MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Comamonas testosteroni CNB-1 plasmid pCNB

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010935	CG	3	6	40	45	0 %	0 %	50 %	50 %	190571921
2	NC_010935	GC	3	6	1943	1948	0 %	0 %	50 %	50 %	190571924
3	NC_010935	GC	3	6	2047	2052	0 %	0 %	50 %	50 %	190571924
4	NC_010935	GC	3	6	2140	2145	0 %	0 %	50 %	50 %	190571924
5	NC_010935	GC	3	6	2510	2515	0 %	0 %	50 %	50 %	190571925
6	NC_010935	GC	3	6	3086	3091	0 %	0 %	50 %	50 %	190571926
7	NC_010935	GC	3	6	3327	3332	0 %	0 %	50 %	50 %	190571926
8	NC_010935	GC	3	6	3677	3682	0 %	0 %	50 %	50 %	190571926
9	NC_010935	GC	3	6	4116	4121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010935	CG	3	6	4538	4543	0 %	0 %	50 %	50 %	190571927
11	NC_010935	TG	3	6	4699	4704	0 %	50 %	50 %	0 %	190571927
12	NC_010935	GC	3	6	5292	5297	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
13	NC_010935	GC	3	6	5315	5320	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
14	NC_010935	CG	3	6	5382	5387	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
15	NC_010935	CG	3	6	5463	5468	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
16	NC_010935	GC	3	6	5704	5709	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
17	NC_010935	GC	3	6	5805	5810	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
18	NC_010935	CG	3	6	6104	6109	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
19	NC_010935	GC	3	6	6235	6240	0 %	0 %	50 %	50 %	190571929
20	NC_010935	GC	3	6	6548	6553	0 %	0 %	50 %	50 %	190571931
21	NC_010935	GC	3	6	6721	6726	0 %	0 %	50 %	50 %	190571931
22	NC_010935	CG	3	6	8757	8762	0 %	0 %	50 %	50 %	190571935
23	NC_010935	GC	3	6	8912	8917	0 %	0 %	50 %	50 %	190571935
24	NC_010935	CG	3	6	10807	10812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010935	TA	3	6	11122	11127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010935	CG	3	6	11175	11180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010935	GC	3	6	14306	14311	0 %	0 %	50 %	50 %	190571940
28	NC_010935	AC	3	6	16122	16127	50 %	0 %	0 %	50 %	190571943
29	NC_010935	GC	3	6	17379	17384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010935	CG	3	6	17678	17683	0 %	0 %	50 %	50 %	190571944
31	NC_010935	GC	3	6	18478	18483	0 %	0 %	50 %	50 %	190571944
32	NC_010935	GC	3	6	21172	21177	0 %	0 %	50 %	50 %	190571948
33	NC_010935	GC	3	6	21344	21349	0 %	0 %	50 %	50 %	190571949
34	NC_010935	GC	3	6	22862	22867	0 %	0 %	50 %	50 %	190571950
35	NC_010935	CG	3	6	23467	23472	0 %	0 %	50 %	50 %	190571950
36	NC_010935	CG	3	6	24974	24979	0 %	0 %	50 %	50 %	190571951
37	NC_010935	GC	3	6	25130	25135	0 %	0 %	50 %	50 %	190571952
38	NC_010935	GC	3	6	25228	25233	0 %	0 %	50 %	50 %	190571952
39	NC_010935	GT	3	6	25657	25662	0 %	50 %	50 %	0 %	190571952
40	NC_010935	CG	3	6	25833	25838	0 %	0 %	50 %	50 %	190571952
41	NC_010935	CG	3	6	26689	26694	0 %	0 %	50 %	50 %	190571954
42	NC_010935	GC	3	6	26862	26867	0 %	0 %	50 %	50 %	190571954
