MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia J2315 chromosome 3

Total Repeats: 744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011002	TCGTC	2	10	2024	2033	0 %	40 %	20 %	40 %	197294854
2	NC_011002	TCCGC	2	10	6117	6126	0 %	20 %	20 %	60 %	197294857
3	NC_011002	GCTCG	2	10	6857	6866	0 %	20 %	40 %	40 %	197294857
4	NC_011002	GGCGC	2	10	8235	8244	0 %	0 %	60 %	40 %	197294858
5	NC_011002	ATCGC	2	10	8551	8560	20 %	20 %	20 %	40 %	197294859
6	NC_011002	GCCGC	2	10	11692	11701	0 %	0 %	40 %	60 %	197294862
7	NC_011002	GCGCC	2	10	15508	15517	0 %	0 %	40 %	60 %	197294866
8	NC_011002	GCCGT	2	10	17737	17746	0 %	20 %	40 %	40 %	197294869
9	NC_011002	CGGCG	2	10	17751	17760	0 %	0 %	60 %	40 %	197294869
10	NC_011002	GACGC	2	10	21228	21237	20 %	0 %	40 %	40 %	197294871
11	NC_011002	CGTGA	2	10	21388	21397	20 %	20 %	40 %	20 %	197294871
12	NC_011002	CGCTG	2	10	23755	23764	0 %	20 %	40 %	40 %	197294873
13	NC_011002	GGCTC	2	10	23932	23941	0 %	20 %	40 %	40 %	197294874
14	NC_011002	TCGGC	2	10	24379	24388	0 %	20 %	40 %	40 %	197294874
15	NC_011002	TGCGA	2	10	25161	25170	20 %	20 %	40 %	20 %	197294874
16	NC_011002	TGCCG	2	10	25309	25318	0 %	20 %	40 %	40 %	197294875
17	NC_011002	TCGCG	2	10	25698	25707	0 %	20 %	40 %	40 %	197294875
18	NC_011002	GCGCG	2	10	25889	25898	0 %	0 %	60 %	40 %	197294875
19	NC_011002	CGGCG	2	10	26708	26717	0 %	0 %	60 %	40 %	197294876
20	NC_011002	GCGCG	2	10	27862	27871	0 %	0 %	60 %	40 %	197294877
21	NC_011002	GCCGC	2	10	29716	29725	0 %	0 %	40 %	60 %	197294879
22	NC_011002	CCGAC	2	10	29816	29825	20 %	0 %	20 %	60 %	197294879
23	NC_011002	ACCTG	2	10	30410	30419	20 %	20 %	20 %	40 %	197294879
24	NC_011002	CGGCT	2	10	34833	34842	0 %	20 %	40 %	40 %	197294883
25	NC_011002	GAACT	2	10	35960	35969	40 %	20 %	20 %	20 %	197294884
26	NC_011002	GCCGC	2	10	39127	39136	0 %	0 %	40 %	60 %	197294887
27	NC_011002	CGCGC	2	10	40518	40527	0 %	0 %	40 %	60 %	197294888
28	NC_011002	GCCGG	2	10	42055	42064	0 %	0 %	60 %	40 %	197294889
29	NC_011002	CGGCG	2	10	42867	42876	0 %	0 %	60 %	40 %	197294890
30	NC_011002	GCGCG	2	10	42885	42894	0 %	0 %	60 %	40 %	197294890
31	NC_011002	GTTTC	2	10	43047	43056	0 %	60 %	20 %	20 %	197294890
32	NC_011002	CGGCG	2	10	47354	47363	0 %	0 %	60 %	40 %	197294894
33	NC_011002	CGATG	2	10	47423	47432	20 %	20 %	40 %	20 %	197294894
34	NC_011002	CGGCG	2	10	47466	47475	0 %	0 %	60 %	40 %	197294894
35	NC_011002	GGCTG	2	10	47929	47938	0 %	20 %	60 %	20 %	197294894
36	NC_011002	TCGGC	2	10	49726	49735	0 %	20 %	40 %	40 %	197294896
37	NC_011002	GCGCG	2	10	54535	54544	0 %	0 %	60 %	40 %	197294900
38	NC_011002	GCGCT	2	10	55552	55561	0 %	20 %	40 %	40 %	197294901
39	NC_011002	CGGCA	2	10	56134	56143	20 %	0 %	40 %	40 %	197294902
40	NC_011002	CCGCC	2	10	57071	57080	0 %	0 %	20 %	80 %	197294903
41	NC_011002	GCGCG	2	10	57512	57521	0 %	0 %	60 %	40 %	197294903
42	NC_011002	ACGCG	2	10	59093	59102	20 %	0 %	40 %	40 %	197294904
