MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pB

Total Repeats: 1140

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010996	CGAG	2	8	552	559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010996	GCGA	2	8	914	921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010996	GACT	2	8	1005	1012	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010996	TGCC	2	8	1405	1412	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010996	CATG	2	8	1518	1525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010996	TCGC	2	8	1903	1910	0 %	25 %	25 %	50 %	190893985
7	NC_010996	GCCG	2	8	2749	2756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010996	GCTC	2	8	3319	3326	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010996	CGAA	2	8	3780	3787	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010996	TCAA	2	8	3984	3991	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010996	CGGA	2	8	4025	4032	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010996	CTGA	2	8	4055	4062	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010996	TGAC	2	8	5069	5076	25 %	25 %	25 %	25 %	190893987
14	NC_010996	TCGA	2	8	5089	5096	25 %	25 %	25 %	25 %	190893987
15	NC_010996	CCTG	2	8	5944	5951	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010996	GACG	2	8	6506	6513	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010996	AGGA	2	8	6678	6685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010996	TTGC	2	8	7469	7476	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010996	GCAC	2	8	8502	8509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010996	GTTG	2	8	8561	8568	0 %	50 %	50 %	0 %	190893989
21	NC_010996	GAGG	2	8	8637	8644	25 %	0 %	75 %	0 %	190893989
22	NC_010996	GATT	2	8	8702	8709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010996	ATCT	2	8	8987	8994	25 %	50 %	0 %	25 %	190893990
24	NC_010996	GTGC	2	8	9044	9051	0 %	25 %	50 %	25 %	190893990
25	NC_010996	CGAA	2	8	9222	9229	50 %	0 %	25 %	25 %	190893990
26	NC_010996	GCCA	2	8	9376	9383	25 %	0 %	25 %	50 %	190893990
27	NC_010996	ATCG	2	8	9395	9402	25 %	25 %	25 %	25 %	190893990
28	NC_010996	GATC	2	8	9493	9500	25 %	25 %	25 %	25 %	190893990
29	NC_010996	TCTG	2	8	9728	9735	0 %	50 %	25 %	25 %	190893990
30	NC_010996	GACG	2	8	10304	10311	25 %	0 %	50 %	25 %	190893990
31	NC_010996	GAGC	2	8	10394	10401	25 %	0 %	50 %	25 %	190893990
32	NC_010996	CGGC	2	8	10402	10409	0 %	0 %	50 %	50 %	190893990
33	NC_010996	GGGA	2	8	10518	10525	25 %	0 %	75 %	0 %	190893990
34	NC_010996	GGCG	2	8	11389	11396	0 %	0 %	75 %	25 %	190893990
35	NC_010996	ATAG	2	8	11483	11490	50 %	25 %	25 %	0 %	190893990
36	NC_010996	GGAA	2	8	11555	11562	50 %	0 %	50 %	0 %	190893990
37	NC_010996	ACTC	2	8	11881	11888	25 %	25 %	0 %	50 %	190893990
38	NC_010996	TCGA	2	8	11981	11988	25 %	25 %	25 %	25 %	190893990
39	NC_010996	TTTG	2	8	12296	12303	0 %	75 %	25 %	0 %	190893990
40	NC_010996	CGTT	2	8	12892	12899	0 %	50 %	25 %	25 %	190893991
41	NC_010996	TTGT	2	8	13234	13241	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010996	GGTT	2	8	13735	13742	0 %	50 %	50 %	0 %	190893992
43	NC_010996	AGAA	2	8	14294	14301	75 %	0 %	25 %	0 %	190893992
44	NC_010996	AGCA	2	8	14466	14473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_010996	ATCC	2	8	15357	15364	25 %	25 %	0 %	50 %	190893993
46	NC_010996	CTGC	2	8	15681	15688	0 %	25 %	25 %	50 %	190893993
47	NC_010996	ATCG	2	8	15766	15773	25 %	25 %	25 %	25 %	190893993
