MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Comamonas testosteroni CNB-1 plasmid pCNB

Total Repeats: 1491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010935	AGC	2	6	17	22	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571921
2	NC_010935	GCC	2	6	59	64	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571921
3	NC_010935	AAG	2	6	65	70	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571921
4	NC_010935	GAC	2	6	151	156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571921
5	NC_010935	CAG	2	6	246	251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571921
6	NC_010935	CGG	2	6	273	278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571921
7	NC_010935	GAA	2	6	355	360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571921
8	NC_010935	GCG	2	6	461	466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571922
9	NC_010935	GAT	2	6	477	482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190571922
10	NC_010935	CCA	2	6	488	493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190571922
11	NC_010935	CGC	2	6	524	529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571922
12	NC_010935	CAT	2	6	600	605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571922
13	NC_010935	CGA	2	6	612	617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571922
14	NC_010935	TGG	2	6	644	649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571922
15	NC_010935	TCA	2	6	677	682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571922
16	NC_010935	GCT	2	6	747	752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571922
17	NC_010935	TGG	2	6	773	778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571922
18	NC_010935	GTC	2	6	787	792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571922
19	NC_010935	CGG	2	6	795	800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571922
20	NC_010935	GTG	2	6	871	876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571922
21	NC_010935	ACA	2	6	947	952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190571922
22	NC_010935	CAT	2	6	969	974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571922
23	NC_010935	GAA	2	6	994	999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571922
24	NC_010935	CAG	2	6	1123	1128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571922
25	NC_010935	CGG	2	6	1139	1144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571922
26	NC_010935	CGA	2	6	1223	1228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571923
27	NC_010935	TCC	2	6	1240	1245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190571923
28	NC_010935	GCA	2	6	1286	1291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571923
29	NC_010935	GGC	2	6	1391	1396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571923
30	NC_010935	CGG	2	6	1430	1435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571923
31	NC_010935	GCC	3	9	1440	1448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571923
32	NC_010935	GCG	2	6	1457	1462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571923
33	NC_010935	GCC	2	6	1476	1481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571923
34	NC_010935	CGC	2	6	1490	1495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571923
35	NC_010935	GGC	2	6	1538	1543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571923
36	NC_010935	GCC	2	6	1563	1568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571923
37	NC_010935	CGG	2	6	1641	1646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010935	TCG	2	6	1684	1689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010935	TGC	2	6	1700	1705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010935	GCC	2	6	1711	1716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_010935	GCG	2	6	1718	1723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010935	GCC	2	6	1895	1900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571924
43	NC_010935	GCC	2	6	1922	1927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571924
44	NC_010935	CTG	3	9	2053	2061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571924
45	NC_010935	CTG	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571924
46	NC_010935	CTG	2	6	2131	2136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571924
47	NC_010935	CTG	2	6	2146	2151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571924
48	NC_010935	GGC	2	6	2254	2259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571924
49	NC_010935	TGC	2	6	2273	2278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571924
50	NC_010935	CAG	2	6	2305	2310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571924
51	NC_010935	CGG	2	6	2319	2324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571924
52	NC_010935	CTG	2	6	2333	2338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571924
53	NC_010935	TTG	2	6	2346	2351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190571924
54	NC_010935	CGG	2	6	2358	2363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571924
55	NC_010935	GCG	2	6	2377	2382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571924
56	NC_010935	GTC	2	6	2412	2417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571924
57	NC_010935	CCT	2	6	2430	2435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_010935	CGG	2	6	2486	2491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571925
59	NC_010935	CTG	2	6	2598	2603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571925
60	NC_010935	GTT	2	6	2613	2618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190571925
61	NC_010935	CTT	2	6	2652	2657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571925
62	NC_010935	CTG	2	6	2664	2669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571925
63	NC_010935	CTT	2	6	2741	2746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571925
64	NC_010935	TCG	2	6	2812	2817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010935	CCT	2	6	2850	2855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_010935	CGC	2	6	2986	2991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571926
67	NC_010935	CCT	2	6	3079	3084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190571926
68	NC_010935	GCT	2	6	3150	3155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571926
69	NC_010935	GCT	2	6	3163	3168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571926
