MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 chromosome

Total Repeats: 79684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010994	CTT	2	6	76	81	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010994	GAA	2	6	231	236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190889640
3	NC_010994	TCC	2	6	338	343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190889640
4	NC_010994	GGC	2	6	389	394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889640
5	NC_010994	CGC	2	6	421	426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889640
6	NC_010994	CAT	2	6	437	442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889640
7	NC_010994	CCG	2	6	541	546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889641
8	NC_010994	GCT	2	6	623	628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889641
9	NC_010994	CGA	2	6	647	652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889641
10	NC_010994	CGA	2	6	707	712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889641
11	NC_010994	TGA	2	6	823	828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889641
12	NC_010994	ACG	2	6	877	882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889641
13	NC_010994	GTC	2	6	918	923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889641
14	NC_010994	ATC	2	6	924	929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889641
15	NC_010994	CTT	2	6	1035	1040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190889641
16	NC_010994	CCA	2	6	1075	1080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190889641
17	NC_010994	CGC	2	6	1160	1165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889641
18	NC_010994	GAG	2	6	1173	1178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190889641
19	NC_010994	CGC	2	6	1236	1241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889641
20	NC_010994	CCG	2	6	1255	1260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889641
21	NC_010994	GAG	2	6	1320	1325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010994	ACA	3	9	1332	1340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190889642
23	NC_010994	ATC	2	6	1341	1346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889642
24	NC_010994	TCG	2	6	1353	1358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889642
25	NC_010994	CGG	2	6	1368	1373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889642
26	NC_010994	GCC	2	6	1519	1524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889642
27	NC_010994	GCG	2	6	1611	1616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889642
28	NC_010994	CAA	2	6	1676	1681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190889642
29	NC_010994	CGT	2	6	1685	1690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889642
30	NC_010994	CGG	2	6	1738	1743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889642
31	NC_010994	GAA	2	6	1892	1897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190889642
32	NC_010994	CGG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889643
33	NC_010994	CGG	2	6	2331	2336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889643
34	NC_010994	CAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889643
35	NC_010994	CGT	2	6	2391	2396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889643
36	NC_010994	TGA	2	6	2483	2488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889643
37	NC_010994	GGC	2	6	2538	2543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889643
38	NC_010994	CGT	2	6	2580	2585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889643
39	NC_010994	CGC	2	6	2615	2620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889643
40	NC_010994	TCG	2	6	2654	2659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889643
41	NC_010994	TGC	3	9	2672	2680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889643
42	NC_010994	CGT	2	6	2724	2729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889643
43	NC_010994	CGC	2	6	2733	2738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889643
44	NC_010994	TCA	2	6	2750	2755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889643
45	NC_010994	GCC	2	6	2922	2927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889644
46	NC_010994	GCC	2	6	2974	2979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889644
47	NC_010994	CCG	2	6	2995	3000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889644
48	NC_010994	CGC	2	6	3074	3079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889644
49	NC_010994	GCT	2	6	3110	3115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889644
50	NC_010994	TCG	3	9	3151	3159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889644
51	NC_010994	ACC	2	6	3409	3414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190889645
52	NC_010994	CAT	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889645
53	NC_010994	CGG	2	6	3450	3455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889645
54	NC_010994	CGA	2	6	3561	3566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889645
55	NC_010994	AGA	2	6	3603	3608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190889645
56	NC_010994	CTT	2	6	3618	3623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190889645
57	NC_010994	TCA	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889645
58	NC_010994	GCC	2	6	3702	3707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889645
59	NC_010994	GGT	2	6	3723	3728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190889645
60	NC_010994	CTG	2	6	3853	3858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889645
61	NC_010994	CGG	2	6	3882	3887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889645
62	NC_010994	GAT	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889645
63	NC_010994	GCG	2	6	4042	4047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889645
64	NC_010994	CCG	2	6	4096	4101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889645
65	NC_010994	CGC	2	6	4123	4128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_010994	TCT	2	6	4141	4146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010994	ATC	2	6	4305	4310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889646
68	NC_010994	GCG	2	6	4312	4317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889646
69	NC_010994	GCC	2	6	4322	4327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889646
70	NC_010994	GAT	2	6	4346	4351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889646
71	NC_010994	GCA	2	6	4402	4407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889646
72	NC_010994	CGC	2	6	4441	4446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889646
73	NC_010994	TCG	2	6	4570	4575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889646
74	NC_010994	GTT	3	9	4679	4687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190889646
75	NC_010994	GTC	2	6	4688	4693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889646
76	NC_010994	GCC	2	6	4730	4735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010994	GCA	2	6	4793	4798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010994	TCC	2	6	4859	4864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190889647
79	NC_010994	TCG	2	6	4865	4870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889647
80	NC_010994	CCA	2	6	4875	4880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190889647
81	NC_010994	GCC	2	6	4933	4938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889647
82	NC_010994	GAC	3	9	4948	4956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889647
