MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 12777

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011004	CGTC	2	8	535	542	0 %	25 %	25 %	50 %	192288434
2	NC_011004	CTCG	2	8	873	880	0 %	25 %	25 %	50 %	192288434
3	NC_011004	GCCG	2	8	994	1001	0 %	0 %	50 %	50 %	192288434
4	NC_011004	CACC	2	8	1158	1165	25 %	0 %	0 %	75 %	192288434
5	NC_011004	CGAC	2	8	2008	2015	25 %	0 %	25 %	50 %	192288435
6	NC_011004	GCCG	2	8	2042	2049	0 %	0 %	50 %	50 %	192288435
7	NC_011004	GCCG	2	8	2175	2182	0 %	0 %	50 %	50 %	192288435
8	NC_011004	GATC	2	8	2288	2295	25 %	25 %	25 %	25 %	192288435
9	NC_011004	TATC	2	8	2345	2352	25 %	50 %	0 %	25 %	192288435
10	NC_011004	CGAC	2	8	2398	2405	25 %	0 %	25 %	50 %	192288435
11	NC_011004	TCCG	2	8	3902	3909	0 %	25 %	25 %	50 %	192288436
12	NC_011004	TGGA	2	8	3930	3937	25 %	25 %	50 %	0 %	192288436
13	NC_011004	GCCG	2	8	4637	4644	0 %	0 %	50 %	50 %	192288437
14	NC_011004	GGCC	2	8	4790	4797	0 %	0 %	50 %	50 %	192288437
15	NC_011004	CTGG	2	8	5711	5718	0 %	25 %	50 %	25 %	192288437
16	NC_011004	TCCG	2	8	5726	5733	0 %	25 %	25 %	50 %	192288437
17	NC_011004	GGAA	2	8	6745	6752	50 %	0 %	50 %	0 %	192288437
18	NC_011004	GCCG	2	8	6804	6811	0 %	0 %	50 %	50 %	192288437
19	NC_011004	CGCT	2	8	6897	6904	0 %	25 %	25 %	50 %	192288437
20	NC_011004	TCGA	2	8	7262	7269	25 %	25 %	25 %	25 %	192288438
21	NC_011004	GCCG	2	8	7990	7997	0 %	0 %	50 %	50 %	192288438
22	NC_011004	CGAG	2	8	8007	8014	25 %	0 %	50 %	25 %	192288438
23	NC_011004	ACCA	2	8	8520	8527	50 %	0 %	0 %	50 %	192288439
24	NC_011004	CGGA	2	8	8723	8730	25 %	0 %	50 %	25 %	192288439
25	NC_011004	ATCG	2	8	8870	8877	25 %	25 %	25 %	25 %	192288439
26	NC_011004	CCGG	2	8	9420	9427	0 %	0 %	50 %	50 %	192288440
27	NC_011004	CGGC	2	8	9853	9860	0 %	0 %	50 %	50 %	192288440
28	NC_011004	GAGC	2	8	10155	10162	25 %	0 %	50 %	25 %	192288440
29	NC_011004	CATC	2	8	10244	10251	25 %	25 %	0 %	50 %	192288440
30	NC_011004	CGCT	2	8	10785	10792	0 %	25 %	25 %	50 %	192288442
31	NC_011004	CAGC	2	8	11441	11448	25 %	0 %	25 %	50 %	192288442
32	NC_011004	ACCG	2	8	11462	11469	25 %	0 %	25 %	50 %	192288442
33	NC_011004	TCGG	2	8	12114	12121	0 %	25 %	50 %	25 %	192288442
34	NC_011004	CGAG	2	8	12184	12191	25 %	0 %	50 %	25 %	192288442
35	NC_011004	TCGA	2	8	13068	13075	25 %	25 %	25 %	25 %	192288443
36	NC_011004	TCGG	2	8	13930	13937	0 %	25 %	50 %	25 %	192288445
37	NC_011004	CGGT	2	8	14025	14032	0 %	25 %	50 %	25 %	192288445
38	NC_011004	GCGA	2	8	14542	14549	25 %	0 %	50 %	25 %	192288447
39	NC_011004	CGGC	2	8	14630	14637	0 %	0 %	50 %	50 %	192288447
40	NC_011004	CCGG	2	8	15036	15043	0 %	0 %	50 %	50 %	192288447
41	NC_011004	CGGC	2	8	15536	15543	0 %	0 %	50 %	50 %	192288447
42	NC_011004	GCAC	2	8	15655	15662	25 %	0 %	25 %	50 %	192288447
43	NC_011004	TGAT	2	8	15847	15854	25 %	50 %	25 %	0 %	192288447
44	NC_011004	GCCG	2	8	16641	16648	0 %	0 %	50 %	50 %	192288448
45	NC_011004	GGCC	2	8	16674	16681	0 %	0 %	50 %	50 %	192288448
46	NC_011004	GGCT	2	8	16803	16810	0 %	25 %	50 %	25 %	192288448
47	NC_011004	TCCG	2	8	17279	17286	0 %	25 %	25 %	50 %	192288449
