	AAC	2	6	99704	99709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011026	TAA	2	6	99770	99775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011026	TCA	2	6	100581	100586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011026	GTT	2	6	100613	100618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011026	ATT	2	6	100626	100631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011026	TCA	2	6	100708	100713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011026	CAG	2	6	100746	100751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011026	CGA	2	6	100876	100881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011026	TCG	2	6	100892	100897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011026	CGG	2	6	100946	100951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011026	CAA	2	6	103197	103202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011026	TGG	2	6	103215	103220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011026	ACA	2	6	104155	104160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011026	GCG	2	6	106283	106288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011026	TTG	2	6	106362	106367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011026	AGC	2	6	109043	109048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011026	AAG	2	6	110119	110124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011026	TTA	2	6	113485	113490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011026	ATA	2	6	113524	113529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011026	TGC	2	6	114224	114229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011026	GAA	2	6	115391	115396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011026	CTT	2	6	117429	117434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011026	TAT	2	6	118347	118352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011026	TTC	2	6	120805	120810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011026	TGT	2	6	120844	120849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_011026	GTT	2	6	120958	120963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_011026	CTT	2	6	123153	123158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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