MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BL23 chromosome

Total Repeats: 5305

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010999	TCA	2	6	17	22	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010999	GGA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010999	GTT	3	9	1504	1512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010999	AGG	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010999	CAA	2	6	2755	2760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010999	TGA	2	6	2791	2796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010999	ATA	3	9	2863	2871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010999	GAA	2	6	2978	2983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010999	TAG	3	9	3009	3017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010999	TCC	2	6	3029	3034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_010999	ATA	3	9	3079	3087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010999	ATA	2	6	3114	3119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010999	AGT	2	6	3500	3505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010999	GAC	2	6	3534	3539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010999	TGA	2	6	4961	4966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010999	AGG	2	6	5035	5040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010999	GAG	2	6	7053	7058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010999	TAA	2	6	9695	9700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010999	TCC	2	6	10508	10513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_010999	AGA	2	6	10606	10611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010999	TGC	2	6	10646	10651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010999	AGG	2	6	10670	10675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010999	CGC	2	6	11126	11131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_010999	AGG	2	6	11228	11233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010999	GGA	2	6	12241	12246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010999	ATT	2	6	12544	12549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010999	AGA	2	6	12614	12619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010999	GAA	2	6	12683	12688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010999	TAG	2	6	12747	12752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010999	TAA	2	6	12828	12833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010999	TGT	2	6	12843	12848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010999	GGA	2	6	12876	12881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010999	AAT	2	6	12900	12905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010999	AAG	3	9	12909	12917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010999	ATA	2	6	14608	14613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010999	CAA	2	6	14721	14726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010999	GGT	2	6	14753	14758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010999	AAT	2	6	15068	15073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010999	AGC	2	6	15239	15244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010999	ATT	2	6	15346	15351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010999	GAA	2	6	18858	18863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010999	CAT	2	6	18947	18952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010999	TTG	2	6	18953	18958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010999	TAA	2	6	19019	19024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010999	AAC	2	6	19081	19086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010999	ATT	2	6	19140	19145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010999	CAA	2	6	20125	20130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010999	AGC	2	6	20205	20210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010999	TTC	2	6	21237	21242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010999	CCT	2	6	21685	21690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_010999	GAT	2	6	21917	21922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010999	CAG	3	9	21923	21931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010999	CCT	2	6	22040	22045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_010999	CTT	2	6	22097	22102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010999	TGA	2	6	23556	23561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010999	GAC	2	6	23588	23593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010999	CCT	2	6	26908	26913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_010999	ATG	2	6	27162	27167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010999	GGA	2	6	27171	27176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010999	ATA	2	6	27758	27763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010999	AGA	2	6	28988	28993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010999	GTT	2	6	29053	29058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010999	TTG	2	6	29156	29161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010999	AGC	2	6	29299	29304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010999	TTG	2	6	29440	29445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010999	TCT	2	6	29456	29461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010999	AGA	2	6	29553	29558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010999	CCT	2	6	30258	30263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_010999	TAT	2	6	32435	32440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010999	CTC	2	6	33381	33386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_010999	GAA	2	6	33545	33550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010999	AAT	2	6	34169	34174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010999	AGC	2	6	35217	35222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010999	CAA	2	6	35911	35916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010999	TCA	2	6	37555	37560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010999	CAT	2	6	38661	38666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010999	AAG	2	6	40193	40198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010999	TCA	2	6	40242	40247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010999	AGC	2	6	41020	41025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010999	TAG	2	6	41369	41374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010999	ACA	2	6	41389	41394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010999	TAA	2	6	41398	41403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010999	TAA	2	6	41421	41426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010999	TGG	2	6	41500	41505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010999	ATT	2	6	41511	41516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010999	AAG	2	6	41728	41733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010999	CTT	2	6	41765	41770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010999	TGA	2	6	41816	41821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010999	CAA	2	6	42679	42684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010999	GGA	2	6	43422	43427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010999	ATG	2	6	43976	43981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010999	TAT	2	6	45740	45745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010999	CAA	2	6	45768	45773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010999	AAT	2	6	46264	46269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010999	ACC	2	6	46332	46337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010999	AAC	2	6	46356	46361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010999	CGT	2	6	46419	46424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010999	GAT	2	6	46445	46450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010999	TGA	2	6	46547	46552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010999	TTA	2	6	47577	47582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010999	CTG	2	6	48546	48551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010999	AGC	2	6	50077	50082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010999	TAT	2	6	50098	50103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010999	AAT	2	6	50109	50114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010999	AGC	2	6	50154	50159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010999	AGA	2	6	51336	51341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010999	GTG	2	6	51534	51539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010999	CTT	2	6	51544	51549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010999	TCA	2	6	51600	51605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010999	AGC	2	6	51723	51728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010999	GCT	2	6	51740	51745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010999	GCT	2	6	52268	52273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010999	ATT	2	6	52274	52279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010999	GGA	2	6	53260	53265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010999	ATT	2	6	55035	55040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010999	CAT	2	6	55163	55168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010999	CTG	2	6	56641	56646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010999	GCT	2	6	56718	56723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010999	TAA	2	6	56724	56729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010999	TTA	2	6	57106	57111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010999	CAA	2	6	57159	57164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010999	CTC	2	6	61178	61183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_010999	TGT	2	6	61269	61274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010999	AAG	2	6	61295	61300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010999	CCA	2	6	61341	61346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_010999	ACA	2	6	61391	61396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010999	TTG	2	6	61783	61788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010999	GAC	2	6	61847	61852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010999	TCC	2	6	65393	65398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_010999	TGA	2	6	65575	65580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010999	AAT	2	6	65595	65600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010999	AAC	2	6	65730	65735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010999	TGT	2	6	65759	65764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010999	GCA	2	6	66025	66030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010999	GCA	2	6	66126	66131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010999	CAA	2	6	66151	66156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010999	AAT	2	6	66232	66237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010999	GAC	2	6	66342	66347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010999	ATT	2	6	66386	66391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010999	ACA	2	6	66408	66413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010999	GTT	2	6	66472	66477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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