MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus casei BL23 chromosome

Total Repeats: 35958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010999	GAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636825
2	NC_010999	CTT	2	6	220	225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191636825
3	NC_010999	GAA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636825
4	NC_010999	GCT	2	6	474	479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636825
5	NC_010999	ACA	2	6	504	509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636825
6	NC_010999	TGG	2	6	530	535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191636825
7	NC_010999	ATA	2	6	589	594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191636825
8	NC_010999	CAG	2	6	598	603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636825
9	NC_010999	CTG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636825
10	NC_010999	GAT	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636825
11	NC_010999	GAA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636825
12	NC_010999	TAA	2	6	875	880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191636825
13	NC_010999	TGA	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636825
14	NC_010999	CGG	2	6	1307	1312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636825
15	NC_010999	TGA	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636825
16	NC_010999	ATG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636826
17	NC_010999	AAC	2	6	1674	1679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636826
18	NC_010999	AAT	2	6	1789	1794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191636826
19	NC_010999	TCA	2	6	1913	1918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636826
20	NC_010999	CAT	2	6	2199	2204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636826
21	NC_010999	CAA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636826
22	NC_010999	GAA	2	6	2539	2544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636826
23	NC_010999	CAA	2	6	2556	2561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636826
24	NC_010999	GCG	2	6	2567	2572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636826
25	NC_010999	AGA	2	6	2691	2696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636826
26	NC_010999	TCA	2	6	2717	2722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636826
27	NC_010999	ACA	2	6	3598	3603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636827
28	NC_010999	GAG	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	191636827
29	NC_010999	GAT	2	6	3757	3762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636827
30	NC_010999	TGC	2	6	3845	3850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636828
31	NC_010999	ACA	2	6	3858	3863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636828
32	NC_010999	TCA	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636828
33	NC_010999	AAC	2	6	4102	4107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636828
34	NC_010999	GCG	2	6	4193	4198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636828
35	NC_010999	AGC	2	6	4276	4281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636828
36	NC_010999	AGC	2	6	4297	4302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636828
37	NC_010999	ATC	2	6	4309	4314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636828
38	NC_010999	GTT	2	6	4397	4402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636828
39	NC_010999	TGC	2	6	4421	4426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636828
40	NC_010999	AGC	2	6	4552	4557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636828
41	NC_010999	GAT	2	6	4605	4610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636828
42	NC_010999	GTT	2	6	4613	4618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636828
43	NC_010999	CAA	2	6	4662	4667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636828
44	NC_010999	CAC	2	6	4670	4675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	191636828
45	NC_010999	TGT	2	6	4756	4761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636828
46	NC_010999	ACC	2	6	4830	4835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	191636828
47	NC_010999	ATC	2	6	4863	4868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636828
48	NC_010999	TGA	2	6	4892	4897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636828
49	NC_010999	GGC	2	6	5092	5097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636829
50	NC_010999	ATG	2	6	5103	5108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636829
51	NC_010999	AGC	2	6	5180	5185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636829
52	NC_010999	CAT	2	6	5195	5200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636829
53	NC_010999	TGA	2	6	5230	5235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636829
54	NC_010999	ATA	2	6	5283	5288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191636829
55	NC_010999	GGT	2	6	5387	5392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191636829
56	NC_010999	CGG	4	12	5398	5409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636829
57	NC_010999	GTG	2	6	5493	5498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191636829
58	NC_010999	TAC	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636829
59	NC_010999	GAT	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636829
60	NC_010999	ACC	2	6	5654	5659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	191636829
61	NC_010999	GGC	2	6	5756	5761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636829
62	NC_010999	TTG	2	6	5894	5899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636829
63	NC_010999	CAA	2	6	5908	5913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636829
64	NC_010999	GGC	2	6	5930	5935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636829
65	NC_010999	GAT	2	6	6017	6022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636829
66	NC_010999	GAT	2	6	6035	6040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636829
67	NC_010999	CGG	2	6	6057	6062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636829
68	NC_010999	GGT	2	6	6139	6144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191636829
69	NC_010999	GGC	2	6	6247	6252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636829
