MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 chromosome

Total Repeats: 1717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010994	GCTC	2	8	4785	4792	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010994	GCCA	2	8	5356	5363	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010994	GGAC	2	8	11851	11858	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010994	ATCG	2	8	11920	11927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010994	CGAA	2	8	21895	21902	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010994	CCGG	2	8	49059	49066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010994	ACGG	2	8	50584	50591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010994	TGAA	2	8	53040	53047	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010994	AGCG	2	8	62145	62152	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010994	TTCC	2	8	62227	62234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010994	AAGC	2	8	62300	62307	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010994	GGTT	2	8	62383	62390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010994	CACT	2	8	62400	62407	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010994	GAAC	2	8	62783	62790	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010994	GTGA	2	8	63126	63133	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010994	GATC	2	8	63285	63292	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010994	TCTT	2	8	64399	64406	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010994	TTTG	2	8	64661	64668	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010994	ATGG	2	8	64956	64963	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010994	GCCG	2	8	64968	64975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010994	AGGT	2	8	64995	65002	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010994	GTGA	2	8	65579	65586	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010994	GCGA	2	8	65722	65729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010994	CAAG	2	8	66056	66063	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010994	CGTC	2	8	66421	66428	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010994	AAAG	2	8	66544	66551	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010994	CAAA	2	8	68777	68784	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010994	CGAG	2	8	68826	68833	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010994	CCAT	2	8	69247	69254	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010994	GCTC	2	8	69413	69420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010994	CCAT	2	8	70083	70090	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010994	CGGC	2	8	70285	70292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010994	AAGC	2	8	71136	71143	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010994	AAGA	2	8	71181	71188	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010994	TCCT	2	8	75074	75081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010994	CAGC	2	8	76479	76486	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010994	GCAA	2	8	93182	93189	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010994	CATT	2	8	102125	102132	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010994	CTGC	2	8	102184	102191	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010994	GGTT	2	8	113765	113772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010994	ATCC	2	8	114547	114554	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010994	CCAT	2	8	117836	117843	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010994	GACG	2	8	121540	121547	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010994	AGGG	2	8	122168	122175	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010994	AGGC	2	8	127537	127544	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010994	CCCT	2	8	131864	131871	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_010994	CAAT	2	8	136602	136609	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010994	GCCT	2	8	137730	137737	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010994	ACGA	2	8	147517	147524	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010994	CGAG	2	8	153086	153093	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010994	ATCT	2	8	153153	153160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010994	AGGA	2	8	154061	154068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010994	ATGA	2	8	156801	156808	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010994	CTTG	2	8	156815	156822	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010994	CATC	2	8	156859	156866	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010994	ATTC	2	8	160720	160727	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010994	AAGC	2	8	179424	179431	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010994	CCGG	2	8	179618	179625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010994	TTCA	2	8	182244	182251	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010994	GAGG	2	8	186188	186195	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010994	GAGG	2	8	186209	186216	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010994	TTTG	2	8	188213	188220	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010994	AGCC	2	8	188306	188313	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010994	AAGC	2	8	196340	196347	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010994	GTCC	2	8	199664	199671	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010994	GGAA	2	8	209087	209094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010994	CCTT	2	8	209103	209110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010994	TGAG	2	8	209144	209151	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010994	TGTT	2	8	215869	215876	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010994	CGTC	2	8	215880	215887	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010994	ATGA	2	8	230088	230095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010994	GGGC	2	8	236979	236986	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010994	CTGG	2	8	246384	246391	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010994	CCGG	2	8	246457	246464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010994	CCAA	2	8	246471	246478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010994	ATCT	2	8	246985	246992	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010994	AGGG	2	8	247814	247821	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010994	CCGT	2	8	248019	248026	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010994	TCCT	2	8	257393	257400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010994	AAGG	2	8	257533	257540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010994	TTCT	2	8	258191	258198	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010994	TTTC	2	8	258207	258214	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010994	CTGC	2	8	261838	261845	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010994	TGAA	2	8	262394	262401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010994	AGAA	2	8	268033	268040	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010994	GGAA	2	8	270541	270548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010994	CGGG	2	8	271608	271615	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010994	GCTC	2	8	271635	271642	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010994	