43	NC_011002	TCGAG	2	10	64097	64106	20 %	20 %	40 %	20 %	197294909
44	NC_011002	GGGCA	2	10	65526	65535	20 %	0 %	60 %	20 %	197294910
45	NC_011002	ATGCG	2	10	66220	66229	20 %	20 %	40 %	20 %	197294910
46	NC_011002	AGCGC	2	10	68850	68859	20 %	0 %	40 %	40 %	197294912
47	NC_011002	AGCAC	2	10	68869	68878	40 %	0 %	20 %	40 %	197294912
48	NC_011002	GCGCC	2	10	70754	70763	0 %	0 %	40 %	60 %	197294913
49	NC_011002	CCGAG	2	10	70781	70790	20 %	0 %	40 %	40 %	197294913
50	NC_011002	AAGCG	2	10	71759	71768	40 %	0 %	40 %	20 %	197294914
51	NC_011002	GCAGC	2	10	72161	72170	20 %	0 %	40 %	40 %	197294914
52	NC_011002	GCGCT	2	10	72285	72294	0 %	20 %	40 %	40 %	197294914
53	NC_011002	CCGGC	2	10	74956	74965	0 %	0 %	40 %	60 %	197294918
54	NC_011002	CAGCG	2	10	79933	79942	20 %	0 %	40 %	40 %	197294922
55	NC_011002	CAGCG	2	10	80102	80111	20 %	0 %	40 %	40 %	197294922
56	NC_011002	CGCTG	2	10	84476	84485	0 %	20 %	40 %	40 %	197294927
57	NC_011002	TGCCG	2	10	84590	84599	0 %	20 %	40 %	40 %	197294927
58	NC_011002	GCTGA	2	10	85555	85564	20 %	20 %	40 %	20 %	197294928
59	NC_011002	GCGCG	2	10	86452	86461	0 %	0 %	60 %	40 %	197294929
60	NC_011002	CGATG	2	10	87248	87257	20 %	20 %	40 %	20 %	197294930
61	NC_011002	GCATG	2	10	88291	88300	20 %	20 %	40 %	20 %	197294931
62	NC_011002	GGCAA	2	10	88496	88505	40 %	0 %	40 %	20 %	197294932
63	NC_011002	CGGGG	2	10	88743	88752	0 %	0 %	80 %	20 %	197294932
64	NC_011002	GCGAT	2	10	89714	89723	20 %	20 %	40 %	20 %	197294932
65	NC_011002	CGCGC	2	10	90416	90425	0 %	0 %	40 %	60 %	197294933
66	NC_011002	CTCGC	2	10	90837	90846	0 %	20 %	20 %	60 %	197294933
67	NC_011002	GCCGG	2	10	92173	92182	0 %	0 %	60 %	40 %	197294934
68	NC_011002	TCGAT	2	10	92250	92259	20 %	40 %	20 %	20 %	197294934
69	NC_011002	CCGCA	2	10	92357	92366	20 %	0 %	20 %	60 %	197294934
70	NC_011002	GAAGC	2	10	93012	93021	40 %	0 %	40 %	20 %	197294935
71	NC_011002	GAAAC	2	10	93711	93720	60 %	0 %	20 %	20 %	197294936
72	NC_011002	ACGCG	2	10	94880	94889	20 %	0 %	40 %	40 %	197294937
73	NC_011002	GCAAC	2	10	95739	95748	40 %	0 %	20 %	40 %	197294938
74	NC_011002	GCGTC	2	10	97225	97234	0 %	20 %	40 %	40 %	197294940
75	NC_011002	CGGCA	2	10	100046	100055	20 %	0 %	40 %	40 %	197294944
76	NC_011002	CGGCG	2	10	100255	100264	0 %	0 %	60 %	40 %	197294944
77	NC_011002	TGCGC	2	10	100681	100690	0 %	20 %	40 %	40 %	197294945
78	NC_011002	CGGTC	2	10	100770	100779	0 %	20 %	40 %	40 %	197294945
79	NC_011002	CCGGG	2	10	101131	101140	0 %	0 %	60 %	40 %	197294945
80	NC_011002	GGGCC	2	10	101371	101380	0 %	0 %	60 %	40 %	197294945
81	NC_011002	CGTCG	2	10	102273	102282	0 %	20 %	40 %	40 %	197294947
82	NC_011002	CGATC	2	10	103995	104004	20 %	20 %	20 %	40 %	197294948
83	NC_011002	CGATG	2	10	104700	104709	20 %	20 %	40 %	20 %	197294948
84	NC_011002	CGGTG	2	10	105410	105419	0 %	20 %	60 %	20 %	197294949