70	NC_010999	ACA	2	6	6324	6329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636829
71	NC_010999	ATT	2	6	6355	6360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191636829
72	NC_010999	TCG	2	6	6363	6368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636829
73	NC_010999	TGG	2	6	6382	6387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191636829
74	NC_010999	GAA	2	6	6491	6496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636829
75	NC_010999	TTG	2	6	6620	6625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636829
76	NC_010999	GCC	2	6	6688	6693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191636829
77	NC_010999	GAA	2	6	6743	6748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636829
78	NC_010999	GCC	2	6	6772	6777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191636829
79	NC_010999	GAC	2	6	6844	6849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636829
80	NC_010999	AAC	2	6	6992	6997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636829
81	NC_010999	GAT	2	6	7074	7079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636830
82	NC_010999	CGG	2	6	7209	7214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636830
83	NC_010999	AAG	2	6	7263	7268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636830
84	NC_010999	TTG	2	6	7279	7284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636830
85	NC_010999	TGC	2	6	7474	7479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636830
86	NC_010999	CAA	2	6	7487	7492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636830
87	NC_010999	ATG	2	6	7519	7524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636830
88	NC_010999	GTT	2	6	7542	7547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636830
89	NC_010999	TTG	2	6	7569	7574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636830
90	NC_010999	GAC	2	6	7607	7612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636830
91	NC_010999	CCG	2	6	7620	7625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191636830
92	NC_010999	CGG	2	6	7730	7735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636830
93	NC_010999	TGG	2	6	8071	8076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191636830
94	NC_010999	ATC	2	6	8137	8142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636830
95	NC_010999	TCG	2	6	8156	8161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636830
96	NC_010999	TGA	2	6	8240	8245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636830
97	NC_010999	ATC	2	6	8247	8252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636830
98	NC_010999	AGC	2	6	8414	8419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636830
99	NC_010999	TCA	2	6	8462	8467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636830
100	NC_010999	ATC	2	6	8469	8474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636830
101	NC_010999	AGA	2	6	8497	8502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636830
102	NC_010999	AAG	2	6	8578	8583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191636830
103	NC_010999	TCA	2	6	8590	8595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636830
104	NC_010999	ATG	2	6	8689	8694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636830
105	NC_010999	ATG	2	6	8731	8736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636830
106	NC_010999	CTT	2	6	8744	8749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191636830
107	NC_010999	CAA	2	6	8753	8758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636830
108	NC_010999	GCA	2	6	8773	8778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636830
109	NC_010999	ATG	2	6	8896	8901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636830
110	NC_010999	TCT	2	6	8911	8916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191636830
111	NC_010999	GTT	2	6	8934	8939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636830
112	NC_010999	GCA	2	6	8974	8979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636830
113	NC_010999	AAT	2	6	9021	9026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191636830
114	NC_010999	GAC	2	6	9456	9461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636830
115	NC_010999	CGA	2	6	9503	9508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636830
116	NC_010999	GCA	2	6	9520	9525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636830
117	NC_010999	CTG	2	6	9559	9564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636830
118	NC_010999	GCA	2	6	9575	9580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636830
119	NC_010999	AAT	2	6	9688	9693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191636830
120	NC_010999	GAT	2	6	9845	9850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636831
121	NC_010999	CGC	2	6	9856	9861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191636831
122	NC_010999	TGA	2	6	10069	10074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636831
123	NC_010999	GCG	2	6	10305	10310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636831
124	NC_010999	GTT	2	6	10336	10341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636831
125	NC_010999	CCA	2	6	10375	10380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	191636831
126	NC_010999	TTG	2	6	10891	10896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636832
127	NC_010999	GGC	2	6	10907	10912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636832
128	NC_010999	TAA	2	6	10917	10922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191636832
129	NC_010999	GTC	2	6	10966	10971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636832
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132	NC_010999	GAC	2	6	11050	11055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636832
133	NC_010999	CGA	2	6	11097	11102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636832
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161	NC_010999	ATG	2	6	13182	13187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636836
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498	NC_010999	ATC	2	6	40817	40822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636864
499	NC_010999	CAT	3	9	40903	40911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636864
500	NC_010999	GAT	2	6	40983	40988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636864

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