MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus casei BL23 chromosome

Total Repeats: 6542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010999	CGGT	2	8	142	149	0 %	25 %	50 %	25 %	191636825
2	NC_010999	ACAG	2	8	164	171	50 %	0 %	25 %	25 %	191636825
3	NC_010999	CAGC	2	8	333	340	25 %	0 %	25 %	50 %	191636825
4	NC_010999	TTTA	2	8	522	529	25 %	75 %	0 %	0 %	191636825
5	NC_010999	GCCT	2	8	826	833	0 %	25 %	25 %	50 %	191636825
6	NC_010999	GGTT	2	8	859	866	0 %	50 %	50 %	0 %	191636825
7	NC_010999	TGTC	2	8	886	893	0 %	50 %	25 %	25 %	191636825
8	NC_010999	ACGT	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	191636825
9	NC_010999	GAAA	2	8	1207	1214	75 %	0 %	25 %	0 %	191636825
10	NC_010999	GGCC	2	8	3774	3781	0 %	0 %	50 %	50 %	191636827
11	NC_010999	AATC	2	8	3925	3932	50 %	25 %	0 %	25 %	191636828
12	NC_010999	TGAC	2	8	4345	4352	25 %	25 %	25 %	25 %	191636828
13	NC_010999	AAGA	2	8	5057	5064	75 %	0 %	25 %	0 %	191636829
14	NC_010999	CCAG	2	8	5109	5116	25 %	0 %	25 %	50 %	191636829
15	NC_010999	GCTG	2	8	5239	5246	0 %	25 %	50 %	25 %	191636829
16	NC_010999	CCTG	2	8	6304	6311	0 %	25 %	25 %	50 %	191636829
17	NC_010999	TGTT	2	8	6978	6985	0 %	75 %	25 %	0 %	191636829
18	NC_010999	ATGA	2	8	7227	7234	50 %	25 %	25 %	0 %	191636830
19	NC_010999	GATT	2	8	7499	7506	25 %	50 %	25 %	0 %	191636830
20	NC_010999	CGGT	2	8	7597	7604	0 %	25 %	50 %	25 %	191636830
21	NC_010999	CTTG	2	8	8834	8841	0 %	50 %	25 %	25 %	191636830
22	NC_010999	ACGG	2	8	9236	9243	25 %	0 %	50 %	25 %	191636830
23	NC_010999	TTTC	2	8	9964	9971	0 %	75 %	0 %	25 %	191636831
24	NC_010999	GACA	2	8	10135	10142	50 %	0 %	25 %	25 %	191636831
25	NC_010999	ATCA	2	8	10460	10467	50 %	25 %	0 %	25 %	191636831
26	NC_010999	TTGG	2	8	10986	10993	0 %	50 %	50 %	0 %	191636832
27	NC_010999	CGTA	2	8	11807	11814	25 %	25 %	25 %	25 %	191636834
28	NC_010999	AACC	2	8	11975	11982	50 %	0 %	0 %	50 %	191636834
29	NC_010999	AAGA	2	8	12488	12495	75 %	0 %	25 %	0 %	191636835
30	NC_010999	TTGG	2	8	13001	13008	0 %	50 %	50 %	0 %	191636836
31	NC_010999	AGTT	2	8	13384	13391	25 %	50 %	25 %	0 %	191636836
32	NC_010999	AAAG	2	8	13722	13729	75 %	0 %	25 %	0 %	191636836
33	NC_010999	TTTA	2	8	14045	14052	25 %	75 %	0 %	0 %	191636836
34	NC_010999	GCAG	2	8	14072	14079	25 %	0 %	50 %	25 %	191636836
35	NC_010999	TTTC	2	8	14242	14249	0 %	75 %	0 %	25 %	191636836
36	NC_010999	GATT	2	8	14920	14927	25 %	50 %	25 %	0 %	191636837
37	NC_010999	GCTG	2	8	15398	15405	0 %	25 %	50 %	25 %	191636838
38	NC_010999	CAAT	2	8	15838	15845	50 %	25 %	0 %	25 %	191636838
39	NC_010999	ACTT	2	8	16278	16285	25 %	50 %	0 %	25 %	191636838
40	NC_010999	CTGG	2	8	16582	16589	0 %	25 %	50 %	25 %	191636838
41	NC_010999	TTCT	2	8	17125	17132	0 %	75 %	0 %	25 %	191636839
42	NC_010999	CAAT	2	8	17163	17170	50 %	25 %	0 %	25 %	191636839
43	NC_010999	ACAA	2	8	18418	18425	75 %	0 %	0 %	25 %	191636841
44	NC_010999	AAAG	2	8	18596	18603	75 %	0 %	25 %	0 %	191636841
45	NC_010999	TGTT	2	8	18815	18822	0 %	75 %	25 %	0 %	191636841
