MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cellvibrio japonicus Ueda107 chromosome

Total Repeats: 2779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010995	ACCAC	2	10	1499	1508	40 %	0 %	0 %	60 %	192359033
2	NC_010995	TGGTG	2	10	1729	1738	0 %	40 %	60 %	0 %	192362292
3	NC_010995	ATAGA	2	10	3318	3327	60 %	20 %	20 %	0 %	192361120
4	NC_010995	GGGAT	2	10	3484	3493	20 %	20 %	60 %	0 %	192361120
5	NC_010995	CTGTT	2	10	4778	4787	0 %	60 %	20 %	20 %	192360461
6	NC_010995	CCAAA	2	10	4984	4993	60 %	0 %	0 %	40 %	192360461
7	NC_010995	GCCGC	2	10	6343	6352	0 %	0 %	40 %	60 %	192360461
8	NC_010995	AGAGA	2	10	10129	10138	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010995	ACACG	2	10	11737	11746	40 %	0 %	20 %	40 %	192359692
10	NC_010995	GAGCG	2	10	12791	12800	20 %	0 %	60 %	20 %	192359975
11	NC_010995	CACCG	2	10	13056	13065	20 %	0 %	20 %	60 %	192359975
12	NC_010995	ATTGC	2	10	13999	14008	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010995	GAAAA	2	10	14543	14552	80 %	0 %	20 %	0 %	192361588
14	NC_010995	GGTGA	2	10	15326	15335	20 %	20 %	60 %	0 %	192361588
15	NC_010995	ACCCA	2	10	16913	16922	40 %	0 %	0 %	60 %	192359310
16	NC_010995	ACCTG	2	10	17432	17441	20 %	20 %	20 %	40 %	192358853
17	NC_010995	AATGC	2	10	17580	17589	40 %	20 %	20 %	20 %	192358853
18	NC_010995	TAATC	2	10	18497	18506	40 %	40 %	0 %	20 %	192361417
19	NC_010995	CAGGT	2	10	20885	20894	20 %	20 %	40 %	20 %	192359249
20	NC_010995	AGACA	2	10	21032	21041	60 %	0 %	20 %	20 %	192359249
21	NC_010995	AGACA	2	10	22142	22151	60 %	0 %	20 %	20 %	192359249
22	NC_010995	AGACA	2	10	23270	23279	60 %	0 %	20 %	20 %	192359249
23	NC_010995	AGACA	2	10	24398	24407	60 %	0 %	20 %	20 %	192359249
24	NC_010995	CAACT	2	10	26434	26443	40 %	20 %	0 %	40 %	192359249
25	NC_010995	CTGGC	2	10	29835	29844	0 %	20 %	40 %	40 %	192359249
26	NC_010995	TCTGG	2	10	31560	31569	0 %	40 %	40 %	20 %	192359249
27	NC_010995	AGGTG	2	10	31964	31973	20 %	20 %	60 %	0 %	192359249
28	NC_010995	GCCAG	2	10	32381	32390	20 %	0 %	40 %	40 %	192359249
29	NC_010995	TAATT	2	10	34195	34204	40 %	60 %	0 %	0 %	192362442
30	NC_010995	TTGTC	2	10	38772	38781	0 %	60 %	20 %	20 %	192362072
31	NC_010995	AATAT	2	10	39078	39087	60 %	40 %	0 %	0 %	192362072
32	NC_010995	ATTTT	2	10	39355	39364	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010995	CCAAA	2	10	40083	40092	60 %	0 %	0 %	40 %	192361868
34	NC_010995	GTGAT	2	10	40613	40622	20 %	40 %	40 %	0 %	192361868
35	NC_010995	CGCTG	2	10	51361	51370	0 %	20 %	40 %	40 %	192360827
36	NC_010995	AATTG	2	10	56054	56063	40 %	40 %	20 %	0 %	192359330
37	NC_010995	CTTCC	2	10	59676	59685	0 %	40 %	0 %	60 %	192359742
38	NC_010995	CTGGC	2	10	60165	60174	0 %	20 %	40 %	40 %	192359742
39	NC_010995	ATTTG	2	10	61493	61502	20 %	60 %	20 %	0 %	192360772
