MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2 chromosome

Total Repeats: 1662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010830	AAAAG	2	10	1908	1917	80 %	0 %	20 %	0 %	189501471
2	NC_010830	ATATA	2	10	2169	2178	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010830	CATTG	2	10	2807	2816	20 %	40 %	20 %	20 %	189501473
4	NC_010830	TTGGA	2	10	3644	3653	20 %	40 %	40 %	0 %	189501474
5	NC_010830	TAAAA	2	10	3820	3829	80 %	20 %	0 %	0 %	189501474
6	NC_010830	AAAAG	2	10	5024	5033	80 %	0 %	20 %	0 %	189501475
7	NC_010830	ATTAG	2	10	5037	5046	40 %	40 %	20 %	0 %	189501475
8	NC_010830	ATATA	2	10	6597	6606	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010830	TAAAT	2	10	7745	7754	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010830	CTATC	2	10	7902	7911	20 %	40 %	0 %	40 %	189501476
11	NC_010830	AAATA	2	10	8434	8443	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010830	ATTAT	2	10	11273	11282	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010830	TATCT	2	10	17464	17473	20 %	60 %	0 %	20 %	189501482
14	NC_010830	GCAGT	2	10	20534	20543	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_010830	AAATT	2	10	23413	23422	60 %	40 %	0 %	0 %	189501487
16	NC_010830	CTGCT	2	10	24821	24830	0 %	40 %	20 %	40 %	189501488
17	NC_010830	CTGAT	2	10	25465	25474	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010830	ATTAT	2	10	27391	27400	40 %	60 %	0 %	0 %	189501490
19	NC_010830	AGCAC	2	10	28401	28410	40 %	0 %	20 %	40 %	189501491
20	NC_010830	TATAC	2	10	29021	29030	40 %	40 %	0 %	20 %	294661089
21	NC_010830	TGATA	2	10	29321	29330	40 %	40 %	20 %	0 %	294661089
22	NC_010830	TATTG	2	10	30257	30266	20 %	60 %	20 %	0 %	294661089
23	NC_010830	GCAAA	2	10	30565	30574	60 %	0 %	20 %	20 %	189501493
24	NC_010830	AAAGA	2	10	31110	31119	80 %	0 %	20 %	0 %	189501493
25	NC_010830	ACATA	2	10	34952	34961	60 %	20 %	0 %	20 %	189501494
26	NC_010830	ATATT	2	10	38007	38016	40 %	60 %	0 %	0 %	189501497
27	NC_010830	ATATT	2	10	38066	38075	40 %	60 %	0 %	0 %	189501497
28	NC_010830	GAAAA	2	10	38865	38874	80 %	0 %	20 %	0 %	189501497
29	NC_010830	CAAAT	2	10	40051	40060	60 %	20 %	0 %	20 %	189501497
30	NC_010830	ATCAT	2	10	40495	40504	40 %	40 %	0 %	20 %	189501497
31	NC_010830	TTAAC	2	10	41959	41968	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_010830	TAAAA	2	10	42034	42043	80 %	20 %	0 %	0 %	189501499
33	NC_010830	AATAA	2	10	42140	42149	80 %	20 %	0 %	0 %	189501499
34	NC_010830	AGCAT	2	10	43423	43432	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_010830	TTCCT	2	10	43775	43784	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_010830	AAGCA	2	10	44422	44431	60 %	0 %	20 %	20 %	294661090
37	NC_010830	AAAAC	2	10	44569	44578	80 %	0 %	0 %	20 %	294661091
38	NC_010830	TTTAA	2	10	44746	44755	40 %	60 %	0 %	0 %	294661091
39	NC_010830	TATTT	2	10	45007	45016	20 %	80 %	0 %	0 %	189501501
40	NC_010830	TATTT	2	10	48961	48970	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010830	AGACA	2	10	49143	49152	60 %	0 %	20 %	20 %	189501504
42	NC_010830	TTAGC	2	10	49708	49717	20 %	40 %	20 %	20 %	189501505
43	NC_010830	TAAGA	2	10	50103	50112	60 %	20 %	20 %	0 %	189501505
44	NC_010830	TCATT	2	10	51748	51757	20 %	60 %	0 %	20 %	189501505
45	NC_010830	TTTAC	2	10	52019	52028	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_010830	TCTTT	2	10	52841	52850	0 %	80 %	0 %	20 %	189501506
47	NC_010830	AGCAT	2	10	53254	53263	40 %	20 %	20 %	20 %	189501506
48	NC_010830	ATTGG	2	10	54215	54224	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010830	CTATT	2	10	54883	54892	20 %	60 %	0 %	20 %	189501507
50	NC_010830	TCCTA	2	10	55433	55442	20 %	40 %	0 %	40 %	189501507
51	NC_010830	ACCGT	2	10	56043	56052	20 %	20 %	20 %	40 %	189501507
52	NC_010830	ATAAA	2	10	57655	57664	80 %	20 %	0 %	0 %	189501507
53	NC_010830	AGTAA	2	10	57915	57924	60 %	20 %	20 %	0 %	189501507
54	NC_010830	TTTAA	2	10	58209	58218	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010830	ATTAA	2	10	58273	58282	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010830	TGGTT	2	10	59872	59881	0 %	60 %	40 %	0 %	189501509
