MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 97044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011004	ACG	2	6	332	337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288434
2	NC_011004	ACT	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288434
3	NC_011004	GCA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288434
4	NC_011004	GCC	2	6	518	523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288434
5	NC_011004	CGA	2	6	525	530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288434
6	NC_011004	GCA	2	6	551	556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288434
7	NC_011004	CGG	2	6	594	599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288434
8	NC_011004	CGC	2	6	602	607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288434
9	NC_011004	GCC	2	6	692	697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288434
10	NC_011004	GCG	2	6	698	703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288434
11	NC_011004	CTG	2	6	763	768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288434
12	NC_011004	CCG	2	6	824	829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288434
13	NC_011004	TCG	2	6	848	853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288434
14	NC_011004	CGA	2	6	921	926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288434
15	NC_011004	ACC	2	6	949	954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288434
16	NC_011004	GGT	3	9	1005	1013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288434
17	NC_011004	CGC	2	6	1014	1019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288434
18	NC_011004	GCC	2	6	1026	1031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288434
19	NC_011004	CGA	2	6	1050	1055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288434
20	NC_011004	GGT	2	6	1078	1083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288434
21	NC_011004	CTG	2	6	1258	1263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288434
22	NC_011004	CTG	2	6	1414	1419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288434
23	NC_011004	TCG	2	6	1420	1425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288434
24	NC_011004	GCC	2	6	1511	1516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288434
25	NC_011004	TGC	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288434
26	NC_011004	CAA	2	6	2068	2073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288435
27	NC_011004	CGC	2	6	2231	2236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288435
28	NC_011004	CTA	2	6	2330	2335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288435
29	NC_011004	CCG	2	6	2359	2364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288435
30	NC_011004	GCG	2	6	2443	2448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288435
31	NC_011004	CGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288435
32	NC_011004	AAC	2	6	2640	2645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288435
33	NC_011004	AAG	2	6	2667	2672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288435
34	NC_011004	CGA	2	6	2701	2706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288435
35	NC_011004	CAG	2	6	2746	2751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288435
36	NC_011004	GAA	2	6	2799	2804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288435
37	NC_011004	CCG	2	6	3238	3243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288436
38	NC_011004	CCG	2	6	3307	3312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288436
39	NC_011004	GGT	2	6	3317	3322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288436
40	NC_011004	GCG	2	6	3398	3403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288436
41	NC_011004	GCC	2	6	3509	3514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288436
42	NC_011004	GCG	2	6	3517	3522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288436
43	NC_011004	CGG	3	9	3571	3579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288436
44	NC_011004	CTG	2	6	3750	3755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288436
45	NC_011004	GGC	2	6	3830	3835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288436
46	NC_011004	CGC	2	6	3863	3868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288436
47	NC_011004	CGC	3	9	4016	4024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288436
48	NC_011004	GCT	2	6	4124	4129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288436
49	NC_011004	TCG	2	6	4159	4164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288436
50	NC_011004	CGC	2	6	4183	4188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288436
51	NC_011004	TGC	3	9	4189	4197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288436
52	NC_011004	CGA	2	6	4199	4204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288436
53	NC_011004	GTG	2	6	4206	4211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288436
54	NC_011004	GTT	2	6	4241	4246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288436
55	NC_011004	CGA	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288437
56	NC_011004	CAC	2	6	4743	4748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288437
57	NC_011004	GTC	2	6	4761	4766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288437
58	NC_011004	CGA	2	6	4778	4783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288437
59	NC_011004	CGA	2	6	4850	4855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288437
60	NC_011004	TCA	2	6	4912	4917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288437
61	NC_011004	CGG	2	6	4934	4939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288437
62	NC_011004	GGC	2	6	4971	4976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288437
63	NC_011004	GGT	2	6	4997	5002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288437
64	NC_011004	TGC	2	6	5026	5031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288437
65	NC_011004	GTC	2	6	5100	5105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288437
66	NC_011004	GCG	2	6	5299	5304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288437
67	NC_011004	CAA	2	6	5333	5338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288437
68	NC_011004	GGT	2	6	5360	5365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288437
69	NC_011004	CAT	2	6	5387	5392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288437
70	NC_011004	TGG	2	6	5409	5414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288437
71	NC_011004	CAA	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288437
72	NC_011004	CGG	2	6	5471	5476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288437
