MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Comamonas testosteroni CNB-1 plasmid pCNB

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010935	GATG	2	8	130	137	25 %	25 %	50 %	0 %	190571921
2	NC_010935	TCGT	2	8	700	707	0 %	50 %	25 %	25 %	190571922
3	NC_010935	GCGA	2	8	1155	1162	25 %	0 %	50 %	25 %	190571923
4	NC_010935	CCTT	2	8	1997	2004	0 %	50 %	0 %	50 %	190571924
5	NC_010935	CGGC	2	8	2393	2400	0 %	0 %	50 %	50 %	190571924
6	NC_010935	GGTG	2	8	2401	2408	0 %	25 %	75 %	0 %	190571924
7	NC_010935	GCCG	2	8	3037	3044	0 %	0 %	50 %	50 %	190571926
8	NC_010935	CTGG	2	8	3071	3078	0 %	25 %	50 %	25 %	190571926
9	NC_010935	GCTC	2	8	3312	3319	0 %	25 %	25 %	50 %	190571926
10	NC_010935	CGCT	2	8	3534	3541	0 %	25 %	25 %	50 %	190571926
11	NC_010935	TGGC	2	8	3837	3844	0 %	25 %	50 %	25 %	190571926
12	NC_010935	CGGC	2	8	4286	4293	0 %	0 %	50 %	50 %	190571927
13	NC_010935	GCCA	2	8	4564	4571	25 %	0 %	25 %	50 %	190571927
14	NC_010935	TTGC	2	8	5513	5520	0 %	50 %	25 %	25 %	190571929
15	NC_010935	GGCC	2	8	5863	5870	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
16	NC_010935	CGAA	2	8	6646	6653	50 %	0 %	25 %	25 %	190571931
17	NC_010935	GGCC	2	8	7058	7065	0 %	0 %	50 %	50 %	190571932
18	NC_010935	GTCG	2	8	7565	7572	0 %	25 %	50 %	25 %	190571933
19	NC_010935	CGGT	2	8	7973	7980	0 %	25 %	50 %	25 %	190571934
20	NC_010935	CGGC	2	8	7994	8001	0 %	0 %	50 %	50 %	190571934
21	NC_010935	TTCG	2	8	8039	8046	0 %	50 %	25 %	25 %	190571934
22	NC_010935	CGCT	2	8	8346	8353	0 %	25 %	25 %	50 %	190571935
23	NC_010935	GCCC	2	8	8382	8389	0 %	0 %	25 %	75 %	190571935
24	NC_010935	GGCC	2	8	8652	8659	0 %	0 %	50 %	50 %	190571935
25	NC_010935	CGGC	2	8	9386	9393	0 %	0 %	50 %	50 %	190571936
26	NC_010935	CCGT	2	8	9442	9449	0 %	25 %	25 %	50 %	190571936
27	NC_010935	TGGC	2	8	9576	9583	0 %	25 %	50 %	25 %	190571937
28	NC_010935	GAAG	2	8	10325	10332	50 %	0 %	50 %	0 %	190571938
29	NC_010935	CTTG	2	8	12324	12331	0 %	50 %	25 %	25 %	190571940
30	NC_010935	CCTG	2	8	12682	12689	0 %	25 %	25 %	50 %	190571940
31	NC_010935	GTCC	2	8	12756	12763	0 %	25 %	25 %	50 %	190571940
32	NC_010935	GCTC	2	8	13245	13252	0 %	25 %	25 %	50 %	190571940
33	NC_010935	GTCG	2	8	13437	13444	0 %	25 %	50 %	25 %	190571940
34	NC_010935	GCCA	2	8	14174	14181	25 %	0 %	25 %	50 %	190571940
35	NC_010935	TCAA	2	8	14360	14367	50 %	25 %	0 %	25 %	190571940
36	NC_010935	TCAG	2	8	14411	14418	25 %	25 %	25 %	25 %	190571940
37	NC_010935	CGCC	2	8	14876	14883	0 %	0 %	25 %	75 %	190571941
38	NC_010935	GTCA	2	8	15809	15816	25 %	25 %	25 %	25 %	190571942
39	NC_010935	TGAC	2	8	16441	16448	25 %	25 %	25 %	25 %	190571943
40	NC_010935	TAGG	2	8	16454	16461	25 %	25 %	50 %	0 %	190571943
41	NC_010935	AGCC	2	8	16763	16770	25 %	0 %	25 %	50 %	190571943
42	NC_010935	AAGA	2	8	16986	16993	75 %	0 %	25 %	0 %	190571943
43	NC_010935	CTCA	2	8	18640	18647	25 %	25 %	0 %	50 %	190571944
44	NC_010935	TCCT	2	8	19295	19302	0 %	50 %	0 %	50 %	190571946
45	NC_010935	CGAG	2	8	19471	19478	25 %	0 %	50 %	25 %	190571946
46	NC_010935	GTGC	2	8	20308	20315	0 %	25 %	50 %	25 %	190571947
