MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 397

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011004	G	6	6	35046	35051	0 %	0 %	100 %	0 %	192288463
2	NC_011004	C	6	6	41897	41902	0 %	0 %	0 %	100 %	192288469
3	NC_011004	G	6	6	43094	43099	0 %	0 %	100 %	0 %	192288470
4	NC_011004	T	6	6	46183	46188	0 %	100 %	0 %	0 %	192288474
5	NC_011004	G	6	6	46423	46428	0 %	0 %	100 %	0 %	192288474
6	NC_011004	G	6	6	49387	49392	0 %	0 %	100 %	0 %	192288477
7	NC_011004	G	6	6	59845	59850	0 %	0 %	100 %	0 %	192288489
8	NC_011004	C	7	7	60221	60227	0 %	0 %	0 %	100 %	192288490
9	NC_011004	C	6	6	92765	92770	0 %	0 %	0 %	100 %	192288517
10	NC_011004	T	6	6	166314	166319	0 %	100 %	0 %	0 %	192288583
11	NC_011004	G	7	7	176631	176637	0 %	0 %	100 %	0 %	192288595
12	NC_011004	C	6	6	197284	197289	0 %	0 %	0 %	100 %	192288614
13	NC_011004	G	6	6	208680	208685	0 %	0 %	100 %	0 %	192288623
14	NC_011004	G	6	6	222638	222643	0 %	0 %	100 %	0 %	192288633
15	NC_011004	C	6	6	226400	226405	0 %	0 %	0 %	100 %	192288639
16	NC_011004	T	6	6	259748	259753	0 %	100 %	0 %	0 %	192288674
17	NC_011004	T	6	6	259758	259763	0 %	100 %	0 %	0 %	192288674
18	NC_011004	C	6	6	286958	286963	0 %	0 %	0 %	100 %	192288698
19	NC_011004	G	7	7	299288	299294	0 %	0 %	100 %	0 %	192288712
20	NC_011004	G	6	6	331090	331095	0 %	0 %	100 %	0 %	192288739
21	NC_011004	A	9	9	345944	345952	100 %	0 %	0 %	0 %	192288757
22	NC_011004	C	6	6	376882	376887	0 %	0 %	0 %	100 %	192288787
23	NC_011004	G	6	6	377386	377391	0 %	0 %	100 %	0 %	192288787
24	NC_011004	A	6	6	388207	388212	100 %	0 %	0 %	0 %	192288795
25	NC_011004	C	6	6	395897	395902	0 %	0 %	0 %	100 %	192288803
26	NC_011004	G	6	6	410907	410912	0 %	0 %	100 %	0 %	192288816
27	NC_011004	A	6	6	413809	413814	100 %	0 %	0 %	0 %	192288818
28	NC_011004	C	6	6	416259	416264	0 %	0 %	0 %	100 %	192288822
29	NC_011004	G	6	6	486614	486619	0 %	0 %	100 %	0 %	192288882
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31	NC_011004	G	7	7	558668	558674	0 %	0 %	100 %	0 %	192288943
32	NC_011004	G	6	6	570482	570487	0 %	0 %	100 %	0 %	192288951
33	NC_011004	T	6	6	577622	577627	0 %	100 %	0 %	0 %	192288960
34	NC_011004	T	6	6	579903	579908	0 %	100 %	0 %	0 %	192288961
35	NC_011004	G	6	6	581605	581610	0 %	0 %	100 %	0 %	192288963
36	NC_011004	G	6	6	586297	586302	0 %	0 %	100 %	0 %	192288966
37	NC_011004	G	6	6	617298	617303	0 %	0 %	100 %	0 %	192288998
38	NC_011004	T	6	6	620783	620788	0 %	100 %	0 %	0 %	192289001
39	NC_011004	T	6	6	631652	631657	0 %	100 %	0 %	0 %	192289010
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41	NC_011004	C	6	6	684302	684307	0 %	0 %	0 %	100 %	192289060
42	NC_011004	G	7	7	695379	695385	0 %	0 %	100 %	0 %	192289072
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44	NC_011004	A	6	6	725294	725299	100 %	0 %	0 %	0 %	192289117
45	NC_011004	T	6	6	730710	730715	0 %	100 %	0 %	0 %	192289123
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47	NC_011004	A	7	7	740316	740322	100 %	0 %	0 %	0 %	192289135
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50	NC_011004	C	6	6	755457	755462	0 %	0 %	0 %	100 %	192289149
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63	NC_011004	T	7	7	888124	888130	0 %	100 %	0 %	0 %	192289267
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65	NC_011004	T	6	6	888542	888547	0 %	100 %	0 %	0 %	192289267
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.