40	NC_010995	AGGGC	2	10	61714	61723	20 %	0 %	60 %	20 %	192360772
41	NC_010995	TGGCG	2	10	64531	64540	0 %	20 %	60 %	20 %	192361520
42	NC_010995	ATTGG	2	10	67388	67397	20 %	40 %	40 %	0 %	192359325
43	NC_010995	AACAG	2	10	68507	68516	60 %	0 %	20 %	20 %	192359325
44	NC_010995	ACCCA	2	10	72621	72630	40 %	0 %	0 %	60 %	192361119
45	NC_010995	GGCAA	2	10	77700	77709	40 %	0 %	40 %	20 %	192362260
46	NC_010995	CAGTT	2	10	78430	78439	20 %	40 %	20 %	20 %	192362260
47	NC_010995	CAATA	2	10	79954	79963	60 %	20 %	0 %	20 %	192362260
48	NC_010995	AGTAC	2	10	81978	81987	40 %	20 %	20 %	20 %	192358998
49	NC_010995	TCGCA	2	10	86571	86580	20 %	20 %	20 %	40 %	192360945
50	NC_010995	CCACG	2	10	87113	87122	20 %	0 %	20 %	60 %	192360945
51	NC_010995	CTGGC	2	10	88711	88720	0 %	20 %	40 %	40 %	192360945
52	NC_010995	TGGCC	2	10	90137	90146	0 %	20 %	40 %	40 %	192361006
53	NC_010995	GTTTG	2	10	91421	91430	0 %	60 %	40 %	0 %	192360408
54	NC_010995	TCGGT	2	10	91822	91831	0 %	40 %	40 %	20 %	192361454
55	NC_010995	TTTTC	2	10	91834	91843	0 %	80 %	0 %	20 %	192361454
56	NC_010995	CAGCG	2	10	93394	93403	20 %	0 %	40 %	40 %	192361234
57	NC_010995	CAACG	2	10	95449	95458	40 %	0 %	20 %	40 %	192362271
58	NC_010995	AAGAG	2	10	96684	96693	60 %	0 %	40 %	0 %	192362271
59	NC_010995	CATTA	2	10	98755	98764	40 %	40 %	0 %	20 %	192359481
60	NC_010995	GCAAA	2	10	99282	99291	60 %	0 %	20 %	20 %	192359481
61	NC_010995	CTTTG	2	10	99792	99801	0 %	60 %	20 %	20 %	192359481
62	NC_010995	ATCTG	2	10	104451	104460	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010995	CGTGA	2	10	105344	105353	20 %	20 %	40 %	20 %	192358937
64	NC_010995	AGAGC	2	10	106383	106392	40 %	0 %	40 %	20 %	192359668
65	NC_010995	CGGTG	2	10	107681	107690	0 %	20 %	60 %	20 %	192360586
66	NC_010995	GGGTT	2	10	107805	107814	0 %	40 %	60 %	0 %	192360586
67	NC_010995	TTGGT	2	10	109041	109050	0 %	60 %	40 %	0 %	192359211
68	NC_010995	ACTGG	2	10	112029	112038	20 %	20 %	40 %	20 %	192359145
69	NC_010995	CGCAC	2	10	115968	115977	20 %	0 %	20 %	60 %	192362211
70	NC_010995	TTGGG	2	10	116106	116115	0 %	40 %	60 %	0 %	192362211
71	NC_010995	GTACG	2	10	116737	116746	20 %	20 %	40 %	20 %	192362211
72	NC_010995	AGCTG	2	10	118636	118645	20 %	20 %	40 %	20 %	192362211
73	NC_010995	GTTGG	2	10	119858	119867	0 %	40 %	60 %	0 %	192362211
74	NC_010995	CGGTT	2	10	120413	120422	0 %	40 %	40 %	20 %	192362211
75	NC_010995	GGGCA	2	10	121361	121370	20 %	0 %	60 %	20 %	192362211
76	NC_010995	TGGTC	2	10	124068	124077	0 %	40 %	40 %	20 %	192362120
77	NC_010995	GTTCA	2	10	125362	125371	20 %	40 %	20 %	20 %	192362120
78	NC_010995	GATCC	2	10	131374	131383	20 %	20 %	20 %	40 %	192361321
79	NC_010995	AGTTC	2	10	131883	131892	20 %	40 %	20 %	20 %	192361321
80	NC_010995	GTGGC	2	10	131970	131979	0 %	20 %	60 %	20 %	192361321
