MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia J2315 chromosome 2

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011001	CGGTTT	2	12	1625	1636	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011001	CGAACC	2	12	15767	15778	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011001	CGCGAC	2	12	53596	53607	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011001	CAATCG	2	12	56937	56948	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011001	CGGTCG	2	12	70242	70253	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011001	AACACC	2	12	90828	90839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011001	CGCGAT	2	12	94587	94598	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011001	GCTGCC	2	12	99552	99563	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011001	ATGAAA	2	12	99594	99605	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011001	CACCGC	2	12	121103	121114	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011001	TCTTTT	2	12	129256	129267	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011001	ATGCGC	2	12	189703	189714	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011001	GCATAT	2	12	190541	190552	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_011001	GACGGC	2	12	200654	200665	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011001	GACGCG	2	12	216573	216584	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011001	CGAGCG	2	12	247040	247051	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011001	GGCGAC	2	12	253172	253183	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011001	ATCGAG	2	12	302767	302778	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_011001	GCTCGC	2	12	326091	326102	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011001	GCCCGC	2	12	375644	375655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_011001	GCCGGC	2	12	447543	447554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011001	GCGGGG	2	12	509855	509866	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_011001	GCTTCC	2	12	523535	523546	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011001	ACGCGA	2	12	559943	559954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011001	AGGTGA	3	18	593893	593910	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011001	GCGGGC	2	12	609765	609776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011001	ACGACA	2	12	617512	617523	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011001	GCCGTC	2	12	649680	649691	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011001	GCGCGT	3	18	653976	653993	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011001	CGATAT	2	12	678497	678508	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011001	ATCCGG	2	12	693275	693286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011001	CGGAGA	2	12	696883	696894	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_011001	CGATAC	2	12	708665	708676	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011001	AGGTGA	2	12	715655	715666	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011001	AGGTGA	2	12	715713	715724	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011001	ATCCGA	2	12	780312	780323	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011001	GCCGCA	2	12	781477	781488	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011001	TCGCCG	2	12	781794	781805	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011001	TCGACA	2	12	818940	818951	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011001	CGTCAG	2	12	823905	823916	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011001	CGAGGA	2	12	850357	850368	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_011001	TCGCGT	2	12	942722	942733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011001	AACCGG	2	12	961750	961761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011001	CGCCGG	2	12	964109	964120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011001	GCATCG	2	12	964549	964560	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011001	AATGAA	2	12	976984	976995	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011001	CGTAAT	2	12	982583	982594	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011001	GCGCCG	2	12	1009554	1009565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011001	GCGGCC	2	12	1045086	1045097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011001	TTGTTC	2	12	1072668	1072679	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_011001	TTTTTG	2	12	1106582	1106593	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011001	AATCGA	2	12	1114388	1114399	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_011001	CGCATC	3	18	1126372	1126389	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011001	CGGGGC	2	12	1136615	1136626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011001	TCGCGA	2	12	1192010	1192021	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011001	CCGCGC	2	12	1192316	1192327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_011001	GCATGA	2	12	1203800	1203811	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_011001	GTCGGC	2	12	1216297	1216308	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011001	GCAGCG	2	12	1216470	1216481	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011001	GAACCG	2	12	1220408	1220419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011001	GTTTGT	2	12	1226703	1226714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011001	GCAGGC	2	12	1235121	1235132	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011001	TGTCGA	2	12	1245488	1245499	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011001	CGAAAC	2	12	1324123	1324134	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011001	GCCCGC	2	12	1337206	1337217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_011001	CGCGCC	2	12	1364213	1364224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_011001	AGCGCG	2	12	1375809	1375820	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011001	CGCGAG	2	12	1376219	1376230	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011001	ATCGCC	2	12	1376427	1376438	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011001	GGGCAC	2	12	1405374	1405385	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011001	CGAAAC	2	12	1423356	1423367	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011001	CCGTCT	2	12	1451787	1451798	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011001	TGAAAT	2	12	1451841	1451852	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011001	ATCGGC	2	12	1468003	1468014	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011001	GACGGG	2	12	1468986	1468997	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_011001	GTTCGA	2	12	1489571	1489582	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_011001	GGGCCG	2	12	1505317	1505328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011001	AAGGGG	2	12	1532024	1532035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011001	CACCGT	2	12	1558593	1558604	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011001	CGGCCG	2	12	1585248	1585259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011001	GGCCGT	2	12	1611264	1611275	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011001	CGTTTC	2	12	1611286	1611297	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011001	GAAACG	2	12	1638480	1638491	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_011001	CGAATT	2	12	1663821	1663832	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_011001	TCGGCA	2	12	1663901	1663912	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011001	ACGATG	2	12	1714761	1714772	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_011001	GCGATT	2	12	1745335	1745346	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_011001	TCCCGC	2	12	1753237	1753248	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_011001	ATCGAC	2	12	1755089	1755100	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011001	CGCGGC	2	12	1757206	