MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlorobium phaeobacteroides BS1 chromosome

Total Repeats: 6272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010831	GAAA	2	8	258	265	75 %	0 %	25 %	0 %	189499001
2	NC_010831	AGCC	2	8	319	326	25 %	0 %	25 %	50 %	189499001
3	NC_010831	ATCA	2	8	836	843	50 %	25 %	0 %	25 %	189499001
4	NC_010831	AAGC	2	8	984	991	50 %	0 %	25 %	25 %	189499001
5	NC_010831	ACGG	2	8	1911	1918	25 %	0 %	50 %	25 %	189499002
6	NC_010831	ACGG	2	8	2295	2302	25 %	0 %	50 %	25 %	189499002
7	NC_010831	CCAG	2	8	2370	2377	25 %	0 %	25 %	50 %	189499002
8	NC_010831	CTTT	2	8	3280	3287	0 %	75 %	0 %	25 %	189499003
9	NC_010831	TTGT	2	8	3523	3530	0 %	75 %	25 %	0 %	189499003
10	NC_010831	TACA	2	8	3812	3819	50 %	25 %	0 %	25 %	189499003
11	NC_010831	ACAA	2	8	4050	4057	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010831	GAAG	2	8	4186	4193	50 %	0 %	50 %	0 %	189499004
13	NC_010831	TTTG	2	8	4569	4576	0 %	75 %	25 %	0 %	189499005
14	NC_010831	TCCT	2	8	4732	4739	0 %	50 %	0 %	50 %	189499005
15	NC_010831	TGTT	2	8	4870	4877	0 %	75 %	25 %	0 %	189499005
16	NC_010831	GGTA	2	8	5024	5031	25 %	25 %	50 %	0 %	189499005
17	NC_010831	TATT	2	8	6860	6867	25 %	75 %	0 %	0 %	189499006
18	NC_010831	AAAC	2	8	6921	6928	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010831	TGAA	2	8	7477	7484	50 %	25 %	25 %	0 %	189499007
20	NC_010831	CGTC	2	8	7668	7675	0 %	25 %	25 %	50 %	189499007
21	NC_010831	AAGA	2	8	8171	8178	75 %	0 %	25 %	0 %	189499007
22	NC_010831	TCTG	2	8	8462	8469	0 %	50 %	25 %	25 %	189499007
23	NC_010831	CTGC	2	8	8577	8584	0 %	25 %	25 %	50 %	189499007
24	NC_010831	TGTA	2	8	8706	8713	25 %	50 %	25 %	0 %	189499007
25	NC_010831	GAAT	2	8	8820	8827	50 %	25 %	25 %	0 %	189499007
26	NC_010831	GAAA	2	8	9237	9244	75 %	0 %	25 %	0 %	189499007
27	NC_010831	GTTG	2	8	9397	9404	0 %	50 %	50 %	0 %	189499007
28	NC_010831	GTTT	2	8	10095	10102	0 %	75 %	25 %	0 %	189499008
29	NC_010831	TACA	2	8	10437	10444	50 %	25 %	0 %	25 %	189499008
30	NC_010831	GTTT	2	8	10449	10456	0 %	75 %	25 %	0 %	189499008
31	NC_010831	ATTC	2	8	10863	10870	25 %	50 %	0 %	25 %	189499008
32	NC_010831	TCGG	2	8	11064	11071	0 %	25 %	50 %	25 %	189499008
33	NC_010831	AGTA	2	8	11611	11618	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010831	TATG	2	8	11666	11673	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010831	ATGT	2	8	11752	11759	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010831	CTGT	2	8	12142	12149	0 %	50 %	25 %	25 %	189499009
37	NC_010831	CCAT	2	8	13450	13457	25 %	25 %	0 %	50 %	189499010
38	NC_010831	CATG	2	8	14077	14084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010831	TCGA	2	8	15004	15011	25 %	25 %	25 %	25 %	189499011
40	NC_010831	AACG	2	8	15944	15951	50 %	0 %	25 %	25 %	189499012
41	NC_010831	TTGT	2	8	16023	16030	0 %	75 %	25 %	0 %	189499012
42	NC_010831	AGGG	2	8	16060	16067	25 %	0 %	75 %	0 %	189499012
43	NC_010831	CGGT	2	8	16116	16123	0 %	25 %	50 %	25 %	189499012
44	NC_010831	GATT	2	8	16283	16290	25 %	50 %	25 %	0 %	189499012
45	NC_010831	GAGC	2	8	17473	17480	25 %	0 %	50 %	25 %	189499013
46	NC_010831	GAAA	2	8	17578	17585	75 %	0 %	25 %	0 %	189499013
47	NC_010831	TGCC	2	8	19380	19387	0 %	25 %	25 %	50 %	189499015
