MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei BL23 chromosome

Total Repeats: 41263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010999	TCA	2	6	17	22	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010999	GGA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010999	GAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636825
4	NC_010999	CTT	2	6	220	225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191636825
5	NC_010999	GAA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636825
6	NC_010999	GCT	2	6	474	479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636825
7	NC_010999	ACA	2	6	504	509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636825
8	NC_010999	TGG	2	6	530	535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191636825
9	NC_010999	ATA	2	6	589	594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191636825
10	NC_010999	CAG	2	6	598	603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636825
11	NC_010999	CTG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636825
12	NC_010999	GAT	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636825
13	NC_010999	GAA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636825
14	NC_010999	TAA	2	6	875	880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191636825
15	NC_010999	TGA	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636825
16	NC_010999	CGG	2	6	1307	1312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636825
17	NC_010999	TGA	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636825
18	NC_010999	GTT	3	9	1504	1512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010999	AGG	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010999	ATG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636826
21	NC_010999	AAC	2	6	1674	1679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636826
22	NC_010999	AAT	2	6	1789	1794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191636826
23	NC_010999	TCA	2	6	1913	1918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636826
24	NC_010999	CAT	2	6	2199	2204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636826
25	NC_010999	CAA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636826
26	NC_010999	GAA	2	6	2539	2544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636826
27	NC_010999	CAA	2	6	2556	2561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636826
28	NC_010999	GCG	2	6	2567	2572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636826
29	NC_010999	AGA	2	6	2691	2696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636826
30	NC_010999	TCA	2	6	2717	2722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636826
31	NC_010999	CAA	2	6	2755	2760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010999	TGA	2	6	2791	2796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010999	ATA	3	9	2863	2871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010999	GAA	2	6	2978	2983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010999	TAG	3	9	3009	3017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010999	TCC	2	6	3029	3034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_010999	ATA	3	9	3079	3087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010999	ATA	2	6	3114	3119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010999	AGT	2	6	3500	3505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010999	GAC	2	6	3534	3539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010999	ACA	2	6	3598	3603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636827
42	NC_010999	GAG	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	191636827
43	NC_010999	GAT	2	6	3757	3762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636827
44	NC_010999	TGC	2	6	3845	3850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636828
45	NC_010999	ACA	2	6	3858	3863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636828
46	NC_010999	TCA	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636828
47	NC_010999	AAC	2	6	4102	4107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636828
48	NC_010999	GCG	2	6	4193	4198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636828
49	NC_010999	AGC	2	6	4276	4281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636828
50	NC_010999	AGC	2	6	4297	4302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636828
51	NC_010999	ATC	2	6	4309	4314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636828
52	NC_010999	GTT	2	6	4397	4402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636828
53	NC_010999	TGC	2	6	4421	4426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636828
54	NC_010999	AGC	2	6	4552	4557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636828
55	NC_010999	GAT	2	6	4605	4610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636828
56	NC_010999	GTT	2	6	4613	4618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636828
57	NC_010999	CAA	2	6	4662	4667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636828
58	NC_010999	CAC	2	6	4670	4675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	191636828
59	NC_010999	TGT	2	6	4756	4761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636828
60	NC_010999	ACC	2	6	4830	4835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	191636828
61	NC_010999	ATC	2	6	4863	4868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636828
62	NC_010999	TGA	2	6	4892	4897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636828
63	NC_010999	TGA	2	6	4961	4966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010999	AGG	2	6	5035	5040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010999	GGC	2	6	5092	5097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636829
66	NC_010999	ATG	2	6	5103	5108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636829
67	NC_010999	AGC	2	6	5180	5185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636829
68	NC_010999	CAT	2	6	5195	5200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636829
69	NC_010999	TGA	2	6	5230	5235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636829
70	NC_010999	ATA	2	6	5283	5288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191636829
71	NC_010999	GGT	2	6	5387	5392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191636829
