MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cellvibrio japonicus Ueda107 chromosome

Total Repeats: 319

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010995	AGAGA	2	10	10129	10138	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010995	ATTGC	2	10	13999	14008	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_010995	ATTTT	2	10	39355	39364	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010995	ATCTG	2	10	104451	104460	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_010995	CCTGT	2	10	178634	178643	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_010995	ATCTC	2	10	185685	185694	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_010995	GGCTT	2	10	185879	185888	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_010995	AAGCA	2	10	186289	186298	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010995	ATGCC	2	10	198525	198534	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_010995	GTGAA	2	10	261038	261047	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010995	GGCCG	2	10	265872	265881	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_010995	GTTTT	2	10	268192	268201	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010995	CTTTT	2	10	278372	278381	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010995	CAGCC	2	10	317947	317956	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_010995	AGCTT	2	10	318542	318551	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010995	GTTGT	2	10	318949	318958	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010995	TTTTA	2	10	323162	323171	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010995	CCAAA	2	10	351233	351242	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_010995	TTTAA	2	10	354514	354523	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010995	GGCCC	2	10	358731	358740	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_010995	AGACT	2	10	378155	378164	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010995	GCCCA	2	10	408163	408172	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_010995	CGGTG	2	10	478844	478853	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_010995	GATTG	2	10	479480	479489	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010995	TGGCC	2	10	482118	482127	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_010995	CTTTT	2	10	539431	539440	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_010995	CACTG	2	10	547245	547254	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_010995	CTTTT	2	10	551134	551143	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_010995	GGGCG	2	10	570869	570878	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010995	GCCGG	2	10	573894	573903	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
31	NC_010995	TTTTG	2	10	581720	581729	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010995	CCGGG	2	10	586875	586884	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_010995	TGTGT	2	10	634396	634405	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010995	TTGAG	2	10	642006	642015	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010995	GTTTT	2	10	644746	644755	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010995	TTGTG	2	10	660635	660644	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010995	GATAG	2	10	674409	674418	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010995	GCCAT	2	10	675025	675034	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_010995	CACAG	2	10	677829	677838	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_010995	ATAAA	2	10	678099	678108	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010995	GCCGG	2	10	701586	701595	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42	NC_010995	AAATT	2	10	728185	728194	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010995	CCCTT	2	10	728245	728254	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
44	NC_010995	AAACC	2	10	728585	728594	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_010995	GTGCT	2	10	759883	759892	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_010995	AAAAG	2	10	767303	767312	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010995	AAAAG	2	10	780548	780557	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010995	TCGTG	2	10	808103	808112	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_010995	AGTCG	2	10	810379	810388	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_010995	AGGCG	2	10	810625	810634	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_010995	TGAAG	2	10	811403	811412	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010995	ATCCC	2	10	812375	812384	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
53	NC_010995	TACCT	2	10	854308	854317	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_010995	ATCAA	2	10	872190	872199	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_010995	TCTGT	2	10	880978	880987	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_010995	AATTA	2	10	909973	909982	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010995	GAAGG	2	10	914468	914477	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010995	CTTTC	2	10	914569	914578	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_010995	CGGAT	2	10	921893	921902	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010995	TAATA	2	10	938733	938742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010995	CTCTC	2	10	951965	951974	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_010995	CTTTT	2	10	954952	954961	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010995	AATTT	2	10	955374	955383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010995	AGCGT	2	10	958292	958301	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_010995	TACCG	2	10	959349	959358	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_010995	GAATT	2	10	959582	959591	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010995	TGGCA	2	10	990629	990638	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_010995	GCACT	2	10	1000353	1000362	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_010995	GGGGA	2	10	1014999	1015008	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010995	AAAAG	2	10	1040150	1040159	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010995	TCGTG	2	10	1055159	1055168	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_010995	AGTCG	2	10	1057435	1057444	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_010995	AGGCG	2	10	1057681	1057690	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_010995	TGAAG	2	10	1058459	1058468	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010995	ATCCC	2	10	1059431	1059440	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
76	NC_010995	TCGTG	2	10	1060987	1060996	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_010995	AGTCG	2	10	1063134	1063143	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_010995	AGGCG	2	10	1063380	1063389	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_010995	TGAAG	2	10	1064158	1064167	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010995	ATCCC	2	10	1065130	1065139	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
81	NC_010995	ACGGA	2	10	1131394	1131403	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_010995	TTTAT	2	10	1149411	1149420	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010995	TTGGT	2	10	1150541	1150550	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010995	TTTGT	2	10	1151819	1151828	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010995	TAAAT	2	10	1152346	1152355	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010995	AGGTA	2	10	1152398	1152407	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010995	TGGTT	2	10	1153040	1153049	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010995	TTGCC	2	10	1278536	1278545	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_010995	GGCGG	2	10	1280769	1280778	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
90	NC_010995	GCAGC	2	10	1321081	1321090	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_010995	CTCGC	2	10	1345313	1345322	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
