MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia K279a chromosome

Total Repeats: 6494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010943	GTT	2	6	1521	1526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010943	CAC	2	6	1551	1556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_010943	CAG	2	6	2709	2714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010943	TGC	2	6	2836	2841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010943	CCG	2	6	3417	3422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010943	GCC	2	6	3491	3496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_010943	CCA	2	6	3557	3562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010943	CGC	2	6	8284	8289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_010943	GCA	2	6	9184	9189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010943	GGC	2	6	9230	9235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010943	CGG	2	6	9271	9276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010943	CAC	2	6	11362	11367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_010943	GCG	2	6	12152	12157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010943	CGA	2	6	12170	12175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010943	AGT	2	6	12181	12186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010943	CGG	2	6	13151	13156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010943	GCG	2	6	14632	14637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010943	ATC	2	6	14638	14643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010943	GCA	2	6	15713	15718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010943	GCG	2	6	15764	15769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010943	GAC	2	6	15860	15865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010943	CAT	2	6	15943	15948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010943	AAT	2	6	16074	16079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010943	AGC	2	6	16407	16412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010943	GCG	2	6	18112	18117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010943	TCC	2	6	18185	18190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_010943	GCA	2	6	18191	18196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010943	GCA	2	6	19831	19836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010943	GTG	2	6	19910	19915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010943	GCA	2	6	19947	19952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010943	TGA	2	6	20040	20045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010943	CGA	2	6	20149	20154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010943	GTT	2	6	20294	20299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010943	ACT	2	6	21700	21705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010943	GAA	2	6	21771	21776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010943	GTA	2	6	21800	21805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010943	ACA	2	6	21900	21905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010943	CAG	2	6	21985	21990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010943	GAC	2	6	21994	21999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010943	AAC	2	6	22016	22021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010943	TCC	2	6	25866	25871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_010943	CTC	2	6	27058	27063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_010943	CTG	2	6	27152	27157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010943	CAT	2	6	27168	27173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010943	CGC	2	6	27201	27206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_010943	ATC	2	6	27210	27215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010943	TTC	2	6	27279	27284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010943	ATG	2	6	27338	27343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010943	CTA	2	6	30594	30599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010943	TGG	2	6	30651	30656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010943	GCT	2	6	30675	30680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010943	CTT	2	6	30736	30741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010943	GCG	2	6	30940	30945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010943	GGC	2	6	31049	31054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010943	GCC	2	6	31062	31067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_010943	CGC	2	6	31198	31203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_010943	GGC	2	6	32626	32631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010943	CAC	2	6	32652	32657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010943	GAC	2	6	32673	32678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010943	CCG	2	6	32680	32685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_010943	CGA	2	6	40025	40030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010943	GAC	2	6	40038	40043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010943	GAA	2	6	40479	40484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010943	CGC	2	6	40611	40616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010943	CTG	2	6	40619	40624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010943	GCC	2	6	40644	40649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_010943	TCC	2	6	40709	40714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_010943	GCT	2	6	40774	40779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010943	GCC	2	6	41548	41553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_010943	TGC	2	6	41600	41605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010943	GCT	2	6	41701	41706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010943	GGC	2	6	41905	41910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010943	TGG	2	6	42054	42059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010943	TGC	3	9	42147	42155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010943	CCA	2	6	42202	42207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_010943	TGA	2	6	42228	42233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010943	CAG	2	6	42242	42247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010943	GCG	2	6	42252	42257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010943	AAC	2	6	42323	42328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010943	GAA	2	6	42424	42429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010943	CGC	2	6	42435	42440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_010943	CTG	2	6	42469	42474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010943	TCG	2	6	42492	42497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010943	GAG	2	6	42632	42637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010943	GCA	2	6	45040	45045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010943	ATC	2	6	45149	45154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010943	TGT	2	6	45919	45924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010943	ACG	2	6	45945	45950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010943	GGC	2	6	49358	49363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010943	GCC	2	6	49385	49390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_010943	CGC	2	6	50605	50610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_010943	GTT	2	6	50696	50701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010943	GGA	2	6	51934	51939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010943	GCC	3	9	52007	52015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_010943	GCC	2	6	52051	52056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010943	GGT	2	6	55241	55246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010943	CGA	2	6	59132	59137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010943	GCC	2	6	59324	59329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_010943	AGC	2	6	59353	59358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010943	GGC	2	6	59359	59364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010943	GGC	2	6	59381	59386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010943	CAC	2	6	59396	59401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_010943	CGT	2	6	59440	59445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010943	CGG	2	6	59494	59499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010943	CGA	2	6	59536	59541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010943	GGC	2	6	59604	59609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010943	CGG	2	6	59637	59642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010943	CCG	2	6	59680	59685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_010943	CCG	2	6	59706	59711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_010943	CTT	2	6	59717	59722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010943	GGT	2	6	59741	59746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010943	TTG	2	6	59796	59801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010943	CAC	2	6	59888	59893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_010943	ACA	2	6	59953	59958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010943	CGA	2	6	59971	59976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010943	GCC	2	6	60038	60043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_010943	ACG	2	6	60192	60197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010943	CGG	2	6	60259	60264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010943	GGT	2	6	61804	61809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010943	CGT	2	6	62063	62068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010943	GCG	2	6	62174	62179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010943	TGC	2	6	62726	62731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010943	GCG	2	6	67133	67138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010943	CTG	2	6	67964	67969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010943	GCC	2	6	69060	69065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_010943	GGC	2	6	69070	69075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010943	AGT	2	6	70264	70269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010943	AGT	2	6	70339	70344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010943	TCT	2	6	70353	70358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010943	CCG	2	6	70608	70613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_010943	CCT	2	6	70616	70621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_010943	TGC	2	6	70723	70728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010943	GCA	3	9	70752	70760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010943	GAA	2	6	70848	70853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010943	ACG	2	6	70986	70991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010943	TGG	2	6	71002	71007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010943	GCA	2	6	71102	71107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010943	CGC	2	6	71784	71789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_010943	ATG	2	6	71813	71818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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