70	NC_010935	GCC	3	9	3246	3254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571926
71	NC_010935	CTG	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571926
72	NC_010935	GCC	2	6	3282	3287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571926
73	NC_010935	GCC	2	6	3378	3383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571926
74	NC_010935	CGG	2	6	3421	3426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571926
75	NC_010935	CCT	2	6	3469	3474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190571926
76	NC_010935	GCC	2	6	3528	3533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571926
77	NC_010935	CCT	2	6	3670	3675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190571926
78	NC_010935	CGG	2	6	3724	3729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571926
79	NC_010935	GTT	2	6	3737	3742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190571926
80	NC_010935	CGC	2	6	3772	3777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571926
81	NC_010935	CGC	2	6	3803	3808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571926
82	NC_010935	GCC	2	6	3831	3836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571926
83	NC_010935	CGC	2	6	3895	3900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571926
84	NC_010935	GCT	2	6	3904	3909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571926
85	NC_010935	CGG	2	6	3940	3945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571926
86	NC_010935	TCG	2	6	3954	3959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571926
87	NC_010935	CCT	2	6	4002	4007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_010935	TGT	2	6	4024	4029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010935	TAC	2	6	4041	4046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010935	ACA	2	6	4052	4057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010935	GCG	2	6	4168	4173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010935	CAG	2	6	4203	4208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571927
93	NC_010935	CGG	2	6	4297	4302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571927
94	NC_010935	GTC	2	6	4326	4331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571927
95	NC_010935	GAT	2	6	4344	4349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190571927
96	NC_010935	CTT	3	9	4389	4397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571927
97	NC_010935	TCC	2	6	4405	4410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190571927
98	NC_010935	TGG	2	6	4492	4497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571927
99	NC_010935	TCC	2	6	4504	4509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190571927
100	NC_010935	GCA	2	6	4520	4525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571927
101	NC_010935	GTC	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571927
102	NC_010935	TTC	2	6	4591	4596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571927
103	NC_010935	TGA	2	6	4619	4624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190571927
104	NC_010935	CAG	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190571927
105	NC_010935	CTT	3	9	4746	4754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571927
106	NC_010935	TGG	2	6	4874	4879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571927
107	NC_010935	TGA	2	6	4925	4930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190571927
108	NC_010935	CGC	2	6	4982	4987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571927
109	NC_010935	CCG	2	6	5045	5050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571927
110	NC_010935	TCG	2	6	5071	5076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571927
111	NC_010935	GCC	2	6	5103	5108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571927
112	NC_010935	CGC	2	6	5180	5185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571927
113	NC_010935	CTT	3	9	5217	5225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571927
114	NC_010935	CTG	2	6	5423	5428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571929
115	NC_010935	TCT	2	6	5545	5550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571929
116	NC_010935	CGG	2	6	5602	5607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571929
117	NC_010935	GCC	2	6	5616	5621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571929
118	NC_010935	GAA	2	6	5669	5674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571929
119	NC_010935	CGG	2	6	5710	5715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190571929
120	NC_010935	TCC	2	6	5784	5789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190571929
121	NC_010935	TCG	2	6	5814	5819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571929
122	NC_010935	CCG	2	6	5820	5825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571929
123	NC_010935	CCG	2	6	6093	6098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571929
124	NC_010935	CGC	2	6	6133	6138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571929
125	NC_010935	CGC	2	6	6231	6236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571929
126	NC_010935	CGC	2	6	6280	6285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571929
127	NC_010935	TTC	2	6	6311	6316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190571929
128	NC_010935	GTT	2	6	6348	6353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010935	GCC	2	6	6372	6377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_010935	CTT	2	6	6445	6450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010935	GTC	2	6	6487	6492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190571931
132	NC_010935	ACC	2	6	6512	6517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190571931
133	NC_010935	GAA	2	6	6590	6595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190571931
134	NC_010935	TCA	2	6	6598	6603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190571931
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145	NC_010935	GCC	2	6	7300	7305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_010935	CTT	2	6	7337	7342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_010935	GCC	2	6	7518	7523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190571933
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262	NC_010935	GGT	2	6	14182	14187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190571940
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