MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Stenotrophomonas maltophilia K279a chromosome

Total Repeats: 4354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010943	TGCGC	2	10	2099	2108	0 %	20 %	40 %	40 %	190572093
2	NC_010943	GCATC	2	10	3371	3380	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_010943	TGCTC	2	10	4201	4210	0 %	40 %	20 %	40 %	190572095
4	NC_010943	GGCCA	2	10	4535	4544	20 %	0 %	40 %	40 %	190572095
5	NC_010943	CGCTG	2	10	6647	6656	0 %	20 %	40 %	40 %	190572096
6	NC_010943	GCCGC	2	10	7489	7498	0 %	0 %	40 %	60 %	190572097
7	NC_010943	CGTGG	2	10	7600	7609	0 %	20 %	60 %	20 %	190572097
8	NC_010943	CGCTA	2	10	8313	8322	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_010943	TAGCT	2	10	11341	11350	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_010943	CAACA	2	10	13066	13075	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_010943	TGGAC	2	10	14239	14248	20 %	20 %	40 %	20 %	190572104
12	NC_010943	ATGCG	2	10	16347	16356	20 %	20 %	40 %	20 %	190572107
13	NC_010943	GAAGT	2	10	19142	19151	40 %	20 %	40 %	0 %	190572110
14	NC_010943	ACCTT	2	10	19932	19941	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_010943	TCCTG	2	10	23351	23360	0 %	40 %	20 %	40 %	190572113
16	NC_010943	GAGGT	2	10	25006	25015	20 %	20 %	60 %	0 %	190572114
17	NC_010943	GCCTC	2	10	25856	25865	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_010943	CTTGC	2	10	26337	26346	0 %	40 %	20 %	40 %	190572115
19	NC_010943	ACCGC	2	10	27006	27015	20 %	0 %	20 %	60 %	190572116
20	NC_010943	CGAGT	2	10	29829	29838	20 %	20 %	40 %	20 %	190572118
21	NC_010943	CGAAT	2	10	30240	30249	40 %	20 %	20 %	20 %	190572118
22	NC_010943	GTCCG	2	10	31713	31722	0 %	20 %	40 %	40 %	190572119
23	NC_010943	CGCCC	2	10	31811	31820	0 %	0 %	20 %	80 %	190572119
24	NC_010943	CAGAA	2	10	34403	34412	60 %	0 %	20 %	20 %	190572123
25	NC_010943	CTTCC	2	10	36110	36119	0 %	40 %	0 %	60 %	190572123
26	NC_010943	GGCTT	2	10	36178	36187	0 %	40 %	40 %	20 %	190572123
27	NC_010943	AGCGT	2	10	36576	36585	20 %	20 %	40 %	20 %	190572123
28	NC_010943	GGCTT	2	10	37138	37147	0 %	40 %	40 %	20 %	190572123
29	NC_010943	CTGGC	2	10	37937	37946	0 %	20 %	40 %	40 %	190572124
30	NC_010943	CGCTT	2	10	39652	39661	0 %	40 %	20 %	40 %	190572125
31	NC_010943	CGCGC	2	10	42215	42224	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_010943	GCTGT	2	10	42499	42508	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_010943	GCCCA	2	10	43205	43214	20 %	0 %	20 %	60 %	190572128
34	NC_010943	CGAAA	2	10	43256	43265	60 %	0 %	20 %	20 %	190572128
35	NC_010943	CTGCC	2	10	44002	44011	0 %	20 %	20 %	60 %	190572128
36	NC_010943	AGCAC	2	10	45091	45100	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_010943	GTGGC	2	10	45681	45690	0 %	20 %	60 %	20 %	190572129
38	NC_010943	AACGA	2	10	47959	47968	60 %	0 %	20 %	20 %	190572130
39	NC_010943	GTCAT	2	10	49408	49417	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_010943	GCAGC	2	10	50064	50073	20 %	0 %	40 %	40 %	190572133
41	NC_010943	AGCGC	2	10	52945	52954	20 %	0 %	40 %	40 %	190572135
42	NC_010943	CACCG	2	10	53168	53177	20 %	0 %	20 %	60 %	190572135
43	NC_010943	TCGAA	2	10	53337	53346	40 %	20 %	20 %	20 %	190572135
44	NC_010943	CGCGC	2	10	54198	54207	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_010943	GGTCG	2	10	54282	54291	0 %	20 %	60 %	20 %	190572136
46	NC_010943	CAGCG	2	10	54794	54803	20 %	0 %	40 %	40 %	190572137
47	NC_010943	GCCAG	2	10	57764	57773	20 %	0 %	40 %	40 %	190572139
48	NC_010943	CGCTG	2	10	58562	58571	0 %	20 %	40 %	40 %	190572139
49	NC_010943	CAGGC	2	10	59160	59169	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_010943	ACCGA	2	10	59228	59237	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_010943	ACCGA	2	10	59267	59276	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_010943	GCCGT	2	10	61873	61882	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_010943	CGCGC	2	10	62955	62964	0 %	0 %	40 %	60 %	190572144
