MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Comamonas testosteroni CNB-1 plasmid pCNB

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010935	CGG	2	6	1641	1646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010935	TCG	2	6	1684	1689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010935	TGC	2	6	1700	1705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010935	GCC	2	6	1711	1716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_010935	GCG	2	6	1718	1723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010935	CCT	2	6	2430	2435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_010935	TCG	2	6	2812	2817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010935	CCT	2	6	2850	2855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_010935	CCT	2	6	4002	4007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_010935	TGT	2	6	4024	4029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010935	TAC	2	6	4041	4046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010935	ACA	2	6	4052	4057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010935	GCG	2	6	4168	4173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010935	GTT	2	6	6348	6353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010935	GCC	2	6	6372	6377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_010935	CTT	2	6	6445	6450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010935	TCC	2	6	7287	7292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_010935	GCC	2	6	7300	7305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_010935	CTT	2	6	7337	7342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010935	CCT	2	6	9500	9505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_010935	GCC	2	6	9528	9533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_010935	GCG	2	6	10775	10780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010935	GCT	2	6	10786	10791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010935	GGC	2	6	10963	10968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010935	CGG	2	6	11044	11049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010935	TGC	2	6	11057	11062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010935	GCC	2	6	11216	11221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_010935	GCC	2	6	11307	11312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_010935	GCC	2	6	11397	11402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_010935	CGG	2	6	11404	11409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010935	GCG	2	6	11626	11631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010935	GGC	2	6	11690	11695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010935	GCC	2	6	11699	11704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_010935	GCA	2	6	11716	11721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010935	GCC	2	6	11742	11747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010935	GTC	2	6	11803	11808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010935	AAT	2	6	17067	17072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010935	TAC	2	6	17129	17134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010935	GCG	2	6	17232	17237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010935	TCG	2	6	17269	17274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010935	TGC	2	6	17363	17368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010935	GCG	2	6	17415	17420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010935	GCC	2	6	17437	17442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_010935	GGC	2	6	17452	17457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010935	GCG	2	6	17472	17477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010935	TCC	2	6	18710	18715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_010935	TGA	2	6	19108	19113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010935	GCC	2	6	19174	19179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_010935	CAG	2	6	19605	19610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010935	CCG	2	6	19638	19643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_010935	GTT	2	6	19717	19722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010935	GCA	2	6	19839	19844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010935	GTG	2	6	33224	33229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010935	GCT	2	6	33707	33712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010935	TGC	2	6	33751	33756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010935	GGT	2	6	33834	33839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010935	CCA	2	6	36987	36992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_010935	ACC	2	6	37181	37186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010935	GTG	2	6	39184	39189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010935	GCC	2	6	39448	39453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_010935	CAC	2	6	39456	39461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_010935	GCG	2	6	39481	39486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010935	GGC	2	6	39926	39931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010935	GCG	2	6	39937	39942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010935	GTT	2	6	40736	40741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010935	GCA	2	6	43239	43244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010935	GCT	3	9	43294	43302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010935	ACG	2	6	43377	43382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010935	CGT	2	6	43383	43388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010935	CGT	2	6	43455	43460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010935	CCG	2	6	43463	43468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_010935	TGC	2	6	43616	43621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010935	TTG	2	6	43673	43678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010935	TGA	2	6	43692	43697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010935	GAG	2	6	43700	43705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010935	CCA	2	6	43881	43886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010935	GAA	3	9	43900	43908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010935	AAC	2	6	43952	43957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010935	TCA	2	6	43980	43985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010935	TGG	2	6	44028	44033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010935	CAA	2	6	44053	44058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010935	CCA	2	6	44162	44167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_010935	GCC	2	6	44176	44181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_010935	TTG	2	6	44186	44191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010935	CCG	2	6	44330	44335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_010935	TTG	2	6	44380	44385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010935	CTT	2	6	46700	46705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010935	ATT	2	6	46876	46881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010935	CGA	2	6	46928	46933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010935	GGA	2	6	47468	47473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010935	GCC	2	6	47565	47570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_010935	CGA	2	6	47577	47582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010935	CGG	2	6	52200	52205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010935	TCG	2	6	52236	52241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010935	CCG	2	6	52412	52417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010935	CTC	2	6	52579	52584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_010935	GAA	2	6	52650	52655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010935	CTG	2	6	52662	52667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010935	TGC	2	6	52705	52710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010935	CTG	2	6	52734	52739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010935	CGT	2	6	52772	52777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010935	GCG	2	6	52814	52819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010935	CGA	2	6	52828	52833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010935	GCC	2	6	52853	52858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_010935	TCG	2	6	52864	52869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010935	GAT	2	6	52874	52879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010935	GGT	2	6	52989	52994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010935	GCA	2	6	55576	55581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010935	CAG	2	6	55685	55690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010935	CCA	2	6	55858	55863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_010935	GCA	2	6	56014	56019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010935	GCT	2	6	56130	56135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010935	GCT	2	6	56193	56198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010935	CCA	2	6	56203	56208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_010935	GTG	2	6	56217	56222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010935	AGT	2	6	56266	56271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010935	CGC	2	6	56284	56289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_010935	GTG	2	6	56372	56377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010935	AGC	2	6	56454	56459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010935	GCG	2	6	56540	56545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010935	GAC	2	6	57198	57203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010935	GGA	2	6	57231	57236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010935	TTG	2	6	57653	57658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010935	CGC	2	6	57746	57751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_010935	TCG	2	6	57787	57792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010935	TGC	2	6	59489	59494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010935	GAC	3	9	59507	59515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010935	CGG	2	6	60437	60442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010935	GGA	2	6	60602	60607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010935	CGG	2	6	60625	60630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010935	TCA	2	6	60701	60706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010935	GAA	2	6	60736	60741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010935	TCC	2	6	60747	60752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_010935	GCT	2	6	60772	60777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010935	TCC	2	6	60818	60823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_010935	CCA	2	6	60837	60842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_010935	CTA	2	6	60874	60879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010935	GCG	2	6	60905	60910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010935	GCT	2	6	61072	61077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010935	CCG	2	6	61096	61101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.