MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Burkholderia cenocepacia J2315 plasmid pBCJ2315

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011003	CCGGGC	2	12	5471	5482	0 %	0 %	50 %	50 %	206479930
2	NC_011003	GATCGC	2	12	7218	7229	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	206479930
3	NC_011003	CGATCT	2	12	7946	7957	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	206479931
4	NC_011003	TCGCGC	2	12	8605	8616	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	206479931
5	NC_011003	TCGACC	2	12	10116	10127	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	206479933
6	NC_011003	TCATGC	2	12	11013	11024	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	206479933
7	NC_011003	CGCCGG	2	12	13802	13813	0 %	0 %	50 %	50 %	206479935
8	NC_011003	CGCTCG	2	12	15674	15685	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011003	CGACGT	2	12	17448	17459	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011003	CGACGT	2	12	17856	17867	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011003	CGACGT	2	12	18264	18275	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011003	ATCGGT	2	12	20299	20310	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	206479937
13	NC_011003	CCCGAA	2	12	21753	21764	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	206479939
14	NC_011003	GGCGCC	2	12	22005	22016	0 %	0 %	50 %	50 %	206479940
15	NC_011003	AGCTCG	2	12	22643	22654	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	206479941
16	NC_011003	GTCGCG	2	12	23478	23489	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	206479942
17	NC_011003	GGCTCC	2	12	26595	26606	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	206479945
18	NC_011003	ACGCCC	2	12	34308	34319	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_011003	CGTGAT	2	12	34435	34446	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011003	GGGTCT	2	12	36280	36291	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	206479954
21	NC_011003	ATCGAG	2	12	37354	37365	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	206479956
22	NC_011003	TCGCGG	2	12	39144	39155	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	206479958
23	NC_011003	GTTCGG	2	12	39618	39629	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	206479959
24	NC_011003	GTTGGG	2	12	41968	41979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206479963
25	NC_011003	CGACCG	2	12	44249	44260	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011003	CGTTGT	2	12	46726	46737	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	206479968
27	NC_011003	CGATTG	2	12	48404	48415	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	206479971
28	NC_011003	TCCCAA	2	12	51310	51321	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	206479974
29	NC_011003	CAGCGT	2	12	54431	54442	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	206479980
30	NC_011003	TCGGCT	2	12	61287	61298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206479985
31	NC_011003	CGTTCC	2	12	65238	65249	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	206479987
32	NC_011003	CGCCGG	2	12	72526	72537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011003	ACGTCG	2	12	75098	75109	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	206480000
34	NC_011003	CGTGTA	2	12	77617	77628	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	206480004
35	NC_011003	GCGGCC	2	12	78052	78063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011003	ACCGAT	2	12	80368	80379	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011003	ATGCCG	2	12	83374	83385	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	206480010
38	NC_011003	CGCTGG	2	12	85738	85749	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	206480012
39	NC_011003	CTCGAT	2	12	86164	86175	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	206480013
40	NC_011003	TACGTG	2	12	86204	86215	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	206480013
41	NC_011003	CCGCCC	2	12	86776	86787	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
42	NC_011003	AGCGTC	2	12	87470	87481	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	206480014
43	NC_011003	TCGGCC	2	12	88640	88651	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	206480014
44	NC_011003	AATTCG	2	12	90974	90985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	206480018
45	NC_011003	ATGTCG	2	12	91129	91140	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.