83	NC_010994	CGG	2	6	4996	5001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889647
84	NC_010994	GAT	2	6	5020	5025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889647
85	NC_010994	GAT	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889647
86	NC_010994	CAG	3	9	5050	5058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889647
87	NC_010994	CAG	2	6	5086	5091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889647
88	NC_010994	GCG	2	6	5134	5139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889647
89	NC_010994	GCA	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889647
90	NC_010994	CGA	4	12	5235	5246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889647
91	NC_010994	GCA	3	9	5268	5276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889647
92	NC_010994	GTC	2	6	5309	5314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010994	GCG	2	6	5345	5350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010994	ATC	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010994	CGG	2	6	5420	5425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010994	TCA	2	6	5454	5459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889648
97	NC_010994	ATT	2	6	5461	5466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190889648
98	NC_010994	TGG	2	6	5472	5477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190889648
99	NC_010994	CGG	2	6	5478	5483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889648
100	NC_010994	GCC	2	6	5517	5522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889648
101	NC_010994	GCC	2	6	5539	5544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889648
102	NC_010994	GCG	2	6	5570	5575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889648
103	NC_010994	GAT	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889648
104	NC_010994	GAA	2	6	5818	5823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190889648
105	NC_010994	CTG	2	6	5825	5830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889648
106	NC_010994	GCG	2	6	5858	5863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889648
107	NC_010994	TCG	2	6	5907	5912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889648
108	NC_010994	GAT	3	9	6202	6210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889649
109	NC_010994	CGC	2	6	6324	6329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889649
110	NC_010994	CGC	2	6	6403	6408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889649
111	NC_010994	ACG	2	6	6410	6415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889649
112	NC_010994	GAC	2	6	6475	6480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889649
113	NC_010994	CCG	2	6	6501	6506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889649
114	NC_010994	CCG	2	6	6545	6550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889649
115	NC_010994	GCC	2	6	6575	6580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889649
116	NC_010994	TCT	2	6	6686	6691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190889649
117	NC_010994	GCC	2	6	6709	6714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889649
118	NC_010994	GCT	2	6	6795	6800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889649
119	NC_010994	TTC	2	6	6916	6921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190889649
120	NC_010994	GCG	2	6	6928	6933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889649
121	NC_010994	CTT	2	6	6979	6984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190889649
122	NC_010994	GAT	2	6	7069	7074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889649
123	NC_010994	TCG	2	6	7124	7129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889649
124	NC_010994	CGC	2	6	7200	7205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889649
125	NC_010994	GCC	3	9	7231	7239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889649
126	NC_010994	GCA	2	6	7312	7317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889650
127	NC_010994	GCG	2	6	7383	7388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889650
128	NC_010994	GCA	2	6	7481	7486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889650
129	NC_010994	GCC	2	6	7525	7530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889650
130	NC_010994	GCA	2	6	7757	7762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889650
131	NC_010994	GGC	2	6	7767	7772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889650
132	NC_010994	GGC	2	6	7885	7890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889651
133	NC_010994	CTG	2	6	7961	7966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889651
134	NC_010994	CAT	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889651
135	NC_010994	GGA	2	6	8008	8013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190889651
136	NC_010994	TCC	2	6	8033	8038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190889651
137	NC_010994	TCA	2	6	8049	8054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889651
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139	NC_010994	CGG	2	6	8108	8113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889651
140	NC_010994	GAA	2	6	8269	8274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010994	GCC	2	6	8296	8301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_010994	ACA	2	6	8310	8315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_010994	CGA	2	6	8452	8457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889652
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145	NC_010994	CGA	2	6	8506	8511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889652
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153	NC_010994	CGG	2	6	9025	9030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889652
154	NC_010994	TCG	2	6	9042	9047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889652
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157	NC_010994	TGG	2	6	9137	9142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190889652
158	NC_010994	CAA	2	6	9178	9183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190889652
159	NC_010994	CGG	2	6	9199	9204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889652
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161	NC_010994	GAG	2	6	9452	9457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190889652
162	NC_010994	TCG	2	6	9480	9485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889652
163	NC_010994	GTC	2	6	9491	9496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889652
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199	NC_010994	GTC	3	9	11832	11840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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252	NC_010994	TCA	2	6	15281	15286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889657
253	NC_010994	GGC	2	6	15289	15294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889657
254	NC_010994	TGA	2	6	15502	15507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889658
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257	NC_010994	CCT	2	6	15625	15630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190889658
258	NC_010994	GCC	2	6	15631	15636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889658
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262	NC_010994	CGA	2	6	15740	15745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889658
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