MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pA

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010998	TCAAC	2	10	17258	17267	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_010998	CCTGC	2	10	18739	18748	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_010998	GCGGG	2	10	25231	25240	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010998	ATTGC	2	10	43378	43387	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_010998	TCTCC	2	10	75213	75222	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_010998	CAGGA	2	10	79172	79181	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_010998	CGGCA	2	10	85074	85083	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_010998	GGGGA	2	10	90063	90072	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010998	CCATT	2	10	128207	128216	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_010998	CGCGC	2	10	130423	130432	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_010998	TCCAA	2	10	150657	150666	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_010998	GCCGC	2	10	169649	169658	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_010998	TCGCA	2	10	190563	190572	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_010998	AACAG	2	10	214552	214561	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_010998	AGGCA	2	10	232550	232559	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010998	AGACA	2	10	232640	232649	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010998	TTTAG	2	10	234878	234887	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010998	AGCCG	2	10	237438	237447	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_010998	ACGCA	2	10	261465	261474	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_010998	GAAAG	2	10	262585	262594	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010998	GCCGC	2	10	273464	273473	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_010998	CAAAA	2	10	305303	305312	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010998	CCCCT	2	10	316823	316832	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
24	NC_010998	GCGCG	2	10	324622	324631	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_010998	GCCTT	2	10	347586	347595	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_010998	TGCCG	2	10	351365	351374	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_010998	TTGAA	2	10	375888	375897	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.