MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pC

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010997	CAGCGG	2	12	24961	24972	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010997	CATCGC	2	12	25797	25808	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010997	CGCTGG	2	12	29744	29755	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010997	CAATGC	2	12	168711	168722	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010997	GAGGGA	2	12	225356	225367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010997	GTTGGT	2	12	247982	247993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010997	AGCCTG	2	12	323094	323105	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010997	GTCGCT	2	12	370006	370017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010997	CGATTT	2	12	393038	393049	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010997	ACCGCC	2	12	393544	393555	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_010997	TTTTCA	2	12	417081	417092	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010997	GAGCGC	2	12	480778	480789	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010997	GCGCAT	2	12	545844	545855	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010997	TATTTC	2	12	681025	681036	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010997	GTCGAT	2	12	681810	681821	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010997	GCATCG	2	12	707273	707284	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010997	ACATCG	2	12	722795	722806	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010997	TCGCAC	2	12	731766	731777	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010997	GCGCGG	2	12	775575	775586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010997	AGCGGC	2	12	790466	790477	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010997	ATGGGC	2	12	796126	796137	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_010997	GCCATT	2	12	800688	800699	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010997	GGTCCA	2	12	801275	801286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010997	GTCGGC	2	12	804316	804327	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010997	CGATTT	2	12	806586	806597	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_010997	GTTGAC	2	12	807847	807858	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010997	CCTCCG	2	12	808183	808194	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_010997	AGGGTC	2	12	822681	822692	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010997	GATCGC	2	12	844260	844271	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010997	GCGCGT	2	12	892553	892564	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010997	CCGCGG	2	12	892762	892773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010997	GAAGCA	2	12	893105	893116	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010997	TCCGGC	2	12	896111	896122	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010997	ACCGCC	2	12	896477	896488	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_010997	TGCCGG	2	12	896785	896796	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010997	CGGCGC	2	12	897463	897474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010997	TGCCGG	2	12	897802	897813	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010997	TGCCGG	2	12	898336	898347	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010997	TGCCGG	2	12	898841	898852	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010997	TGCCGG	2	12	899306	899317	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010997	TGCCGG	2	12	899810	899821	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010997	TGCCGG	2	12	900275	900286	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010997	CGCCGT	2	12	907500	907511	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010997	TGCCGT	2	12	908127	908138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010997	CCATCA	2	12	919724	919735	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010997	GATGTC	2	12	940195	940206	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.