46	NC_010999	GACT	2	8	19172	19179	25 %	25 %	25 %	25 %	191636842
47	NC_010999	AAAC	2	8	19258	19265	75 %	0 %	0 %	25 %	191636842
48	NC_010999	ATAA	2	8	20486	20493	75 %	25 %	0 %	0 %	191636844
49	NC_010999	GACT	2	8	22473	22480	25 %	25 %	25 %	25 %	191636847
50	NC_010999	CAAC	2	8	22754	22761	50 %	0 %	0 %	50 %	191636847
51	NC_010999	CAAA	2	8	24430	24437	75 %	0 %	0 %	25 %	191636848
52	NC_010999	AGAC	2	8	24749	24756	50 %	0 %	25 %	25 %	191636848
53	NC_010999	AAGA	2	8	25172	25179	75 %	0 %	25 %	0 %	191636848
54	NC_010999	CTGC	2	8	25939	25946	0 %	25 %	25 %	50 %	191636848
55	NC_010999	TAGT	2	8	26173	26180	25 %	50 %	25 %	0 %	191636848
56	NC_010999	AGCC	2	8	26572	26579	25 %	0 %	25 %	50 %	191636849
57	NC_010999	TTAC	2	8	27328	27335	25 %	50 %	0 %	25 %	191636850
58	NC_010999	TGGT	2	8	27434	27441	0 %	50 %	50 %	0 %	191636850
59	NC_010999	AATT	2	8	27790	27797	50 %	50 %	0 %	0 %	191636851
60	NC_010999	AATT	2	8	28006	28013	50 %	50 %	0 %	0 %	191636851
61	NC_010999	ATTT	2	8	28224	28231	25 %	75 %	0 %	0 %	191636851
62	NC_010999	ATTG	2	8	28770	28777	25 %	50 %	25 %	0 %	191636852
63	NC_010999	AACA	2	8	29927	29934	75 %	0 %	0 %	25 %	191636853
64	NC_010999	AATG	2	8	30279	30286	50 %	25 %	25 %	0 %	191636854
65	NC_010999	TACA	2	8	31133	31140	50 %	25 %	0 %	25 %	191636854
66	NC_010999	TTGC	2	8	31829	31836	0 %	50 %	25 %	25 %	191636854
67	NC_010999	CAAA	2	8	32018	32025	75 %	0 %	0 %	25 %	191636854
68	NC_010999	CTAC	2	8	32209	32216	25 %	25 %	0 %	50 %	191636854
69	NC_010999	GTGC	2	8	32976	32983	0 %	25 %	50 %	25 %	191636855
70	NC_010999	GCAA	2	8	33270	33277	50 %	0 %	25 %	25 %	191636855
71	NC_010999	ATTT	2	8	33929	33936	25 %	75 %	0 %	0 %	191636856
72	NC_010999	AGCA	2	8	34818	34825	50 %	0 %	25 %	25 %	191636857
73	NC_010999	TTCA	2	8	37155	37162	25 %	50 %	0 %	25 %	191636860
74	NC_010999	GTAT	2	8	38873	38880	25 %	50 %	25 %	0 %	191636863
75	NC_010999	GATT	2	8	39308	39315	25 %	50 %	25 %	0 %	191636863
76	NC_010999	AAGG	2	8	39390	39397	50 %	0 %	50 %	0 %	191636863
77	NC_010999	GCCG	2	8	39960	39967	0 %	0 %	50 %	50 %	191636863
78	NC_010999	TACT	2	8	42193	42200	25 %	50 %	0 %	25 %	191636867
79	NC_010999	TATT	2	8	43439	43446	25 %	75 %	0 %	0 %	191636869
80	NC_010999	CTTT	2	8	43678	43685	0 %	75 %	0 %	25 %	191636869
81	NC_010999	TCTT	2	8	43770	43777	0 %	75 %	0 %	25 %	191636870
82	NC_010999	ATGA	2	8	44103	44110	50 %	25 %	25 %	0 %	191636871
83	NC_010999	TCAT	2	8	45650	45657	25 %	50 %	0 %	25 %	191636873
84	NC_010999	ATCC	2	8	46086	46093	25 %	25 %	0 %	50 %	191636874
85	NC_010999	AATG	2	8	46704	46711	50 %	25 %	25 %	0 %	191636875
86	NC_010999	TAAT	2	8	46844	46851	50 %	50 %	0 %	0 %	191636875
87	NC_010999	GAAA	2	8	47085	47092	75 %	0 %	25 %	0 %	191636875
88	NC_010999	AAAT	2	8	47126	47133	75 %	25 %	0 %	0 %	191636875
89	NC_010999	CAAA	2	8	47324	47331	75 %	0 %	0 %	25 %	191636875
90	NC_010999	AAAG	2	8	47382	47389	75 %	0 %	25 %	0 %	191636875
91	NC_010999	ATCG	2	8	49488	49495	25 %	25 %	25 %	25 %	191636877
92	NC_010999	CTTG	2	8	49516	49523	0 %	50 %	25 %	25 %	191636877
93	NC_010999	TCAT	2	8	49639	49646	25 %	50 %	0 %	25 %	191636877