48	NC_011004	GATG	2	8	17455	17462	25 %	25 %	50 %	0 %	192288449
49	NC_011004	GCCG	2	8	18799	18806	0 %	0 %	50 %	50 %	192288450
50	NC_011004	CCGG	2	8	18819	18826	0 %	0 %	50 %	50 %	192288450
51	NC_011004	CGAA	3	12	18844	18855	50 %	0 %	25 %	25 %	192288450
52	NC_011004	CGAG	2	8	19140	19147	25 %	0 %	50 %	25 %	192288450
53	NC_011004	TCGG	2	8	19707	19714	0 %	25 %	50 %	25 %	192288452
54	NC_011004	CGGA	2	8	20123	20130	25 %	0 %	50 %	25 %	192288452
55	NC_011004	CGAC	2	8	20521	20528	25 %	0 %	25 %	50 %	192288453
56	NC_011004	CGAG	2	8	20554	20561	25 %	0 %	50 %	25 %	192288453
57	NC_011004	CGAC	2	8	20860	20867	25 %	0 %	25 %	50 %	192288453
58	NC_011004	CGGA	2	8	21635	21642	25 %	0 %	50 %	25 %	192288453
59	NC_011004	GCCG	2	8	21643	21650	0 %	0 %	50 %	50 %	192288453
60	NC_011004	GGCC	2	8	21709	21716	0 %	0 %	50 %	50 %	192288453
61	NC_011004	ATCA	2	8	22410	22417	50 %	25 %	0 %	25 %	192288454
62	NC_011004	ACCG	2	8	22632	22639	25 %	0 %	25 %	50 %	192288454
63	NC_011004	GAGC	2	8	22823	22830	25 %	0 %	50 %	25 %	192288454
64	NC_011004	GCCG	2	8	23192	23199	0 %	0 %	50 %	50 %	192288454
65	NC_011004	GCCC	2	8	23710	23717	0 %	0 %	25 %	75 %	192288455
66	NC_011004	CGAG	3	12	23874	23885	25 %	0 %	50 %	25 %	192288455
67	NC_011004	CGGC	2	8	23951	23958	0 %	0 %	50 %	50 %	192288455
68	NC_011004	CCAC	2	8	24409	24416	25 %	0 %	0 %	75 %	192288456
69	NC_011004	CGGC	2	8	25227	25234	0 %	0 %	50 %	50 %	192288457
70	NC_011004	CGCC	2	8	25599	25606	0 %	0 %	25 %	75 %	192288457
71	NC_011004	GTCG	2	8	26324	26331	0 %	25 %	50 %	25 %	192288458
72	NC_011004	ATCG	2	8	28441	28448	25 %	25 %	25 %	25 %	192288459
73	NC_011004	GGGC	2	8	31018	31025	0 %	0 %	75 %	25 %	192288461
74	NC_011004	GCCA	2	8	31172	31179	25 %	0 %	25 %	50 %	192288461
75	NC_011004	GCGG	2	8	31763	31770	0 %	0 %	75 %	25 %	192288462
76	NC_011004	GCGG	2	8	31775	31782	0 %	0 %	75 %	25 %	192288462
77	NC_011004	TCGG	2	8	31908	31915	0 %	25 %	50 %	25 %	192288462
78	NC_011004	CCAT	2	8	32922	32929	25 %	25 %	0 %	50 %	192288462
79	NC_011004	GGCC	2	8	32974	32981	0 %	0 %	50 %	50 %	192288462
80	NC_011004	GGCG	2	8	33330	33337	0 %	0 %	75 %	25 %	192288463
81	NC_011004	TCGA	2	8	33407	33414	25 %	25 %	25 %	25 %	192288463
82	NC_011004	GCCA	2	8	33460	33467	25 %	0 %	25 %	50 %	192288463
83	NC_011004	GGCG	2	8	34039	34046	0 %	0 %	75 %	25 %	192288463
84	NC_011004	AGCG	2	8	34709	34716	25 %	0 %	50 %	25 %	192288463
85	NC_011004	CAGC	2	8	34762	34769	25 %	0 %	25 %	50 %	192288463
86	NC_011004	CGGC	2	8	34868	34875	0 %	0 %	50 %	50 %	192288463
87	NC_011004	GATC	2	8	35500	35507	25 %	25 %	25 %	25 %	192288464
88	NC_011004	AGCG	2	8	35657	35664	25 %	0 %	50 %	25 %	192288464
89	NC_011004	TCCA	2	8	36393	36400	25 %	25 %	0 %	50 %	192288464
90	NC_011004	TCGG	2	8	36450	36457	0 %	25 %	50 %	25 %	192288464
91	NC_011004	GAAC	2	8	37185	37192	50 %	0 %	25 %	25 %	192288466
92	NC_011004	CTTC	2	8	38575	38582	0 %	50 %	0 %	50 %	192288467
93	NC_011004	GGGC	3	12	39054	39065	0 %	0 %	75 %	25 %	192288468
94	NC_011004	CGGC	2	8	39713	39720	0 %	0 %	50 %	50 %	192288468
95	NC_011004	GCCC	2	8	40394	40401	0 %	0 %	25 %	75 %	192288468
