MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Comamonas testosteroni CNB-1 plasmid pCNB

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010935	GCGCG	2	10	1509	1518	0 %	0 %	60 %	40 %	190571923
2	NC_010935	CCGGC	2	10	3339	3348	0 %	0 %	40 %	60 %	190571926
3	NC_010935	CGCTC	2	10	3447	3456	0 %	20 %	20 %	60 %	190571926
4	NC_010935	CGGGC	2	10	4315	4324	0 %	0 %	60 %	40 %	190571927
5	NC_010935	CGGGT	2	10	4368	4377	0 %	20 %	60 %	20 %	190571927
6	NC_010935	CGTTG	2	10	4808	4817	0 %	40 %	40 %	20 %	190571927
7	NC_010935	AAGGG	2	10	5636	5645	40 %	0 %	60 %	0 %	190571929
8	NC_010935	CCGGC	2	10	7395	7404	0 %	0 %	40 %	60 %	190571933
9	NC_010935	CGCGC	2	10	8631	8640	0 %	0 %	40 %	60 %	190571935
10	NC_010935	GCAGG	2	10	11567	11576	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_010935	ACGCA	2	10	11986	11995	40 %	0 %	20 %	40 %	190571940
12	NC_010935	TGCGC	2	10	11996	12005	0 %	20 %	40 %	40 %	190571940
13	NC_010935	CGTCG	2	10	18628	18637	0 %	20 %	40 %	40 %	190571944
14	NC_010935	AGGGA	2	10	19577	19586	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010935	AACAC	2	10	19892	19901	60 %	0 %	0 %	40 %	190571947
16	NC_010935	CTTCG	2	10	20056	20065	0 %	40 %	20 %	40 %	190571947
17	NC_010935	AGGCG	2	10	20718	20727	20 %	0 %	60 %	20 %	190571947
18	NC_010935	GCCTG	2	10	22510	22519	0 %	20 %	40 %	40 %	190571950
19	NC_010935	GCGCT	2	10	25036	25045	0 %	20 %	40 %	40 %	190571952
20	NC_010935	TCGCA	2	10	25467	25476	20 %	20 %	20 %	40 %	190571952
21	NC_010935	GCTGT	2	10	26039	26048	0 %	40 %	40 %	20 %	190571953
22	NC_010935	GGTCG	2	10	27310	27319	0 %	20 %	60 %	20 %	190571954
23	NC_010935	TCGGC	2	10	27483	27492	0 %	20 %	40 %	40 %	190571954
24	NC_010935	ATGTC	2	10	29811	29820	20 %	40 %	20 %	20 %	190571957
25	NC_010935	GGACG	2	10	30868	30877	20 %	0 %	60 %	20 %	190571958
26	NC_010935	GCGCG	2	10	32220	32229	0 %	0 %	60 %	40 %	190571961
27	NC_010935	CTTCG	2	10	33081	33090	0 %	40 %	20 %	40 %	190571962
28	NC_010935	GCTGC	2	10	33341	33350	0 %	20 %	40 %	40 %	190571963
29	NC_010935	GTGTC	2	10	33635	33644	0 %	40 %	40 %	20 %	190571963
30	NC_010935	CGTGC	2	10	35280	35289	0 %	20 %	40 %	40 %	190571964
31	NC_010935	TGTTC	2	10	37275	37284	0 %	60 %	20 %	20 %	190571965
32	NC_010935	GCTGC	2	10	45237	45246	0 %	20 %	40 %	40 %	190571972
33	NC_010935	AGTTG	2	10	47590	47599	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010935	TGCCG	2	10	48116	48125	0 %	20 %	40 %	40 %	190571975
35	NC_010935	GCAGC	2	10	48881	48890	20 %	0 %	40 %	40 %	190571976
36	NC_010935	GTCGA	2	10	49146	49155	20 %	20 %	40 %	20 %	190571977
37	NC_010935	CCGCG	2	10	49988	49997	0 %	0 %	40 %	60 %	190571977
38	NC_010935	GAACC	2	10	53533	53542	40 %	0 %	20 %	40 %	190571980
39	NC_010935	GCGTG	2	10	54031	54040	0 %	20 %	60 %	20 %	190571981
40	NC_010935	CGCTG	2	10	55489	55498	0 %	20 %	40 %	40 %	190571982
41	NC_010935	CAGCG	2	10	55589	55598	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_010935	TCAGG	2	10	57255	57264	20 %	20 %	40 %	20 %	190571985
43	NC_010935	CCGCG	2	10	59420	59429	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
44	NC_010935	GGTTC	2	10	59852	59861	0 %	40 %	40 %	20 %	190571988
45	NC_010935	GGTGA	2	10	60399	60408	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010935	GGTCG	2	10	61634	61643	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_010935	CGCTG	2	10	61698	61707	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_010935	TTAAG	2	10	61742	61751	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010935	ATTTT	2	10	62336	62345	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010935	GCCCA	2	10	63855	63864	20 %	0 %	20 %	60 %	190571989
51	NC_010935	CGCTG	2	10	66949	66958	0 %	20 %	40 %	40 %	190571991
52	NC_010935	CAGCG	2	10	67049	67058	20 %	0 %	40 %	40 %	190571991
53	NC_010935	CCCGG	2	10	68625	68634	0 %	0 %	40 %	60 %	190571992
54	NC_010935	CATGG	2	10	69251	69260	20 %	20 %	40 %	20 %	190571993
55	NC_010935	GCGCC	2	10	69739	69748	0 %	0 %	40 %	60 %	190571994
56	NC_010935	CTGGC	2	10	71086	71095	0 %	20 %	40 %	40 %	190571995
57	NC_010935	GCGCG	2	10	71152	71161	0 %	0 %	60 %	40 %	190571995
58	NC_010935	GCGCG	2	10	72663	72672	0 %	0 %	60 %	40 %	190571997
59	NC_010935	CGCTG	2	10	73917	73926	0 %	20 %	40 %	40 %	190571983
60	NC_010935	CAGCG	2	10	74017	74026	20 %	0 %	40 %	40 %	190571983
61	NC_010935	GCACC	2	10	76864	76873	20 %	0 %	20 %	60 %	190571999
62	NC_010935	TGTTC	2	10	82054	82063	0 %	60 %	20 %	20 %	190572000
63	NC_010935	CCGAT	2	10	86906	86915	20 %	20 %	20 %	40 %	190572004
64	NC_010935	CACTT	2	10	88334	88343	20 %	40 %	0 %	40 %	190572005
65	NC_010935	CGCTT	2	10	89397	89406	0 %	40 %	20 %	40 %	190572005
66	NC_010935	CGGGT	2	10	89811	89820	0 %	20 %	60 %	20 %	190572005

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.