MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Comamonas testosteroni CNB-1 plasmid pCNB

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010935	GCCTGC	2	12	1838	1849	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190571924
2	NC_010935	GGCGCG	2	12	7123	7134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571932
3	NC_010935	CCCAGC	2	12	7900	7911	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	190571934
4	NC_010935	CCGTGT	2	12	12537	12548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571940
5	NC_010935	GAACGT	2	12	17962	17973	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	190571944
6	NC_010935	CTTCAT	2	12	22567	22578	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	190571950
7	NC_010935	CAACAC	2	12	22663	22674	50 %	0 %	0 %	50 %	190571950
8	NC_010935	CTGGCC	2	12	24059	24070	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190571950
9	NC_010935	CCCTGG	2	12	25057	25068	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190571952
10	NC_010935	CCTGCG	2	12	25454	25465	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190571952
11	NC_010935	CCGCAT	2	12	26767	26778	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190571954
12	NC_010935	TCGGCA	2	12	29469	29480	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190571957
13	NC_010935	CGCTGC	2	12	32579	32590	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190571961
14	NC_010935	GATCCT	2	12	34382	34393	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	190571964
15	NC_010935	GACGTC	2	12	38065	38076	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190572011
16	NC_010935	CCGCGC	2	12	38091	38102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572011
17	NC_010935	CGCCCG	2	12	38682	38693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572011
18	NC_010935	CAGGTC	2	12	40193	40204	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190572010
19	NC_010935	CGAGGT	2	12	41003	41014	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	190571969
20	NC_010935	GATCTT	2	12	41085	41096	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	190571969
21	NC_010935	AGACCA	2	12	45070	45081	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	190571971
22	NC_010935	TCCACG	2	12	45864	45875	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190571972
23	NC_010935	GCTCGG	2	12	64746	64757	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	190572009
24	NC_010935	TGCCCA	2	12	64975	64986	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190572009
25	NC_010935	GTTCTT	2	12	65384	65395	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	190572009
26	NC_010935	GGGTGT	2	12	66680	66691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571991
27	NC_010935	TCGCCC	2	12	67284	67295	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	190571991
28	NC_010935	GCCCAG	2	12	69188	69199	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	190571993
29	NC_010935	CAGCGC	2	12	70589	70600	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	190571994
30	NC_010935	ACCAGC	2	12	70659	70670	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	190571994
31	NC_010935	GCATGT	2	12	71211	71222	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190571995
32	NC_010935	GCCAGC	2	12	71234	71245	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	190571995
33	NC_010935	GCGCCA	2	12	71764	71775	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	190571996
34	NC_010935	CTGGGC	2	12	72499	72510	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	190571997
35	NC_010935	GGGTGT	2	12	73648	73659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571983
36	NC_010935	TCGCCC	2	12	74252	74263	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	190571983
37	NC_010935	GCGCTC	2	12	84281	84292	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190572002
38	NC_010935	TCGCGG	2	12	84846	84857	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	190572002
39	NC_010935	CGGTGG	2	12	87479	87490	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	190572004
40	NC_010935	GCTTCG	2	12	87881	87892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572004
41	NC_010935	GATGTG	2	12	89837	89848	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	190572005

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.