MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Comamonas testosteroni CNB-1 plasmid pCNB

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010935	ACCG	2	8	2959	2966	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010935	CGGC	2	8	9265	9272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010935	CCTT	2	8	10755	10762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010935	GCCG	2	8	11510	11517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010935	CTTA	2	8	17167	17174	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010935	AAGA	2	8	19565	19572	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010935	TGCT	2	8	19777	19784	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010935	TGCG	2	8	19825	19832	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010935	CGCT	2	8	33188	33195	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010935	AACC	2	8	33263	33270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010935	GATC	2	8	41635	41642	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010935	TGAT	2	8	43231	43238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010935	GGCG	2	8	43489	43496	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010935	ACAT	2	8	43580	43587	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010935	AGGG	2	8	46192	46199	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010935	TTGA	2	8	46202	46209	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010935	GAGC	2	8	47714	47721	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010935	AGGA	2	8	52636	52643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010935	CATC	2	8	52669	52676	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010935	TGAA	2	8	55911	55918	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010935	GCCT	2	8	55940	55947	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010935	AGCG	2	8	56290	56297	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010935	GAAC	2	8	60725	60732	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010935	CGCC	2	8	60843	60850	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_010935	AAGG	2	8	60993	61000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010935	CGCT	2	8	61403	61410	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010935	GGAA	2	8	61962	61969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010935	ACAA	2	8	62039	62046	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010935	GCCA	2	8	62172	62179	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010935	GAAG	2	8	63146	63153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010935	AAGG	2	8	63623	63630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010935	AAGG	2	8	66243	66250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010935	TGAA	2	8	67371	67378	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010935	GCCT	2	8	67400	67407	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010935	AGCG	2	8	67750	67757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010935	TCCA	2	8	69032	69039	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010935	AAGG	2	8	73211	73218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010935	AGGG	2	8	78225	78232	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010935	TCGT	2	8	90827	90834	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010935	AGAT	2	8	90920	90927	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010935	TCTG	2	8	91017	91024	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.