48	NC_010996	AAGG	2	8	15994	16001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010996	TCGT	2	8	16139	16146	0 %	50 %	25 %	25 %	190893994
50	NC_010996	CGAC	2	8	16213	16220	25 %	0 %	25 %	50 %	190893994
51	NC_010996	TCAA	2	8	16513	16520	50 %	25 %	0 %	25 %	190893994
52	NC_010996	TGTA	2	8	17110	17117	25 %	50 %	25 %	0 %	190893994
53	NC_010996	GCCG	2	8	17498	17505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010996	AGTT	2	8	17562	17569	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010996	TCAC	2	8	17636	17643	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010996	CGAT	2	8	18429	18436	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010996	AAGC	2	8	19048	19055	50 %	0 %	25 %	25 %	190893995
58	NC_010996	CAAA	2	8	19281	19288	75 %	0 %	0 %	25 %	190893995
59	NC_010996	GACT	2	8	19534	19541	25 %	25 %	25 %	25 %	190893996
60	NC_010996	TCAA	2	8	19746	19753	50 %	25 %	0 %	25 %	190893996
61	NC_010996	TGCA	2	8	19874	19881	25 %	25 %	25 %	25 %	190893996
62	NC_010996	AGCA	2	8	21156	21163	50 %	0 %	25 %	25 %	190893998
63	NC_010996	ATCG	2	8	21906	21913	25 %	25 %	25 %	25 %	190893999
64	NC_010996	ATGA	2	8	22249	22256	50 %	25 %	25 %	0 %	190893999
65	NC_010996	GCGG	2	8	22265	22272	0 %	0 %	75 %	25 %	190893999
66	NC_010996	GAAA	2	8	22415	22422	75 %	0 %	25 %	0 %	190893999
67	NC_010996	CCGA	2	8	23135	23142	25 %	0 %	25 %	50 %	190893999
68	NC_010996	AGCG	2	8	23160	23167	25 %	0 %	50 %	25 %	190893999
69	NC_010996	GTCC	2	8	23241	23248	0 %	25 %	25 %	50 %	190893999
70	NC_010996	ACCG	2	8	23639	23646	25 %	0 %	25 %	50 %	190894000
71	NC_010996	GACC	2	8	23649	23656	25 %	0 %	25 %	50 %	190894000
72	NC_010996	GCCG	2	8	23825	23832	0 %	0 %	50 %	50 %	190894000
73	NC_010996	GTCC	2	8	24250	24257	0 %	25 %	25 %	50 %	190894000
74	NC_010996	CTTG	2	8	24502	24509	0 %	50 %	25 %	25 %	190894000
75	NC_010996	CCAG	2	8	24655	24662	25 %	0 %	25 %	50 %	190894000
76	NC_010996	TGAG	2	8	24796	24803	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010996	ACGC	2	8	25895	25902	25 %	0 %	25 %	50 %	190894001
78	NC_010996	ATGC	2	8	26070	26077	25 %	25 %	25 %	25 %	190894001
79	NC_010996	GGGC	2	8	26200	26207	0 %	0 %	75 %	25 %	190894001
80	NC_010996	GTTC	2	8	26742	26749	0 %	50 %	25 %	25 %	190894001
81	NC_010996	AAGA	2	8	27263	27270	75 %	0 %	25 %	0 %	190894002
82	NC_010996	ATCG	2	8	28061	28068	25 %	25 %	25 %	25 %	190894002
83	NC_010996	GATC	2	8	28324	28331	25 %	25 %	25 %	25 %	190894002
84	NC_010996	TTCA	2	8	28499	28506	25 %	50 %	0 %	25 %	190894002
85	NC_010996	AGCG	2	8	28596	28603	25 %	0 %	50 %	25 %	190894002
86	NC_010996	AGCG	2	8	28892	28899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010996	AAAT	2	8	30940	30947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010996	CCAA	2	8	31138	31145	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010996	ATCG	2	8	31681	31688	25 %	25 %	25 %	25 %	190894006
90	NC_010996	AGCG	2	8	32703	32710	25 %	0 %	50 %	25 %	190894007
91	NC_010996	GATC	2	8	33027	33034	25 %	25 %	25 %	25 %	190894007
92	NC_010996	TCGG	2	8	33315	33322	0 %	25 %	50 %	25 %	190894007
93	NC_010996	CCGC	2	8	34646	34653	0 %	0 %	25 %	75 %	190894008
94	NC_010996	CGAA	2	8	34760	34767	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010996	GGAT	2	8	34902	34909	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010996	GACC	2	8	35088	35095	25 %	0 %	25 %	50 %	190894009
97	NC_010996	AAAG	2	8	35589	35596	75 %	0 %	25 %	0 %	190894010