1757217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011001	CATCGG	2	12	1782428	1782439	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011001	GTTCCG	2	12	1838046	1838057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011001	CGCAGG	2	12	1847037	1847048	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011001	TGCCCG	2	12	1853973	1853984	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011001	CCCGGC	2	12	1885162	1885173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_011001	CGGTCG	2	12	1906518	1906529	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011001	GAAGTG	2	12	1910343	1910354	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011001	GGTTCG	2	12	1956993	1957004	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_011001	CGGCAG	2	12	2005800	2005811	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011001	CGCTGG	2	12	2012406	2012417	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011001	CACGCC	2	12	2020404	2020415	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_011001	CCGCGC	2	12	2029158	2029169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011001	GCCGGC	2	12	2031207	2031218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011001	CGACAG	2	12	2031309	2031320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011001	TCAACC	2	12	2039146	2039157	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_011001	TCGCGC	2	12	2049513	2049524	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011001	AAAACG	2	12	2076816	2076827	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_011001	TGCGCG	2	12	2090125	2090136	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011001	GCTCGC	2	12	2150358	2150369	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011001	TTGCAA	2	12	2154441	2154452	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_011001	ATTGCA	2	12	2156161	2156172	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_011001	TATGCA	2	12	2238422	2238433	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_011001	GCCGGC	2	12	2267381	2267392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011001	GTCGCG	2	12	2267498	2267509	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011001	GCGCCG	2	12	2268036	2268047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_011001	ACGCGG	2	12	2269971	2269982	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011001	GGCGCC	2	12	2271505	2271516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011001	CGATCG	2	12	2273736	2273747	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011001	CGCCGT	2	12	2274703	2274714	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011001	ACTGTC	2	12	2294686	2294697	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011001	TGCGAC	2	12	2337564	2337575	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011001	GGAAAA	2	12	2392248	2392259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011001	CCCACG	2	12	2394029	2394040	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_011001	GGGAAC	2	12	2407969	2407980	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_011001	CGCCCG	2	12	2412269	2412280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_011001	TTGGTA	2	12	2425365	2425376	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011001	TTGCAA	2	12	2431332	2431343	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_011001	CCGGTA	2	12	2437147	2437158	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011001	GCCGAT	2	12	2460990	2461001	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011001	CGCATC	2	12	2468929	2468940	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
131	NC_011001	CGTTTT	2	12	2470750	2470761	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_011001	CGCTCG	2	12	2491461	2491472	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_011001	TGCGCG	2	12	2492280	2492291	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011001	GCCGGC	2	12	2492469	2492480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_011001	GCTGAT	2	12	2492825	2492836	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_011001	CCGCGT	2	12	2493499	2493510	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
137	NC_011001	ATCGAT	2	12	2494778	2494789	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_011001	TTTCTG	2	12	2522303	2522314	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_011001	TCGACG	2	12	2535360	2535371	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011001	ATCCGA	2	12	2552361	2552372	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011001	AACGGA	2	12	2567634	2567645	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_011001	TGCCGC	2	12	2570793	2570804	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011001	CCCGGG	2	12	2577341	2577352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_011001	TGCGAA	2	12	2577510	2577521	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_011001	TCGCCG	2	12	2587194	2587205	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
146	NC_011001	GGCCGG	2	12	2646342	2646353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_011001	CGTCGC	2	12	2648577	2648588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
148	NC_011001	CGGCCG	2	12	2693656	2693667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_011001	CGAGCG	2	12	2702061	2702072	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_011001	ACGATA	2	12	2712605	2712616	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_011001	GACGCG	2	12	2745252	2745263	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_011001	ACCGCC	2	12	2751410	2751421	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_011001	ATTGCA	2	12	2755847	2755858	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_011001	CCAATG	2	12	2764120	2764131	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_011001	GGGCGC	2	12	2772709	2772720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_011001	GGCGCG	2	12	2777317	2777328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_011001	CGGCCG	2	12	2784702	2784713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
158	NC_011001	CTTCTC	2	12	2819296	2819307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_011001	GCCGCG	2	12	2857970	2857981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
160	NC_011001	TCAGGA	2	12	2866165	2866176	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_011001	TTGCTC	2	12	2885838	2885849	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_011001	GAATTC	2	12	2912787	2912798	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_011001	GGCCAC	2	12	2965705	2965716	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
164	NC_011001	GGGCAC	2	12	2972133	2972144	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_011001	TCGGGC	2	12	2972395	2972406	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_011001	TACACG	2	12	2972479	2972490	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_011001	TCGATC	2	12	2988581	2988592	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_011001	AATGTC	2	12	3001262	3001273	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
169	NC_011001	GCCGCG	2	12	3015010	3015021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
170	NC_011001	CGGCAT	2	12	3016974	3016985	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_011001	CGGGAG	2	12	3038288	3038299	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
172	NC_011001	GCATCG	2	12	3071386	3071397	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_011001	GCGCCG	2	12	3109997	3110008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
174	NC_011001	ATCCGG	2	12	3112337	3112348	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_011001	TGCGCG	2	12	3133065	3133076	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_011001	TTCGCG	2	12	3145920	3145931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_011001	CGATAT	2	12	3170999	3171010	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
178	NC_011001	GCCGGC	2	12	3216323	3216334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.