MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei BL23 chromosome

Total Repeats: 7857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010999	CGGT	2	8	142	149	0 %	25 %	50 %	25 %	191636825
2	NC_010999	ACAG	2	8	164	171	50 %	0 %	25 %	25 %	191636825
3	NC_010999	CAGC	2	8	333	340	25 %	0 %	25 %	50 %	191636825
4	NC_010999	TTTA	2	8	522	529	25 %	75 %	0 %	0 %	191636825
5	NC_010999	GCCT	2	8	826	833	0 %	25 %	25 %	50 %	191636825
6	NC_010999	GGTT	2	8	859	866	0 %	50 %	50 %	0 %	191636825
7	NC_010999	TGTC	2	8	886	893	0 %	50 %	25 %	25 %	191636825
8	NC_010999	ACGT	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	191636825
9	NC_010999	GAAA	2	8	1207	1214	75 %	0 %	25 %	0 %	191636825
10	NC_010999	ACGT	2	8	2963	2970	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010999	TAAT	2	8	3515	3522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010999	GGCC	2	8	3774	3781	0 %	0 %	50 %	50 %	191636827
13	NC_010999	AATC	2	8	3925	3932	50 %	25 %	0 %	25 %	191636828
14	NC_010999	TGAC	2	8	4345	4352	25 %	25 %	25 %	25 %	191636828
15	NC_010999	AAGA	2	8	5057	5064	75 %	0 %	25 %	0 %	191636829
16	NC_010999	CCAG	2	8	5109	5116	25 %	0 %	25 %	50 %	191636829
17	NC_010999	GCTG	2	8	5239	5246	0 %	25 %	50 %	25 %	191636829
18	NC_010999	CCTG	2	8	6304	6311	0 %	25 %	25 %	50 %	191636829
19	NC_010999	TGTT	2	8	6978	6985	0 %	75 %	25 %	0 %	191636829
20	NC_010999	ATGA	2	8	7227	7234	50 %	25 %	25 %	0 %	191636830
21	NC_010999	GATT	2	8	7499	7506	25 %	50 %	25 %	0 %	191636830
22	NC_010999	CGGT	2	8	7597	7604	0 %	25 %	50 %	25 %	191636830
23	NC_010999	CTTG	2	8	8834	8841	0 %	50 %	25 %	25 %	191636830
24	NC_010999	ACGG	2	8	9236	9243	25 %	0 %	50 %	25 %	191636830
25	NC_010999	TTTG	2	8	9776	9783	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010999	TTTC	2	8	9964	9971	0 %	75 %	0 %	25 %	191636831
27	NC_010999	GACA	2	8	10135	10142	50 %	0 %	25 %	25 %	191636831
28	NC_010999	ATCA	2	8	10460	10467	50 %	25 %	0 %	25 %	191636831
29	NC_010999	GCAA	2	8	10592	10599	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010999	TTGG	2	8	10986	10993	0 %	50 %	50 %	0 %	191636832
31	NC_010999	CGTA	2	8	11807	11814	25 %	25 %	25 %	25 %	191636834
32	NC_010999	AACC	2	8	11975	11982	50 %	0 %	0 %	50 %	191636834
33	NC_010999	AAGA	2	8	12488	12495	75 %	0 %	25 %	0 %	191636835
34	NC_010999	ATTA	2	8	12660	12667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010999	TTGG	2	8	13001	13008	0 %	50 %	50 %	0 %	191636836
36	NC_010999	AGTT	2	8	13384	13391	25 %	50 %	25 %	0 %	191636836
37	NC_010999	AAAG	2	8	13722	13729	75 %	0 %	25 %	0 %	191636836
38	NC_010999	TTTA	2	8	14045	14052	25 %	75 %	0 %	0 %	191636836
39	NC_010999	GCAG	2	8	14072	14079	25 %	0 %	50 %	25 %	191636836
40	NC_010999	TTTC	2	8	14242	14249	0 %	75 %	0 %	25 %	191636836
41	NC_010999	GATT	2	8	14920	14927	25 %	50 %	25 %	0 %	191636837
42	NC_010999	AACG	2	8	15204	15211	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010999	GCTG	2	8	15398	15405	0 %	25 %	50 %	25 %	191636838
44	NC_010999	CAAT	2	8	15838	15845	50 %	25 %	0 %	25 %	191636838
45	NC_010999	ACTT	2	8	16278	16285	25 %	50 %	0 %	25 %	191636838
46	NC_010999	CTGG	2	8	16582	16589	0 %	25 %	50 %	25 %	191636838
47	NC_010999	TTCT	2	8	17125	17132	0 %	75 %	0 %	25 %	191636839
48	NC_010999	CAAT	2	8	17163	17170	50 %	25 %	0 %	25 %	191636839