54	NC_010943	CAGCG	2	10	64495	64504	20 %	0 %	40 %	40 %	190572148
55	NC_010943	CCACC	2	10	64998	65007	20 %	0 %	0 %	80 %	190572148
56	NC_010943	GGCGA	2	10	66713	66722	20 %	0 %	60 %	20 %	190572149
57	NC_010943	GCGTG	2	10	67944	67953	0 %	20 %	60 %	20 %	190572150
58	NC_010943	ACCGC	2	10	68237	68246	20 %	0 %	20 %	60 %	190572151
59	NC_010943	GTGCA	2	10	70677	70686	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010943	CCGTG	2	10	71362	71371	0 %	20 %	40 %	40 %	190572155
61	NC_010943	GCAGC	2	10	71798	71807	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_010943	CCCTG	2	10	71845	71854	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
63	NC_010943	TGCCC	2	10	72186	72195	0 %	20 %	20 %	60 %	190572156
64	NC_010943	AAGGC	2	10	72735	72744	40 %	0 %	40 %	20 %	190572157
65	NC_010943	TGCCC	2	10	73749	73758	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_010943	GTGGC	2	10	76044	76053	0 %	20 %	60 %	20 %	190572160
67	NC_010943	CACGC	2	10	76925	76934	20 %	0 %	20 %	60 %	190572161
68	NC_010943	GGCGG	2	10	78116	78125	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
69	NC_010943	GCTCG	2	10	79905	79914	0 %	20 %	40 %	40 %	190572164
70	NC_010943	CTCGG	2	10	80626	80635	0 %	20 %	40 %	40 %	190572164
71	NC_010943	CCGTT	2	10	81074	81083	0 %	40 %	20 %	40 %	190572164
72	NC_010943	CGACC	2	10	81567	81576	20 %	0 %	20 %	60 %	190572164
73	NC_010943	GCGCA	2	10	83053	83062	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_010943	GCTGG	2	10	83651	83660	0 %	20 %	60 %	20 %	190572166
75	NC_010943	CGCAG	2	10	84115	84124	20 %	0 %	40 %	40 %	190572167
76	NC_010943	CACGC	2	10	86835	86844	20 %	0 %	20 %	60 %	190572169
77	NC_010943	AGGGC	2	10	87831	87840	20 %	0 %	60 %	20 %	190572170
78	NC_010943	GCGCC	2	10	88052	88061	0 %	0 %	40 %	60 %	190572171
79	NC_010943	CTGCC	2	10	88695	88704	0 %	20 %	20 %	60 %	190572171
80	NC_010943	GGGCA	2	10	88807	88816	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_010943	GGGTT	2	10	90497	90506	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010943	GGTGG	2	10	90585	90594	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010943	CCGCC	2	10	90936	90945	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
84	NC_010943	AGCAC	2	10	91325	91334	40 %	0 %	20 %	40 %	190572173
85	NC_010943	CTGGC	2	10	93872	93881	0 %	20 %	40 %	40 %	190572176
86	NC_010943	CTGGC	2	10	94427	94436	0 %	20 %	40 %	40 %	190572176
87	NC_010943	GCGCC	2	10	94768	94777	0 %	0 %	40 %	60 %	190572176
88	NC_010943	AGCCG	2	10	95118	95127	20 %	0 %	40 %	40 %	190572176
89	NC_010943	TGGGC	2	10	95874	95883	0 %	20 %	60 %	20 %	190572177
90	NC_010943	TGGCG	2	10	96353	96362	0 %	20 %	60 %	20 %	190572178
91	NC_010943	AGCTG	2	10	97281	97290	20 %	20 %	40 %	20 %	190572179
92	NC_010943	CGCGG	2	10	98463	98472	0 %	0 %	60 %	40 %	190572180
93	NC_010943	GTCAC	2	10	98890	98899	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_010943	GCAGC	2	10	99268	99277	20 %	0 %	40 %	40 %	190572181
95	NC_010943	GACCA	2	10	102040	102049	40 %	0 %	20 %	40 %	190572182
96	NC_010943	GGCGA	2	10	103019	103028	20 %	0 %	60 %	20 %	190572183
97	NC_010943	CTGCG	2	10	104501	104510	0 %	20 %	40 %	40 %	190572184
98	NC_010943	GCGCG	2	10	104982	104991	0 %	0 %	60 %	40 %	190572185
99	NC_010943	CGCTG	2	10	105158	105167	0 %	20 %	40 %	40 %	190572185
100	NC_010943	AGCCG	2	10	105613	105622	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_010943	GGCTC	2	10	105684	105693	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_010943	GAGTG	2	10	108163	108172	20 %	20 %	60 %	0 %	190572187