43	NC_010935	CG	3	6	26886	26891	0 %	0 %	50 %	50 %	190571954
44	NC_010935	GC	3	6	27169	27174	0 %	0 %	50 %	50 %	190571954
45	NC_010935	CG	3	6	27348	27353	0 %	0 %	50 %	50 %	190571954
46	NC_010935	CG	3	6	28283	28288	0 %	0 %	50 %	50 %	190571955
47	NC_010935	CG	3	6	29503	29508	0 %	0 %	50 %	50 %	190571957
48	NC_010935	GC	3	6	30579	30584	0 %	0 %	50 %	50 %	190571958
49	NC_010935	GC	3	6	30663	30668	0 %	0 %	50 %	50 %	190571958
50	NC_010935	CG	3	6	30801	30806	0 %	0 %	50 %	50 %	190571958
51	NC_010935	GC	3	6	31993	31998	0 %	0 %	50 %	50 %	190571960
52	NC_010935	GC	3	6	33046	33051	0 %	0 %	50 %	50 %	190571962
53	NC_010935	CA	3	6	33933	33938	50 %	0 %	0 %	50 %	190571964
54	NC_010935	GC	3	6	35234	35239	0 %	0 %	50 %	50 %	190571964
55	NC_010935	GC	3	6	35358	35363	0 %	0 %	50 %	50 %	190571964
56	NC_010935	GC	3	6	35481	35486	0 %	0 %	50 %	50 %	190571964
57	NC_010935	GT	3	6	37017	37022	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010935	CG	3	6	37388	37393	0 %	0 %	50 %	50 %	190571965
59	NC_010935	GC	4	8	37608	37615	0 %	0 %	50 %	50 %	190571965
60	NC_010935	GC	3	6	37768	37773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010935	GC	3	6	37791	37796	0 %	0 %	50 %	50 %	190572011
62	NC_010935	GC	3	6	37865	37870	0 %	0 %	50 %	50 %	190572011
63	NC_010935	GC	3	6	37935	37940	0 %	0 %	50 %	50 %	190572011
64	NC_010935	GC	3	6	38316	38321	0 %	0 %	50 %	50 %	190572011
65	NC_010935	CT	3	6	38459	38464	0 %	50 %	0 %	50 %	190572011
66	NC_010935	CG	3	6	38837	38842	0 %	0 %	50 %	50 %	190572011
67	NC_010935	GC	5	10	39014	39023	0 %	0 %	50 %	50 %	190572011
68	NC_010935	GC	3	6	39061	39066	0 %	0 %	50 %	50 %	190572011
69	NC_010935	GC	3	6	39075	39080	0 %	0 %	50 %	50 %	190572011
70	NC_010935	GT	3	6	39196	39201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010935	CG	4	8	40072	40079	0 %	0 %	50 %	50 %	190572010
72	NC_010935	GC	4	8	40583	40590	0 %	0 %	50 %	50 %	190572010
73	NC_010935	AG	3	6	40848	40853	50 %	0 %	50 %	0 %	190571969
74	NC_010935	CG	3	6	41015	41020	0 %	0 %	50 %	50 %	190571969
75	NC_010935	GC	3	6	41152	41157	0 %	0 %	50 %	50 %	190571969
76	NC_010935	CG	3	6	41195	41200	0 %	0 %	50 %	50 %	190571969
77	NC_010935	TG	3	6	41545	41550	0 %	50 %	50 %	0 %	190571969
78	NC_010935	CG	3	6	42060	42065	0 %	0 %	50 %	50 %	190571970
79	NC_010935	CG	3	6	42115	42120	0 %	0 %	50 %	50 %	190571970
80	NC_010935	CG	3	6	42172	42177	0 %	0 %	50 %	50 %	190571970
81	NC_010935	AC	3	6	42331	42336	50 %	0 %	0 %	50 %	190571970
82	NC_010935	CA	3	6	42343	42348	50 %	0 %	0 %	50 %	190571970
83	NC_010935	GC	3	6	42378	42383	0 %	0 %	50 %	50 %	190571970
84	NC_010935	CG	3	6	42895	42900	0 %	0 %	50 %	50 %	190571970
85	NC_010935	CG	3	6	43067	43072	0 %	0 %	50 %	50 %	190571970
86	NC_010935	GA	3	6	44075	44080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010935	CG	3	6	44083	44088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010935	CA	3	6	44339	44344	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010935	CG	3	6	44647	44652	0 %	0 %	50 %	50 %	190571971
