MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlorobium phaeobacteroides BS1 chromosome

Total Repeats: 5436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010831	CAA	2	6	1517	1522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010831	TGT	2	6	1625	1630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010831	CAC	2	6	1644	1649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_010831	ACA	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010831	CAA	5	15	1724	1738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010831	ATA	2	6	1754	1759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010831	AAG	2	6	1760	1765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010831	TTC	2	6	4062	4067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010831	TGA	2	6	4087	4092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010831	AGG	2	6	4405	4410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010831	TAT	2	6	4448	4453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010831	AAT	2	6	4473	4478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010831	GTA	2	6	4510	4515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010831	TAA	2	6	4522	4527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010831	AAT	2	6	4538	4543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010831	TTG	2	6	5382	5387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010831	TTG	2	6	6955	6960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010831	AAG	2	6	11459	11464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010831	AAC	2	6	11593	11598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010831	ATG	2	6	11734	11739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010831	AGG	2	6	11782	11787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010831	GAA	2	6	11908	11913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010831	TCA	2	6	12075	12080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010831	ATA	2	6	12093	12098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010831	GTA	2	6	13984	13989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010831	ATA	2	6	22279	22284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010831	TAA	2	6	24218	24223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010831	GGC	2	6	24240	24245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010831	AGA	2	6	25203	25208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010831	GTT	2	6	28735	28740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010831	ATT	2	6	30294	30299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010831	GTA	2	6	30305	30310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010831	TGC	2	6	30383	30388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010831	ATA	2	6	30679	30684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010831	GTT	2	6	30695	30700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010831	TGT	2	6	30740	30745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010831	TTG	2	6	31401	31406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010831	ATT	2	6	31455	31460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010831	GCT	2	6	31528	31533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010831	CAT	2	6	31561	31566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010831	CGA	2	6	31579	31584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010831	AGG	2	6	31625	31630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010831	TGC	2	6	33093	33098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010831	AGC	3	9	33221	33229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010831	TGT	2	6	33244	33249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010831	CCT	2	6	33289	33294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_010831	TAA	2	6	33380	33385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010831	CGT	2	6	33427	33432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010831	GGC	2	6	33438	33443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010831	TGG	2	6	33446	33451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010831	TAA	2	6	33828	33833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010831	CCG	2	6	33868	33873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_010831	TCC	2	6	34024	34029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_010831	ATT	2	6	34034	34039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010831	ACC	2	6	34097	34102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_010831	TCC	2	6	34103	34108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_010831	TGA	2	6	35436	35441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010831	TGT	2	6	36909	36914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010831	TTA	3	9	37078	37086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010831	GGA	2	6	37090	37095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010831	ATG	2	6	37736	37741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010831	AAG	2	6	39749	39754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010831	CGT	2	6	39775	39780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010831	GTG	2	6	39812	39817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010831	TTG	3	9	39849	39857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010831	GAC	2	6	40063	40068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010831	CGG	2	6	40296	40301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010831	TAA	2	6	40814	40819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010831	ATT	2	6	41393	41398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010831	TGT	2	6	41410	41415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010831	AAG	2	6	42236	42241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010831	TTC	2	6	42302	42307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010831	TGC	2	6	42337	42342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010831	TGA	2	6	42359	42364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010831	GCT	2	6	42387	42392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010831	GAT	2	6	42731	42736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010831	GAT	2	6	42745	42750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010831	GAT	2	6	42785	42790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010831	CAT	2	6	42795	42800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010831	CTT	2	6	44439	44444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010831	TTA	2	6	44450	44455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010831	TAA	2	6	44497	44502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010831	GAT	2	6	48049	48054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010831	GCA	2	6	48421	48426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010831	TGT	2	6	48458	48463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010831	TTG	2	6	48478	48483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010831	CAA	2	6	48540	48545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010831	GCA	2	6	50624	50629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010831	CTT	2	6	50766	50771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010831	CAC	2	6	50844	50849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_010831	CAA	2	6	50855	50860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010831	TGA	2	6	50998	51003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010831	TAT	2	6	51030	51035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010831	CGA	2	6	51157	51162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010831	TTG	2	6	51356	51361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010831	AAC	2	6	51496	51501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010831	CAC	2	6	51617	51622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_010831	CAA	2	6	51641	51646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010831	ATC	2	6	51726	51731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010831	GAC	2	6	51841	51846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010831	ATC	2	6	51977	51982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010831	CAT	2	6	52029	52034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010831	ATG	2	6	52112	52117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010831	TAA	2	6	52964	52969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010831	TCA	2	6	52986	52991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010831	GTC	2	6	53013	53018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010831	AAT	2	6	53111	53116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010831	GCG	2	6	53149	53154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010831	TGA	2	6	53274	53279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010831	ATT	2	6	53320	53325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010831	ACC	2	6	53577	53582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_010831	TGG	2	6	55996	56001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010831	GGT	2	6	56021	56026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010831	GGT	2	6	56045	56050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010831	GTT	2	6	56654	56659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010831	TCG	2	6	56705	56710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010831	TCT	2	6	56738	56743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010831	GAT	2	6	57065	57070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010831	ATC	2	6	57698	57703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010831	ATC	2	6	58209	58214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010831	GTT	2	6	58243	58248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010831	ATA	2	6	58297	58302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010831	ATA	2	6	58406	58411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010831	CTG	2	6	58456	58461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010831	GAA	2	6	60316	60321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010831	AGC	2	6	60370	60375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010831	AGG	2	6	60400	60405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010831	GAA	2	6	60444	60449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010831	CCA	2	6	60451	60456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_010831	TTG	2	6	60570	60575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010831	AGC	2	6	60605	60610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010831	AGC	2	6	60649	60654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010831	GAA	2	6	60657	60662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010831	AGA	2	6	60779	60784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010831	CGT	2	6	60803	60808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010831	CGG	2	6	60921	60926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010831	CTT	2	6	60959	60964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010831	TCA	2	6	60997	61002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010831	TCA	2	6	61036	61041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010831	CAC	2	6	61102	61107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_010831	CGC	2	6	61123	61128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_010831	TCA	2	6	61207	61212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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