47	NC_010935	CCGA	2	8	20404	20411	25 %	0 %	25 %	50 %	190571947
48	NC_010935	GCCG	2	8	21972	21979	0 %	0 %	50 %	50 %	190571950
49	NC_010935	GATG	2	8	22786	22793	25 %	25 %	50 %	0 %	190571950
50	NC_010935	GTCG	2	8	22825	22832	0 %	25 %	50 %	25 %	190571950
51	NC_010935	GCCG	2	8	22935	22942	0 %	0 %	50 %	50 %	190571950
52	NC_010935	CAAT	2	8	23247	23254	50 %	25 %	0 %	25 %	190571950
53	NC_010935	GCCG	2	8	23704	23711	0 %	0 %	50 %	50 %	190571950
54	NC_010935	CTGG	2	8	24151	24158	0 %	25 %	50 %	25 %	190571950
55	NC_010935	ATGA	2	8	24694	24701	50 %	25 %	25 %	0 %	190571951
56	NC_010935	CCGC	2	8	24824	24831	0 %	0 %	25 %	75 %	190571951
57	NC_010935	GATG	2	8	25397	25404	25 %	25 %	50 %	0 %	190571952
58	NC_010935	ACCG	2	8	25566	25573	25 %	0 %	25 %	50 %	190571952
59	NC_010935	CCCG	2	8	26298	26305	0 %	0 %	25 %	75 %	190571953
60	NC_010935	GTGG	2	8	27029	27036	0 %	25 %	75 %	0 %	190571954
61	NC_010935	CGCC	2	8	28165	28172	0 %	0 %	25 %	75 %	190571955
62	NC_010935	GCGA	2	8	28206	28213	25 %	0 %	50 %	25 %	190571955
63	NC_010935	GCCA	2	8	28786	28793	25 %	0 %	25 %	50 %	190571957
64	NC_010935	TGGC	2	8	28823	28830	0 %	25 %	50 %	25 %	190571957
65	NC_010935	GGCC	2	8	30079	30086	0 %	0 %	50 %	50 %	190571957
66	NC_010935	GGCC	2	8	30190	30197	0 %	0 %	50 %	50 %	190571957
67	NC_010935	TCGG	2	8	30563	30570	0 %	25 %	50 %	25 %	190571958
68	NC_010935	CCCG	2	8	30648	30655	0 %	0 %	25 %	75 %	190571958
69	NC_010935	ACCA	2	8	30920	30927	50 %	0 %	0 %	50 %	190571958
70	NC_010935	AACG	2	8	31034	31041	50 %	0 %	25 %	25 %	190571958
71	NC_010935	GAAG	2	8	31205	31212	50 %	0 %	50 %	0 %	190571959
72	NC_010935	GCTG	2	8	31338	31345	0 %	25 %	50 %	25 %	190571959
73	NC_010935	CACG	2	8	31435	31442	25 %	0 %	25 %	50 %	190571959
74	NC_010935	TCCA	2	8	31652	31659	25 %	25 %	0 %	50 %	190571959
75	NC_010935	GGGC	2	8	31730	31737	0 %	0 %	75 %	25 %	190571959
76	NC_010935	GGCC	2	8	32148	32155	0 %	0 %	50 %	50 %	190571961
77	NC_010935	CCGG	2	8	32895	32902	0 %	0 %	50 %	50 %	190571962
78	NC_010935	ACCT	2	8	33939	33946	25 %	25 %	0 %	50 %	190571964
79	NC_010935	CGCC	2	8	34034	34041	0 %	0 %	25 %	75 %	190571964
80	NC_010935	CAAA	2	8	34583	34590	75 %	0 %	0 %	25 %	190571964
81	NC_010935	CCTC	2	8	34704	34711	0 %	25 %	0 %	75 %	190571964
82	NC_010935	GCTG	2	8	34904	34911	0 %	25 %	50 %	25 %	190571964
83	NC_010935	GCCA	2	8	34977	34984	25 %	0 %	25 %	50 %	190571964
84	NC_010935	GTTT	2	8	35026	35033	0 %	75 %	25 %	0 %	190571964
85	NC_010935	GCCA	2	8	35405	35412	25 %	0 %	25 %	50 %	190571964
86	NC_010935	CAGG	2	8	36051	36058	25 %	0 %	50 %	25 %	190571964
87	NC_010935	CCAG	2	8	36100	36107	25 %	0 %	25 %	50 %	190571964
88	NC_010935	TTGA	2	8	36282	36289	25 %	50 %	25 %	0 %	190571964
89	NC_010935	AGGC	2	8	37328	37335	25 %	0 %	50 %	25 %	190571965
90	NC_010935	CGGT	2	8	37487	37494	0 %	25 %	50 %	25 %	190571965
91	NC_010935	GGCG	2	8	37686	37693	0 %	0 %	75 %	25 %	190571965
92	NC_010935	GTTG	2	8	37713	37720	0 %	50 %	50 %	0 %	190571965
93	NC_010935	TGGT	2	8	38393	38400	0 %	50 %	50 %	0 %	190572011
