MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pB

Total Repeats: 374

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010996	CGAG	2	8	552	559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010996	GCGA	2	8	914	921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010996	GACT	2	8	1005	1012	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010996	TGCC	2	8	1405	1412	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010996	CATG	2	8	1518	1525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010996	GCCG	2	8	2749	2756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010996	GCTC	2	8	3319	3326	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010996	CGAA	2	8	3780	3787	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010996	TCAA	2	8	3984	3991	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010996	CGGA	2	8	4025	4032	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010996	CTGA	2	8	4055	4062	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010996	CCTG	2	8	5944	5951	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010996	GACG	2	8	6506	6513	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010996	AGGA	2	8	6678	6685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010996	TTGC	2	8	7469	7476	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010996	GCAC	2	8	8502	8509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010996	GATT	2	8	8702	8709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010996	TTGT	2	8	13234	13241	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010996	AGCA	2	8	14466	14473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010996	AAGG	2	8	15994	16001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010996	GCCG	2	8	17498	17505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010996	AGTT	2	8	17562	17569	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010996	TCAC	2	8	17636	17643	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010996	CGAT	2	8	18429	18436	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010996	TGAG	2	8	24796	24803	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010996	AGCG	2	8	28892	28899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010996	AAAT	2	8	30940	30947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010996	CCAA	2	8	31138	31145	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010996	CGAA	2	8	34760	34767	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010996	GGAT	2	8	34902	34909	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010996	CGAT	2	8	35665	35672	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010996	GCCG	2	8	36708	36715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010996	ACAT	2	8	36735	36742	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010996	CTGC	2	8	36782	36789	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010996	CGGC	2	8	36971	36978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010996	CTGC	2	8	37382	37389	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010996	ACGA	2	8	38934	38941	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010996	CAGT	2	8	41918	41925	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010996	CGTT	2	8	42181	42188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010996	GTTT	2	8	42280	42287	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010996	CGGA	2	8	42372	42379	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010996	TTGC	2	8	43273	43280	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010996	CAGC	2	8	45858	45865	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010996	CGAT	2	8	46910	46917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_010996	GTTG	2	8	46987	46994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010996	TTTG	2	8	47005	47012	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010996	TGCA	2	8	47132	47139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010996	GTTC	2	8	47394	47401	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010996	TGCT	2	8	48742	48749	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010996	TCGC	2	8	50834	50841	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010996	GATT	3	12	53435	53446	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010996	GCCT	2	8	54240	54247	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010996	GATC	2	8	55307	55314	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010996	TCAG	2	8	55625	55632	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010996	GAAC	2	8	56357	56364	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010996	GCCG	2	8	56526	56533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010996	AGCC	2	8	57273	57280	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010996	CTGG	2	8	57393	57400	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010996	TCGG	2	8	57524	57531	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010996	GGTC	2	8	57871	57878	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010996	GGCG	2	8	57915	57922	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010996	GTCG	2	8	57981	57988	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010996	TTGT	3	12	58559	58570	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010996	TTGC	2	8	58738	58745	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010996	GCCG	2	8	60502	60509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010996	CGCA	2	8	60646	60653	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010996	TCAC	2	8	60773	60780	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010996	GCCG	2	8	61778	61785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010996	TCAG	2	8	61800	61807	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010996	AGGA	2	8	62176	62183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010996	AACC	2	8	62469	62476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010996	GCCG	2	8	62674	62681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010996	AAAC	2	8	63101	63108	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010996	ATGG	2	8	64266	64273	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010996	TGAG	2	8	67020	67027	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010996	AGTG	2	8	67462	67469	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010996	AGCC	2	8	67682	67689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010996	TTCA	2	8	68587	68594	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010996	AGGA	2	8	69203	69210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010996	GCGA	2	8	71531	71538	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010996	GGCA	2	8	71746	71753	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010996	CGAC	2	8	71802	71809	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_010996	GGCG	2	8	72488	72495	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_010996	CCGG	2	8	72721	72728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010996	CCAT	2	8	74092	74099	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010996	GTCC	2	8	74192	74199	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010996	GCTC	2	8	74258	74265	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010996	CCAT	2	8	74928	74935	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010996	CGGC	2	8	75130	75137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010996	AAGC	2	8	75980	75987	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010996	AAGA	2	8	76025	76032	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010996	AATG	2	8	76992	76999	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010996	GGCT	2	8	77254	77261	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_010996	TGAG	2	8	78413	78420	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010996	GCGA	2	8	80227	80234	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010996	CCGA	2	8	80526	80533	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_010996	GGCA	2	8	80650	80657	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010996	ATCG	2	8	81875	81882	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010996	GACG	2	8	82001	82008	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010996	ACGG	2	8	82310	82317	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010996	GCAG	2	8	83582	83589	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_010996	GTCG	2	8	85114	85121	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010996	CGAA	2	8	85277	85284	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010996	CCGG	2	8	85726	85733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010996	GCCG	2	8	86322	86329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010996	CGTG	2	8	86707	86714	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010996	CGAG	2	8	86766	86773	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_010996	TGCC	2	8	89282	89289	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_010996	GCAG	2	8	89744	89751	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010996	ATGG	2	8	89757	89764	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010996	CATT	2	8	97461	97468	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010996	GGCC	2	8	103406	103413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010996	CCGT	2	8	109174	109181	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_010996	CCAG	2	8	113803	113810	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_010996	AGGC	2	8	114655	114662	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010996	TCGC	2	8	125431	125438	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010996	GGCC	2	8	125585	125592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010996	CGAT	2	8	125774	125781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_010996	TCGT	2	8	126762	126769	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010996	CGGT	2	8	127048	127055	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010996	CCAC	2	8	127091	127098	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
