MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76

Total Repeats: 6550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_010939	AAAC	2	8	2313902	2313909	75 %	0 %	0 %	25 %	190151382
6502	NC_010939	GCTA	2	8	2313941	2313948	25 %	25 %	25 %	25 %	190151382
6503	NC_010939	AGAC	2	8	2314013	2314020	50 %	0 %	25 %	25 %	190151382
6504	NC_010939	GCGT	2	8	2314510	2314517	0 %	25 %	50 %	25 %	190151382
6505	NC_010939	CGTG	2	8	2314587	2314594	0 %	25 %	50 %	25 %	190151383
6506	NC_010939	GCGG	2	8	2314792	2314799	0 %	0 %	75 %	25 %	190151383
6507	NC_010939	AACT	2	8	2315016	2315023	50 %	25 %	0 %	25 %	190151383
6508	NC_010939	CGTG	2	8	2315139	2315146	0 %	25 %	50 %	25 %	190151383
6509	NC_010939	AAAT	2	8	2316092	2316099	75 %	25 %	0 %	0 %	190151384
6510	NC_010939	TTGA	2	8	2316702	2316709	25 %	50 %	25 %	0 %	190151385
6511	NC_010939	CTTT	2	8	2316718	2316725	0 %	75 %	0 %	25 %	190151385
6512	NC_010939	TGTT	2	8	2316808	2316815	0 %	75 %	25 %	0 %	190151385
6513	NC_010939	ATGT	2	8	2317330	2317337	25 %	50 %	25 %	0 %	190151386
6514	NC_010939	ATAA	2	8	2317806	2317813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_010939	ACCA	2	8	2318223	2318230	50 %	0 %	0 %	50 %	190151387
6516	NC_010939	CAAG	2	8	2319048	2319055	50 %	0 %	25 %	25 %	190151388
6517	NC_010939	CAAA	2	8	2320199	2320206	75 %	0 %	0 %	25 %	190151389
6518	NC_010939	TCGC	2	8	2320532	2320539	0 %	25 %	25 %	50 %	190151389
6519	NC_010939	TAAA	2	8	2320782	2320789	75 %	25 %	0 %	0 %	190151389
6520	NC_010939	TTAA	2	8	2321509	2321516	50 %	50 %	0 %	0 %	190151390
6521	NC_010939	CCGC	2	8	2321815	2321822	0 %	0 %	25 %	75 %	190151390
6522	NC_010939	TAAA	2	8	2323129	2323136	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_010939	TTGT	2	8	2323537	2323544	0 %	75 %	25 %	0 %	190151392
6524	NC_010939	ATTC	2	8	2323773	2323780	25 %	50 %	0 %	25 %	190151392
6525	NC_010939	TCGG	2	8	2323913	2323920	0 %	25 %	50 %	25 %	190151392
6526	NC_010939	TCAA	2	8	2324120	2324127	50 %	25 %	0 %	25 %	190151392
6527	NC_010939	CTCG	2	8	2324286	2324293	0 %	25 %	25 %	50 %	190151392
6528	NC_010939	TAAT	2	8	2324319	2324326	50 %	50 %	0 %	0 %	190151392
6529	NC_010939	ATTT	2	8	2324489	2324496	25 %	75 %	0 %	0 %	190151393
6530	NC_010939	GTGA	2	8	2324511	2324518	25 %	25 %	50 %	0 %	190151393
6531	NC_010939	TGAG	2	8	2325552	2325559	25 %	25 %	50 %	0 %	190151394
6532	NC_010939	GCTT	2	8	2325820	2325827	0 %	50 %	25 %	25 %	190151394
6533	NC_010939	ACCA	2	8	2325847	2325854	50 %	0 %	0 %	50 %	190151394
6534	NC_010939	TAAA	2	8	2325858	2325865	75 %	25 %	0 %	0 %	190151394
6535	NC_010939	CATT	2	8	2326248	2326255	25 %	50 %	0 %	25 %	190151394
6536	NC_010939	AAGC	2	8	2326430	2326437	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6537	NC_010939	TTTA	2	8	2326564	2326571	25 %	75 %	0 %	0 %	190151395
6538	NC_010939	TAAT	2	8	2326617	2326624	50 %	50 %	0 %	0 %	190151395
6539	NC_010939	ATTA	2	8	2326774	2326781	50 %	50 %	0 %	0 %	190151395
6540	NC_010939	CGGT	2	8	2326788	2326795	0 %	25 %	50 %	25 %	190151395
6541	NC_010939	AATT	2	8	2327263	2327270	50 %	50 %	0 %	0 %	190151395
6542	NC_010939	AATG	2	8	2327772	2327779	50 %	25 %	25 %	0 %	190151396
6543	NC_010939	GAAT	2	8	2328180	2328187	50 %	25 %	25 %	0 %	190151396
6544	NC_010939	TAAG	2	8	2328411	2328418	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_010939	CTTT	2	8	2328446	2328453	0 %	75 %	0 %	25 %	190151397
6546	NC_010939	GAGT	2	8	2328672	2328679	25 %	25 %	50 %	0 %	190151397
6547	NC_010939	TAAA	2	8	2328937	2328944	75 %	25 %	0 %	0 %	190151397
6548	NC_010939	ATTT	2	8	2329298	2329305	25 %	75 %	0 %	0 %	190151397
6549	NC_010939	AATT	2	8	2330824	2330831	50 %	50 %	0 %	0 %	190151400
6550	NC_010939	ACGG	2	8	2331764	2331771	25 %	0 %	50 %	25 %	190151400

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.