MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 chromosome

Total Repeats: 3317

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010994	CGTCG	2	10	793	802	0 %	20 %	40 %	40 %	190889641
2	NC_010994	GGGCA	2	10	1815	1824	20 %	0 %	60 %	20 %	190889642
3	NC_010994	GGCGC	2	10	3744	3753	0 %	0 %	60 %	40 %	190889645
4	NC_010994	CAGAA	2	10	4201	4210	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_010994	GATCG	2	10	4295	4304	20 %	20 %	40 %	20 %	190889646
6	NC_010994	CGATA	2	10	5429	5438	40 %	20 %	20 %	20 %	190889648
7	NC_010994	GCTCC	2	10	5500	5509	0 %	20 %	20 %	60 %	190889648
8	NC_010994	CCGAG	2	10	6822	6831	20 %	0 %	40 %	40 %	190889649
9	NC_010994	GCCCG	2	10	7130	7139	0 %	0 %	40 %	60 %	190889649
10	NC_010994	ATGAG	2	10	8784	8793	40 %	20 %	40 %	0 %	190889652
11	NC_010994	AGCCG	2	10	12084	12093	20 %	0 %	40 %	40 %	190889655
12	NC_010994	CGGGC	2	10	12317	12326	0 %	0 %	60 %	40 %	190889655
13	NC_010994	TGAAT	2	10	14046	14055	40 %	40 %	20 %	0 %	190889657
14	NC_010994	CGCGC	2	10	15213	15222	0 %	0 %	40 %	60 %	190889657
15	NC_010994	CGGCA	2	10	16717	16726	20 %	0 %	40 %	40 %	190889659
16	NC_010994	TCGTT	2	10	17576	17585	0 %	60 %	20 %	20 %	190889661
17	NC_010994	TCCGA	2	10	18891	18900	20 %	20 %	20 %	40 %	190889662
18	NC_010994	GGCGA	2	10	20025	20034	20 %	0 %	60 %	20 %	190889663
19	NC_010994	ATGGT	2	10	20371	20380	20 %	40 %	40 %	0 %	190889663
20	NC_010994	GGCCG	2	10	21430	21439	0 %	0 %	60 %	40 %	190889664
21	NC_010994	GCGAT	2	10	21685	21694	20 %	20 %	40 %	20 %	190889664
22	NC_010994	GGTGC	2	10	22329	22338	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010994	GCTCC	2	10	23075	23084	0 %	20 %	20 %	60 %	190889666
24	NC_010994	GATCG	2	10	26676	26685	20 %	20 %	40 %	20 %	190889667
25	NC_010994	GCGCC	2	10	26857	26866	0 %	0 %	40 %	60 %	190889667
26	NC_010994	TGCGC	2	10	27395	27404	0 %	20 %	40 %	40 %	190889667
27	NC_010994	GCGTT	2	10	27688	27697	0 %	40 %	40 %	20 %	190889667
28	NC_010994	GAACC	2	10	28370	28379	40 %	0 %	20 %	40 %	190889667
29	NC_010994	GCCGG	2	10	28463	28472	0 %	0 %	60 %	40 %	190889667
30	NC_010994	GGCAA	2	10	31255	31264	40 %	0 %	40 %	20 %	190889669
31	NC_010994	CGTCA	2	10	31440	31449	20 %	20 %	20 %	40 %	190889670
32	NC_010994	TCGTG	2	10	32975	32984	0 %	40 %	40 %	20 %	190889670
33	NC_010994	GATCG	2	10	34697	34706	20 %	20 %	40 %	20 %	190889671
34	NC_010994	GCTGA	2	10	34934	34943	20 %	20 %	40 %	20 %	190889671
35	NC_010994	ATCGC	2	10	34989	34998	20 %	20 %	20 %	40 %	190889671
36	NC_010994	GCAAT	2	10	37860	37869	40 %	20 %	20 %	20 %	190889675
37	NC_010994	GCGTC	2	10	38752	38761	0 %	20 %	40 %	40 %	190889675
38	NC_010994	CGCGC	2	10	38955	38964	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_010994	GCAGC	2	10	40105	40114	20 %	0 %	40 %	40 %	190889678
40	NC_010994	AGCCG	2	10	40898	40907	20 %	0 %	40 %	40 %	190889678
41	NC_010994	CCGTG	2	10	42301	42310	0 %	20 %	40 %	40 %	190889680
42	NC_010994	CGCGC	2	10	44453	44462	0 %	0 %	40 %	60 %	190889683
43	NC_010994	CGACA	2	10	44774	44783	40 %	0 %	20 %	40 %	190889683
44	NC_010994	GATCA	2	10	46168	46177	40 %	20 %	20 %	20 %	190889685
45	NC_010994	TCGTC	2	10	47964	47973	0 %	40 %	20 %	40 %	190889689
46	NC_010994	GACAA	2	10	49017	49026	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_010994	TGCGC	2	10	49193	49202	0 %	20 %	40 %	40 %	190889691
48	NC_010994	GTTTT	2	10	50511	50520	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010994	CCCTG	2	10	51726	51735	0 %	20 %	20 %	60 %	190889693
50	NC_010994	CACGG	2	10	52423	52432	20 %	0 %	40 %	40 %	190889693
51	NC_010994	CGGCC	2	10	54221	54230	0 %	0 %	40 %	60 %	190889694