72	NC_010999	CGG	4	12	5398	5409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636829
73	NC_010999	GTG	2	6	5493	5498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191636829
74	NC_010999	TAC	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636829
75	NC_010999	GAT	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636829
76	NC_010999	ACC	2	6	5654	5659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	191636829
77	NC_010999	GGC	2	6	5756	5761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636829
78	NC_010999	TTG	2	6	5894	5899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636829
79	NC_010999	CAA	2	6	5908	5913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636829
80	NC_010999	GGC	2	6	5930	5935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636829
81	NC_010999	GAT	2	6	6017	6022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636829
82	NC_010999	GAT	2	6	6035	6040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636829
83	NC_010999	CGG	2	6	6057	6062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636829
84	NC_010999	GGT	2	6	6139	6144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191636829
85	NC_010999	GGC	2	6	6247	6252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636829
86	NC_010999	ACA	2	6	6324	6329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636829
87	NC_010999	ATT	2	6	6355	6360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191636829
88	NC_010999	TCG	2	6	6363	6368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636829
89	NC_010999	TGG	2	6	6382	6387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191636829
90	NC_010999	GAA	2	6	6491	6496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636829
91	NC_010999	TTG	2	6	6620	6625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636829
92	NC_010999	GCC	2	6	6688	6693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191636829
93	NC_010999	GAA	2	6	6743	6748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636829
94	NC_010999	GCC	2	6	6772	6777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191636829
95	NC_010999	GAC	2	6	6844	6849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636829
96	NC_010999	AAC	2	6	6992	6997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636829
97	NC_010999	GAG	2	6	7053	7058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010999	GAT	2	6	7074	7079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636830
99	NC_010999	CGG	2	6	7209	7214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636830
100	NC_010999	AAG	2	6	7263	7268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636830
101	NC_010999	TTG	2	6	7279	7284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636830
102	NC_010999	TGC	2	6	7474	7479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636830
103	NC_010999	CAA	2	6	7487	7492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636830
104	NC_010999	ATG	2	6	7519	7524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636830
105	NC_010999	GTT	2	6	7542	7547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636830
106	NC_010999	TTG	2	6	7569	7574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636830
107	NC_010999	GAC	2	6	7607	7612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636830
108	NC_010999	CCG	2	6	7620	7625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191636830
109	NC_010999	CGG	2	6	7730	7735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636830
110	NC_010999	TGG	2	6	8071	8076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191636830
111	NC_010999	ATC	2	6	8137	8142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636830
112	NC_010999	TCG	2	6	8156	8161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636830
113	NC_010999	TGA	2	6	8240	8245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636830
114	NC_010999	ATC	2	6	8247	8252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636830
115	NC_010999	AGC	2	6	8414	8419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636830
116	NC_010999	TCA	2	6	8462	8467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636830
117	NC_010999	ATC	2	6	8469	8474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636830
118	NC_010999	AGA	2	6	8497	8502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636830
119	NC_010999	AAG	2	6	8578	8583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636830
120	NC_010999	TCA	2	6	8590	8595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636830
121	NC_010999	ATG	2	6	8689	8694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636830
122	NC_010999	ATG	2	6	8731	8736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636830
123	NC_010999	CTT	2	6	8744	8749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191636830
124	NC_010999	CAA	2	6	8753	8758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636830
125	NC_010999	GCA	2	6	8773	8778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636830
126	NC_010999	ATG	2	6	8896	8901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636830
127	NC_010999	TCT	2	6	8911	8916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191636830
128	NC_010999	GTT	2	6	8934	8939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636830
129	NC_010999	GCA	2	6	8974	8979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636830
130	NC_010999	AAT	2	6	9021	9026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191636830
131	NC_010999	GAC	2	6	9456	9461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636830
132	NC_010999	CGA	2	6	9503	9508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636830
133	NC_010999	GCA	2	6	9520	9525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636830
134	NC_010999	CTG	2	6	9559	9564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636830
135	NC_010999	GCA	2	6	9575	9580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636830
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137	NC_010999	TAA	2	6	9695	9700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_010999	TAC	2	6	17830	17835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636839
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499	NC_010999	CAT	2	6	34907	34912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636857
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