MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 15119

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011004	TC	3	6	71	76	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011004	CG	3	6	306	311	0 %	0 %	50 %	50 %	192288434
3	NC_011004	CG	3	6	1890	1895	0 %	0 %	50 %	50 %	192288435
4	NC_011004	GC	3	6	2387	2392	0 %	0 %	50 %	50 %	192288435
5	NC_011004	GC	3	6	2956	2961	0 %	0 %	50 %	50 %	192288435
6	NC_011004	GC	3	6	2996	3001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011004	GC	3	6	3472	3477	0 %	0 %	50 %	50 %	192288436
8	NC_011004	GC	3	6	4092	4097	0 %	0 %	50 %	50 %	192288436
9	NC_011004	GC	3	6	4267	4272	0 %	0 %	50 %	50 %	192288436
10	NC_011004	CG	3	6	4363	4368	0 %	0 %	50 %	50 %	192288436
11	NC_011004	GC	3	6	5796	5801	0 %	0 %	50 %	50 %	192288437
12	NC_011004	GC	3	6	5821	5826	0 %	0 %	50 %	50 %	192288437
13	NC_011004	GC	5	10	5996	6005	0 %	0 %	50 %	50 %	192288437
14	NC_011004	GC	3	6	6142	6147	0 %	0 %	50 %	50 %	192288437
15	NC_011004	CG	3	6	6247	6252	0 %	0 %	50 %	50 %	192288437
16	NC_011004	CG	3	6	6282	6287	0 %	0 %	50 %	50 %	192288437
17	NC_011004	GC	4	8	6390	6397	0 %	0 %	50 %	50 %	192288437
18	NC_011004	CG	3	6	6530	6535	0 %	0 %	50 %	50 %	192288437
19	NC_011004	CG	3	6	8017	8022	0 %	0 %	50 %	50 %	192288438
20	NC_011004	GC	3	6	8067	8072	0 %	0 %	50 %	50 %	192288438
21	NC_011004	CG	4	8	9903	9910	0 %	0 %	50 %	50 %	192288440
22	NC_011004	GC	3	6	10181	10186	0 %	0 %	50 %	50 %	192288440
23	NC_011004	GC	3	6	10795	10800	0 %	0 %	50 %	50 %	192288442
24	NC_011004	GC	3	6	10982	10987	0 %	0 %	50 %	50 %	192288442
25	NC_011004	GC	3	6	10999	11004	0 %	0 %	50 %	50 %	192288442
26	NC_011004	GC	3	6	11970	11975	0 %	0 %	50 %	50 %	192288442
27	NC_011004	GC	3	6	12260	12265	0 %	0 %	50 %	50 %	192288442
28	NC_011004	GC	3	6	12933	12938	0 %	0 %	50 %	50 %	192288443
29	NC_011004	GA	3	6	13322	13327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011004	AT	3	6	13360	13365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011004	GC	3	6	13750	13755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011004	GC	3	6	14265	14270	0 %	0 %	50 %	50 %	192288447
33	NC_011004	GC	3	6	14647	14652	0 %	0 %	50 %	50 %	192288447
34	NC_011004	GC	3	6	15242	15247	0 %	0 %	50 %	50 %	192288447
35	NC_011004	CG	3	6	15750	15755	0 %	0 %	50 %	50 %	192288447
36	NC_011004	GC	3	6	15935	15940	0 %	0 %	50 %	50 %	192288447
37	NC_011004	GA	3	6	16406	16411	50 %	0 %	50 %	0 %	192288447
38	NC_011004	CG	3	6	16772	16777	0 %	0 %	50 %	50 %	192288448
39	NC_011004	GC	3	6	17979	17984	0 %	0 %	50 %	50 %	192288449
40	NC_011004	GC	3	6	18253	18258	0 %	0 %	50 %	50 %	192288449
41	NC_011004	CG	3	6	18422	18427	0 %	0 %	50 %	50 %	192288449
42	NC_011004	GC	3	6	18495	18500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011004	AC	3	6	18526	18531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011004	GC	3	6	18540	18545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011004	GC	3	6	18946	18951	0 %	0 %	50 %	50 %	192288450
46	NC_011004	GC	3	6	19217	19222	0 %	0 %	50 %	50 %	192288450
47	NC_011004	AG	3	6	20085	20090	50 %	0 %	50 %	0 %	192288452
48	NC_011004	GC	3	6	20458	20463	0 %	0 %	50 %	50 %	192288453
49	NC_011004	GC	3	6	20752	20757	0 %	0 %	50 %	50 %	192288453
