MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pB

Total Repeats: 6186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010996	ACC	2	6	52	57	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_010996	GGC	2	6	91	96	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893984
3	NC_010996	GCC	2	6	242	247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893984
4	NC_010996	TCA	2	6	250	255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893984
5	NC_010996	GGC	2	6	286	291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893984
6	NC_010996	AAC	2	6	350	355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190893984
7	NC_010996	CTG	2	6	359	364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893984
8	NC_010996	CGG	2	6	400	405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893984
9	NC_010996	TCA	2	6	429	434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893984
10	NC_010996	CGA	2	6	561	566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010996	CGC	2	6	591	596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_010996	CGA	2	6	620	625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010996	GAA	2	6	832	837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010996	GGC	2	6	851	856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010996	GGA	2	6	859	864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010996	GCC	2	6	880	885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_010996	GAT	2	6	895	900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010996	GCG	2	6	980	985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010996	CGC	2	6	1035	1040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_010996	GGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010996	GGC	2	6	1084	1089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010996	CGA	2	6	1095	1100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010996	TCA	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010996	GAA	2	6	1171	1176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010996	ATC	2	6	1184	1189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010996	GCT	2	6	1194	1199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010996	CGA	2	6	1209	1214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010996	GGT	2	6	1249	1254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010996	AGC	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010996	CGA	2	6	1302	1307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010996	CTT	2	6	1344	1349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010996	TCG	2	6	1374	1379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010996	GCC	2	6	1498	1503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_010996	CAT	2	6	1570	1575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893985
35	NC_010996	AAG	2	6	1577	1582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190893985
36	NC_010996	CGG	2	6	1622	1627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893985
37	NC_010996	CGG	2	6	1631	1636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893985
38	NC_010996	GAA	2	6	1683	1688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190893985
39	NC_010996	GGC	2	6	1719	1724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893985
40	NC_010996	TCG	2	6	1837	1842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893985
41	NC_010996	GGC	2	6	1865	1870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893985
42	NC_010996	CGT	2	6	1893	1898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893985
43	NC_010996	GAT	2	6	1949	1954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893985
44	NC_010996	CGA	2	6	2157	2162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010996	CGC	2	6	2385	2390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_010996	GCA	2	6	2483	2488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010996	TCG	2	6	2514	2519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010996	GGT	2	6	2546	2551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010996	TCC	2	6	2573	2578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_010996	CAT	2	6	2626	2631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010996	CGC	2	6	2639	2644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_010996	CGT	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010996	GAT	2	6	2794	2799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010996	AAG	2	6	2813	2818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010996	CGA	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010996	CTT	2	6	2995	3000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010996	GGC	2	6	3004	3009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010996	TAT	2	6	3017	3022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010996	ACC	2	6	3304	3309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_010996	CTG	2	6	3426	3431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010996	GCT	2	6	3475	3480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010996	GGT	2	6	3486	3491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010996	ACA	2	6	3507	3512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010996	CTA	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010996	CTC	2	6	3565	3570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_010996	CGC	2	6	3619	3624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_010996	GTA	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010996	CGG	2	6	3839	3844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010996	GGC	2	6	3965	3970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010996	TCG	2	6	4083	4088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893986
71	NC_010996	CGC	2	6	4146	4151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893986
72	NC_010996	GGA	2	6	4238	4243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190893986
73	NC_010996	CAG	2	6	4444	4449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893987
74	NC_010996	GCC	2	6	4565	4570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893987
75	NC_010996	TCA	2	6	4578	4583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893987
76	NC_010996	CGA	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893987
77	NC_010996	TGC	2	6	4736	4741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893987
78	NC_010996	CGT	2	6	4847	4852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893987
79	NC_010996	CGC	2	6	4894	4899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893987
80	NC_010996	CGC	2	6	5031	5036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893987
81	NC_010996	TTG	2	6	5293	5298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190893987
82	NC_010996	AGT	2	6	5351	5356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893987
83	NC_010996	TAG	2	6	5417	5422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893988
84	NC_010996	GCC	2	6	5440	5445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893988
85	NC_010996	AGC	2	6	5517	5522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893988
86	NC_010996	CTG	2	6	5553	5558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893988
87	NC_010996	ACC	2	6	5702	5707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_010996	ACC	2	6	5781	5786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010996	CGG	2	6	5957	5962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010996	GCG	2	6	6060	6065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010996	GCC	2	6	6069	6074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_010996	TGC	3	9	6102	6110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010996	GCA	2	6	6217	6222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010996	TAG	2	6	6294	6299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010996	GTC	2	6	6333	6338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010996	GAA	2	6	6476	6481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010996	CCG	2	6	6589	6594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_010996	TTC	2	6	6636	6641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010996	CCG	3	9	6697	6705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_010996	TCG	2	6	6747	6752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010996	GCA	2	6	6864	6869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010996	TGC	2	6	6978	6983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010996	TCT	2	6	7035	7040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010996	CGC	2	6	7144	7149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_010996	CGG	2	6	7165	7170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010996	GGC	2	6	7175	7180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010996	AAG	2	6	7346	7351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010996	TCC	2	6	7371	7376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_010996	GCC	3	9	7479	7487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_010996	GAT	2	6	7517	7522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010996	CGC	3	9	7605	7613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_010996	ACA	2	6	7777	7782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010996	GCG	2	6	7853	7858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010996	CCG	2	6	7900	7905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_010996	CCG	3	9	8095	8103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_010996	GGT	2	6	8149	8154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010996	TGA	2	6	8263	8268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010996	CGG	2	6	8463	8468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010996	GGC	2	6	8513	8518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893989
120	NC_010996	TGC	2	6	8552	8557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893989
121	NC_010996	GTT	2	6	8736	8741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010996	TTG	2	6	8744	8749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010996	GCA	2	6	8767	8772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010996	TTC	2	6	8997	9002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190893990
125	NC_010996	CGC	2	6	9003	9008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893990
126	NC_010996	CCG	2	6	9058	9063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893990
127	NC_010996	GCG	2	6	9156	9161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893990
128	NC_010996	CGT	2	6	9202	9207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
129	NC_010996	CAT	2	6	9208	9213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893990
130	NC_010996	CGA	2	6	9271	9276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893990
131	NC_010996	AGA	2	6	9463	9468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190893990
132	NC_010996	CAA	2	6	9626	9631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190893990
133	NC_010996	TGC	2	6	9700	9705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
134	NC_010996	GCT	2	6	9736	9741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
135	NC_010996	GGA	2	6	9804	9809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190893990
136	NC_010996	GCG	2	6	9814	9819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893990
137	NC_010996	TGA	2	6	9837	9842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893990
138	NC_010996	GTT	2	6	9872	9877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190893990
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283	NC_010996	AAT	2	6	21567	21572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_010996	GTT	2	6	21676	21681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
285	NC_010996	AGG	2	6	21721	21726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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389	NC_010996	CCA	2	6	30726	30731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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