MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BL23 chromosome

Total Repeats: 1315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010999	ACGT	2	8	2963	2970	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010999	TAAT	2	8	3515	3522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010999	TTTG	2	8	9776	9783	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010999	GCAA	2	8	10592	10599	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010999	ATTA	2	8	12660	12667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010999	AACG	2	8	15204	15211	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010999	AAGC	2	8	18874	18881	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010999	TAAT	2	8	19641	19648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010999	CGTT	2	8	20295	20302	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010999	AGCT	2	8	21734	21741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010999	CGAG	2	8	21944	21951	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010999	GGGT	2	8	22161	22168	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010999	GGTT	2	8	28928	28935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010999	CATA	2	8	28974	28981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010999	AGTG	2	8	29120	29127	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010999	ATGA	2	8	34209	34216	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010999	AAGC	2	8	35975	35982	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010999	AGCA	2	8	37481	37488	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010999	ATTT	2	8	37529	37536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010999	AAAC	2	8	38566	38573	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010999	AGAA	2	8	40299	40306	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010999	GTCA	2	8	46473	46480	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010999	CAAA	2	8	47707	47714	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010999	AATC	2	8	51388	51395	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010999	TCAA	2	8	51427	51434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010999	CGCT	2	8	51623	51630	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010999	AACA	2	8	54895	54902	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010999	TGAA	2	8	55074	55081	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010999	TGAA	2	8	55116	55123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010999	GTGC	2	8	57247	57254	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010999	TAGC	2	8	65483	65490	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010999	ACAA	2	8	65853	65860	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010999	TTGT	2	8	65891	65898	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010999	GACT	2	8	65965	65972	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010999	ATAA	2	8	71049	71056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010999	TCAA	2	8	71124	71131	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010999	TACT	2	8	71510	71517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010999	CAGG	2	8	76552	76559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010999	GAGG	2	8	84418	84425	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010999	ATTA	2	8	85425	85432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010999	GAAA	2	8	88501	88508	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010999	TCCC	2	8	89848	89855	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_010999	AGTA	2	8	89883	89890	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010999	GCAC	2	8	90189	90196	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010999	CTGG	2	8	90341	90348	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010999	TTGC	2	8	90375	90382	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010999	TATT	2	8	91119	91126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010999	TATC	2	8	91183	91190	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010999	GTAT	2	8	94114	94121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010999	TAAA	2	8	94188	94195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010999	TTTC	2	8	94249	94256	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010999	CAAT	2	8	94346	94353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010999	CAAA	2	8	99621	99628	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010999	GTTG	2	8	99806	99813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010999	AAAT	2	8	99863	99870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010999	GTCT	2	8	100010	100017	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010999	GGCA	2	8	104427	104434	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010999	GTGA	2	8	104482	104489	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010999	CTTT	2	8	105927	105934	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010999	ATCA	2	8	106862	106869	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010999	TTGT	2	8	110161	110168	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010999	AAGA	2	8	111674	111681	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010999	TGAC	2	8	119629	119636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010999	GATG	2	8	128283	128290	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010999	ATTA	2	8	128499	128506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010999	TTAG	2	8	128549	128556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010999	TGAC	2	8	129975	129982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010999	TGGT	2	8	132471	132478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010999	TGTT	2	8	134252	134259	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010999	CAGA	2	8	134336	134343	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010999	AAAT	2	8	135445	135452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010999	ATTA	2	8	137793	137800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010999	TTAA	2	8	137933	137940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010999	GATT	2	8	141269	141276	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010999	TTTC	2	8	143775	143782	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010999	GCCT	2	8	147442	147449	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010999	TTAC	2	8	148480	148487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010999	AGTA	2	8	148492	148499	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010999	ACAT	2	8	154277	154284	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010999	GAAT	2	8	155516	155523	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010999	TAAC	2	8	169045	169052	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010999	GCAG	2	8	169080	169087	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010999	CAGA	2	8	173993	174000	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_010999	GGTA	2	8	174031	174038	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010999	TGAA	2	8	174192	174199	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010999	AAGG	2	8	178695	178702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010999	AAAC	2	8	183957	183964	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010999	AGAA	2	8	187396	187403	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010999	AGTA	2	8	187647	187654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010999	TTAA	2	8	188131	188138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010999	AAAG	2	8	188289	188296	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010999	TGCT	2	8	192941	192948	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_010999	GTTT	2	8	194400	194407	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010999	GAAA	2	8	194444	194451	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010999	CAGC	2	8	195018	195025	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010999	TGTT	2	8	195164	195171	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010999	CTTT	2	8	201002	201009	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010999	AAGA	2	8	209836	209843	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010999	TCAA	2	8	209906	209913	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010999	TACT	2	8	209915	209922	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010999	TAAA	2	8	210896	210903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010999	CCTT	2	8	211828	211835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_010999	TATT	2	8	211913	211920	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010999	TGAA	2	8	211972	211979	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010999	ATGA	2	8	224803	224810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010999	TACA	2	8	224863	224870	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010999	ATAA	2	8	227638	227645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010999	ATTA	2	8	234077	234084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010999	CAAA	2	8	249800	249807	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010999	AAGC	2	8	253900	253907	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010999	ATCA	2	8	253949	253956	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010999	TATG	2	8	253980	253987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010999	AGCA	2	8	255902	255909	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010999	TGCA	2	8	255988	255995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010999	GTGC	2	8	258535	258542	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010999	TGAG	2	8	258584	258591	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010999	GTCA	2	8	258617	258624	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010999	TGGA	2	8	259102	259109	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010999	GTGA	2	8	259281	259288	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010999	AGCG	2	8	259451	259458	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010999	ATGG	2	8	260116	260123	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010999	GAGC	2	8	260335	260342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010999	TAAG	2	8	260730	260737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010999	AGAA	2	8	260860	260867	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010999	GCGA	2	8	260889	260896	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010999	GCTT	2	8	260921	260928	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_010999	TTGC	2	8	261275	261282	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010999	ATGT	2	8	261423	261430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010999	GAGC	2	8	262331	262338	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_010999	TAGG	2	8	262777	262784	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010999	CTGC	2	8	263770	263777	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_010999	TAAG	2	8	263844	263851	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010999	AGCA	2	8	263875	263882	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_010999	GACT	2	8	265687	265694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_010999	AACC	2	8	265879	265886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_010999	CCGA	2	8	265994	266001	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_010999	AAAG	2	8	273191	273198	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010999	ATGG	2	8	278752	278759	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010999	TAGA	2	8	278963	278970	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010999	AAAG	2	8	282174	282181	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010999	CTTG	2	8	286217	286224	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010999	GTTA	2	8	286230	286237	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010999	ACAT	2	8	286248	286255	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010999	CCGG	2	8	286326	286333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_010999	TTTA	2	8	287801	287808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010999	TTGC	2	8	287831	287838	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_010999	TGCT	2	8	287865	287872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_010999	ATGA	2	8	290896	290903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010999	TGGT	2	8	292296	292303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010999	ATGA	2	8	295583	295590	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010999	CTTA	2	8	300175	300182	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_010999	TTGA	2	8	300221	300228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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