73	NC_011004	AAG	2	6	5544	5549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288437
74	NC_011004	CGA	2	6	5570	5575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288437
75	NC_011004	CCG	2	6	5593	5598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288437
76	NC_011004	TCG	2	6	5631	5636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288437
77	NC_011004	GGT	2	6	5675	5680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288437
78	NC_011004	TCA	2	6	5689	5694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288437
79	NC_011004	GGT	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288437
80	NC_011004	TCG	2	6	5899	5904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288437
81	NC_011004	GGC	2	6	5919	5924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288437
82	NC_011004	ATC	2	6	6111	6116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288437
83	NC_011004	TGA	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288437
84	NC_011004	GCT	3	9	6158	6166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288437
85	NC_011004	TTC	3	9	6171	6179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288437
86	NC_011004	GGC	2	6	6204	6209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288437
87	NC_011004	GCC	2	6	6227	6232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288437
88	NC_011004	CGA	2	6	6317	6322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288437
89	NC_011004	GCG	2	6	6355	6360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288437
90	NC_011004	CTG	2	6	6369	6374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288437
91	NC_011004	GCG	2	6	6456	6461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288437
92	NC_011004	CAC	2	6	6488	6493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288437
93	NC_011004	GCC	3	9	6516	6524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288437
94	NC_011004	GCG	2	6	6625	6630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288437
95	NC_011004	AGG	2	6	6634	6639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288437
96	NC_011004	CGA	2	6	6650	6655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288437
97	NC_011004	GCT	2	6	6659	6664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288437
98	NC_011004	CGG	2	6	6670	6675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288437
99	NC_011004	TCC	2	6	6706	6711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288437
100	NC_011004	TGC	2	6	6736	6741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288437
101	NC_011004	GAC	2	6	6875	6880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288437
102	NC_011004	CGA	2	6	6938	6943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288437
103	NC_011004	CGT	2	6	6968	6973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288437
104	NC_011004	CGC	2	6	7216	7221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288438
105	NC_011004	CGG	2	6	7244	7249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288438
106	NC_011004	TCT	2	6	7256	7261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288438
107	NC_011004	CGT	2	6	7305	7310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288438
108	NC_011004	GAA	2	6	7333	7338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288438
109	NC_011004	CCG	2	6	7391	7396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288438
110	NC_011004	CGA	2	6	7398	7403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288438
111	NC_011004	CGG	2	6	7501	7506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288438
112	NC_011004	CGG	2	6	7527	7532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288438
113	NC_011004	CGC	2	6	7596	7601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288438
114	NC_011004	GAA	2	6	7729	7734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288438
115	NC_011004	GAT	2	6	7815	7820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288438
116	NC_011004	CGG	2	6	7842	7847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288438
117	NC_011004	CGA	2	6	7917	7922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288438
118	NC_011004	CAG	2	6	7927	7932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288438
119	NC_011004	GCC	2	6	7936	7941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288438
120	NC_011004	GCT	2	6	8115	8120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288438
121	NC_011004	ATG	2	6	8457	8462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288439
122	NC_011004	GAC	2	6	8505	8510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288439
123	NC_011004	ACA	2	6	8596	8601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288439
124	NC_011004	TCA	2	6	8602	8607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288439
125	NC_011004	CGA	2	6	8732	8737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288439
126	NC_011004	TGC	2	6	8791	8796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288439
127	NC_011004	AAC	2	6	8826	8831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288439
128	NC_011004	AGC	2	6	8917	8922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288439
129	NC_011004	CTC	2	6	8986	8991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288440
130	NC_011004	CGG	2	6	9017	9022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288440
131	NC_011004	GCC	2	6	9042	9047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288440
132	NC_011004	CGG	2	6	9108	9113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288440
133	NC_011004	CGT	2	6	9116	9121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288440
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252	NC_011004	CAC	2	6	15351	15356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288447
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254	NC_011004	CAG	2	6	15447	15452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288447
255	NC_011004	GCA	3	9	15635	15643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288447
256	NC_011004	GCG	2	6	15664	15669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288447
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258	NC_011004	CGA	2	6	15698	15703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288447
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263	NC_011004	CAG	2	6	15795	15800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288447
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375	NC_011004	AGC	2	6	21588	21593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288453
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