85	NC_011002	GCGCC	2	10	106874	106883	0 %	0 %	40 %	60 %	197294950
86	NC_011002	GTACG	2	10	108116	108125	20 %	20 %	40 %	20 %	197294951
87	NC_011002	TGCGA	2	10	108309	108318	20 %	20 %	40 %	20 %	197294951
88	NC_011002	CGCGA	2	10	109223	109232	20 %	0 %	40 %	40 %	197294952
89	NC_011002	GCACG	2	10	110521	110530	20 %	0 %	40 %	40 %	197294953
90	NC_011002	ACCTG	2	10	110583	110592	20 %	20 %	20 %	40 %	197294953
91	NC_011002	CGCAA	2	10	111538	111547	40 %	0 %	20 %	40 %	197294954
92	NC_011002	TGCGC	2	10	112675	112684	0 %	20 %	40 %	40 %	197294955
93	NC_011002	AGGCC	2	10	117017	117026	20 %	0 %	40 %	40 %	197294958
94	NC_011002	GACCA	2	10	118041	118050	40 %	0 %	20 %	40 %	197294958
95	NC_011002	GGCGC	2	10	119099	119108	0 %	0 %	60 %	40 %	197294959
96	NC_011002	GCTCG	2	10	119708	119717	0 %	20 %	40 %	40 %	197294960
97	NC_011002	CGGCG	2	10	119903	119912	0 %	0 %	60 %	40 %	197294960
98	NC_011002	CGACG	2	10	120677	120686	20 %	0 %	40 %	40 %	197294960
99	NC_011002	GCGCG	2	10	120770	120779	0 %	0 %	60 %	40 %	197294960
100	NC_011002	CCGCG	2	10	120932	120941	0 %	0 %	40 %	60 %	197294961
101	NC_011002	CGACG	2	10	121205	121214	20 %	0 %	40 %	40 %	197294961
102	NC_011002	GTGCA	2	10	122472	122481	20 %	20 %	40 %	20 %	197294962
103	NC_011002	CGGCG	2	10	123328	123337	0 %	0 %	60 %	40 %	197294963
104	NC_011002	GCGTC	2	10	124680	124689	0 %	20 %	40 %	40 %	197294964
105	NC_011002	ACCGC	2	10	125496	125505	20 %	0 %	20 %	60 %	197294965
106	NC_011002	GGCGC	2	10	126369	126378	0 %	0 %	60 %	40 %	197294966
107	NC_011002	AGCGC	2	10	129398	129407	20 %	0 %	40 %	40 %	197294969
108	NC_011002	ATCGC	2	10	129430	129439	20 %	20 %	20 %	40 %	197294969
109	NC_011002	GCTCG	2	10	132096	132105	0 %	20 %	40 %	40 %	197294971
110	NC_011002	CGGAC	2	10	132651	132660	20 %	0 %	40 %	40 %	197294972
111	NC_011002	GCCGC	2	10	132764	132773	0 %	0 %	40 %	60 %	197294972
112	NC_011002	GCGTC	2	10	135620	135629	0 %	20 %	40 %	40 %	197294974
113	NC_011002	CGCGC	2	10	135657	135666	0 %	0 %	40 %	60 %	197294974
114	NC_011002	CGCTG	2	10	141165	141174	0 %	20 %	40 %	40 %	197294979
115	NC_011002	GCCCG	2	10	141549	141558	0 %	0 %	40 %	60 %	197294980
116	NC_011002	GCGAT	2	10	141798	141807	20 %	20 %	40 %	20 %	197294980
117	NC_011002	GATCG	2	10	141911	141920	20 %	20 %	40 %	20 %	197294980
118	NC_011002	GCGAG	2	10	144366	144375	20 %	0 %	60 %	20 %	197294983
119	NC_011002	AGCGC	2	10	145616	145625	20 %	0 %	40 %	40 %	197294984
120	NC_011002	GCCGT	2	10	145731	145740	0 %	20 %	40 %	40 %	197294984
121	NC_011002	GAATC	2	10	145835	145844	40 %	20 %	20 %	20 %	197294984
122	NC_011002	CGCGC	2	10	145869	145878	0 %	0 %	40 %	60 %	197294984
123	NC_011002	CACAC	2	10	146860	146869	40 %	0 %	0 %	60 %	197294985
124	NC_011002	GGCGC	2	10	149077	149086	0 %	0 %	60 %	40 %	197294987
125	NC_011002	GCAGC	2	10	149513	149522	20 %	0 %	40 %	40 %	197294987
126	NC_011002	CGCGC	2	10	150093	150102	0 %	0 %	40 %	60 %	197294988