94	NC_010999	AAAT	2	8	50902	50909	75 %	25 %	0 %	0 %	191636878
95	NC_010999	CTAT	2	8	51895	51902	25 %	50 %	0 %	25 %	191636879
96	NC_010999	CTAG	2	8	52117	52124	25 %	25 %	25 %	25 %	191636879
97	NC_010999	ACTA	2	8	52402	52409	50 %	25 %	0 %	25 %	191636880
98	NC_010999	AAAT	2	8	52744	52751	75 %	25 %	0 %	0 %	191636880
99	NC_010999	TAGG	2	8	52782	52789	25 %	25 %	50 %	0 %	191636880
100	NC_010999	TGAT	2	8	53518	53525	25 %	50 %	25 %	0 %	191636881
101	NC_010999	CAAA	2	8	53579	53586	75 %	0 %	0 %	25 %	191636881
102	NC_010999	AAAT	2	8	53888	53895	75 %	25 %	0 %	0 %	191636881
103	NC_010999	TATT	2	8	54498	54505	25 %	75 %	0 %	0 %	191636881
104	NC_010999	TTGA	2	8	54795	54802	25 %	50 %	25 %	0 %	191636881
105	NC_010999	CCGC	2	8	55218	55225	0 %	0 %	25 %	75 %	191636882
106	NC_010999	TGAG	2	8	55941	55948	25 %	25 %	50 %	0 %	191636882
107	NC_010999	CAAA	2	8	56268	56275	75 %	0 %	0 %	25 %	191636882
108	NC_010999	TGCG	2	8	56549	56556	0 %	25 %	50 %	25 %	191636882
109	NC_010999	GTTA	2	8	56757	56764	25 %	50 %	25 %	0 %	191636883
110	NC_010999	TTTG	2	8	57067	57074	0 %	75 %	25 %	0 %	191636883
111	NC_010999	GTCA	2	8	57457	57464	25 %	25 %	25 %	25 %	191636884
112	NC_010999	GTTG	2	8	58458	58465	0 %	50 %	50 %	0 %	191636884
113	NC_010999	TTAA	2	8	58703	58710	50 %	50 %	0 %	0 %	191636884
114	NC_010999	TGGC	2	8	58751	58758	0 %	25 %	50 %	25 %	191636884
115	NC_010999	GCTG	2	8	58917	58924	0 %	25 %	50 %	25 %	191636884
116	NC_010999	CTGT	2	8	59132	59139	0 %	50 %	25 %	25 %	191636884
117	NC_010999	AGGT	2	8	59249	59256	25 %	25 %	50 %	0 %	191636884
118	NC_010999	TTGG	2	8	59431	59438	0 %	50 %	50 %	0 %	191636884
119	NC_010999	TCGT	2	8	59775	59782	0 %	50 %	25 %	25 %	191636884
120	NC_010999	CAGT	2	8	60339	60346	25 %	25 %	25 %	25 %	191636884
121	NC_010999	CTTT	2	8	60405	60412	0 %	75 %	0 %	25 %	191636884
122	NC_010999	TAAG	2	8	61683	61690	50 %	25 %	25 %	0 %	191636886
123	NC_010999	GTTG	2	8	62013	62020	0 %	50 %	50 %	0 %	191636887
124	NC_010999	GACA	2	8	62130	62137	50 %	0 %	25 %	25 %	191636887
125	NC_010999	CATC	2	8	62201	62208	25 %	25 %	0 %	50 %	191636887
126	NC_010999	CTGG	2	8	63606	63613	0 %	25 %	50 %	25 %	191636889
127	NC_010999	ATTG	2	8	63761	63768	25 %	50 %	25 %	0 %	191636889
128	NC_010999	ATCA	2	8	63799	63806	50 %	25 %	0 %	25 %	191636889
129	NC_010999	GACA	2	8	65270	65277	50 %	0 %	25 %	25 %	191636890
130	NC_010999	AGCA	2	8	67798	67805	50 %	0 %	25 %	25 %	191636891
131	NC_010999	GTGA	2	8	67837	67844	25 %	25 %	50 %	0 %	191636891
132	NC_010999	GGCA	2	8	68318	68325	25 %	0 %	50 %	25 %	191636891
133	NC_010999	CCTA	2	8	68333	68340	25 %	25 %	0 %	50 %	191636891
134	NC_010999	GATG	2	8	68838	68845	25 %	25 %	50 %	0 %	191636891
135	NC_010999	TAAA	2	8	69153	69160	75 %	25 %	0 %	0 %	191636891
136	NC_010999	CTGA	2	8	70656	70663	25 %	25 %	25 %	25 %	191636895
137	NC_010999	CTAC	2	8	70742	70749	25 %	25 %	0 %	50 %	191636895
138	NC_010999	TGCC	2	8	71701	71708	0 %	25 %	25 %	50 %	191636896
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