MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia J2315 chromosome 3

Total Repeats: 14445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011002	GCA	2	6	132	137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191639870
2	NC_011002	AGG	2	6	179	184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	191639870
3	NC_011002	CAA	2	6	255	260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191639870
4	NC_011002	CGT	2	6	303	308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191639870
5	NC_011002	AGG	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	191639870
6	NC_011002	GGC	2	6	882	887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191639870
7	NC_011002	GAA	3	9	915	923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191639870
8	NC_011002	CGC	2	6	945	950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191639870
9	NC_011002	GGC	2	6	1071	1076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191639870
10	NC_011002	CGA	2	6	1119	1124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191639870
11	NC_011002	GAA	3	9	1191	1199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191639870
12	NC_011002	CTT	2	6	1224	1229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191639870
13	NC_011002	GAC	2	6	1270	1275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191639870
14	NC_011002	CTG	2	6	1276	1281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191639870
15	NC_011002	CTG	2	6	1288	1293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191639870
16	NC_011002	AGC	2	6	1297	1302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191639870
17	NC_011002	TGG	2	6	1489	1494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197294854
18	NC_011002	CTT	2	6	1614	1619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197294854
19	NC_011002	CAG	2	6	1692	1697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294854
20	NC_011002	CGC	2	6	1749	1754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294854
21	NC_011002	CGA	2	6	1763	1768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294854
22	NC_011002	CGT	2	6	1769	1774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294854
23	NC_011002	CAG	2	6	1794	1799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294854
24	NC_011002	TCG	2	6	1897	1902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294854
25	NC_011002	TCG	2	6	1927	1932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294854
26	NC_011002	GCT	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294854
27	NC_011002	TCG	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294854
28	NC_011002	ACG	2	6	2077	2082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294854
29	NC_011002	GCG	2	6	2237	2242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294854
30	NC_011002	CGG	2	6	2261	2266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294854
31	NC_011002	GGC	3	9	2271	2279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294854
32	NC_011002	CGA	2	6	2303	2308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294854
33	NC_011002	GGC	2	6	2446	2451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294855
34	NC_011002	GTG	2	6	2561	2566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197294855
35	NC_011002	TTC	2	6	2635	2640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197294855
36	NC_011002	TTC	2	6	2662	2667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197294855
37	NC_011002	GAA	2	6	2711	2716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197294855
38	NC_011002	ATC	2	6	2759	2764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197294855
39	NC_011002	CGA	3	9	2874	2882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294855
40	NC_011002	CTT	2	6	2905	2910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197294855
41	NC_011002	CCG	2	6	2918	2923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294855
42	NC_011002	CGC	2	6	2976	2981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294855
43	NC_011002	CCG	2	6	3041	3046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294855
44	NC_011002	CAA	2	6	4866	4871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197294856
45	NC_011002	CGG	2	6	4893	4898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294856
46	NC_011002	CGT	2	6	5003	5008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294856
47	NC_011002	GGC	2	6	5233	5238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294856
48	NC_011002	CAG	2	6	5248	5253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294856
49	NC_011002	AGT	2	6	5315	5320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197294856
50	NC_011002	CTG	2	6	5353	5358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294856
51	NC_011002	TCG	2	6	5363	5368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294856
52	NC_011002	GAC	2	6	5509	5514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294856
53	NC_011002	GTT	2	6	5647	5652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197294856
54	NC_011002	CGC	2	6	6221	6226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294857
55	NC_011002	GTG	2	6	6329	6334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197294857
56	NC_011002	ATC	2	6	6374	6379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197294857
57	NC_011002	GCC	2	6	6476	6481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294857
58	NC_011002	CAG	2	6	6494	6499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294857
59	NC_011002	GTA	2	6	6503	6508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197294857
60	NC_011002	GTC	2	6	6554	6559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294857
61	NC_011002	CAG	2	6	6560	6565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294857
62	NC_011002	CGT	2	6	6586	6591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294857
63	NC_011002	CGA	3	9	6613	6621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294857
64	NC_011002	CTG	2	6	6631	6636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294857
65	NC_011002	TCG	2	6	6642	6647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294857
66	NC_011002	CAT	2	6	6665	6670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197294857
67	NC_011002	GAT	2	6	6740	6745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197294857
68	NC_011002	ACG	2	6	6843	6848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294857
69	NC_011002	GTC	3	9	7055	7063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294857
70	NC_011002	TTG	2	6	7064	7069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197294857
71	NC_011002	ACT	2	6	7233	7238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197294858
72	NC_011002	CGC	2	6	7279	7284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294858
73	NC_011002	GCC	2	6	7289	7294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294858
74	NC_011002	TCG	2	6	7301	7306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294858
75	NC_011002	CCA	2	6	7315	7320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197294858
76	NC_011002	CGC	2	6	7326	7331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294858
77	NC_011002	TTC	2	6	7516	7521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197294858
78	NC_011002	CGC	2	6	7638	7643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294858
79	NC_011002	GAA	2	6	7645	7650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197294858
80	NC_011002	GTC	3	9	7660	7668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294858
81	NC_011002	ACG	2	6	7680	7685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294858
82	NC_011002	CCA	2	6	7780	7785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197294858
83	NC_011002	CGT	2	6	7849	7854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294858
84	NC_011002	GGT	2	6	7867	7872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197294858
85	NC_011002	GCG	2	6	7874	7879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294858
86	NC_011002	CGC	2	6	7935	7940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294858
87	NC_011002	GCG	2	6	7944	7949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294858
88	NC_011002	CGG	2	6	7969	7974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294858
89	NC_011002	GCC	2	6	8111	8116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294858
90	NC_011002	TTG	2	6	8180	8185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197294858
91	NC_011002	CGG	2	6	8229	8234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294858
