MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2 chromosome

Total Repeats: 1176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010830	AAAAG	2	10	1908	1917	80 %	0 %	20 %	0 %	189501471
2	NC_010830	CATTG	2	10	2807	2816	20 %	40 %	20 %	20 %	189501473
3	NC_010830	TTGGA	2	10	3644	3653	20 %	40 %	40 %	0 %	189501474
4	NC_010830	TAAAA	2	10	3820	3829	80 %	20 %	0 %	0 %	189501474
5	NC_010830	AAAAG	2	10	5024	5033	80 %	0 %	20 %	0 %	189501475
6	NC_010830	ATTAG	2	10	5037	5046	40 %	40 %	20 %	0 %	189501475
7	NC_010830	CTATC	2	10	7902	7911	20 %	40 %	0 %	40 %	189501476
8	NC_010830	TATCT	2	10	17464	17473	20 %	60 %	0 %	20 %	189501482
9	NC_010830	AAATT	2	10	23413	23422	60 %	40 %	0 %	0 %	189501487
10	NC_010830	CTGCT	2	10	24821	24830	0 %	40 %	20 %	40 %	189501488
11	NC_010830	ATTAT	2	10	27391	27400	40 %	60 %	0 %	0 %	189501490
12	NC_010830	AGCAC	2	10	28401	28410	40 %	0 %	20 %	40 %	189501491
13	NC_010830	TATAC	2	10	29021	29030	40 %	40 %	0 %	20 %	294661089
14	NC_010830	TGATA	2	10	29321	29330	40 %	40 %	20 %	0 %	294661089
15	NC_010830	TATTG	2	10	30257	30266	20 %	60 %	20 %	0 %	294661089
16	NC_010830	GCAAA	2	10	30565	30574	60 %	0 %	20 %	20 %	189501493
17	NC_010830	AAAGA	2	10	31110	31119	80 %	0 %	20 %	0 %	189501493
18	NC_010830	ACATA	2	10	34952	34961	60 %	20 %	0 %	20 %	189501494
19	NC_010830	ATATT	2	10	38007	38016	40 %	60 %	0 %	0 %	189501497
20	NC_010830	ATATT	2	10	38066	38075	40 %	60 %	0 %	0 %	189501497
21	NC_010830	GAAAA	2	10	38865	38874	80 %	0 %	20 %	0 %	189501497
22	NC_010830	CAAAT	2	10	40051	40060	60 %	20 %	0 %	20 %	189501497
23	NC_010830	ATCAT	2	10	40495	40504	40 %	40 %	0 %	20 %	189501497
24	NC_010830	TAAAA	2	10	42034	42043	80 %	20 %	0 %	0 %	189501499
25	NC_010830	AATAA	2	10	42140	42149	80 %	20 %	0 %	0 %	189501499
26	NC_010830	AAGCA	2	10	44422	44431	60 %	0 %	20 %	20 %	294661090
27	NC_010830	AAAAC	2	10	44569	44578	80 %	0 %	0 %	20 %	294661091
28	NC_010830	TTTAA	2	10	44746	44755	40 %	60 %	0 %	0 %	294661091
29	NC_010830	TATTT	2	10	45007	45016	20 %	80 %	0 %	0 %	189501501
30	NC_010830	AGACA	2	10	49143	49152	60 %	0 %	20 %	20 %	189501504
31	NC_010830	TTAGC	2	10	49708	49717	20 %	40 %	20 %	20 %	189501505
32	NC_010830	TAAGA	2	10	50103	50112	60 %	20 %	20 %	0 %	189501505
33	NC_010830	TCATT	2	10	51748	51757	20 %	60 %	0 %	20 %	189501505
34	NC_010830	TCTTT	2	10	52841	52850	0 %	80 %	0 %	20 %	189501506
35	NC_010830	AGCAT	2	10	53254	53263	40 %	20 %	20 %	20 %	189501506
36	NC_010830	CTATT	2	10	54883	54892	20 %	60 %	0 %	20 %	189501507
37	NC_010830	TCCTA	2	10	55433	55442	20 %	40 %	0 %	40 %	189501507
