MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pC

Total Repeats: 18136

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010997	GGC	2	6	117	122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894341
2	NC_010997	GTT	2	6	124	129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894341
3	NC_010997	TCC	2	6	130	135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894341
4	NC_010997	CTG	2	6	150	155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894341
5	NC_010997	GGC	2	6	225	230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894341
6	NC_010997	CGA	2	6	257	262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894341
7	NC_010997	CGC	2	6	314	319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894341
8	NC_010997	GGC	2	6	366	371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894341
9	NC_010997	CGA	2	6	410	415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894341
10	NC_010997	CAG	2	6	474	479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894341
11	NC_010997	GAT	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894341
12	NC_010997	TTG	2	6	520	525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894341
13	NC_010997	GGA	2	6	534	539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894341
14	NC_010997	CCA	2	6	575	580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894341
15	NC_010997	GCG	2	6	688	693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894341
16	NC_010997	GTT	2	6	750	755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894341
17	NC_010997	TGA	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894341
18	NC_010997	AGC	2	6	805	810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894341
19	NC_010997	GCC	2	6	813	818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894341
20	NC_010997	GCT	2	6	821	826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894341
21	NC_010997	CGG	2	6	926	931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894341
22	NC_010997	TGC	2	6	960	965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894341
23	NC_010997	TCG	2	6	1108	1113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894341
24	NC_010997	GAT	2	6	1236	1241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894341
25	NC_010997	GGC	2	6	1242	1247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894341
26	NC_010997	CGA	2	6	1331	1336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894341
27	NC_010997	CTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894341
28	NC_010997	ACC	2	6	1621	1626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894341
29	NC_010997	TGT	2	6	1645	1650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894341
30	NC_010997	CCT	2	6	1685	1690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894341
31	NC_010997	CAC	2	6	1692	1697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894341
32	NC_010997	GCG	2	6	1699	1704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894341
33	NC_010997	AGG	2	6	1741	1746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894341
34	NC_010997	CGA	3	9	1760	1768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894341
35	NC_010997	CCA	2	6	1775	1780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894341
36	NC_010997	CGG	2	6	1866	1871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894342
37	NC_010997	CAG	2	6	1918	1923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894342
38	NC_010997	CAT	2	6	1930	1935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894342
39	NC_010997	GGC	2	6	1936	1941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894342
40	NC_010997	GGC	2	6	1953	1958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894342
41	NC_010997	CGC	3	9	1962	1970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894342
42	NC_010997	TTG	2	6	2147	2152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894342
43	NC_010997	TCG	2	6	2246	2251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894342
44	NC_010997	CGC	2	6	2455	2460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894342
45	NC_010997	CTC	2	6	2464	2469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894342
46	NC_010997	AGA	2	6	2493	2498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894342
47	NC_010997	TTG	2	6	2633	2638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894342
48	NC_010997	GAA	2	6	2656	2661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894342
49	NC_010997	GCG	2	6	2688	2693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894342
50	NC_010997	GCC	2	6	2753	2758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894342
51	NC_010997	ACC	2	6	2905	2910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_010997	CAG	2	6	2949	2954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010997	TTC	2	6	2959	2964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010997	TTC	2	6	2986	2991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010997	GAC	2	6	3017	3022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010997	CGG	2	6	3061	3066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010997	CCA	2	6	3109	3114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_010997	CGT	2	6	3144	3149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010997	GCA	2	6	3159	3164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010997	GCG	2	6	3172	3177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010997	AGG	2	6	3219	3224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010997	GGA	2	6	3270	3275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894343
63	NC_010997	GCG	2	6	3278	3283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894343
64	NC_010997	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894343
65	NC_010997	GAG	2	6	3312	3317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894343
66	NC_010997	CCT	2	6	3330	3335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894343
67	NC_010997	GGC	2	6	3338	3343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894343
68	NC_010997	TCC	2	6	3401	3406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894343