48	NC_010831	TGTC	2	8	19948	19955	0 %	50 %	25 %	25 %	189499015
49	NC_010831	ATGT	2	8	20701	20708	25 %	50 %	25 %	0 %	189499015
50	NC_010831	ATAA	2	8	20827	20834	75 %	25 %	0 %	0 %	189499015
51	NC_010831	TGAA	2	8	20851	20858	50 %	25 %	25 %	0 %	189499015
52	NC_010831	GGAA	2	8	21094	21101	50 %	0 %	50 %	0 %	189499016
53	NC_010831	ATTC	2	8	21715	21722	25 %	50 %	0 %	25 %	189499018
54	NC_010831	CGGA	2	8	22013	22020	25 %	0 %	50 %	25 %	189499018
55	NC_010831	CGGA	2	8	22555	22562	25 %	0 %	50 %	25 %	189499019
56	NC_010831	TCGA	2	8	23024	23031	25 %	25 %	25 %	25 %	189499019
57	NC_010831	AACC	2	8	23516	23523	50 %	0 %	0 %	50 %	189499019
58	NC_010831	ACAG	2	8	23919	23926	50 %	0 %	25 %	25 %	189499019
59	NC_010831	TGAG	2	8	24063	24070	25 %	25 %	50 %	0 %	189499019
60	NC_010831	GGAT	2	8	24194	24201	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010831	TGAT	2	8	24740	24747	25 %	50 %	25 %	0 %	189499020
62	NC_010831	CGGG	2	8	25956	25963	0 %	0 %	75 %	25 %	189499021
63	NC_010831	CGTT	2	8	26192	26199	0 %	50 %	25 %	25 %	189499021
64	NC_010831	TCAG	2	8	26215	26222	25 %	25 %	25 %	25 %	189499021
65	NC_010831	TACA	2	8	26503	26510	50 %	25 %	0 %	25 %	189499021
66	NC_010831	ACAT	2	8	27058	27065	50 %	25 %	0 %	25 %	189499022
67	NC_010831	TGCC	2	8	27481	27488	0 %	25 %	25 %	50 %	189499022
68	NC_010831	GAGG	2	8	27516	27523	25 %	0 %	75 %	0 %	189499022
69	NC_010831	ACCA	2	8	27942	27949	50 %	0 %	0 %	50 %	189499023
70	NC_010831	CTGC	2	8	29211	29218	0 %	25 %	25 %	50 %	189499024
71	NC_010831	AGTA	2	8	30394	30401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010831	TATT	2	8	30671	30678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010831	TCAG	2	8	30869	30876	25 %	25 %	25 %	25 %	189499026
74	NC_010831	TGGT	2	8	31610	31617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010831	TTCC	2	8	31754	31761	0 %	50 %	0 %	50 %	189499027
76	NC_010831	GTTC	2	8	32501	32508	0 %	50 %	25 %	25 %	189499027
77	NC_010831	TGGC	2	8	34177	34184	0 %	25 %	50 %	25 %	189499029
78	NC_010831	CAGG	2	8	34497	34504	25 %	0 %	50 %	25 %	189499029
79	NC_010831	TGCC	2	8	34520	34527	0 %	25 %	25 %	50 %	189499029
80	NC_010831	TTTG	2	8	35962	35969	0 %	75 %	25 %	0 %	189499031
81	NC_010831	CCTG	2	8	36071	36078	0 %	25 %	25 %	50 %	189499031
82	NC_010831	GTTC	2	8	36192	36199	0 %	50 %	25 %	25 %	189499031
83	NC_010831	CAAA	2	8	36381	36388	75 %	0 %	0 %	25 %	189499031
84	NC_010831	TCCG	2	8	36721	36728	0 %	25 %	25 %	50 %	189499031
85	NC_010831	TTTA	2	8	37031	37038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010831	GATT	2	8	37681	37688	25 %	50 %	25 %	0 %	189499032
87	NC_010831	AAGT	2	8	37710	37717	50 %	25 %	25 %	0 %	189499032
88	NC_010831	AATT	2	8	37843	37850	50 %	50 %	0 %	0 %	189499033
89	NC_010831	GCAG	2	8	38065	38072	25 %	0 %	50 %	25 %	189499033
90	NC_010831	ATGT	2	8	38163	38170	25 %	50 %	25 %	0 %	189499033
91	NC_010831	TCGG	2	8	38334	38341	0 %	25 %	50 %	25 %	189499033
92	NC_010831	TGGC	2	8	38523	38530	0 %	25 %	50 %	25 %	189499033
93	NC_010831	TATT	3	12	39895	39906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010831	AATA	2	8	40011	40018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010831	CCTG	2	8	40194	40201	0 %	25 %	25 %	50 %	189499034