81	NC_010995	ATCCA	2	10	133459	133468	40 %	20 %	0 %	40 %	192361248
82	NC_010995	AAAAT	2	10	138484	138493	80 %	20 %	0 %	0 %	192358892
83	NC_010995	GGGGT	2	10	140325	140334	0 %	20 %	80 %	0 %	192359537
84	NC_010995	CGCTG	2	10	140444	140453	0 %	20 %	40 %	40 %	192359537
85	NC_010995	GCCGG	2	10	140638	140647	0 %	0 %	60 %	40 %	192359537
86	NC_010995	AGGTG	2	10	142556	142565	20 %	20 %	60 %	0 %	192359138
87	NC_010995	GTTTG	2	10	145386	145395	0 %	60 %	40 %	0 %	192361475
88	NC_010995	GCCAG	2	10	146200	146209	20 %	0 %	40 %	40 %	192358813
89	NC_010995	GCCAG	2	10	147571	147580	20 %	0 %	40 %	40 %	192358970
90	NC_010995	TCCGG	2	10	148641	148650	0 %	20 %	40 %	40 %	192359784
91	NC_010995	TGGCC	2	10	149336	149345	0 %	20 %	40 %	40 %	192359515
92	NC_010995	GCCTG	2	10	150731	150740	0 %	20 %	40 %	40 %	192358942
93	NC_010995	ACCCC	2	10	152126	152135	20 %	0 %	0 %	80 %	192360964
94	NC_010995	GGCAG	2	10	154686	154695	20 %	0 %	60 %	20 %	192362365
95	NC_010995	GCGCC	2	10	155869	155878	0 %	0 %	40 %	60 %	192359753
96	NC_010995	AAAGA	2	10	157935	157944	80 %	0 %	20 %	0 %	192361252
97	NC_010995	ATAGG	2	10	162276	162285	40 %	20 %	40 %	0 %	192359378
98	NC_010995	CCTGT	2	10	165278	165287	0 %	40 %	20 %	40 %	192360216
99	NC_010995	AACCG	2	10	168793	168802	40 %	0 %	20 %	40 %	192359225
100	NC_010995	CCCAT	2	10	172464	172473	20 %	20 %	0 %	60 %	192359225
101	NC_010995	GGTTG	2	10	173835	173844	0 %	40 %	60 %	0 %	192359225
102	NC_010995	CATCG	2	10	175783	175792	20 %	20 %	20 %	40 %	192359225
103	NC_010995	CTGGC	2	10	175946	175955	0 %	20 %	40 %	40 %	192359225
104	NC_010995	ATGGT	2	10	177885	177894	20 %	40 %	40 %	0 %	192359225
105	NC_010995	CCTGT	2	10	178634	178643	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_010995	GTGTT	2	10	178895	178904	0 %	60 %	40 %	0 %	192360063
107	NC_010995	TTGAT	2	10	179621	179630	20 %	60 %	20 %	0 %	192360063
108	NC_010995	CATCG	2	10	180046	180055	20 %	20 %	20 %	40 %	192360884
109	NC_010995	CTGGC	2	10	180209	180218	0 %	20 %	40 %	40 %	192360884
110	NC_010995	AATAA	2	10	181676	181685	80 %	20 %	0 %	0 %	192361639
111	NC_010995	CAAAG	2	10	182011	182020	60 %	0 %	20 %	20 %	192360629
112	NC_010995	ATGCC	2	10	182516	182525	20 %	20 %	20 %	40 %	192360629
113	NC_010995	GCATT	2	10	183163	183172	20 %	40 %	20 %	20 %	192360629
114	NC_010995	ATCTC	2	10	185685	185694	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_010995	GGCTT	2	10	185879	185888	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_010995	AAGCA	2	10	186289	186298	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_010995	GTTGG	2	10	187173	187182	0 %	40 %	60 %	0 %	192360782
118	NC_010995	ACACT	2	10	188813	188822	40 %	20 %	0 %	40 %	192361795
119	NC_010995	TTGAA	2	10	189089	189098	40 %	40 %	20 %	0 %	192361795