90	NC_010935	CA	3	6	44924	44929	50 %	0 %	0 %	50 %	190571971
91	NC_010935	GC	3	6	45114	45119	0 %	0 %	50 %	50 %	190571971
92	NC_010935	CG	3	6	45640	45645	0 %	0 %	50 %	50 %	190571972
93	NC_010935	GC	3	6	46035	46040	0 %	0 %	50 %	50 %	190571972
94	NC_010935	GA	3	6	46454	46459	50 %	0 %	50 %	0 %	190571973
95	NC_010935	GC	3	6	46481	46486	0 %	0 %	50 %	50 %	190571973
96	NC_010935	GC	3	6	47066	47071	0 %	0 %	50 %	50 %	190571974
97	NC_010935	CG	3	6	47123	47128	0 %	0 %	50 %	50 %	190571974
98	NC_010935	GC	3	6	47678	47683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010935	TC	3	6	47802	47807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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102	NC_010935	CG	3	6	47999	48004	0 %	0 %	50 %	50 %	190571975
103	NC_010935	GC	3	6	48207	48212	0 %	0 %	50 %	50 %	190571975
104	NC_010935	GC	3	6	48383	48388	0 %	0 %	50 %	50 %	190571975
105	NC_010935	CG	3	6	48486	48491	0 %	0 %	50 %	50 %	190571975
106	NC_010935	GA	3	6	48578	48583	50 %	0 %	50 %	0 %	190571975
107	NC_010935	GC	3	6	49378	49383	0 %	0 %	50 %	50 %	190571977
108	NC_010935	GA	3	6	49550	49555	50 %	0 %	50 %	0 %	190571977
109	NC_010935	CG	3	6	49787	49792	0 %	0 %	50 %	50 %	190571977
110	NC_010935	CG	4	8	50352	50359	0 %	0 %	50 %	50 %	190571978
111	NC_010935	GC	3	6	50470	50475	0 %	0 %	50 %	50 %	190571978
112	NC_010935	CG	3	6	51233	51238	0 %	0 %	50 %	50 %	190571979
113	NC_010935	CG	3	6	51995	52000	0 %	0 %	50 %	50 %	190571979
114	NC_010935	CG	3	6	52056	52061	0 %	0 %	50 %	50 %	190571979
115	NC_010935	GC	3	6	52420	52425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_010935	AC	3	6	53153	53158	50 %	0 %	0 %	50 %	190571980
117	NC_010935	GC	3	6	53377	53382	0 %	0 %	50 %	50 %	190571980
118	NC_010935	CG	3	6	53998	54003	0 %	0 %	50 %	50 %	190571981
119	NC_010935	AT	3	6	54283	54288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010935	CA	3	6	54352	54357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_010935	GC	3	6	54569	54574	0 %	0 %	50 %	50 %	190571982
122	NC_010935	CG	3	6	54610	54615	0 %	0 %	50 %	50 %	190571982
123	NC_010935	GC	3	6	54630	54635	0 %	0 %	50 %	50 %	190571982
124	NC_010935	GC	3	6	54641	54646	0 %	0 %	50 %	50 %	190571982
125	NC_010935	CG	3	6	54786	54791	0 %	0 %	50 %	50 %	190571982
126	NC_010935	CG	3	6	55563	55568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010935	GC	3	6	55707	55712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_010935	CA	3	6	55862	55867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_010935	GC	3	6	56627	56632	0 %	0 %	50 %	50 %	190571984
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132	NC_010935	GC	4	8	58317	58324	0 %	0 %	50 %	50 %	190571986
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142	NC_010935	GC	5	10	61061	61070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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145	NC_010935	TG	3	6	61976	61981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.