49	NC_010999	ACAA	2	8	18418	18425	75 %	0 %	0 %	25 %	191636841
50	NC_010999	AAAG	2	8	18596	18603	75 %	0 %	25 %	0 %	191636841
51	NC_010999	TGTT	2	8	18815	18822	0 %	75 %	25 %	0 %	191636841
52	NC_010999	AAGC	2	8	18874	18881	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010999	GACT	2	8	19172	19179	25 %	25 %	25 %	25 %	191636842
54	NC_010999	AAAC	2	8	19258	19265	75 %	0 %	0 %	25 %	191636842
55	NC_010999	TAAT	2	8	19641	19648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010999	CGTT	2	8	20295	20302	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010999	ATAA	2	8	20486	20493	75 %	25 %	0 %	0 %	191636844
58	NC_010999	AGCT	2	8	21734	21741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010999	CGAG	2	8	21944	21951	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010999	GGGT	2	8	22161	22168	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010999	GACT	2	8	22473	22480	25 %	25 %	25 %	25 %	191636847
62	NC_010999	CAAC	2	8	22754	22761	50 %	0 %	0 %	50 %	191636847
63	NC_010999	CAAA	2	8	24430	24437	75 %	0 %	0 %	25 %	191636848
64	NC_010999	AGAC	2	8	24749	24756	50 %	0 %	25 %	25 %	191636848
65	NC_010999	AAGA	2	8	25172	25179	75 %	0 %	25 %	0 %	191636848
66	NC_010999	CTGC	2	8	25939	25946	0 %	25 %	25 %	50 %	191636848
67	NC_010999	TAGT	2	8	26173	26180	25 %	50 %	25 %	0 %	191636848
68	NC_010999	AGCC	2	8	26572	26579	25 %	0 %	25 %	50 %	191636849
69	NC_010999	TTAC	2	8	27328	27335	25 %	50 %	0 %	25 %	191636850
70	NC_010999	TGGT	2	8	27434	27441	0 %	50 %	50 %	0 %	191636850
71	NC_010999	AATT	2	8	27790	27797	50 %	50 %	0 %	0 %	191636851
72	NC_010999	AATT	2	8	28006	28013	50 %	50 %	0 %	0 %	191636851
73	NC_010999	ATTT	2	8	28224	28231	25 %	75 %	0 %	0 %	191636851
74	NC_010999	ATTG	2	8	28770	28777	25 %	50 %	25 %	0 %	191636852
75	NC_010999	GGTT	2	8	28928	28935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010999	CATA	2	8	28974	28981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010999	AGTG	2	8	29120	29127	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010999	AACA	2	8	29927	29934	75 %	0 %	0 %	25 %	191636853
79	NC_010999	AATG	2	8	30279	30286	50 %	25 %	25 %	0 %	191636854
80	NC_010999	TACA	2	8	31133	31140	50 %	25 %	0 %	25 %	191636854
81	NC_010999	TTGC	2	8	31829	31836	0 %	50 %	25 %	25 %	191636854
82	NC_010999	CAAA	2	8	32018	32025	75 %	0 %	0 %	25 %	191636854
83	NC_010999	CTAC	2	8	32209	32216	25 %	25 %	0 %	50 %	191636854
84	NC_010999	GTGC	2	8	32976	32983	0 %	25 %	50 %	25 %	191636855
85	NC_010999	GCAA	2	8	33270	33277	50 %	0 %	25 %	25 %	191636855
86	NC_010999	ATTT	2	8	33929	33936	25 %	75 %	0 %	0 %	191636856
87	NC_010999	ATGA	2	8	34209	34216	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010999	AGCA	2	8	34818	34825	50 %	0 %	25 %	25 %	191636857
89	NC_010999	AAGC	2	8	35975	35982	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010999	TTCA	2	8	37155	37162	25 %	50 %	0 %	25 %	191636860
91	NC_010999	AGCA	2	8	37481	37488	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010999	ATTT	2	8	37529	37536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010999	AAAC	2	8	38566	38573	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_010999	GTAT	2	8	38873	38880	25 %	50 %	25 %	0 %	191636863
95	NC_010999	GATT	2	8	39308	39315	25 %	50 %	25 %	0 %	191636863
96	NC_010999	AAGG	2	8	39390	39397	50 %	0 %	50 %	0 %	191636863