GCCG	2	8	274797	274804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010994	CGTT	2	8	279477	279484	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010994	CACC	2	8	279489	279496	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_010994	TGAA	2	8	279546	279553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010994	TCAA	2	8	281350	281357	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_010994	CGGG	2	8	282760	282767	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010994	GAAA	2	8	283024	283031	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010994	GGCA	2	8	286179	286186	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010994	TCAT	2	8	287197	287204	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010994	TTGC	2	8	292974	292981	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010994	ATCG	2	8	299797	299804	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010994	TTGC	2	8	299842	299849	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010994	GTGC	2	8	306435	306442	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_010994	GATC	2	8	306621	306628	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010994	CGGA	2	8	306966	306973	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010994	CAAC	2	8	307396	307403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010994	CAGC	2	8	307449	307456	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010994	TCTT	2	8	311555	311562	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010994	CCGA	2	8	315628	315635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_010994	TTTG	2	8	316750	316757	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010994	GATC	2	8	316782	316789	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010994	AGTG	2	8	320444	320451	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010994	TGCC	2	8	325488	325495	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_010994	AGAA	2	8	325580	325587	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010994	GTCT	2	8	335527	335534	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010994	CGGC	2	8	338570	338577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_010994	GGCC	2	8	338590	338597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_010994	CAAA	2	8	339228	339235	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010994	GAGG	2	8	348573	348580	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010994	TGCC	2	8	350204	350211	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_010994	CCGA	2	8	355429	355436	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_010994	TGGC	2	8	361373	361380	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010994	TTGA	2	8	364690	364697	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010994	GCGG	2	8	365839	365846	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010994	CAAT	2	8	370109	370116	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_010994	TGCC	2	8	370151	370158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010994	GCGG	2	8	376238	376245	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010994	CCTT	2	8	386605	386612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010994	GTTT	2	8	387728	387735	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010994	TTCG	2	8	390105	390112	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010994	GCCG	2	8	398747	398754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_010994	GCCC	2	8	404819	404826	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_010994	TTTC	2	8	405444	405451	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_010994	GGGC	2	8	405534	405541	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010994	TTTG	2	8	413160	413167	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010994	CAAG	2	8	415062	415069	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_010994	GGCG	2	8	415072	415079	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010994	CTTG	2	8	416673	416680	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010994	ATCC	2	8	419410	419417	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_010994	CAGT	2	8	419433	419440	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_010994	TCCG	2	8	428063	428070	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010994	CGAA	2	8	428093	428100	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010994	GTCG	2	8	441663	441670	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010994	CGTC	2	8	454730	454737	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_010994	CTTG	2	8	457505	457512	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010994	TGAA	2	8	461321	461328	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010994	TCCC	2	8	463788	463795	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_010994	CGCC	2	8	465371	465378	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_010994	CTGC	2	8	473928	473935	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010994	GGAT	2	8	478815	478822	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010994	GCCG	2	8	481395	481402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_010994	GGCA	2	8	483433	483440	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_010994	CCTG	2	8	483919	483926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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449	NC_010994	AGCC	2	8	1251790	1251797	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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457	NC_010994	TGCA	2	8	1261400	1261407	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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471	NC_010994	TTGA	2	8	1295791	1295798	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_010994	TCGA	2	8	1313585	1313592	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_010994	GCTT	2	8	1323782	1323789	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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486	NC_010994	GCGA	2	8	1333087	1333094	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
487	NC_010994	CGGG	2	8	1333350	1333357	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
488	NC_010994	AGAA	2	8	1340117	1340124	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
489	NC_010994	TCGA	2	8	1341452	1341459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
490	NC_010994	GCTT	2	8	1343777	1343784	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
491	NC_010994	TTGA	2	8	1343910	1343917	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
492	NC_010994	TTAT	2	8	1345057	1345064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_010994	GCGG	2	8	1345312	1345319	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
494	NC_010994	CGCA	2	8	1345377	1345384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
495	NC_010994	GGCT	2	8	1345734	1345741	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
496	NC_010994	CAGG	2	8	1347275	1347282	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
497	NC_010994	CCTA	2	8	1350479	1350486	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
498	NC_010994	GCCG	2	8	1370545	1370552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
499	NC_010994	TTCC	2	8	1370554	1370561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
500	NC_010994	CGCT	2	8	1375878	1375885	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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