92	NC_011002	TGC	2	6	8270	8275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294858
93	NC_011002	GGC	2	6	8308	8313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294858
94	NC_011002	TCG	2	6	8494	8499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294859
95	NC_011002	CGA	2	6	8539	8544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294859
96	NC_011002	CGC	2	6	8624	8629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294859
97	NC_011002	TGA	2	6	8740	8745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197294859
98	NC_011002	ATG	2	6	8746	8751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197294859
99	NC_011002	GGA	2	6	8843	8848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197294859
100	NC_011002	GCG	2	6	8877	8882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294859
101	NC_011002	CGC	2	6	8915	8920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294859
102	NC_011002	GCC	2	6	8981	8986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294859
103	NC_011002	AGC	2	6	9001	9006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294859
104	NC_011002	TAC	2	6	9045	9050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197294859
105	NC_011002	GAC	2	6	9060	9065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294859
106	NC_011002	GCA	2	6	9335	9340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294860
107	NC_011002	GCG	2	6	9363	9368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294860
108	NC_011002	AGC	2	6	9373	9378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294860
109	NC_011002	GCC	2	6	9435	9440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294860
110	NC_011002	GCG	2	6	9474	9479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294860
111	NC_011002	TGA	2	6	9490	9495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197294860
112	NC_011002	TTC	2	6	9501	9506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197294860
113	NC_011002	GCT	2	6	9511	9516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294860
114	NC_011002	GCG	2	6	9555	9560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294860
115	NC_011002	GGC	2	6	9625	9630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294860
116	NC_011002	GAA	2	6	9632	9637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197294860
117	NC_011002	CGA	2	6	9694	9699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294860
118	NC_011002	CGA	2	6	10020	10025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294861
119	NC_011002	CGC	2	6	10027	10032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294861
120	NC_011002	CGT	2	6	10056	10061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294861
121	NC_011002	CGA	2	6	10160	10165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294861
122	NC_011002	CGC	3	9	10181	10189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294861
123	NC_011002	GAC	2	6	10239	10244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294861
124	NC_011002	GCG	2	6	10286	10291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294861
125	NC_011002	CCG	2	6	10315	10320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294861
126	NC_011002	CGT	2	6	10442	10447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294861
127	NC_011002	GTC	2	6	10455	10460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294861
128	NC_011002	AAC	2	6	11123	11128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197294862
129	NC_011002	GCA	2	6	11274	11279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294862
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133	NC_011002	TCG	2	6	11519	11524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294862
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142	NC_011002	AGC	2	6	11759	11764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294862
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246	NC_011002	GGT	2	6	17999	18004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197294869
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249	NC_011002	TCC	2	6	18112	18117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197294869
250	NC_011002	GCA	2	6	18128	18133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294869
251	NC_011002	CAG	2	6	18195	18200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294869
252	NC_011002	GAA	2	6	18237	18242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197294869
253	NC_011002	TGA	2	6	18269	18274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197294869
254	NC_011002	CGA	2	6	18293	18298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294869
255	NC_011002	GCA	2	6	18329	18334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294869
256	NC_011002	GCA	2	6	18401	18406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294869
257	NC_011002	CGA	2	6	18407	18412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294869
258	NC_011002	ACG	2	6	18433	18438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294869
259	NC_011002	GGT	2	6	18444	18449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197294869
260	NC_011002	GCG	2	6	18473	18478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294869
261	NC_011002	TCG	2	6	18484	18489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294869
262	NC_011002	GCG	2	6	18493	18498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294869
263	NC_011002	AAG	2	6	18499	18504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197294869
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265	NC_011002	CGT	2	6	18542	18547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294869
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273	NC_011002	GCG	2	6	18823	18828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294869
274	NC_011002	GTC	2	6	18843	18848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294869
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277	NC_011002	CAG	2	6	19098	19103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294869
278	NC_011002	CAG	2	6	19443	19448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294869
279	NC_011002	CGA	2	6	19466	19471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294869
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281	NC_011002	CGA	2	6	19496	19501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294869
282	NC_011002	CGG	2	6	19503	19508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294869
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284	NC_011002	CGG	2	6	19523	19528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294869
285	NC_011002	CGA	2	6	19583	19588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294869
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290	NC_011002	TCG	2	6	19950	19955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294870
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376	NC_011002	AGC	2	6	24442	24447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294874
377	NC_011002	GCC	2	6	24462	24467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294874
378	NC_011002	GGC	2	6	24482	24487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294874
379	NC_011002	GGC	2	6	24548	24553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294874
380	NC_011002	CGT	2	6	24625	24630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294874
381	NC_011002	CGT	2	6	24643	24648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294874
382	NC_011002	GCC	2	6	24649	24654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294874
383	NC_011002	GCC	2	6	24666	24671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197294874
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396	NC_011002	CGA	2	6	25420	25425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197294875
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401	NC_011002	GCG	2	6	25589	25594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294875
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497	NC_011002	CTG	2	6	31298	31303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197294880
498	NC_011002	GGA	2	6	31384	31389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197294880
499	NC_011002	GCG	3	9	31533	31541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294880
500	NC_011002	CGG	2	6	31551	31556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197294880

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