98	NC_010996	CGAT	2	8	35665	35672	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010996	TCGC	2	8	36117	36124	0 %	25 %	25 %	50 %	190894011
100	NC_010996	GCCG	2	8	36319	36326	0 %	0 %	50 %	50 %	190894011
101	NC_010996	CGAT	2	8	36567	36574	25 %	25 %	25 %	25 %	190894011
102	NC_010996	GCCG	2	8	36708	36715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_010996	ACAT	2	8	36735	36742	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010996	CTGC	2	8	36782	36789	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010996	CGGC	2	8	36971	36978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010996	CTGC	2	8	37382	37389	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_010996	GCTC	2	8	37559	37566	0 %	25 %	25 %	50 %	190894012
108	NC_010996	ATCG	2	8	38066	38073	25 %	25 %	25 %	25 %	190894012
109	NC_010996	ACGG	2	8	38341	38348	25 %	0 %	50 %	25 %	190894012
110	NC_010996	ACGA	2	8	38934	38941	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010996	CCGC	2	8	39782	39789	0 %	0 %	25 %	75 %	190894013
112	NC_010996	ATTT	2	8	40747	40754	25 %	75 %	0 %	0 %	190894014
113	NC_010996	CAGT	2	8	41918	41925	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010996	CGTT	2	8	42181	42188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010996	GTTT	2	8	42280	42287	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010996	CGGA	2	8	42372	42379	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010996	GGCG	2	8	42730	42737	0 %	0 %	75 %	25 %	190894016
118	NC_010996	CGGA	2	8	42850	42857	25 %	0 %	50 %	25 %	190894016
119	NC_010996	GCCG	2	8	42943	42950	0 %	0 %	50 %	50 %	190894016
120	NC_010996	TTGC	2	8	43273	43280	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010996	CGTT	2	8	43355	43362	0 %	50 %	25 %	25 %	190894017
122	NC_010996	TCGC	2	8	43433	43440	0 %	25 %	25 %	50 %	190894017
123	NC_010996	ACCA	2	8	43640	43647	50 %	0 %	0 %	50 %	190894017
124	NC_010996	ATTC	2	8	43924	43931	25 %	50 %	0 %	25 %	190894017
125	NC_010996	GACG	2	8	43933	43940	25 %	0 %	50 %	25 %	190894017
126	NC_010996	GGCC	2	8	44533	44540	0 %	0 %	50 %	50 %	190894017
127	NC_010996	GACG	2	8	44584	44591	25 %	0 %	50 %	25 %	190894017
128	NC_010996	CAGA	2	8	44839	44846	50 %	0 %	25 %	25 %	190894018
129	NC_010996	ACTG	2	8	44926	44933	25 %	25 %	25 %	25 %	190894018
130	NC_010996	CAGC	2	8	45858	45865	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010996	GTTG	2	8	46747	46754	0 %	50 %	50 %	0 %	190894019
132	NC_010996	TCGG	2	8	46770	46777	0 %	25 %	50 %	25 %	190894019
133	NC_010996	CGAT	2	8	46910	46917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_010996	GTTG	2	8	46987	46994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010996	TTTG	2	8	47005	47012	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010996	TGCA	2	8	47132	47139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010996	GTTC	2	8	47394	47401	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010996	GCAC	2	8	47892	47899	25 %	0 %	25 %	50 %	190894020
139	NC_010996	TTCG	2	8	48283	48290	0 %	50 %	25 %	25 %	190894020
140	NC_010996	TGCT	2	8	48742	48749	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010996	TGGG	2	8	49893	49900	0 %	25 %	75 %	0 %	190894022
142	NC_010996	ATCT	2	8	50094	50101	25 %	50 %	0 %	25 %	190894022
143	NC_010996	TCGC	2	8	50834	50841	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_010996	GCGA	2	8	51163	51170	25 %	0 %	50 %	25 %	190894023
145	NC_010996	ACCC	2	8	51636	51643	25 %	0 %	0 %	75 %	190894023
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