120	NC_010995	CTGCC	2	10	190457	190466	0 %	20 %	20 %	60 %	192359809
121	NC_010995	GCTGT	2	10	190894	190903	0 %	40 %	40 %	20 %	192359809
122	NC_010995	CATGC	2	10	191855	191864	20 %	20 %	20 %	40 %	192358964
123	NC_010995	AGGTC	2	10	193994	194003	20 %	20 %	40 %	20 %	192362420
124	NC_010995	GGGAT	2	10	195400	195409	20 %	20 %	60 %	0 %	192361590
125	NC_010995	GATTT	2	10	196094	196103	20 %	60 %	20 %	0 %	192360296
126	NC_010995	ATGCC	2	10	198525	198534	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_010995	CAGTC	2	10	199417	199426	20 %	20 %	20 %	40 %	192359267
128	NC_010995	GAGTA	2	10	200850	200859	40 %	20 %	40 %	0 %	192359267
129	NC_010995	GGTTC	2	10	200966	200975	0 %	40 %	40 %	20 %	192359267
130	NC_010995	TGCCG	2	10	211276	211285	0 %	20 %	40 %	40 %	192360508
131	NC_010995	GGCCT	2	10	211813	211822	0 %	20 %	40 %	40 %	192359846
132	NC_010995	AACCA	2	10	213049	213058	60 %	0 %	0 %	40 %	192360773
133	NC_010995	GGATT	2	10	213605	213614	20 %	40 %	40 %	0 %	192362153
134	NC_010995	AGGCC	2	10	214346	214355	20 %	0 %	40 %	40 %	192359080
135	NC_010995	AAATC	2	10	218658	218667	60 %	20 %	0 %	20 %	192361647
136	NC_010995	AGGCC	2	10	221168	221177	20 %	0 %	40 %	40 %	192360542
137	NC_010995	TGCAC	2	10	221305	221314	20 %	20 %	20 %	40 %	192360542
138	NC_010995	TGGCC	2	10	227184	227193	0 %	20 %	40 %	40 %	192362237
139	NC_010995	CAGGC	2	10	228767	228776	20 %	0 %	40 %	40 %	192359350
140	NC_010995	CGGTG	2	10	231879	231888	0 %	20 %	60 %	20 %	192359751
141	NC_010995	TATGG	2	10	232627	232636	20 %	40 %	40 %	0 %	192359751
142	NC_010995	GTGAT	2	10	233290	233299	20 %	40 %	40 %	0 %	192359092
143	NC_010995	AGCGT	2	10	233883	233892	20 %	20 %	40 %	20 %	192360178
144	NC_010995	AGTGA	2	10	235751	235760	40 %	20 %	40 %	0 %	192360295
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150	NC_010995	GGCGC	2	10	242620	242629	0 %	0 %	60 %	40 %	192358825
151	NC_010995	CGCTG	2	10	244442	244451	0 %	20 %	40 %	40 %	192359424
152	NC_010995	GCCAG	2	10	244804	244813	20 %	0 %	40 %	40 %	192359424
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154	NC_010995	GTCCA	2	10	246358	246367	20 %	20 %	20 %	40 %	192361978
155	NC_010995	CCGGG	2	10	246934	246943	0 %	0 %	60 %	40 %	192359842
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157	NC_010995	GGTCG	2	10	251443	251452	0 %	20 %	60 %	20 %	192361832
158	NC_010995	TTGGC	2	10	252271	252280	0 %	40 %	40 %	20 %	192361832
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161	NC_010995	CGCTG	2	10	256744	256753	0 %	20 %	40 %	40 %	192359697
162	NC_010995	TGGCA	2	10	257289	257298	20 %	20 %	40 %	20 %	192359697
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165	NC_010995	CCACT	2	10	260863	260872	20 %	20 %	0 %	60 %	192361004