103	NC_010943	GGCCG	2	10	110338	110347	0 %	0 %	60 %	40 %	190572188
104	NC_010943	AGGCC	2	10	111156	111165	20 %	0 %	40 %	40 %	190572189
105	NC_010943	CACCG	2	10	111583	111592	20 %	0 %	20 %	60 %	190572189
106	NC_010943	CGCGG	2	10	111800	111809	0 %	0 %	60 %	40 %	190572189
107	NC_010943	CGCAG	2	10	113406	113415	20 %	0 %	40 %	40 %	190572189
108	NC_010943	GCGGG	2	10	115513	115522	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
109	NC_010943	GCGCC	2	10	116112	116121	0 %	0 %	40 %	60 %	190572190
110	NC_010943	GGCCA	2	10	117224	117233	20 %	0 %	40 %	40 %	190572191
111	NC_010943	CGGCA	2	10	117745	117754	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_010943	CGGTG	2	10	118774	118783	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_010943	CAGCG	2	10	118843	118852	20 %	0 %	40 %	40 %	190572193
114	NC_010943	CGCGG	2	10	118969	118978	0 %	0 %	60 %	40 %	190572193
115	NC_010943	GCGAC	2	10	119067	119076	20 %	0 %	40 %	40 %	190572193
116	NC_010943	CGATG	2	10	119185	119194	20 %	20 %	40 %	20 %	190572193
117	NC_010943	CCACG	2	10	119379	119388	20 %	0 %	20 %	60 %	190572193
118	NC_010943	GCGAA	2	10	119973	119982	40 %	0 %	40 %	20 %	190572193
119	NC_010943	CGCTG	2	10	120457	120466	0 %	20 %	40 %	40 %	190572194
120	NC_010943	CGGAT	2	10	122166	122175	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_010943	GATCG	2	10	125446	125455	20 %	20 %	40 %	20 %	190572199
122	NC_010943	CCACC	2	10	126476	126485	20 %	0 %	0 %	80 %	190572200
123	NC_010943	CAGCG	2	10	128445	128454	20 %	0 %	40 %	40 %	190572200
124	NC_010943	GCCGT	2	10	129770	129779	0 %	20 %	40 %	40 %	190572202
125	NC_010943	CGCGC	3	15	129941	129955	0 %	0 %	40 %	60 %	190572202
126	NC_010943	TGCAG	2	10	130316	130325	20 %	20 %	40 %	20 %	190572203
127	NC_010943	GCGCA	2	10	130415	130424	20 %	0 %	40 %	40 %	190572203
128	NC_010943	CATCG	2	10	132003	132012	20 %	20 %	20 %	40 %	190572204
129	NC_010943	ATCGC	2	10	132817	132826	20 %	20 %	20 %	40 %	190572204
130	NC_010943	TGGCC	2	10	133577	133586	0 %	20 %	40 %	40 %	190572204
131	NC_010943	CGCAG	2	10	134343	134352	20 %	0 %	40 %	40 %	190572205
132	NC_010943	TGCGT	2	10	135352	135361	0 %	40 %	40 %	20 %	190572206
133	NC_010943	ACGGC	2	10	136159	136168	20 %	0 %	40 %	40 %	190572207
134	NC_010943	GCCGG	2	10	136403	136412	0 %	0 %	60 %	40 %	190572207
135	NC_010943	GCGCG	2	10	137074	137083	0 %	0 %	60 %	40 %	190572207
136	NC_010943	CACGG	2	10	138778	138787	20 %	0 %	40 %	40 %	190572209
137	NC_010943	CAGCG	2	10	141986	141995	20 %	0 %	40 %	40 %	190572211
138	NC_010943	GGCGG	2	10	142706	142715	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010943	GCCCA	2	10	148643	148652	20 %	0 %	20 %	60 %	190572215
140	NC_010943	GCAGG	2	10	151866	151875	20 %	0 %	60 %	20 %	190572218
141	NC_010943	GTGCT	2	10	152612	152621	0 %	40 %	40 %	20 %	190572219
142	NC_010943	CGGCG	2	10	152625	152634	0 %	0 %	60 %	40 %	190572219
143	NC_010943	GGCGC	2	10	152951	152960	0 %	0 %	60 %	40 %	190572220
144	NC_010943	CGGCC	2	10	152993	153002	0 %	0 %	40 %	60 %	190572220
145	NC_010943	CGCGG	2	10	153927	153936	0 %	0 %	60 %	40 %	190572221
146	NC_010943	GTGCT	2	10	154091	154100	0 %	40 %	40 %	20 %	190572221
147	NC_010943	CCCGA	2	10	154847	154856	20 %	0 %	20 %	60 %	190572221
148	NC_010943	GCCCG	2	10	155446	155455	0 %	0 %	40 %	60 %	190572221
149	NC_010943	GGCGA	2	10	156317	156326	20 %	0 %	60 %	20 %	190572223
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152	NC_010943	CCTGG	2	10	160238	160247	0 %	20 %	40 %	40 %	190572226
153	NC_010943	CCGGC	2	10	160471	160480	0 %	0 %	40 %	60 %	190572226
154	NC_010943	ACTTC	2	10	161664	161673	20 %	40 %	0 %	40 %	190572228
155	NC_010943	GGGGT	2	10	162324	162333	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
156	NC_010943	CTGCC	2	10	162542	162551	0 %	20 %	20 %	60 %	190572229
