MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma arthritidis 158L3-1 chromosome

Total Repeats: 409

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011025	AAAAAC	2	12	686	697	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	193216431
2	NC_011025	GAAATT	2	12	2587	2598	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	193216433
3	NC_011025	GATGAA	2	12	7294	7305	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	193216440
4	NC_011025	TTGATG	2	12	9306	9317	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	193216443
5	NC_011025	CTATGA	2	12	9723	9734	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	193216443
6	NC_011025	ACAAAA	2	12	9912	9923	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	193216444
7	NC_011025	CTAATA	2	12	9961	9972	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	193216444
8	NC_011025	AAAGAA	2	12	11294	11305	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	193216445
9	NC_011025	ACTTTG	2	12	15230	15241	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	193216447
10	NC_011025	AACAAA	2	12	18156	18167	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	193216447
11	NC_011025	AGCGAT	2	12	24364	24375	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	193216451
12	NC_011025	CAATTT	2	12	24426	24437	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	193216451
13	NC_011025	TGATTT	2	12	28206	28217	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	193216455
14	NC_011025	ACTTAA	2	12	29928	29939	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	193216455
15	NC_011025	CCAGTT	2	12	30400	30411	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	193216455
16	NC_011025	GTCAAA	2	12	32194	32205	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	193216457
17	NC_011025	GTCAAA	2	12	32853	32864	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	193216458
18	NC_011025	CTTTTT	2	12	34229	34240	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	193216459
19	NC_011025	TTTTTA	2	12	35651	35662	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	193216461
20	NC_011025	TGCCAA	2	12	37102	37113	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	193216462
21	NC_011025	TTTGCT	2	12	40197	40208	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	193216464
22	NC_011025	AGAAAG	2	12	43648	43659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	193216468
23	NC_011025	AATCAA	2	12	44330	44341	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	193216469
24	NC_011025	GGCAAG	2	12	44784	44795	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	193216470
25	NC_011025	GCAATT	2	12	44964	44975	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	193216470
26	NC_011025	CATTGA	2	12	46180	46191	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	193216471
27	NC_011025	TCTTTT	2	12	49622	49633	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	193216475
28	NC_011025	TTAATT	2	12	50027	50038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193216475
29	NC_011025	CTTTTT	2	12	53702	53713	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	193216477
30	NC_011025	ATTTGT	2	12	54636	54647	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	193216477
31	NC_011025	TTTCTT	2	12	56408	56419	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	193216477
32	NC_011025	TTTTGC	2	12	56436	56447	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	193216477
33	NC_011025	TTTTCT	2	12	58199	58210	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	193216477
34	NC_011025	TTTTTC	2	12	59806	59817	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	193216479
35	NC_011025	ATATCT	2	12	64811	64822	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	193216483
36	NC_011025	CATAAT	2	12	64959	64970	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	193216483
37	NC_011025	TAAAAA	2	12	64991	65002	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	193216483
38	NC_011025	AAATAA	2	12	65861	65872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	193216484
39	NC_011025	TGAAAT	2	12	66955	66966	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	193216485
40	NC_011025	ATTTTG	2	12	68648	68659	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	193216487
41	NC_011025	TCATAC	2	12	71051	71062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216489
42	NC_011025	TCATAT	2	12	71276	71287	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	193216490
43	NC_011025	TCCAAT	2	12	72316	72327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216490
44	NC_011025	GAAAAT	2	12	72821	72832	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	193216490
45	NC_011025	TTTGTT	2	12	75402	75413	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	193216492
46	NC_011025	AAAGCA	2	12	81002	81013	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	193216499
47	NC_011025	TGATGT	2	12	84180	84191	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	193216501
48	NC_011025	TAAAAA	2	12	84324	84335	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	193216501
49	NC_011025	GAAACC	2	12	86478	86489	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	193216505
50	NC_011025	AAGTAA	2	12	87695	87706	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	193216506
51	NC_011025	CAATTT	2	12	88286	88297	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	193216506
52	NC_011025	TTTGAT	2	12	88863	88874	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	193216507
53	NC_011025	AGCAAA	2	12	88930	88941	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	193216507
54	NC_011025	AAACAA	2	12	100975	100986	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	193216516
55	NC_011025	ACTATT	2	12	100997	101008	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	193216516
56	NC_011025	GATTTT	2	12	101088	101099	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	193216516
57	NC_011025	GTAATG	2	12	104395	104406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193216518
58	NC_011025	TACTTC	2	12	105392	105403	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	193216518
59	NC_011025	TAATCG	2	12	107416	107427	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	193216518
60	NC_011025	AAAATT	2	12	109379	109390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193216518
61	NC_011025	AAATAA	2	12	112193	112204	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	193216521
62	NC_011025	GATAAA	2	12	114545	114556	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	193216523
63	NC_011025	GTTTTT	2	12	118573	118584	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	193216527
64	NC_011025	ATTTTA	2	12	120062	120073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193216527
65	NC_011025	ATTTTC	2	12	123975	123986	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	193216531
66	NC_011025	TTTTCA	2	12	126538	126549	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	193216532
67	NC_011025	ATTTTT	2	12	127269	127280	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	193216532
68	NC_011025	GTTTTA	2	12	129753	129764	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	193216534
69	NC_011025	AAATTA	2	12	129856	129867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193216534