92	NC_010995	GGTGT	2	10	1357401	1357410	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010995	ATCTG	2	10	1393372	1393381	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_010995	ATTAA	2	10	1430821	1430830	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010995	AAAGC	2	10	1432045	1432054	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_010995	ATTAA	2	10	1432108	1432117	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010995	CTAGA	2	10	1432178	1432187	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010995	TACCG	2	10	1439678	1439687	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_010995	CAAAA	2	10	1461188	1461197	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_010995	TGATG	2	10	1482103	1482112	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010995	TATTT	2	10	1487107	1487116	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010995	GGGGT	2	10	1489612	1489621	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010995	GCCTG	2	10	1490648	1490657	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_010995	AAATA	2	10	1506896	1506905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010995	GGTTG	2	10	1506934	1506943	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010995	GGTTG	2	10	1513955	1513964	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010995	CCTGG	2	10	1517946	1517955	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_010995	TGGAT	2	10	1526430	1526439	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010995	TGTCG	2	10	1527371	1527380	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_010995	TTTTA	2	10	1550690	1550699	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010995	CGGCG	2	10	1552728	1552737	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
112	NC_010995	CTGCT	2	10	1586751	1586760	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_010995	GCCGC	2	10	1603947	1603956	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
114	NC_010995	GCATG	2	10	1605687	1605696	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010995	TCGGT	2	10	1608040	1608049	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_010995	TAAGG	2	10	1635926	1635935	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010995	GTGAT	2	10	1645873	1645882	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010995	GGTAT	2	10	1652484	1652493	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010995	TGAAT	2	10	1657792	1657801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010995	AAAAC	2	10	1664441	1664450	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_010995	GTTTT	2	10	1664465	1664474	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010995	ACAAT	2	10	1711299	1711308	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_010995	ATTTG	2	10	1728845	1728854	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010995	TCTTT	2	10	1737199	1737208	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_010995	GGGTT	2	10	1749043	1749052	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010995	GCGAT	2	10	1766363	1766372	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_010995	GGGCA	2	10	1774296	1774305	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_010995	ATCTG	2	10	1793037	1793046	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_010995	GCCGA	2	10	1806505	1806514	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_010995	TTGGT	2	10	1816748	1816757	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010995	TTGTG	2	10	1817367	1817376	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010995	AGTGT	2	10	1826392	1826401	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010995	ATTTT	2	10	1839505	1839514	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010995	CAATG	2	10	1854095	1854104	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_010995	AAGGT	2	10	1855522	1855531	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010995	CCTTG	2	10	1888165	1888174	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_010995	GATTG	2	10	1904416	1904425	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010995	CAAAG	2	10	1919635	1919644	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010995	CTAAA	2	10	1923163	1923172	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_010995	ACAAA	2	10	1930404	1930413	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_010995	TCAAA	2	10	1955341	1955350	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_010995	AAAAG	2	10	1962890	1962899	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010995	CATGA	2	10	1999947	1999956	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_010995	GTTTT	2	10	2006232	2006241	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_010995	GAAAA	2	10	4064053	4064062	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
284	NC_010995	CGGCG	2	10	4064094	4064103	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
285	NC_010995	CAGCA	2	10	4064258	4064267	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
286	NC_010995	AAAAT	2	10	4078127	4078136	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_010995	CCATG	2	10	4108243	4108252	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
288	NC_010995	GCCTC	2	10	4113626	4113635	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
289	NC_010995	GCTGC	2	10	4114054	4114063	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
290	NC_010995	AAAAC	2	10	4147761	4147770	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
291	NC_010995	TAACA	2	10	4155665	4155674	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
292	NC_010995	CTTTC	2	10	4166887	4166896	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
293	NC_010995	GGAAA	2	10	4171561	4171570	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
294	NC_010995	GCTAT	2	10	4194630	4194639	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
295	NC_010995	TTTGT	2	10	4198035	4198044	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
296	NC_010995	AGCCC	2	10	4204412	4204421	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
297	NC_010995	GCACA	2	10	4221349	4221358	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
298	NC_010995	AAAAT	2	10	4271104	4271113	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_010995	GGGGA	2	10	4275778	4275787	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
300	NC_010995	TGTGC	2	10	4373588	4373597	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
301	NC_010995	AACCA	2	10	4394896	4394905	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
302	NC_010995	CCTGG	2	10	4414480	4414489	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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304	NC_010995	TGGTT	2	10	4416660	4416669	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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306	NC_010995	CCCAG	2	10	4417606	4417615	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
307	NC_010995	CAGCA	2	10	4417635	4417644	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
308	NC_010995	TACCC	2	10	4419865	4419874	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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310	NC_010995	AGGTT	2	10	4466591	4466600	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
311	NC_010995	CCTGA	2	10	4480725	4480734	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
312	NC_010995	TTGTT	2	10	4488010	4488019	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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314	NC_010995	AACCT	2	10	4490728	4490737	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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316	NC_010995	AGCTA	2	10	4531215	4531224	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
317	NC_010995	GACCC	2	10	4532794	4532803	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
318	NC_010995	CGAAA	2	10	4554493	4554502	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
319	NC_010995	GAAAT	2	10	4571590	4571599	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.