MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia K279a chromosome

Total Repeats: 613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010943	GCATC	2	10	3371	3380	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_010943	CGCTA	2	10	8313	8322	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_010943	TAGCT	2	10	11341	11350	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010943	CAACA	2	10	13066	13075	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_010943	ACCTT	2	10	19932	19941	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_010943	GCCTC	2	10	25856	25865	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_010943	CGCGC	2	10	42215	42224	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_010943	GCTGT	2	10	42499	42508	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010943	AGCAC	2	10	45091	45100	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_010943	GTCAT	2	10	49408	49417	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_010943	CGCGC	2	10	54198	54207	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_010943	CAGGC	2	10	59160	59169	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_010943	ACCGA	2	10	59228	59237	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_010943	ACCGA	2	10	59267	59276	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_010943	GCCGT	2	10	61873	61882	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_010943	GTGCA	2	10	70677	70686	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010943	GCAGC	2	10	71798	71807	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_010943	CCCTG	2	10	71845	71854	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_010943	TGCCC	2	10	73749	73758	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_010943	GGCGG	2	10	78116	78125	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010943	GCGCA	2	10	83053	83062	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_010943	GGGCA	2	10	88807	88816	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010943	GGGTT	2	10	90497	90506	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010943	GGTGG	2	10	90585	90594	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010943	CCGCC	2	10	90936	90945	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
26	NC_010943	GTCAC	2	10	98890	98899	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_010943	AGCCG	2	10	105613	105622	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_010943	GGCTC	2	10	105684	105693	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_010943	GCGGG	2	10	115513	115522	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
30	NC_010943	CGGCA	2	10	117745	117754	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_010943	CGGTG	2	10	118774	118783	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_010943	CGGAT	2	10	122166	122175	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_010943	GGCGG	2	10	142706	142715	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010943	GGGGT	2	10	162324	162333	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010943	AAGGG	2	10	169161	169170	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010943	AGCCG	2	10	175772	175781	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_010943	GAGAG	2	10	189570	189579	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010943	CGAGC	2	10	213647	213656	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_010943	GATCC	2	10	241642	241651	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_010943	CGAGC	2	10	259760	259769	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_010943	CTTTT	2	10	259907	259916	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_010943	AAAAG	2	10	259923	259932	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010943	CAGGG	2	10	260850	260859	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_010943	CCGGC	2	10	266855	266864	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_010943	GGCGG	2	10	277448	277457	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
46	NC_010943	GGTGG	2	10	279649	279658	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010943	CCGCC	2	10	279741	279750	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
48	NC_010943	CGGCG	2	10	308392	308401	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_010943	CTGCG	2	10	330592	330601	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_010943	ATCTA	2	10	335398	335407	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_010943	GTCAT	2	10	348939	348948	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_010943	GGGGC	2	10	350911	350920	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
53	NC_010943	TCCTT	2	10	355135	355144	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_010943	AAAAG	2	10	360550	360559	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010943	GCTCG	2	10	369103	369112	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_010943	CGGCG	2	10	376231	376240	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
57	NC_010943	CGATG	2	10	384297	384306	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_010943	GGCCC	2	10	384968	384977	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
59	NC_010943	CAGTG	2	10	386356	386365	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010943	GCCGC	2	10	411794	411803	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
61	NC_010943	CCACG	2	10	411845	411854	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
62	NC_010943	TCGTG	2	10	417505	417514	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010943	ACCGT	2	10	420054	420063	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_010943	ATCCC	2	10	421515	421524	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
65	NC_010943	TCGTG	2	10	423169	423178	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_010943	ACCGT	2	10	425718	425727	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_010943	ATCCC	2	10	427179	427188	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
68	NC_010943	AAAAG	2	10	427510	427519	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010943	GCTCT	2	10	427539	427548	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_010943	CTAGC	2	10	433776	433785	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_010943	AAAGG	2	10	449536	449545	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010943	CAGGG	2	10	453754	453763	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_010943	CGAGC	2	10	464463	464472	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_010943	CGTGG	2	10	468093	468102	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010943	CGAGC	2	10	468138	468147	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_010943	GTTTT	2	10	485087	485096	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010943	GCCCG	2	10	489535	489544	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
78	NC_010943	AGGGC	2	10	497901	497910	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_010943	CACGC	2	10	514201	514210	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_010943	CCTGG	2	10	518625	518634	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_010943	GAATG	2	10	520254	520263	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010943	TTGGC	2	10	520334	520343	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_010943	CTGGT	2	10	521266	521275	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_010943	GCGGG	2	10	536146	536155	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
85	NC_010943	GCCGG	2	10	536215	536224	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_010943	GGGTT	2	10	543154	543163	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010943	TCGCT	2	10	543356	543365	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_010943	GGCAG	2	10	543494	543503	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_010943	CTGCC	2	10	543562	543571	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_010943	CCAAC	2	10	543612	543621	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
