MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010939	AGATAA	2	12	63857	63868	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010939	CGAAGG	2	12	69782	69793	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_010939	TGAAAT	2	12	73149	73160	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010939	GCGAAA	2	12	74325	74336	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010939	CCTTAT	2	12	74428	74439	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010939	TGTTTT	2	12	94511	94522	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010939	TTGCCG	2	12	131127	131138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010939	GCGATT	2	12	173904	173915	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010939	TAATTT	2	12	179915	179926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010939	TTATTT	2	12	190687	190698	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010939	TTATTT	2	12	216150	216161	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010939	AGCTGA	2	12	216232	216243	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010939	TTTTTA	2	12	249214	249225	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010939	CGAAGG	2	12	286858	286869	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010939	TGAAAT	2	12	290125	290136	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010939	CATTTT	2	12	317424	317435	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010939	ATATTC	2	12	320761	320772	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010939	ATTTTC	2	12	342153	342164	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010939	AAAGTT	2	12	355760	355771	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010939	TAAAAA	2	12	392758	392769	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010939	TATTTA	2	12	400197	400208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010939	ATTAAA	2	12	457001	457012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010939	GAATGC	2	12	472248	472259	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010939	AATAAA	2	12	504494	504505	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010939	TATTTA	2	12	514034	514045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010939	GTCGGA	2	12	527083	527094	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010939	ATAAAT	2	12	569892	569903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010939	ATTAAA	2	12	573142	573153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010939	GATAAA	2	12	629198	629209	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010939	CGTTTT	2	12	633263	633274	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010939	ATTAGC	2	12	634761	634772	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010939	ACATTT	2	12	671451	671462	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010939	TTTTGT	2	12	714810	714821	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010939	TTTATA	2	12	768367	768378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010939	TTATTT	2	12	800703	800714	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010939	TAATGA	2	12	806997	807008	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010939	AATATA	2	12	814431	814442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010939	CGTTTT	2	12	893650	893661	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_010939	TTTTTA	2	12	961888	961899	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010939	TTTAAA	2	12	966026	966037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010939	CAAAGG	2	12	1018267	1018278	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_010939	TCTGAT	2	12	1066547	1066558	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010939	AAAACT	2	12	1098607	1098618	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_010939	TAAATA	2	12	1121423	1121434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010939	GCTTGT	2	12	1154214	1154225	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010939	TCTTAA	2	12	1222611	1222622	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010939	TAAAAA	2	12	1290784	1290795	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010939	AAAGAA	2	12	1312342	1312353	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010939	CCAGCT	2	12	1313903	1313914	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010939	CTAAAG	2	12	1315692	1315703	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010939	TAAATT	2	12	1334686	1334697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010939	ATTAAA	2	12	1348857	1348868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010939	TTTTAA	2	12	1349149	1349160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010939	CTAAAG	2	12	1349172	1349183	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010939	TGAGAA	2	12	1423802	1423813	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010939	GATAAA	2	12	1436717	1436728	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010939	TGAATA	2	12	1453804	1453815	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010939	TCGCAA	2	12	1486729	1486740	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010939	AAATTT	2	12	1512910	1512921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010939	AGAAAA	2	12	1587810	1587821	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010939	ATTTCA	2	12	1589122	1589133	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010939	GCCTTC	2	12	1592488	1592499	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010939	AACATA	2	12	1607651	1607662	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010939	ATATCT	2	12	1609465	1609476	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_010939	ATAAAA	2	12	1618796	1618807	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010939	TTGTCC	2	12	1690475	1690486	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010939	GAGTAT	2	12	1711261	1711272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010939	CAAAAA	2	12	1752106	1752117	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010939	ATTTCA	2	12	1783262	1783273	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010939	GCCTTC	2	12	1786627	1786638	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010939	TATTTA	2	12	1813585	1813596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010939	TATAAT	2	12	1813835	1813846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010939	TAAAAA	2	12	1813898	1813909	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010939	AAATAA	2	12	1825201	1825212	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010939	TATAAA	2	12	1839923	1839934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010939	CTTTCT	2	12	1847301	1847312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010939	ATTTCA	2	12	1895582	1895593	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_010939	GCCTTC	2	12	1898842	1898853	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010939	ATGGGA	2	12	1912209	1912220	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010939	TGTGTT	2	12	1915845	1915856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010939	ATCATT	2	12	1925252	1925263	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_010939	GCTTTA	2	12	1979716	1979727	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_010939	GCTGGA	2	12	2005439	2005450	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_010939	TTGCAA	2	12	2066682	2066693	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_010939	CTTTAA	2	12	2067663	2067674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_010939	AAAATA	2	12	2084134	2084145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010939	TAAAGA	2	12	2094723	2094734	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010939	CGAAAT	2	12	2117872	2117883	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_010939	CGAAGG	2	12	2123266	2123277	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_010939	TGAAAT	2	12	2126527	2126538	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010939	GTTTTT	2	12	2127744	2127755	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010939	GTAAAG	2	12	2128323	2128334	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010939	ATGAAA	2	12	2200134	2200145	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010939	AAATAA	2	12	2243987	2243998	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010939	GTTTTT	2	12	2252250	2252261	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010939	GACTGT	2	12	2270137	2270148	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_010939	AAAAAG	2	12	2278824	2278835	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010939	TAATAT	2	12	2290650	2290661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010939	ATCATA	2	12	2304979	2304990	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.