166	NC_010995	GTGAA	2	10	261038	261047	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
167	NC_010995	TTTCC	2	10	261912	261921	0 %	60 %	0 %	40 %	192359927
168	NC_010995	GCCAG	2	10	263835	263844	20 %	0 %	40 %	40 %	192358797
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172	NC_010995	GTTTT	2	10	268192	268201	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_010995	GCTTG	2	10	271559	271568	0 %	40 %	40 %	20 %	192359354
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176	NC_010995	CGATC	2	10	271862	271871	20 %	20 %	20 %	40 %	192359354
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196	NC_010995	GAATG	2	10	314104	314113	40 %	20 %	40 %	0 %	192359740
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200	NC_010995	AGCTT	2	10	318542	318551	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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202	NC_010995	AGCGA	2	10	321758	321767	40 %	0 %	40 %	20 %	192361459
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204	NC_010995	AACAT	2	10	323408	323417	60 %	20 %	0 %	20 %	192359836
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226	NC_010995	GCTGC	2	10	360246	360255	0 %	20 %	40 %	40 %	192359512
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235	NC_010995	AGACT	2	10	378155	378164	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
236	NC_010995	GTTGT	2	10	379395	379404	0 %	60 %	40 %	0 %	192362354
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249	NC_010995	CCGAT	2	10	402773	402782	20 %	20 %	20 %	40 %	192360046
250	NC_010995	GCACT	2	10	403414	403423	20 %	20 %	20 %	40 %	192360855
251	NC_010995	GCAGG	2	10	403552	403561	20 %	0 %	60 %	20 %	192360855
252	NC_010995	ACGCC	2	10	403708	403717	20 %	0 %	20 %	60 %	192360855
253	NC_010995	CCAAC	2	10	407409	407418	40 %	0 %	0 %	60 %	192361535
254	NC_010995	GCCCA	2	10	408163	408172	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
255	NC_010995	AATAA	2	10	408487	408496	80 %	20 %	0 %	0 %	192359819
256	NC_010995	AATAA	2	10	413374	413383	80 %	20 %	0 %	0 %	192359945
257	NC_010995	CGTTG	2	10	415305	415314	0 %	40 %	40 %	20 %	192362388
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259	NC_010995	CGTTG	2	10	417858	417867	0 %	40 %	40 %	20 %	192359448
260	NC_010995	GCGCA	2	10	421812	421821	20 %	0 %	40 %	40 %	192359448
261	NC_010995	GCATC	2	10	422627	422636	20 %	20 %	20 %	40 %	192359448
262	NC_010995	TGCTC	2	10	422642	422651	0 %	40 %	20 %	40 %	192359448
263	NC_010995	GATGT	2	10	425878	425887	20 %	40 %	40 %	0 %	192359448
264	NC_010995	TGTGC	2	10	426823	426832	0 %	40 %	40 %	20 %	192359448
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266	NC_010995	GATGG	2	10	427960	427969	20 %	20 %	60 %	0 %	192359448
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