97	NC_010999	GCCG	2	8	39960	39967	0 %	0 %	50 %	50 %	191636863
98	NC_010999	AGAA	2	8	40299	40306	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010999	TACT	2	8	42193	42200	25 %	50 %	0 %	25 %	191636867
100	NC_010999	TATT	2	8	43439	43446	25 %	75 %	0 %	0 %	191636869
101	NC_010999	CTTT	2	8	43678	43685	0 %	75 %	0 %	25 %	191636869
102	NC_010999	TCTT	2	8	43770	43777	0 %	75 %	0 %	25 %	191636870
103	NC_010999	ATGA	2	8	44103	44110	50 %	25 %	25 %	0 %	191636871
104	NC_010999	TCAT	2	8	45650	45657	25 %	50 %	0 %	25 %	191636873
105	NC_010999	ATCC	2	8	46086	46093	25 %	25 %	0 %	50 %	191636874
106	NC_010999	GTCA	2	8	46473	46480	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010999	AATG	2	8	46704	46711	50 %	25 %	25 %	0 %	191636875
108	NC_010999	TAAT	2	8	46844	46851	50 %	50 %	0 %	0 %	191636875
109	NC_010999	GAAA	2	8	47085	47092	75 %	0 %	25 %	0 %	191636875
110	NC_010999	AAAT	2	8	47126	47133	75 %	25 %	0 %	0 %	191636875
111	NC_010999	CAAA	2	8	47324	47331	75 %	0 %	0 %	25 %	191636875
112	NC_010999	AAAG	2	8	47382	47389	75 %	0 %	25 %	0 %	191636875
113	NC_010999	CAAA	2	8	47707	47714	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010999	ATCG	2	8	49488	49495	25 %	25 %	25 %	25 %	191636877
115	NC_010999	CTTG	2	8	49516	49523	0 %	50 %	25 %	25 %	191636877
116	NC_010999	TCAT	2	8	49639	49646	25 %	50 %	0 %	25 %	191636877
117	NC_010999	AAAT	2	8	50902	50909	75 %	25 %	0 %	0 %	191636878
118	NC_010999	AATC	2	8	51388	51395	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_010999	TCAA	2	8	51427	51434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010999	CGCT	2	8	51623	51630	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_010999	CTAT	2	8	51895	51902	25 %	50 %	0 %	25 %	191636879
122	NC_010999	CTAG	2	8	52117	52124	25 %	25 %	25 %	25 %	191636879
123	NC_010999	ACTA	2	8	52402	52409	50 %	25 %	0 %	25 %	191636880
124	NC_010999	AAAT	2	8	52744	52751	75 %	25 %	0 %	0 %	191636880
125	NC_010999	TAGG	2	8	52782	52789	25 %	25 %	50 %	0 %	191636880
126	NC_010999	TGAT	2	8	53518	53525	25 %	50 %	25 %	0 %	191636881
127	NC_010999	CAAA	2	8	53579	53586	75 %	0 %	0 %	25 %	191636881
128	NC_010999	AAAT	2	8	53888	53895	75 %	25 %	0 %	0 %	191636881
129	NC_010999	TATT	2	8	54498	54505	25 %	75 %	0 %	0 %	191636881
130	NC_010999	TTGA	2	8	54795	54802	25 %	50 %	25 %	0 %	191636881
131	NC_010999	AACA	2	8	54895	54902	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_010999	TGAA	2	8	55074	55081	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010999	TGAA	2	8	55116	55123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010999	CCGC	2	8	55218	55225	0 %	0 %	25 %	75 %	191636882
135	NC_010999	TGAG	2	8	55941	55948	25 %	25 %	50 %	0 %	191636882
136	NC_010999	CAAA	2	8	56268	56275	75 %	0 %	0 %	25 %	191636882
137	NC_010999	TGCG	2	8	56549	56556	0 %	25 %	50 %	25 %	191636882
138	NC_010999	GTTA	2	8	56757	56764	25 %	50 %	25 %	0 %	191636883
139	NC_010999	TTTG	2	8	57067	57074	0 %	75 %	25 %	0 %	191636883
140	NC_010999	GTGC	2	8	57247	57254	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010999	GTCA	2	8	57457	57464	25 %	25 %	25 %	25 %	191636884
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143	NC_010999	TTAA	2	8	58703	58710	50 %	50 %	0 %	0 %	191636884
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