52	NC_010994	CGTGC	2	10	55474	55483	0 %	20 %	40 %	40 %	190889695
53	NC_010994	GCGCC	2	10	56351	56360	0 %	0 %	40 %	60 %	190889696
54	NC_010994	TTCTG	2	10	57278	57287	0 %	60 %	20 %	20 %	190889697
55	NC_010994	GCTCC	2	10	59563	59572	0 %	20 %	20 %	60 %	190889699
56	NC_010994	ACGCC	2	10	61099	61108	20 %	0 %	20 %	60 %	190889699
57	NC_010994	GCGCC	2	10	61218	61227	0 %	0 %	40 %	60 %	190889700
58	NC_010994	GCTCT	2	10	61299	61308	0 %	40 %	20 %	40 %	190889700
59	NC_010994	GCTTG	2	10	61438	61447	0 %	40 %	40 %	20 %	190889700
60	NC_010994	CGCGC	2	10	61547	61556	0 %	0 %	40 %	60 %	190889700
61	NC_010994	TCGTG	2	10	63766	63775	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_010994	GGGCT	2	10	63911	63920	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010994	GAAGA	2	10	64878	64887	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010994	AGCGG	2	10	66922	66931	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_010994	AGAGG	2	10	67197	67206	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010994	CCTGG	2	10	68894	68903	0 %	20 %	40 %	40 %	190889701
67	NC_010994	GATGG	2	10	71166	71175	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010994	ACCGC	2	10	71215	71224	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
69	NC_010994	CGATG	2	10	71419	71428	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_010994	GACGC	2	10	72222	72231	20 %	0 %	40 %	40 %	190889702
71	NC_010994	CGATG	2	10	72393	72402	20 %	20 %	40 %	20 %	190889702
72	NC_010994	GAGAT	2	10	74056	74065	40 %	20 %	40 %	0 %	190889702
73	NC_010994	GCGAG	2	10	74303	74312	20 %	0 %	60 %	20 %	190889702
74	NC_010994	GACGA	2	10	74646	74655	40 %	0 %	40 %	20 %	190889702
75	NC_010994	TTGAG	2	10	74859	74868	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010994	ACATT	2	10	74944	74953	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_010994	GCTGC	2	10	76394	76403	0 %	20 %	40 %	40 %	190889704
78	NC_010994	AGCGC	2	10	77312	77321	20 %	0 %	40 %	40 %	190889705
79	NC_010994	GGGAC	2	10	80658	80667	20 %	0 %	60 %	20 %	190889707
80	NC_010994	CCTCT	2	10	82292	82301	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
81	NC_010994	AGGCC	2	10	83544	83553	20 %	0 %	40 %	40 %	190889710
82	NC_010994	TCGAT	2	10	86055	86064	20 %	40 %	20 %	20 %	190889712
83	NC_010994	CGGCC	2	10	86235	86244	0 %	0 %	40 %	60 %	190889712
84	NC_010994	GCCCA	2	10	86405	86414	20 %	0 %	20 %	60 %	190889712
85	NC_010994	TGCCG	2	10	86964	86973	0 %	20 %	40 %	40 %	190889713
86	NC_010994	AGCGC	2	10	93277	93286	20 %	0 %	40 %	40 %	190889719
87	NC_010994	CGGCG	2	10	93544	93553	0 %	0 %	60 %	40 %	190889719
88	NC_010994	ATGCG	2	10	94538	94547	20 %	20 %	40 %	20 %	190889720
89	NC_010994	TGCCG	2	10	96882	96891	0 %	20 %	40 %	40 %	190889722
90	NC_010994	AGGAT	2	10	98690	98699	40 %	20 %	40 %	0 %	190889724
91	NC_010994	GGCCA	2	10	100003	100012	20 %	0 %	40 %	40 %	190889725
92	NC_010994	CCAAT	2	10	100361	100370	40 %	20 %	0 %	40 %	190889725
93	NC_010994	TGGCC	2	10	100775	100784	0 %	20 %	40 %	40 %	190889725
94	NC_010994	TGACC	2	10	101157	101166	20 %	20 %	20 %	40 %	190889725
95	NC_010994	CGTCA	2	10	104485	104494	20 %	20 %	20 %	40 %	190889727
96	NC_010994	GCCCG	2	10	107363	107372	0 %	0 %	40 %	60 %	190889730
97	NC_010994	GCCGC	2	10	109592	109601	0 %	0 %	40 %	60 %	190889732
98	NC_010994	CGCTC	2	10	111107	111116	0 %	20 %	20 %	60 %	190889733
99	NC_010994	CGAAC	2	10	112085	112094	40 %	0 %	20 %	40 %	190889734
100	NC_010994	GCCAT	2	10	113029	113038	20 %	20 %	20 %	40 %	190889734
