MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pB

Total Repeats: 4401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010996	GGC	2	6	91	96	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893984
2	NC_010996	GCC	2	6	242	247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893984
3	NC_010996	TCA	2	6	250	255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893984
4	NC_010996	GGC	2	6	286	291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893984
5	NC_010996	AAC	2	6	350	355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190893984
6	NC_010996	CTG	2	6	359	364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893984
7	NC_010996	CGG	2	6	400	405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893984
8	NC_010996	TCA	2	6	429	434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893984
9	NC_010996	CAT	2	6	1570	1575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893985
10	NC_010996	AAG	2	6	1577	1582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190893985
11	NC_010996	CGG	2	6	1622	1627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893985
12	NC_010996	CGG	2	6	1631	1636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893985
13	NC_010996	GAA	2	6	1683	1688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190893985
14	NC_010996	GGC	2	6	1719	1724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893985
15	NC_010996	TCG	2	6	1837	1842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893985
16	NC_010996	GGC	2	6	1865	1870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893985
17	NC_010996	CGT	2	6	1893	1898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893985
18	NC_010996	GAT	2	6	1949	1954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893985
19	NC_010996	TCG	2	6	4083	4088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893986
20	NC_010996	CGC	2	6	4146	4151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893986
21	NC_010996	GGA	2	6	4238	4243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190893986
22	NC_010996	CAG	2	6	4444	4449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893987
23	NC_010996	GCC	2	6	4565	4570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893987
24	NC_010996	TCA	2	6	4578	4583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893987
25	NC_010996	CGA	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893987
26	NC_010996	TGC	2	6	4736	4741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893987
27	NC_010996	CGT	2	6	4847	4852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893987
28	NC_010996	CGC	2	6	4894	4899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893987
29	NC_010996	CGC	2	6	5031	5036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893987
30	NC_010996	TTG	2	6	5293	5298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190893987
31	NC_010996	AGT	2	6	5351	5356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893987
32	NC_010996	TAG	2	6	5417	5422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893988
33	NC_010996	GCC	2	6	5440	5445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893988
34	NC_010996	AGC	2	6	5517	5522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893988
35	NC_010996	CTG	2	6	5553	5558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893988
36	NC_010996	GGC	2	6	8513	8518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893989
37	NC_010996	TGC	2	6	8552	8557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893989
38	NC_010996	TTC	2	6	8997	9002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190893990
39	NC_010996	CGC	2	6	9003	9008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893990
40	NC_010996	CCG	2	6	9058	9063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893990
41	NC_010996	GCG	2	6	9156	9161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893990
42	NC_010996	CGT	2	6	9202	9207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
43	NC_010996	CAT	2	6	9208	9213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893990
44	NC_010996	CGA	2	6	9271	9276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893990
45	NC_010996	AGA	2	6	9463	9468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190893990
46	NC_010996	CAA	2	6	9626	9631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190893990
47	NC_010996	TGC	2	6	9700	9705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
48	NC_010996	GCT	2	6	9736	9741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
49	NC_010996	GGA	2	6	9804	9809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190893990
50	NC_010996	GCG	2	6	9814	9819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893990
51	NC_010996	TGA	2	6	9837	9842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893990
52	NC_010996	GTT	2	6	9872	9877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190893990
53	NC_010996	AGC	2	6	10026	10031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893990
54	NC_010996	TCA	2	6	10098	10103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893990
55	NC_010996	TGC	2	6	10146	10151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
56	NC_010996	TGG	2	6	10263	10268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190893990
57	NC_010996	CTT	2	6	10334	10339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190893990
58	NC_010996	GCA	2	6	10508	10513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893990
59	NC_010996	TCA	2	6	10608	10613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893990
60	NC_010996	CGG	2	6	10631	10636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893990
61	NC_010996	TGC	2	6	10656	10661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
62	NC_010996	GCT	2	6	10682	10687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
63	NC_010996	GGC	2	6	10774	10779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893990
64	NC_010996	CGT	2	6	10829	10834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
65	NC_010996	GCC	2	6	10907	10912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893990
66	NC_010996	TCT	2	6	10966	10971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190893990
67	NC_010996	GGC	2	6	11044	11049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893990