96	NC_010831	AGGA	2	8	40266	40273	50 %	0 %	50 %	0 %	189499034
97	NC_010831	TAAA	2	8	40633	40640	75 %	25 %	0 %	0 %	189499036
98	NC_010831	TTTC	2	8	41094	41101	0 %	75 %	0 %	25 %	189499037
99	NC_010831	ATTG	2	8	41202	41209	25 %	50 %	25 %	0 %	189499037
100	NC_010831	TTGA	2	8	41608	41615	25 %	50 %	25 %	0 %	189499038
101	NC_010831	TGCT	2	8	42405	42412	0 %	50 %	25 %	25 %	189499039
102	NC_010831	GGCA	2	8	42982	42989	25 %	0 %	50 %	25 %	189499040
103	NC_010831	GGTC	2	8	43407	43414	0 %	25 %	50 %	25 %	189499040
104	NC_010831	TTTC	2	8	43792	43799	0 %	75 %	0 %	25 %	189499040
105	NC_010831	CTGC	2	8	44131	44138	0 %	25 %	25 %	50 %	189499040
106	NC_010831	AAGG	2	8	44313	44320	50 %	0 %	50 %	0 %	189499040
107	NC_010831	GGAC	2	8	45150	45157	25 %	0 %	50 %	25 %	189499041
108	NC_010831	TGAA	2	8	45656	45663	50 %	25 %	25 %	0 %	189499041
109	NC_010831	TGTA	2	8	46041	46048	25 %	50 %	25 %	0 %	189499042
110	NC_010831	ATCG	2	8	46127	46134	25 %	25 %	25 %	25 %	189499042
111	NC_010831	CAAG	2	8	46803	46810	50 %	0 %	25 %	25 %	189499043
112	NC_010831	CATG	2	8	47169	47176	25 %	25 %	25 %	25 %	189499043
113	NC_010831	TTGG	2	8	47670	47677	0 %	50 %	50 %	0 %	189499043
114	NC_010831	AAAT	2	8	48173	48180	75 %	25 %	0 %	0 %	189499044
115	NC_010831	TAAT	2	8	48287	48294	50 %	50 %	0 %	0 %	189499044
116	NC_010831	CCGT	2	8	48383	48390	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010831	TGTT	2	8	48436	48443	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010831	TGGT	2	8	49155	49162	0 %	50 %	50 %	0 %	189499046
119	NC_010831	TGAA	2	8	49397	49404	50 %	25 %	25 %	0 %	189499046
120	NC_010831	AGTA	2	8	49426	49433	50 %	25 %	25 %	0 %	189499046
121	NC_010831	AAGG	2	8	49721	49728	50 %	0 %	50 %	0 %	189499046
122	NC_010831	TTTA	2	8	49808	49815	25 %	75 %	0 %	0 %	189499046
123	NC_010831	ATGG	2	8	50355	50362	25 %	25 %	50 %	0 %	189499047
124	NC_010831	TCAT	2	8	51142	51149	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_010831	TGAT	2	8	51627	51634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010831	GTGA	2	8	52266	52273	25 %	25 %	50 %	0 %	189499049
127	NC_010831	GAAA	2	8	52413	52420	75 %	0 %	25 %	0 %	189499049
128	NC_010831	GTAT	2	8	52507	52514	25 %	50 %	25 %	0 %	189499049
129	NC_010831	GATA	2	8	52799	52806	50 %	25 %	25 %	0 %	189499049
130	NC_010831	CAAA	2	8	53649	53656	75 %	0 %	0 %	25 %	189499051
131	NC_010831	CTGC	2	8	54010	54017	0 %	25 %	25 %	50 %	189499051
132	NC_010831	AACG	2	8	54539	54546	50 %	0 %	25 %	25 %	189499051
133	NC_010831	GCGT	2	8	54808	54815	0 %	25 %	50 %	25 %	189499051
134	NC_010831	ACTT	2	8	55239	55246	25 %	50 %	0 %	25 %	189499052
135	NC_010831	GGCT	2	8	55763	55770	0 %	25 %	50 %	25 %	189499052
136	NC_010831	GCAG	2	8	55803	55810	25 %	0 %	50 %	25 %	189499052
137	NC_010831	GGAT	2	8	56092	56099	25 %	25 %	50 %	0 %	189499053
138	NC_010831	ATGA	2	8	56285	56292	50 %	25 %	25 %	0 %	189499053
139	NC_010831	GATC	2	8	57275	57282	25 %	25 %	25 %	25 %	189499055
140	NC_010831	TGAT	2	8	57415	57422	25 %	50 %	25 %	0 %	189499055
141	NC_010831	TACA	2	8	57739	57746	50 %	25 %	0 %	25 %	189499057
142	NC_010831	GGCA	2	8	58363	58370	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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