122	NC_010996	ATCG	2	8	127485	127492	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010996	GAAT	2	8	127745	127752	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010996	CAGC	2	8	129876	129883	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010996	CTAT	2	8	131652	131659	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010996	GCGA	2	8	131725	131732	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_010996	AATC	2	8	132029	132036	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010996	GTTC	2	8	133726	133733	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010996	GGAT	2	8	138082	138089	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010996	CCAT	2	8	143102	143109	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010996	ATCC	2	8	143284	143291	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_010996	GCGG	2	8	146146	146153	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010996	CTCA	2	8	146370	146377	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_010996	GTTG	2	8	146758	146765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010996	CGTC	2	8	147158	147165	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_010996	TCGA	2	8	148614	148621	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010996	CCCA	2	8	153973	153980	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
138	NC_010996	GTGA	2	8	154123	154130	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010996	GCCA	2	8	157688	157695	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010996	TATT	2	8	158449	158456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010996	TGAT	2	8	166163	166170	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010996	GAAG	2	8	166299	166306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010996	CCGA	2	8	167304	167311	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_010996	CTGA	2	8	173300	173307	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_010996	CCTG	2	8	175614	175621	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_010996	CGGG	2	8	175810	175817	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_010996	GCGG	2	8	175973	175980	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_010996	AAGG	2	8	189459	189466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010996	TTAG	2	8	189502	189509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010996	AGCG	2	8	191971	191978	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_010996	ATCG	2	8	192910	192917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_010996	AGGA	2	8	193922	193929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010996	ACTA	2	8	196753	196760	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_010996	TTGA	2	8	201595	201602	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_010996	GATC	2	8	201630	201637	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
156	NC_010996	CCTG	2	8	202142	202149	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
157	NC_010996	GCCT	2	8	203223	203230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
158	NC_010996	GGAC	2	8	203679	203686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
159	NC_010996	ATCG	2	8	204078	204085	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_010996	GACC	2	8	204212	204219	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
161	NC_010996	AACT	2	8	207221	207228	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_010996	CGAT	2	8	213105	213112	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
163	NC_010996	CAAT	2	8	213974	213981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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165	NC_010996	CGAC	2	8	216014	216021	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
166	NC_010996	TCAT	2	8	216196	216203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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168	NC_010996	CGGC	2	8	217936	217943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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170	NC_010996	GCCC	2	8	221085	221092	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
171	NC_010996	CCCA	2	8	223741	223748	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
172	NC_010996	GCTG	2	8	231726	231733	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
173	NC_010996	CGGC	2	8	232487	232494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
174	NC_010996	CAAC	2	8	233113	233120	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
175	NC_010996	TGCA	2	8	236462	236469	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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179	NC_010996	ATGA	2	8	237400	237407	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
180	NC_010996	GCCG	2	8	247426	247433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
181	NC_010996	TCCA	2	8	247919	247926	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
182	NC_010996	ACCT	2	8	248539	248546	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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189	NC_010996	GCGG	2	8	257911	257918	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
190	NC_010996	GGCG	2	8	258220	258227	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
191	NC_010996	TTGC	2	8	258673	258680	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
192	NC_010996	TTTC	2	8	258853	258860	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
193	NC_010996	GAAA	2	8	258877	258884	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_010996	CTTT	2	8	259018	259025	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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198	NC_010996	TTGG	2	8	259747	259754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_010996	GTAC	2	8	322825	322832	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
277	NC_010996	GAGG	2	8	323029	323036	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
278	NC_010996	GAAA	2	8	323178	323185	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
279	NC_010996	GCCG	2	8	323268	323275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
280	NC_010996	CGGA	2	8	323551	323558	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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282	NC_010996	GCCG	2	8	325333	325340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
283	NC_010996	GCAG	2	8	328984	328991	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
284	NC_010996	CGTT	2	8	336440	336447	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
285	NC_010996	GCAA	2	8	336549	336556	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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297	NC_010996	GAAG	2	8	347147	347154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
298	NC_010996	CACG	2	8	347518	347525	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
299	NC_010996	TGGA	2	8	347981	347988	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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339	NC_010996	CCAC	2	8	385839	385846	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
340	NC_010996	TGCC	2	8	386669	386676	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
341	NC_010996	GGTC	2	8	387177	387184	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
342	NC_010996	AGCC	2	8	389788	389795	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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344	NC_010996	GATC	2	8	390749	390756	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
345	NC_010996	CCAG	2	8	391128	391135	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
346	NC_010996	CAGC	2	8	392569	392576	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
347	NC_010996	CTAT	2	8	392679	392686	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
348	NC_010996	CGAC	2	8	392810	392817	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
349	NC_010996	ATCG	2	8	392876	392883	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
350	NC_010996	ATTG	2	8	400615	400622	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
351	NC_010996	CTGG	2	8	400955	400962	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
352	NC_010996	TCAG	2	8	401078	401085	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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360	NC_010996	TTCA	2	8	404473	404480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
361	NC_010996	GATC	2	8	405220	405227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
362	NC_010996	CCAG	2	8	405599	405606	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
363	NC_010996	TTCA	2	8	406899	406906	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
364	NC_010996	CAGC	2	8	408462	408469	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
365	NC_010996	TGAA	2	8	411214	411221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
366	NC_010996	GCGT	2	8	413220	413227	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
367	NC_010996	TGCT	3	12	413705	413716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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370	NC_010996	CCTA	2	8	420991	420998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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373	NC_010996	GGTC	2	8	424894	424901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
374	NC_010996	GAGT	2	8	425209	425216	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.