57	NC_010830	TAAGA	2	10	60697	60706	60 %	20 %	20 %	0 %	189501509
58	NC_010830	AGAGC	2	10	60815	60824	40 %	0 %	40 %	20 %	189501509
59	NC_010830	AGTAT	2	10	61770	61779	40 %	40 %	20 %	0 %	189501510
60	NC_010830	TTTTA	2	10	63089	63098	20 %	80 %	0 %	0 %	189501511
61	NC_010830	CAAAC	2	10	64942	64951	60 %	0 %	0 %	40 %	189501512
62	NC_010830	GCCAA	2	10	65714	65723	40 %	0 %	20 %	40 %	189501512
63	NC_010830	ATTAA	2	10	66557	66566	60 %	40 %	0 %	0 %	189501513
64	NC_010830	GGATA	2	10	68528	68537	40 %	20 %	40 %	0 %	189501515
65	NC_010830	AGGCA	2	10	70903	70912	40 %	0 %	40 %	20 %	189501518
66	NC_010830	AATTT	2	10	72158	72167	40 %	60 %	0 %	0 %	294661092
67	NC_010830	ATATT	2	10	74837	74846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010830	ATTTT	2	10	76725	76734	20 %	80 %	0 %	0 %	189501525
69	NC_010830	TTTAT	2	10	77097	77106	20 %	80 %	0 %	0 %	189501525
70	NC_010830	CAGCT	2	10	77806	77815	20 %	20 %	20 %	40 %	189501526
71	NC_010830	TTTTA	2	10	78038	78047	20 %	80 %	0 %	0 %	189501527
72	NC_010830	AAGGT	2	10	80119	80128	40 %	20 %	40 %	0 %	189501529
73	NC_010830	AGCTC	2	10	80693	80702	20 %	20 %	20 %	40 %	189501529
74	NC_010830	TAAAT	2	10	81630	81639	60 %	40 %	0 %	0 %	189501530
75	NC_010830	AAAAG	2	10	83401	83410	80 %	0 %	20 %	0 %	189501531
76	NC_010830	TTGAG	2	10	84795	84804	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010830	TATTT	2	10	88503	88512	20 %	80 %	0 %	0 %	189501534
78	NC_010830	CTTTA	2	10	88982	88991	20 %	60 %	0 %	20 %	189501535
79	NC_010830	AGTAA	2	10	93602	93611	60 %	20 %	20 %	0 %	189501540
80	NC_010830	GAAAG	2	10	93623	93632	60 %	0 %	40 %	0 %	189501540
81	NC_010830	TTTTC	2	10	95351	95360	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_010830	TAATA	2	10	96136	96145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010830	TTGAA	2	10	96538	96547	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010830	TGACT	2	10	96917	96926	20 %	40 %	20 %	20 %	294661098
85	NC_010830	TCAAC	2	10	99157	99166	40 %	20 %	0 %	40 %	189501545
86	NC_010830	AAACC	2	10	99776	99785	60 %	0 %	0 %	40 %	189501545
87	NC_010830	ATAAG	2	10	104403	104412	60 %	20 %	20 %	0 %	294661101
88	NC_010830	TATTT	2	10	104558	104567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010830	CTTCC	2	10	106410	106419	0 %	40 %	0 %	60 %	189501552
90	NC_010830	AAAGG	2	10	106814	106823	60 %	0 %	40 %	0 %	189501552
91	NC_010830	CTATA	2	10	107838	107847	40 %	40 %	0 %	20 %	189501552
92	NC_010830	ACTTA	2	10	108118	108127	40 %	40 %	0 %	20 %	189501552
93	NC_010830	AAACT	2	10	108198	108207	60 %	20 %	0 %	20 %	189501552
94	NC_010830	AGTTT	2	10	109085	109094	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010830	TAAAT	2	10	110684	110693	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010830	TCCTG	2	10	114897	114906	0 %	40 %	20 %	40 %	189501558
97	NC_010830	TATTT	2	10	115469	115478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010830	ATATT	2	10	115539	115548	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010830	TTAAT	2	10	115597	115606	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010830	AGAGA	2	10	116927	116936	60 %	0 %	40 %	0 %	189501559
101	NC_010830	TTTAG	2	10	116995	117004	20 %	60 %	20 %	0 %	189501559
102	NC_010830	TTACA	2	10	120397	120406	40 %	40 %	0 %	20 %	189501562
103	NC_010830	TGCTA	2	10	121260	121269	20 %	40 %	20 %	20 %	189501564
104	NC_010830	TTAAA	2	10	123846	123855	60 %	40 %	0 %	0 %	294661103
105	NC_010830	AATTT	2	10	124365	124374	40 %	60 %	0 %	0 %	294661103
106	NC_010830	AACTT	2	10	124803	124812	40 %	40 %	0 %	20 %	294661103
107	NC_010830	GATAG	2	10	125165	125174	40 %	20 %	40 %	0 %	294661103
108	NC_010830	AAGGT	2	10	126272	126281	40 %	20 %	40 %	0 %	189501567
109	NC_010830	TTTAT	2	10	127425	127434	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010830	GCTTT	2	10	127464	127473	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_010830	TATTG	2	10	127726	127735	20 %	60 %	20 %	0 %	189501570
112	NC_010830	CTGAC	2	10	128401	128410	20 %	20 %	20 %	40 %	189501570
113	NC_010830	TACTC	2	10	128713	128722	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_010830	ATTAA	2	10	129255	129264	60 %	40 %	0 %	0 %	189501572