50	NC_011004	CG	3	6	22117	22122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011004	CG	3	6	23126	23131	0 %	0 %	50 %	50 %	192288454
52	NC_011004	CG	3	6	23550	23555	0 %	0 %	50 %	50 %	192288455
53	NC_011004	CG	3	6	23572	23577	0 %	0 %	50 %	50 %	192288455
54	NC_011004	GC	3	6	23668	23673	0 %	0 %	50 %	50 %	192288455
55	NC_011004	CA	3	6	24522	24527	50 %	0 %	0 %	50 %	192288456
56	NC_011004	GC	3	6	25122	25127	0 %	0 %	50 %	50 %	192288457
57	NC_011004	GC	3	6	25350	25355	0 %	0 %	50 %	50 %	192288457
58	NC_011004	GC	3	6	25397	25402	0 %	0 %	50 %	50 %	192288457
59	NC_011004	CG	3	6	25618	25623	0 %	0 %	50 %	50 %	192288457
60	NC_011004	CG	3	6	26009	26014	0 %	0 %	50 %	50 %	192288458
61	NC_011004	GA	3	6	26118	26123	50 %	0 %	50 %	0 %	192288458
62	NC_011004	CG	3	6	27049	27054	0 %	0 %	50 %	50 %	192288459
63	NC_011004	CG	3	6	27507	27512	0 %	0 %	50 %	50 %	192288459
64	NC_011004	GC	3	6	27542	27547	0 %	0 %	50 %	50 %	192288459
65	NC_011004	GC	3	6	27659	27664	0 %	0 %	50 %	50 %	192288459
66	NC_011004	CG	3	6	28548	28553	0 %	0 %	50 %	50 %	192288459
67	NC_011004	CG	3	6	30278	30283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011004	GC	4	8	30864	30871	0 %	0 %	50 %	50 %	192288461
69	NC_011004	GC	3	6	32019	32024	0 %	0 %	50 %	50 %	192288462
70	NC_011004	GC	3	6	32035	32040	0 %	0 %	50 %	50 %	192288462
71	NC_011004	GC	4	8	32142	32149	0 %	0 %	50 %	50 %	192288462
72	NC_011004	GC	3	6	32390	32395	0 %	0 %	50 %	50 %	192288462
73	NC_011004	CG	3	6	32495	32500	0 %	0 %	50 %	50 %	192288462
74	NC_011004	GC	3	6	32570	32575	0 %	0 %	50 %	50 %	192288462
75	NC_011004	GT	3	6	32853	32858	0 %	50 %	50 %	0 %	192288462
76	NC_011004	GC	3	6	33160	33165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011004	CG	3	6	33217	33222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011004	GC	3	6	33822	33827	0 %	0 %	50 %	50 %	192288463
79	NC_011004	GC	4	8	34988	34995	0 %	0 %	50 %	50 %	192288463
80	NC_011004	CG	3	6	35006	35011	0 %	0 %	50 %	50 %	192288463
81	NC_011004	GC	3	6	35194	35199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011004	CA	3	6	35286	35291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011004	CG	3	6	35379	35384	0 %	0 %	50 %	50 %	192288464
84	NC_011004	CG	3	6	35850	35855	0 %	0 %	50 %	50 %	192288464
85	NC_011004	CG	3	6	36183	36188	0 %	0 %	50 %	50 %	192288464
86	NC_011004	GC	3	6	36215	36220	0 %	0 %	50 %	50 %	192288464
87	NC_011004	CG	3	6	36283	36288	0 %	0 %	50 %	50 %	192288464
88	NC_011004	GC	3	6	36427	36432	0 %	0 %	50 %	50 %	192288464
89	NC_011004	GC	3	6	36438	36443	0 %	0 %	50 %	50 %	192288464
90	NC_011004	GC	3	6	36541	36546	0 %	0 %	50 %	50 %	192288464
91	NC_011004	CG	3	6	36756	36761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011004	GC	3	6	36939	36944	0 %	0 %	50 %	50 %	192288465
93	NC_011004	GC	4	8	36994	37001	0 %	0 %	50 %	50 %	192288465
94	NC_011004	GC	3	6	37363	37368	0 %	0 %	50 %	50 %	192288466
95	NC_011004	AC	3	6	38297	38302	50 %	0 %	0 %	50 %	192288467
96	NC_011004	CG	3	6	39080	39085	0 %	0 %	50 %	50 %	192288468
97	NC_011004	GC	4	8	39245	39252	0 %	0 %	50 %	50 %	192288468
98	NC_011004	GC	3	6	39292	39297	0 %	0 %	50 %	50 %	192288468
99	NC_011004	CG	3	6	39368	39373	0 %	0 %	50 %	50 %	192288468