127	NC_011002	TGAAT	2	10	151412	151421	40 %	40 %	20 %	0 %	197294988
128	NC_011002	GCGAT	2	10	151693	151702	20 %	20 %	40 %	20 %	197294989
129	NC_011002	AATCG	2	10	152096	152105	40 %	20 %	20 %	20 %	197294989
130	NC_011002	CGGCG	2	10	154461	154470	0 %	0 %	60 %	40 %	197294991
131	NC_011002	TTCGC	2	10	154639	154648	0 %	40 %	20 %	40 %	197294991
132	NC_011002	CGGCG	2	10	157366	157375	0 %	0 %	60 %	40 %	197294993
133	NC_011002	GCATT	2	10	157449	157458	20 %	40 %	20 %	20 %	197294993
134	NC_011002	GGGCA	2	10	157864	157873	20 %	0 %	60 %	20 %	197294994
135	NC_011002	GCGTC	2	10	157922	157931	0 %	20 %	40 %	40 %	197294994
136	NC_011002	CGGCG	2	10	158490	158499	0 %	0 %	60 %	40 %	197294994
137	NC_011002	AGCGA	2	10	158682	158691	40 %	0 %	40 %	20 %	197294994
138	NC_011002	GCGCG	2	10	160748	160757	0 %	0 %	60 %	40 %	197294997
139	NC_011002	CACGA	2	10	160815	160824	40 %	0 %	20 %	40 %	197294997
140	NC_011002	CGTGC	2	10	161336	161345	0 %	20 %	40 %	40 %	197294997
141	NC_011002	TGCGA	2	10	161714	161723	20 %	20 %	40 %	20 %	197294998
142	NC_011002	GGACC	2	10	165980	165989	20 %	0 %	40 %	40 %	197295000
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144	NC_011002	AGCCG	2	10	170160	170169	20 %	0 %	40 %	40 %	197295004
145	NC_011002	GCGAT	2	10	171548	171557	20 %	20 %	40 %	20 %	197295004
146	NC_011002	CGCAG	2	10	172241	172250	20 %	0 %	40 %	40 %	197295005
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148	NC_011002	CCGCG	2	10	175211	175220	0 %	0 %	40 %	60 %	197295007
149	NC_011002	ACGCG	2	10	175812	175821	20 %	0 %	40 %	40 %	197295008
150	NC_011002	CGACG	2	10	177562	177571	20 %	0 %	40 %	40 %	197295010
151	NC_011002	GCGAT	2	10	178406	178415	20 %	20 %	40 %	20 %	197295011
152	NC_011002	GGTCG	2	10	180617	180626	0 %	20 %	60 %	20 %	197295013
153	NC_011002	GCGAC	2	10	180667	180676	20 %	0 %	40 %	40 %	197295013
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156	NC_011002	AGCAC	2	10	186218	186227	40 %	0 %	20 %	40 %	197295018
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174	NC_011002	CGCTG	2	10	203744	203753	0 %	20 %	40 %	40 %	197295038
175	NC_011002	GCTGG	2	10	204029	204038	0 %	20 %	60 %	20 %	197295038
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254	NC_011002	CGCGG	2	10	278750	278759	0 %	0 %	60 %	40 %	197295101
255	NC_011002	CGTTG	2	10	279299	279308	0 %	40 %	40 %	20 %	197295102
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257	NC_011002	TCGCA	2	10	282204	282213	20 %	20 %	20 %	40 %	197295104
258	NC_011002	TGCGC	2	10	283898	283907	0 %	20 %	40 %	40 %	197295106
259	NC_011002	ATCGT	2	10	287187	287196	20 %	40 %	20 %	20 %	197295108
260	NC_011002	GCGCA	2	10	287641	287650	20 %	0 %	40 %	40 %	197295109
261	NC_011002	GCGTC	2	10	288994	289003	0 %	20 %	40 %	40 %	197295110
262	NC_011002	GCCTG	2	10	289953	289962	0 %	20 %	40 %	40 %	197295111
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