70	NC_011025	CCTAAA	2	12	130266	130277	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	193216534
71	NC_011025	AAAGCA	2	12	135333	135344	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	193216540
72	NC_011025	TTTTTA	2	12	139619	139630	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	193216543
73	NC_011025	TTTTAG	2	12	139836	139847	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	193216543
74	NC_011025	GTGATC	2	12	142906	142917	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	193216543
75	NC_011025	TTCTTT	2	12	145117	145128	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	193216543
76	NC_011025	TTTTCT	2	12	146070	146081	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	193216543
77	NC_011025	ACTTTA	2	12	148761	148772	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	193216546
78	NC_011025	TTGATT	2	12	152905	152916	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	193216548
79	NC_011025	AGCCAA	2	12	155803	155814	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	193216552
80	NC_011025	ATTTAA	2	12	162788	162799	50 %	50 %	0 %	0 %	193216558
81	NC_011025	AAGAAA	2	12	163026	163037	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	193216558
82	NC_011025	AAGAAA	2	12	163266	163277	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	193216559
83	NC_011025	ATAAAA	2	12	163362	163373	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	193216559
84	NC_011025	AAATTA	2	12	165089	165100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	193216561
85	NC_011025	CTAATC	2	12	165666	165677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216561
86	NC_011025	AGCCAA	2	12	166253	166264	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	193216562
87	NC_011025	ATTTTT	2	12	167442	167453	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	193216563
88	NC_011025	GTTTTA	2	12	168310	168321	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	193216563
89	NC_011025	ATGAAA	2	12	170578	170589	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	193216565
90	NC_011025	ATTGCC	2	12	172882	172893	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	193216569
91	NC_011025	ATAAAG	2	12	175534	175545	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	193216571
92	NC_011025	CTATGA	2	12	177046	177057	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	193216573
93	NC_011025	GTTTGA	2	12	178646	178657	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	193216574
94	NC_011025	TTTCAA	2	12	179239	179250	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	193216574
95	NC_011025	CTATTT	2	12	179410	179421	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	193216574
96	NC_011025	AAATTT	2	12	179550	179561	50 %	50 %	0 %	0 %	193216574
97	NC_011025	TTTTTC	2	12	179752	179763	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	193216574
98	NC_011025	GATTTT	2	12	182517	182528	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	193216579
99	NC_011025	ATCATG	2	12	187931	187942	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	193216583
100	NC_011025	CCAAAA	2	12	189662	189673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193216585
101	NC_011025	AAAAAG	2	12	201782	201793	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	193216591
102	NC_011025	TAGTGA	2	12	205251	205262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193216591
103	NC_011025	TGAAGA	2	12	205353	205364	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	193216591
104	NC_011025	TGAAGA	2	12	208699	208710	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	193216594
105	NC_011025	TCCTCT	2	12	209266	209277	0 %	50 %	0 %	50 %	193216594
106	NC_011025	CTTTTT	2	12	210313	210324	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	193216595
107	NC_011025	TAATTT	2	12	210373	210384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193216595
108	NC_011025	ATCTTT	2	12	210560	210571	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	193216595
109	NC_011025	GTTTTT	2	12	211476	211487	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	193216596
110	NC_011025	TCTTTT	2	12	217950	217961	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	193216601
111	NC_011025	GATTGA	2	12	220383	220394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193216605
112	NC_011025	TAGAAT	2	12	220445	220456	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	193216605
113	NC_011025	CTGAAG	2	12	223245	223256	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	193216608
114	NC_011025	AAATAC	2	12	223376	223387	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	193216608
115	NC_011025	ATAAAA	2	12	225638	225649	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	193216611
116	NC_011025	CAAAAC	2	12	226769	226780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	193216611
117	NC_011025	TAATTT	2	12	229452	229463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193216613
118	NC_011025	ATGAAA	2	12	230885	230896	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	193216616
119	NC_011025	AGAACA	2	12	233205	233216	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	193216619
120	NC_011025	GCAAAA	2	12	233722	233733	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	193216620
121	NC_011025	CTTCAA	2	12	240218	240229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216624
122	NC_011025	AGCACC	2	12	241539	241550	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	193216626
123	NC_011025	TTCAAG	2	12	242568	242579	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	193216627
124	NC_011025	CATTTC	2	12	244240	244251	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	193216629
125	NC_011025	TCCATA	2	12	246706	246717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	193216631
126	NC_011025	TAATGG	2	12	248970	248981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	193216633
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132	NC_011025	CATTAA	2	12	258802	258813	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	193216640
133	NC_011025	TTGATA	2	12	264551	264562	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	193216648
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232	NC_011025	AATATC	2	12	460365	460376	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	193216793
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234	NC_011025	TCAATA	2	12	461790	461801	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	193216794
235	NC_011025	GTTTTT	2	12	462880	462891	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	193216795
236	NC_011025	TAAAAC	2	12	467005	467016	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	193216799
237	NC_011025	ACACCA	2	12	467888	467899	50 %	0 %	0 %	50 %	193216800
238	NC_011025	AGCTTG	2	12	472595	472606	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	193216805
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349	NC_011025	ATTTCA	2	12	688309	688320	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	193216956
350	NC_011025	AATTTT	2	12	689007	689018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	193216956
351	NC_011025	ATTTAA	2	12	689724	689735	50 %	50 %	0 %	0 %	193216956
352	NC_011025	CAGGAA	2	12	689792	689803	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	193216956
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.