91	NC_010943	CGGGC	2	10	545523	545532	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_010943	CCGCA	2	10	555911	555920	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_010943	GCCCG	2	10	584143	584152	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
94	NC_010943	CCCGG	2	10	588642	588651	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
95	NC_010943	GCCAT	2	10	589805	589814	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_010943	CGGGC	2	10	608325	608334	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
97	NC_010943	CCGCC	2	10	620481	620490	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
98	NC_010943	CCCCG	2	10	627792	627801	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
99	NC_010943	CGGAC	2	10	627884	627893	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_010943	GGGCC	2	10	627901	627910	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_010943	TCTGT	2	10	646054	646063	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_010943	GAAGG	2	10	661299	661308	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010943	GGAAA	2	10	661366	661375	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010943	TCACG	2	10	663499	663508	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_010943	GGACG	2	10	684409	684418	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_010943	GCAGG	2	10	691443	691452	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_010943	CGCGC	2	10	736434	736443	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
108	NC_010943	GAATG	2	10	767818	767827	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010943	CGGCA	2	10	778413	778422	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_010943	CGGCA	2	10	778655	778664	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_010943	CCTGC	2	10	790530	790539	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_010943	GGAGC	2	10	797690	797699	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_010943	CCGCG	2	10	799155	799164	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
114	NC_010943	GCAGG	2	10	834443	834452	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010943	ACGGG	2	10	835619	835628	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_010943	ACGGG	2	10	835630	835639	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_010943	ACGGG	2	10	835641	835650	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
118	NC_010943	AGGGC	2	10	844923	844932	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
119	NC_010943	GGCGG	2	10	846370	846379	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
120	NC_010943	CCGCC	2	10	846464	846473	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
121	NC_010943	GCGCC	2	10	847411	847420	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
122	NC_010943	CGGCC	2	10	848654	848663	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
123	NC_010943	AAGCG	2	10	876021	876030	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_010943	GGGTT	2	10	876101	876110	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010943	CGTGG	2	10	882068	882077	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_010943	CGTGG	2	10	885249	885258	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_010943	CTCGC	2	10	890879	890888	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_010943	CCATC	2	10	898181	898190	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_010943	CGCCC	2	10	919033	919042	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
130	NC_010943	GCCGA	2	10	919189	919198	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_010943	CAGGG	2	10	926907	926916	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_010943	CGGCG	2	10	946410	946419	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
133	NC_010943	CAGGG	2	10	950828	950837	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_010943	GGGTC	2	10	970843	970852	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_010943	GGGCC	2	10	975360	975369	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
136	NC_010943	TGACG	2	10	975526	975535	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_010943	GCCTG	2	10	981632	981641	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
138	NC_010943	ACCCC	2	10	984107	984116	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
139	NC_010943	TTCCT	2	10	995331	995340	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_010943	CCGGG	2	10	998464	998473	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
141	NC_010943	CGGGG	2	10	1000873	1000882	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
142	NC_010943	GCCCG	3	15	1003178	1003192	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
143	NC_010943	TCCGG	2	10	1005267	1005276	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_010943	TGATC	2	10	1018251	1018260	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_010943	GCCCG	2	10	1032087	1032096	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
146	NC_010943	TTTCG	2	10	1032762	1032771	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_010943	TCGAA	2	10	1036060	1036069	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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151	NC_010943	TCCGC	2	10	1041161	1041170	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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404	NC_010943	GCATG	2	10	2999272	2999281	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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422	NC_010943	AGCGA	2	10	3118343	3118352	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
423	NC_010943	ACCGC	2	10	3123691	3123700	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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444	NC_010943	CCCAC	2	10	3349654	3349663	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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461	NC_010943	CGGAC	2	10	3415254	3415263	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
462	NC_010943	AAAAC	2	10	3425079	3425088	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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464	NC_010943	CCCGA	2	10	3450885	3450894	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
465	NC_010943	GGCAC	2	10	3463470	3463479	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
466	NC_010943	GGCTC	2	10	3481593	3481602	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
467	NC_010943	GAGCC	2	10	3501734	3501743	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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473	NC_010943	GCCTG	2	10	3566133	3566142	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
474	NC_010943	GGCGG	2	10	3566892	3566901	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
475	NC_010943	GGCGG	2	10	3567143	3567152	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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485	NC_010943	CAATG	2	10	3662477	3662486	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
486	NC_010943	GCTGC	2	10	3684377	3684386	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
487	NC_010943	GACCA	2	10	3684565	3684574	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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489	NC_010943	CTGTC	2	10	3686932	3686941	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
490	NC_010943	GGCTC	2	10	3691991	3692000	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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492	NC_010943	TGGGC	2	10	3714127	3714136	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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