115	NC_010830	ATTAA	2	10	129822	129831	60 %	40 %	0 %	0 %	189501572
116	NC_010830	TACCT	2	10	131090	131099	20 %	40 %	0 %	40 %	189501572
117	NC_010830	AATAG	2	10	132216	132225	60 %	20 %	20 %	0 %	189501573
118	NC_010830	AATGT	2	10	135805	135814	40 %	40 %	20 %	0 %	294661104
119	NC_010830	ATGTT	2	10	136875	136884	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010830	TTTAA	2	10	138068	138077	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010830	TTCGT	2	10	138251	138260	0 %	60 %	20 %	20 %	189501578
122	NC_010830	TATGT	2	10	141979	141988	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010830	AAAGT	2	10	142121	142130	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010830	ATCTG	2	10	142671	142680	20 %	40 %	20 %	20 %	294661106
125	NC_010830	ATATA	2	10	143529	143538	60 %	40 %	0 %	0 %	294661106
126	NC_010830	TATAA	2	10	143774	143783	60 %	40 %	0 %	0 %	294661106
127	NC_010830	TAATT	2	10	144025	144034	40 %	60 %	0 %	0 %	294661106
128	NC_010830	AATAG	2	10	146156	146165	60 %	20 %	20 %	0 %	189501584
129	NC_010830	AGTAT	2	10	147332	147341	40 %	40 %	20 %	0 %	189501584
130	NC_010830	TGTAG	2	10	147644	147653	20 %	40 %	40 %	0 %	189501585
131	NC_010830	TATTT	2	10	151430	151439	20 %	80 %	0 %	0 %	189501590
132	NC_010830	ATAAA	2	10	151731	151740	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010830	TTATT	2	10	154806	154815	20 %	80 %	0 %	0 %	294661107
134	NC_010830	TAAGA	2	10	156142	156151	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010830	TTTAG	2	10	156212	156221	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010830	ATAAG	2	10	156587	156596	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010830	TCATT	2	10	156604	156613	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_010830	AAATA	2	10	156757	156766	80 %	20 %	0 %	0 %	294661108
139	NC_010830	TTAAA	2	10	158467	158476	60 %	40 %	0 %	0 %	189501595
140	NC_010830	TAAAA	2	10	163028	163037	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010830	TACAG	2	10	164075	164084	40 %	20 %	20 %	20 %	189501600
142	NC_010830	CATAA	2	10	164679	164688	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_010830	ACTAT	2	10	165259	165268	40 %	40 %	0 %	20 %	189501601
144	NC_010830	ATAAA	2	10	165300	165309	80 %	20 %	0 %	0 %	189501601
145	NC_010830	ATGAT	2	10	166082	166091	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010830	CAATG	2	10	167219	167228	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_010830	CAATG	2	10	167318	167327	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_010830	CATTC	2	10	168212	168221	20 %	40 %	0 %	40 %	189501606
149	NC_010830	TTAGC	2	10	168572	168581	20 %	40 %	20 %	20 %	189501606
150	NC_010830	GACTT	2	10	169222	169231	20 %	40 %	20 %	20 %	189501606
151	NC_010830	GCTTG	2	10	170218	170227	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_010830	ACAAT	2	10	176986	176995	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_010830	TAAAA	2	10	177008	177017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010830	TTATT	2	10	178226	178235	20 %	80 %	0 %	0 %	189501614
155	NC_010830	ATAAA	2	10	178943	178952	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_010830	TATAG	2	10	179113	179122	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010830	TTATC	2	10	180270	180279	20 %	60 %	0 %	20 %	189501616
158	NC_010830	TATAT	2	10	181145	181154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_010830	ATAAG	2	10	181362	181371	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_010830	ACAAA	2	10	181633	181642	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
161	NC_010830	AAATA	2	10	181792	181801	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_010830	TCAAA	2	10	185321	185330	60 %	20 %	0 %	20 %	189501617
163	NC_010830	CACTT	2	10	188829	188838	20 %	40 %	0 %	40 %	189501621
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165	NC_010830	AATTA	2	10	189802	189811	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_010830	GTAGC	2	10	190844	190853	20 %	20 %	40 %	20 %	294661111
167	NC_010830	AGATA	2	10	192241	192250	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