96	NC_011004	CAGC	2	8	40977	40984	25 %	0 %	25 %	50 %	192288469
97	NC_011004	GCCG	2	8	41043	41050	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
98	NC_011004	GCGA	2	8	41912	41919	25 %	0 %	50 %	25 %	192288469
99	NC_011004	GCGA	2	8	42069	42076	25 %	0 %	50 %	25 %	192288469
100	NC_011004	ACCG	2	8	42418	42425	25 %	0 %	25 %	50 %	192288469
101	NC_011004	CGGC	2	8	42432	42439	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
102	NC_011004	CCGC	2	8	43723	43730	0 %	0 %	25 %	75 %	192288471
103	NC_011004	CGAT	2	8	43837	43844	25 %	25 %	25 %	25 %	192288471
104	NC_011004	CCAG	2	8	43937	43944	25 %	0 %	25 %	50 %	192288471
105	NC_011004	CTTC	2	8	44294	44301	0 %	50 %	0 %	50 %	192288471
106	NC_011004	GGCC	2	8	45166	45173	0 %	0 %	50 %	50 %	192288472
107	NC_011004	GCTG	2	8	47029	47036	0 %	25 %	50 %	25 %	192288475
108	NC_011004	GCTG	2	8	47438	47445	0 %	25 %	50 %	25 %	192288475
109	NC_011004	CCGA	2	8	47454	47461	25 %	0 %	25 %	50 %	192288475
110	NC_011004	CCGC	2	8	47742	47749	0 %	0 %	25 %	75 %	192288476
111	NC_011004	AGGC	2	8	48260	48267	25 %	0 %	50 %	25 %	192288476
112	NC_011004	CGGA	2	8	48936	48943	25 %	0 %	50 %	25 %	192288477
113	NC_011004	ATCG	2	8	49020	49027	25 %	25 %	25 %	25 %	192288477
114	NC_011004	CAGC	2	8	49101	49108	25 %	0 %	25 %	50 %	192288477
115	NC_011004	CATC	2	8	49157	49164	25 %	25 %	0 %	50 %	192288477
116	NC_011004	CGCC	2	8	50001	50008	0 %	0 %	25 %	75 %	192288478
117	NC_011004	GTGG	2	8	50100	50107	0 %	25 %	75 %	0 %	192288478
118	NC_011004	GCCG	2	8	51526	51533	0 %	0 %	50 %	50 %	192288479
119	NC_011004	ACCG	2	8	52330	52337	25 %	0 %	25 %	50 %	192288480
120	NC_011004	CCAG	2	8	53151	53158	25 %	0 %	25 %	50 %	192288481
121	NC_011004	CTCG	2	8	53482	53489	0 %	25 %	25 %	50 %	192288481
122	NC_011004	CTGA	2	8	55264	55271	25 %	25 %	25 %	25 %	192288483
123	NC_011004	AGCC	2	8	55948	55955	25 %	0 %	25 %	50 %	192288485
124	NC_011004	CGTC	2	8	56525	56532	0 %	25 %	25 %	50 %	192288485
125	NC_011004	CTGC	2	8	56663	56670	0 %	25 %	25 %	50 %	192288485
126	NC_011004	CTGG	2	8	56681	56688	0 %	25 %	50 %	25 %	192288485
127	NC_011004	CGAT	2	8	58389	58396	25 %	25 %	25 %	25 %	192288487
128	NC_011004	CGCC	2	8	58492	58499	0 %	0 %	25 %	75 %	192288487
129	NC_011004	TCGA	2	8	59581	59588	25 %	25 %	25 %	25 %	192288489
130	NC_011004	CGGC	2	8	60968	60975	0 %	0 %	50 %	50 %	192288490
131	NC_011004	ACGA	2	8	61794	61801	50 %	0 %	25 %	25 %	192288491
132	NC_011004	CGGC	2	8	62826	62833	0 %	0 %	50 %	50 %	192288492
133	NC_011004	TCGG	2	8	63256	63263	0 %	25 %	50 %	25 %	192288493
134	NC_011004	GCCG	2	8	63858	63865	0 %	0 %	50 %	50 %	192288493
135	NC_011004	GCTG	2	8	64745	64752	0 %	25 %	50 %	25 %	192288494
136	NC_011004	GCCG	2	8	64899	64906	0 %	0 %	50 %	50 %	192288494
137	NC_011004	GCTG	2	8	64952	64959	0 %	25 %	50 %	25 %	192288494
138	NC_011004	CGCC	2	8	65602	65609	0 %	0 %	25 %	75 %	192288494
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140	NC_011004	CCGG	2	8	65716	65723	0 %	0 %	50 %	50 %	192288494
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