MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma arthritidis 158L3-1 chromosome

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011025	TAATT	2	10	4810	4819	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011025	TAAAT	2	10	25123	25132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011025	TTGGT	2	10	34644	34653	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011025	TAAAA	2	10	38164	38173	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011025	TAAAA	2	10	38503	38512	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011025	AAAAC	2	10	41688	41697	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011025	TTTTA	2	10	62291	62300	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011025	ATTTT	2	10	65400	65409	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011025	TTTAA	2	10	79946	79955	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011025	CATCT	2	10	82489	82498	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_011025	TACAT	2	10	83737	83746	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011025	TTTTA	2	10	91419	91428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011025	TATAA	2	10	128063	128072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011025	TTTCA	2	10	134243	134252	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011025	TCAAA	2	10	138531	138540	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011025	TAAGT	2	10	147118	147127	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011025	TTTTA	2	10	147823	147832	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011025	GTGTT	2	10	147833	147842	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011025	TCTAG	2	10	159848	159857	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011025	TTTTA	2	10	159859	159868	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011025	ATTAA	2	10	176678	176687	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011025	TTGCT	2	10	177781	177790	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011025	AATAA	2	10	180118	180127	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011025	TTTTA	2	10	180274	180283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011025	ATTGA	2	10	181566	181575	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011025	CAAAT	2	10	191399	191408	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011025	TCGTG	2	10	192458	192467	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011025	CAATA	2	10	193106	193115	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011025	GGGAG	2	10	193682	193691	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011025	ATTAA	2	10	207499	207508	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011025	TTTTA	2	10	213523	213532	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011025	TAAAA	2	10	225034	225043	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011025	TAACC	2	10	225103	225112	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_011025	TTTGT	2	10	227576	227585	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011025	TTTAA	2	10	227632	227641	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011025	ATTAA	2	10	231538	231547	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011025	ATTAA	2	10	231602	231611	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011025	ACAAA	2	10	231671	231680	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011025	AAATT	2	10	244287	244296	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011025	AAAAT	2	10	244519	244528	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011025	AACTA	2	10	245299	245308	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011025	AGTTA	2	10	251978	251987	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011025	TTATT	2	10	259749	259758	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011025	AATGC	2	10	271606	271615	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_011025	TAATT	2	10	279716	279725	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011025	TTAAA	2	10	282965	282974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011025	GTTTA	2	10	283636	283645	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011025	ACATA	2	10	293718	293727	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011025	TAAAT	2	10	297966	297975	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011025	ACTAA	2	10	302381	302390	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011025	CAATA	2	10	303702	303711	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_011025	AATTA	2	10	309631	309640	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011025	AAATA	2	10	310354	310363	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011025	TTAAA	2	10	317665	317674	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011025	TAAAA	2	10	341293	341302	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011025	AAAAT	2	10	344927	344936	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011025	TTTCA	2	10	346766	346775	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_011025	TTTAT	2	10	366840	366849	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011025	TTCAT	2	10	367608	367617	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_011025	ATATT	2	10	387740	387749	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011025	CCAAA	2	10	397832	397841	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_011025	TAAAA	2	10	398013	398022	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011025	TAATT	2	10	398833	398842	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011025	TTATT	2	10	398849	398858	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011025	TTTGT	2	10	408928	408937	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011025	AGCAA	2	10	411562	411571	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011025	TATTT	2	10	421166	421175	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011025	AACAA	2	10	421219	421228	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_011025	TAATC	2	10	421281	421290	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_011025	AAAAT	2	10	423689	423698	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011025	TTACT	2	10	423822	423831	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_011025	AATAT	2	10	479225	479234	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011025	ATTTT	2	10	480514	480523	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011025	TTTTA	2	10	489084	489093	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011025	TTTTA	2	10	502977	502986	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011025	AATAA	2	10	505764	505773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011025	TAAAT	2	10	518156	518165	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011025	ATTTA	2	10	518901	518910	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011025	ATTAG	2	10	521441	521450	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011025	AAAAT	2	10	526671	526680	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011025	AGATA	2	10	526825	526834	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011025	AGTAA	2	10	539607	539616	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011025	AGTAA	2	10	539872	539881	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011025	AGTAA	2	10	540071	540080	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011025	TAAAT	2	10	542198	542207	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011025	TTTTA	2	10	542821	542830	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011025	TAATT	2	10	544866	544875	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011025	GCTTT	2	10	545894	545903	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_011025	TTTTC	2	10	546790	546799	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_011025	TGAAA	2	10	547058	547067	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011025	AAAAT	2	10	573028	573037	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011025	TAAAA	2	10	581284	581293	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011025	TAATT	2	10	597710	597719	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011025	ATTTT	2	10	600181	600190	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011025	AAAAT	2	10	602449	602458	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011025	TGAAT	2	10	602775	602784	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011025	GCAAT	2	10	616002	616011	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_011025	AAAAC	2	10	617397	617406	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011025	TAAAA	2	10	673535	673544	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011025	ATTTT	2	10	674402	674411	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011025	TAAAA	2	10	683934	683943	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011025	AATAA	2	10	691485	691494	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011025	TTTAT	2	10	693557	693566	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011025	TTTTG	2	10	694292	694301	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011025	TAAAA	2	10	694563	694572	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011025	TAAAA	2	10	696942	696951	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011025	TAAAA	2	10	700060	700069	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011025	TTTTA	2	10	702899	702908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011025	TAAAA	2	10	706633	706642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011025	TAAAT	2	10	720336	720345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011025	TATTT	2	10	722207	722216	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011025	ATTAA	2	10	734209	734218	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011025	ATTTT	2	10	734359	734368	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011025	GATTT	2	10	746747	746756	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011025	TAAAA	2	10	752217	752226	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011025	TTATT	2	10	754146	754155	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011025	AATTT	2	10	766318	766327	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011025	ATTTA	2	10	766508	766517	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011025	TAAAA	2	10	781365	781374	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011025	GCAAT	2	10	786117	786126	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_011025	AAAAT	2	10	792180	792189	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011025	TAATT	2	10	792224	792233	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011025	TTTTA	2	10	805863	805872	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011025	ATAAA	2	10	806054	806063	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011025	TTAAA	2	10	807100	807109	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011025	CTTGG	2	10	817743	817752	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.