100	NC_011004	GC	4	8	39540	39547	0 %	0 %	50 %	50 %	192288468
101	NC_011004	GC	4	8	39730	39737	0 %	0 %	50 %	50 %	192288468
102	NC_011004	CG	3	6	39893	39898	0 %	0 %	50 %	50 %	192288468
103	NC_011004	CG	3	6	40536	40541	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
104	NC_011004	CG	3	6	40707	40712	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
105	NC_011004	CG	3	6	41337	41342	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
106	NC_011004	GC	4	8	41349	41356	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
107	NC_011004	GC	3	6	41782	41787	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
108	NC_011004	CG	4	8	42318	42325	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
109	NC_011004	AT	3	6	42557	42562	50 %	50 %	0 %	0 %	192288469
110	NC_011004	GC	4	8	42596	42603	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
111	NC_011004	GC	3	6	42609	42614	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
112	NC_011004	GA	3	6	42883	42888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011004	GC	3	6	43052	43057	0 %	0 %	50 %	50 %	192288470
114	NC_011004	GC	3	6	43061	43066	0 %	0 %	50 %	50 %	192288470
115	NC_011004	GC	3	6	43216	43221	0 %	0 %	50 %	50 %	192288470
116	NC_011004	CG	3	6	43419	43424	0 %	0 %	50 %	50 %	192288470
117	NC_011004	CA	3	6	43689	43694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011004	GC	3	6	45118	45123	0 %	0 %	50 %	50 %	192288472
119	NC_011004	CG	3	6	45433	45438	0 %	0 %	50 %	50 %	192288473
120	NC_011004	CG	3	6	45597	45602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_011004	GC	3	6	46189	46194	0 %	0 %	50 %	50 %	192288474
122	NC_011004	CG	3	6	46568	46573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011004	CG	3	6	46603	46608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011004	GC	3	6	46947	46952	0 %	0 %	50 %	50 %	192288475
125	NC_011004	AG	3	6	47039	47044	50 %	0 %	50 %	0 %	192288475
126	NC_011004	AG	3	6	47635	47640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011004	CG	4	8	48048	48055	0 %	0 %	50 %	50 %	192288476
128	NC_011004	GC	4	8	48145	48152	0 %	0 %	50 %	50 %	192288476
129	NC_011004	GC	3	6	48487	48492	0 %	0 %	50 %	50 %	192288476
130	NC_011004	GC	3	6	48584	48589	0 %	0 %	50 %	50 %	192288476
131	NC_011004	CG	3	6	48727	48732	0 %	0 %	50 %	50 %	192288476
132	NC_011004	CG	3	6	48964	48969	0 %	0 %	50 %	50 %	192288477
133	NC_011004	GC	3	6	49095	49100	0 %	0 %	50 %	50 %	192288477
134	NC_011004	GC	3	6	50225	50230	0 %	0 %	50 %	50 %	192288478
135	NC_011004	TC	3	6	50577	50582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011004	GC	3	6	50633	50638	0 %	0 %	50 %	50 %	192288479
137	NC_011004	GC	3	6	51316	51321	0 %	0 %	50 %	50 %	192288479
138	NC_011004	GC	3	6	51511	51516	0 %	0 %	50 %	50 %	192288479
139	NC_011004	GC	3	6	52886	52891	0 %	0 %	50 %	50 %	192288481
140	NC_011004	GC	3	6	53182	53187	0 %	0 %	50 %	50 %	192288481
141	NC_011004	CG	3	6	54347	54352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_011004	GC	3	6	54434	54439	0 %	0 %	50 %	50 %	192288483
143	NC_011004	CG	3	6	54919	54924	0 %	0 %	50 %	50 %	192288483
144	NC_011004	CG	3	6	55066	55071	0 %	0 %	50 %	50 %	192288483
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