168	NC_010830	ATATT	2	10	192251	192260	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_010830	ATTTT	2	10	197152	197161	20 %	80 %	0 %	0 %	189501627
174	NC_010830	TAAGA	2	10	200023	200032	60 %	20 %	20 %	0 %	189501633
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181	NC_010830	TCTAG	2	10	205866	205875	20 %	40 %	20 %	20 %	189501646
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183	NC_010830	ATCAG	2	10	207578	207587	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
184	NC_010830	AGTAA	2	10	208465	208474	60 %	20 %	20 %	0 %	189501651
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191	NC_010830	AGTAT	2	10	214439	214448	40 %	40 %	20 %	0 %	294661115
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196	NC_010830	AATTA	2	10	219259	219268	60 %	40 %	0 %	0 %	189501662
197	NC_010830	GCAAT	2	10	219441	219450	40 %	20 %	20 %	20 %	189501662
198	NC_010830	AAGCC	2	10	219543	219552	40 %	0 %	20 %	40 %	189501662
199	NC_010830	ATGAG	2	10	220115	220124	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
200	NC_010830	GTACA	2	10	220709	220718	40 %	20 %	20 %	20 %	294661116
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202	NC_010830	CCATA	2	10	221705	221714	40 %	20 %	0 %	40 %	294661116
203	NC_010830	GCTAA	2	10	223849	223858	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
204	NC_010830	TTAAC	2	10	224918	224927	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
205	NC_010830	ATTAT	2	10	225770	225779	40 %	60 %	0 %	0 %	294661118
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219	NC_010830	ATGAG	2	10	234625	234634	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
220	NC_010830	GTACA	2	10	235219	235228	40 %	20 %	20 %	20 %	294661119
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223	NC_010830	GCTAA	2	10	238359	238368	40 %	20 %	20 %	20 %	189501673
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225	NC_010830	ATTAT	2	10	240280	240289	40 %	60 %	0 %	0 %	294661120
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232	NC_010830	TTGAG	2	10	244255	244264	20 %	40 %	40 %	0 %	189501676
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240	NC_010830	CTATG	2	10	250370	250379	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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250	NC_010830	ATAAA	2	10	264446	264455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_010830	AAGTT	2	10	265947	265956	40 %	40 %	20 %	0 %	189501691
252	NC_010830	AAATA	2	10	266244	266253	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_010830	ATTTT	2	10	267485	267494	20 %	80 %	0 %	0 %	189501692
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255	NC_010830	TAGCA	2	10	271053	271062	40 %	20 %	20 %	20 %	189501695
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259	NC_010830	TGGGA	2	10	273362	273371	20 %	20 %	60 %	0 %	189501697
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261	NC_010830	GTATT	2	10	275262	275271	20 %	60 %	20 %	0 %	294661122
262	NC_010830	GTTCC	2	10	275923	275932	0 %	40 %	20 %	40 %	189501700
263	NC_010830	ATCAC	2	10	277452	277461	40 %	20 %	0 %	40 %	189501701
264	NC_010830	ATACT	2	10	278856	278865	40 %	40 %	0 %	20 %	189501701
265	NC_010830	TCATA	2	10	280332	280341	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
266	NC_010830	AGTTT	2	10	280476	280485	20 %	60 %	20 %	0 %	189501704
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268	NC_010830	AATAT	2	10	283746	283755	60 %	40 %	0 %	0 %	294661127
269	NC_010830	TCTAA	2	10	286033	286042	40 %	40 %	0 %	20 %	189501709
270	NC_010830	CTAAA	2	10	288518	288527	60 %	20 %	0 %	20 %	189501711
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272	NC_010830	CTTTT	2	10	290878	290887	0 %	80 %	0 %	20 %	189501712
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385	NC_010830	TATTT	2	10	423321	423330	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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405	NC_010830	TTAAA	2	10	438063	438072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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