101	NC_010994	GCATG	2	10	115436	115445	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_010994	TCGGC	2	10	115501	115510	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_010994	TGACG	2	10	115524	115533	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_010994	GCACG	2	10	116506	116515	20 %	0 %	40 %	40 %	190889738
105	NC_010994	CCGGT	2	10	117278	117287	0 %	20 %	40 %	40 %	190889738
106	NC_010994	TCCCA	2	10	118037	118046	20 %	20 %	0 %	60 %	190889739
107	NC_010994	ACGGG	2	10	120202	120211	20 %	0 %	60 %	20 %	190889741
108	NC_010994	AGCCG	2	10	121915	121924	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_010994	AGGGC	2	10	123728	123737	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_010994	TCGTG	2	10	125750	125759	0 %	40 %	40 %	20 %	190889746
111	NC_010994	AGCGC	2	10	125915	125924	20 %	0 %	40 %	40 %	190889746
112	NC_010994	CGCAG	2	10	130145	130154	20 %	0 %	40 %	40 %	190889751
113	NC_010994	CCAGC	2	10	130951	130960	20 %	0 %	20 %	60 %	190889752
114	NC_010994	AACCG	2	10	131371	131380	40 %	0 %	20 %	40 %	190889752
115	NC_010994	GAAGA	2	10	132422	132431	60 %	0 %	40 %	0 %	190889753
116	NC_010994	TCGCC	2	10	133765	133774	0 %	20 %	20 %	60 %	190889753
117	NC_010994	TGCAA	2	10	134254	134263	40 %	20 %	20 %	20 %	190889754
118	NC_010994	AGCGA	2	10	134296	134305	40 %	0 %	40 %	20 %	190889754
119	NC_010994	GCGCT	2	10	134572	134581	0 %	20 %	40 %	40 %	190889754
120	NC_010994	GAACA	2	10	134782	134791	60 %	0 %	20 %	20 %	190889754
121	NC_010994	GATCG	2	10	134926	134935	20 %	20 %	40 %	20 %	190889754
122	NC_010994	CATGA	2	10	134938	134947	40 %	20 %	20 %	20 %	190889754
123	NC_010994	TGGCG	2	10	136152	136161	0 %	20 %	60 %	20 %	190889754
124	NC_010994	GCGAT	2	10	136883	136892	20 %	20 %	40 %	20 %	190889755
125	NC_010994	TGAGC	2	10	137848	137857	20 %	20 %	40 %	20 %	190889756
126	NC_010994	CGTCT	2	10	138045	138054	0 %	40 %	20 %	40 %	190889756
127	NC_010994	CCGGC	2	10	139247	139256	0 %	0 %	40 %	60 %	190889757
128	NC_010994	TGCTG	2	10	139274	139283	0 %	40 %	40 %	20 %	190889757
129	NC_010994	CGAGC	2	10	142727	142736	20 %	0 %	40 %	40 %	190889760
130	NC_010994	GTCAT	2	10	143094	143103	20 %	40 %	20 %	20 %	190889761
131	NC_010994	CAGGC	2	10	146029	146038	20 %	0 %	40 %	40 %	190889764
132	NC_010994	ATCCT	2	10	148906	148915	20 %	40 %	0 %	40 %	190889766
133	NC_010994	CGAAC	2	10	150228	150237	40 %	0 %	20 %	40 %	190889768
134	NC_010994	CGCGG	2	10	150740	150749	0 %	0 %	60 %	40 %	190889768
135	NC_010994	CTCCC	2	10	150945	150954	0 %	20 %	0 %	80 %	190889768
136	NC_010994	GTGCG	2	10	152403	152412	0 %	20 %	60 %	20 %	190889769
137	NC_010994	TTTGC	2	10	153124	153133	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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268	NC_010994	TCGAC	2	10	339740	339749	20 %	20 %	20 %	40 %	190889961
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281	NC_010994	GCATT	2	10	356268	356277	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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384	NC_010994	CCATT	2	10	512703	512712	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
385	NC_010994	GCTTG	2	10	513641	513650	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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390	NC_010994	GGTTG	2	10	515568	515577	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
391	NC_010994	ATGGC	2	10	515578	515587	20 %	20 %	40 %	20 %	190890147
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394	NC_010994	CTGTC	2	10	519278	519287	0 %	40 %	20 %	40 %	190890152
395	NC_010994	GCAGA	2	10	519896	519905	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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