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159	NC_010943	AAGGG	2	10	169161	169170	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
160	NC_010943	CAGCG	2	10	174584	174593	20 %	0 %	40 %	40 %	190572239
161	NC_010943	GCCGC	2	10	175150	175159	0 %	0 %	40 %	60 %	190572240
162	NC_010943	AGCCG	2	10	175772	175781	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
163	NC_010943	GTCGC	2	10	175826	175835	0 %	20 %	40 %	40 %	190572241
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167	NC_010943	CTGCG	2	10	181357	181366	0 %	20 %	40 %	40 %	190572245
168	NC_010943	CGGGG	2	10	181615	181624	0 %	0 %	80 %	20 %	190572245
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173	NC_010943	CACGG	2	10	188517	188526	20 %	0 %	40 %	40 %	190572255
174	NC_010943	GAGAG	2	10	189570	189579	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
175	NC_010943	CATCG	2	10	189683	189692	20 %	20 %	20 %	40 %	190572257
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179	NC_010943	GCCGC	2	10	191679	191688	0 %	0 %	40 %	60 %	190572260
180	NC_010943	TGCAA	2	10	191987	191996	40 %	20 %	20 %	20 %	190572260
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197	NC_010943	GACCG	2	10	206741	206750	20 %	0 %	40 %	40 %	190572275
198	NC_010943	GCTGC	2	10	206805	206814	0 %	20 %	40 %	40 %	190572275
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207	NC_010943	AGCGC	2	10	216122	216131	20 %	0 %	40 %	40 %	190572281
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209	NC_010943	GGTGC	2	10	217561	217570	0 %	20 %	60 %	20 %	190572281
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241	NC_010943	CTTTT	2	10	259907	259916	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
242	NC_010943	AAAAG	2	10	259923	259932	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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244	NC_010943	CAGGG	2	10	260850	260859	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
245	NC_010943	CGGCC	2	10	260939	260948	0 %	0 %	40 %	60 %	190572320
246	NC_010943	GCGCG	2	10	261503	261512	0 %	0 %	60 %	40 %	190572320
247	NC_010943	GCGAT	2	10	261978	261987	20 %	20 %	40 %	20 %	190572321
248	NC_010943	ACCGC	2	10	265382	265391	20 %	0 %	20 %	60 %	190572322
249	NC_010943	GGCCT	2	10	266436	266445	0 %	20 %	40 %	40 %	190572323
250	NC_010943	CCGGC	2	10	266855	266864	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
251	NC_010943	GCCAG	2	10	267880	267889	20 %	0 %	40 %	40 %	190572325
252	NC_010943	ACGGT	2	10	267937	267946	20 %	20 %	40 %	20 %	190572325
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254	NC_010943	CATGC	2	10	269805	269814	20 %	20 %	20 %	40 %	190572328
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258	NC_010943	TGCGG	2	10	271668	271677	0 %	20 %	60 %	20 %	190572329
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260	NC_010943	CGCTG	2	10	274764	274773	0 %	20 %	40 %	40 %	190572333
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262	NC_010943	GGCGG	2	10	277448	277457	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
263	NC_010943	CGCGG	2	10	277835	277844	0 %	0 %	60 %	40 %	190572336
264	NC_010943	GGTGG	2	10	279649	279658	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
265	NC_010943	CCGCC	2	10	279741	279750	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
266	NC_010943	GCGCC	2	10	280261	280270	0 %	0 %	40 %	60 %	190572337
267	NC_010943	GTGCA	2	10	282065	282074	20 %	20 %	40 %	20 %	190572338
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402	NC_010943	ACCGT	2	10	425718	425727	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
403	NC_010943	ATCCC	2	10	427179	427188	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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