68	NC_010996	GCT	2	6	11209	11214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
69	NC_010996	TCT	2	6	11226	11231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190893990
70	NC_010996	CGA	2	6	11419	11424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893990
71	NC_010996	GAA	2	6	11461	11466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190893990
72	NC_010996	TGG	2	6	11695	11700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190893990
73	NC_010996	TGA	2	6	11803	11808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893990
74	NC_010996	GCC	2	6	11893	11898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893990
75	NC_010996	TCG	2	6	11925	11930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
76	NC_010996	AGT	2	6	12140	12145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893990
77	NC_010996	GAT	2	6	12224	12229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893990
78	NC_010996	TCA	2	6	12232	12237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893990
79	NC_010996	TGG	2	6	12258	12263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190893990
80	NC_010996	CTT	2	6	12266	12271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190893990
81	NC_010996	ATA	2	6	12273	12278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190893990
82	NC_010996	CGG	2	6	12307	12312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893990
83	NC_010996	GCG	3	9	12336	12344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893990
84	NC_010996	TTC	2	6	12447	12452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190893990
85	NC_010996	CTA	2	6	12998	13003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893991
86	NC_010996	TAA	2	6	13121	13126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190893991
87	NC_010996	GTT	2	6	13500	13505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190893992
88	NC_010996	ACG	2	6	13556	13561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893992
89	NC_010996	ATG	2	6	13610	13615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893992
90	NC_010996	GAG	2	6	13691	13696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190893992
91	NC_010996	CTG	2	6	13811	13816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893992
92	NC_010996	TCT	2	6	13898	13903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190893992
93	NC_010996	CGG	2	6	13947	13952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893992
94	NC_010996	AGG	2	6	13963	13968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190893992
95	NC_010996	GAC	2	6	14093	14098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893992
96	NC_010996	CAG	2	6	14152	14157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893992
97	NC_010996	AGA	2	6	14242	14247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190893992
98	NC_010996	AGG	2	6	14264	14269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190893992
99	NC_010996	TGA	2	6	14535	14540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893993
100	NC_010996	TTC	2	6	14560	14565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190893993
101	NC_010996	CAG	2	6	14590	14595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893993
102	NC_010996	TGT	2	6	14601	14606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190893993
103	NC_010996	CGG	2	6	14607	14612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893993
104	NC_010996	TTC	2	6	14665	14670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190893993
105	NC_010996	GAG	2	6	14707	14712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190893993
106	NC_010996	AGT	2	6	14727	14732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893993
107	NC_010996	TCC	2	6	14754	14759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190893993
108	NC_010996	CGA	2	6	14772	14777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893993
109	NC_010996	CTG	2	6	14882	14887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893993
110	NC_010996	ACT	2	6	14998	15003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893993
111	NC_010996	GTT	2	6	15012	15017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190893993
112	NC_010996	CTT	2	6	15036	15041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190893993
113	NC_010996	GCG	2	6	15114	15119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893993
114	NC_010996	TTC	2	6	15287	15292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190893993
115	NC_010996	GCG	2	6	15498	15503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893993
116	NC_010996	GCA	2	6	15566	15571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893993
117	NC_010996	CGT	2	6	15610	15615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893993
118	NC_010996	TCA	2	6	15692	15697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893993
119	NC_010996	CTG	2	6	15729	15734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893993
120	NC_010996	CGC	2	6	15780	15785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893993
121	NC_010996	TCG	2	6	16015	16020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893994
122	NC_010996	CGG	2	6	16022	16027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893994
123	NC_010996	GCG	2	6	16089	16094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893994
124	NC_010996	GCC	2	6	16095	16100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893994
125	NC_010996	GTC	2	6	16194	16199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893994
126	NC_010996	AGC	2	6	16204	16209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893994
127	NC_010996	GAA	2	6	16452	16457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190893994
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497	NC_010996	GGC	2	6	53894	53899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894027
498	NC_010996	AGG	2	6	55857	55862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894028
499	NC_010996	GCG	2	6	55877	55882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894028
500	NC_010996	ACC	2	6	56076	56081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894028

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