94	NC_010935	CGAG	2	8	38529	38536	25 %	0 %	50 %	25 %	190572011
95	NC_010935	GCCG	2	8	38851	38858	0 %	0 %	50 %	50 %	190572011
96	NC_010935	GGCG	2	8	39123	39130	0 %	0 %	75 %	25 %	190572011
97	NC_010935	GCCA	2	8	40903	40910	25 %	0 %	25 %	50 %	190571969
98	NC_010935	CGGT	2	8	41452	41459	0 %	25 %	50 %	25 %	190571969
99	NC_010935	CGAA	2	8	42454	42461	50 %	0 %	25 %	25 %	190571970
100	NC_010935	CGCC	2	8	42565	42572	0 %	0 %	25 %	75 %	190571970
101	NC_010935	GTTT	2	8	44713	44720	0 %	75 %	25 %	0 %	190571971
102	NC_010935	AACC	2	8	44794	44801	50 %	0 %	0 %	50 %	190571971
103	NC_010935	TGCA	2	8	44839	44846	25 %	25 %	25 %	25 %	190571971
104	NC_010935	AGCC	2	8	45511	45518	25 %	0 %	25 %	50 %	190571972
105	NC_010935	CATC	2	8	45661	45668	25 %	25 %	0 %	50 %	190571972
106	NC_010935	CGGC	2	8	46249	46256	0 %	0 %	50 %	50 %	190571973
107	NC_010935	GATT	2	8	46369	46376	25 %	50 %	25 %	0 %	190571973
108	NC_010935	AGGC	2	8	46604	46611	25 %	0 %	50 %	25 %	190571973
109	NC_010935	GCGA	2	8	47042	47049	25 %	0 %	50 %	25 %	190571974
110	NC_010935	GCCC	2	8	48475	48482	0 %	0 %	25 %	75 %	190571975
111	NC_010935	GTTC	2	8	48743	48750	0 %	50 %	25 %	25 %	190571975
112	NC_010935	TGCG	2	8	49290	49297	0 %	25 %	50 %	25 %	190571977
113	NC_010935	CCGC	2	8	49399	49406	0 %	0 %	25 %	75 %	190571977
114	NC_010935	ATTG	2	8	50247	50254	25 %	50 %	25 %	0 %	190571978
115	NC_010935	CCAT	2	8	52065	52072	25 %	25 %	0 %	50 %	190571979
116	NC_010935	CCGG	2	8	53361	53368	0 %	0 %	50 %	50 %	190571980
117	NC_010935	GCTG	2	8	53801	53808	0 %	25 %	50 %	25 %	190571980
118	NC_010935	CGCC	2	8	53849	53856	0 %	0 %	25 %	75 %	190571980
119	NC_010935	GGCG	2	8	54736	54743	0 %	0 %	75 %	25 %	190571982
120	NC_010935	TCGG	2	8	55058	55065	0 %	25 %	50 %	25 %	190571982
121	NC_010935	GCGT	2	8	55088	55095	0 %	25 %	50 %	25 %	190571982
122	NC_010935	CGTA	2	8	55383	55390	25 %	25 %	25 %	25 %	190571982
123	NC_010935	ACTT	2	8	56619	56626	25 %	50 %	0 %	25 %	190571984
124	NC_010935	ACCC	2	8	56993	57000	25 %	0 %	0 %	75 %	190571984
125	NC_010935	CGCA	2	8	57844	57851	25 %	0 %	25 %	50 %	190571986
126	NC_010935	GCCG	2	8	58029	58036	0 %	0 %	50 %	50 %	190571986
127	NC_010935	GCGG	2	8	58183	58190	0 %	0 %	75 %	25 %	190571986
128	NC_010935	CGGC	2	8	58826	58833	0 %	0 %	50 %	50 %	190571987
129	NC_010935	CGCC	2	8	59631	59638	0 %	0 %	25 %	75 %	190571988
130	NC_010935	CGAT	2	8	59643	59650	25 %	25 %	25 %	25 %	190571988
131	NC_010935	TCGC	2	8	59886	59893	0 %	25 %	25 %	50 %	190571988
132	NC_010935	TCCC	2	8	60292	60299	0 %	25 %	0 %	75 %	190571988
133	NC_010935	GCCT	2	8	60359	60366	0 %	25 %	25 %	50 %	190571988
134	NC_010935	CATC	2	8	62531	62538	25 %	25 %	0 %	50 %	190572008
135	NC_010935	ATAC	2	8	62693	62700	50 %	25 %	0 %	25 %	190572008
136	NC_010935	TCGA	2	8	62796	62803	25 %	25 %	25 %	25 %	190572008
137	NC_010935	GGAT	2	8	62833	62840	25 %	25 %	50 %	0 %	190572008
138	NC_010935	GGTA	2	8	63123	63130	25 %	25 %	50 %	0 %	190572008
139	NC_010935	ATCC	2	8	63378	63385	25 %	25 %	0 %	50 %	190572012
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.