69	NC_010997	ATA	2	6	3475	3480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190894343
70	NC_010997	CGA	3	9	3573	3581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894343
71	NC_010997	GGA	2	6	3585	3590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894343
72	NC_010997	CGC	2	6	3679	3684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894343
73	NC_010997	CCG	2	6	3866	3871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_010997	AAG	2	6	3945	3950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010997	GTC	3	9	4125	4133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894344
76	NC_010997	GGT	2	6	4289	4294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894344
77	NC_010997	CGT	2	6	4364	4369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894344
78	NC_010997	CAG	2	6	4428	4433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894344
79	NC_010997	ATC	2	6	4440	4445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894344
80	NC_010997	TGG	2	6	4453	4458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894344
81	NC_010997	GTC	2	6	4526	4531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894344
82	NC_010997	CGA	2	6	4553	4558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894344
83	NC_010997	TCG	2	6	4753	4758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894344
84	NC_010997	TCA	2	6	4768	4773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894344
85	NC_010997	ACG	2	6	4782	4787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894344
86	NC_010997	ACA	3	9	4831	4839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894344
87	NC_010997	AAC	2	6	4848	4853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894344
88	NC_010997	GGC	2	6	4946	4951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894345
89	NC_010997	GCT	2	6	4996	5001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894345
90	NC_010997	CTG	3	9	5018	5026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894345
91	NC_010997	ACC	2	6	5066	5071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894345
92	NC_010997	ATG	2	6	5090	5095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894345
93	NC_010997	GCG	2	6	5121	5126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894345
94	NC_010997	CGT	3	9	5140	5148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894345
95	NC_010997	GAG	2	6	5255	5260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894345
96	NC_010997	GCA	2	6	5329	5334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894345
97	NC_010997	CCG	2	6	5343	5348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894345
98	NC_010997	CGG	2	6	5416	5421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894345
99	NC_010997	CGT	3	9	5437	5445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894345
100	NC_010997	CGA	2	6	5551	5556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894345
101	NC_010997	ACG	2	6	5604	5609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894345
102	NC_010997	GCC	4	12	5633	5644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894345
103	NC_010997	CGA	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894345
104	NC_010997	CGT	2	6	5784	5789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010997	CCG	2	6	5825	5830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894346
106	NC_010997	GCG	2	6	5832	5837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894346
107	NC_010997	CCT	2	6	5852	5857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894346
108	NC_010997	GCG	2	6	5918	5923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894346
109	NC_010997	AGC	4	12	6124	6135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894346
110	NC_010997	GCC	2	6	6174	6179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894346
111	NC_010997	GCC	2	6	6188	6193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894346
112	NC_010997	CTC	2	6	6207	6212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894346
113	NC_010997	CGA	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894346
114	NC_010997	TTG	2	6	6355	6360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894346
115	NC_010997	GCA	2	6	6380	6385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894346
116	NC_010997	TCG	2	6	6398	6403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894346
117	NC_010997	GAT	2	6	6405	6410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894346
118	NC_010997	CGG	2	6	6632	6637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894346
119	NC_010997	GCA	2	6	6722	6727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010997	ATT	2	6	6748	6753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010997	CAA	2	6	6899	6904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894347
122	NC_010997	TGG	2	6	6930	6935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894347
123	NC_010997	TTC	2	6	6958	6963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894347
124	NC_010997	GAG	2	6	7014	7019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894347
125	NC_010997	AAG	2	6	7023	7028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894347
126	NC_010997	GAA	2	6	7046	7051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894347
127	NC_010997	TGA	2	6	7066	7071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894347
128	NC_010997	TGG	2	6	7086	7091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894347
129	NC_010997	CGG	2	6	7112	7117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894347
130	NC_010997	GCG	3	9	7174	7182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894347
131	NC_010997	CGC	2	6	7251	7256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894347
132	NC_010997	CGG	2	6	7370	7375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894347
133	NC_010997	TGA	2	6	7436	7441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894347
134	NC_010997	GCG	2	6	7450	7455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894347
135	NC_010997	GGC	2	6	7524	7529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894347
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