38	NC_010830	ACCGT	2	10	56043	56052	20 %	20 %	20 %	40 %	189501507
39	NC_010830	ATAAA	2	10	57655	57664	80 %	20 %	0 %	0 %	189501507
40	NC_010830	AGTAA	2	10	57915	57924	60 %	20 %	20 %	0 %	189501507
41	NC_010830	TGGTT	2	10	59872	59881	0 %	60 %	40 %	0 %	189501509
42	NC_010830	TAAGA	2	10	60697	60706	60 %	20 %	20 %	0 %	189501509
43	NC_010830	AGAGC	2	10	60815	60824	40 %	0 %	40 %	20 %	189501509
44	NC_010830	AGTAT	2	10	61770	61779	40 %	40 %	20 %	0 %	189501510
45	NC_010830	TTTTA	2	10	63089	63098	20 %	80 %	0 %	0 %	189501511
46	NC_010830	CAAAC	2	10	64942	64951	60 %	0 %	0 %	40 %	189501512
47	NC_010830	GCCAA	2	10	65714	65723	40 %	0 %	20 %	40 %	189501512
48	NC_010830	ATTAA	2	10	66557	66566	60 %	40 %	0 %	0 %	189501513
49	NC_010830	GGATA	2	10	68528	68537	40 %	20 %	40 %	0 %	189501515
50	NC_010830	AGGCA	2	10	70903	70912	40 %	0 %	40 %	20 %	189501518
51	NC_010830	AATTT	2	10	72158	72167	40 %	60 %	0 %	0 %	294661092
52	NC_010830	ATTTT	2	10	76725	76734	20 %	80 %	0 %	0 %	189501525
53	NC_010830	TTTAT	2	10	77097	77106	20 %	80 %	0 %	0 %	189501525
54	NC_010830	CAGCT	2	10	77806	77815	20 %	20 %	20 %	40 %	189501526
55	NC_010830	TTTTA	2	10	78038	78047	20 %	80 %	0 %	0 %	189501527
56	NC_010830	AAGGT	2	10	80119	80128	40 %	20 %	40 %	0 %	189501529
57	NC_010830	AGCTC	2	10	80693	80702	20 %	20 %	20 %	40 %	189501529
58	NC_010830	TAAAT	2	10	81630	81639	60 %	40 %	0 %	0 %	189501530
59	NC_010830	AAAAG	2	10	83401	83410	80 %	0 %	20 %	0 %	189501531
60	NC_010830	TATTT	2	10	88503	88512	20 %	80 %	0 %	0 %	189501534
61	NC_010830	CTTTA	2	10	88982	88991	20 %	60 %	0 %	20 %	189501535
62	NC_010830	AGTAA	2	10	93602	93611	60 %	20 %	20 %	0 %	189501540
63	NC_010830	GAAAG	2	10	93623	93632	60 %	0 %	40 %	0 %	189501540
64	NC_010830	TGACT	2	10	96917	96926	20 %	40 %	20 %	20 %	294661098
65	NC_010830	TCAAC	2	10	99157	99166	40 %	20 %	0 %	40 %	189501545
66	NC_010830	AAACC	2	10	99776	99785	60 %	0 %	0 %	40 %	189501545
67	NC_010830	ATAAG	2	10	104403	104412	60 %	20 %	20 %	0 %	294661101
68	NC_010830	CTTCC	2	10	106410	106419	0 %	40 %	0 %	60 %	189501552
69	NC_010830	AAAGG	2	10	106814	106823	60 %	0 %	40 %	0 %	189501552
70	NC_010830	CTATA	2	10	107838	107847	40 %	40 %	0 %	20 %	189501552
71	NC_010830	ACTTA	2	10	108118	108127	40 %	40 %	0 %	20 %	189501552
72	NC_010830	AAACT	2	10	108198	108207	60 %	20 %	0 %	20 %	189501552
73	NC_010830	TCCTG	2	10	114897	114906	0 %	40 %	20 %	40 %	189501558
74	NC_010830	AGAGA	2	10	116927	116936	60 %	0 %	40 %	0 %	189501559
75	NC_010830	TTTAG	2	10	116995	117004	20 %	60 %	20 %	0 %	189501559
76	NC_010830	TTACA	2	10	120397	120406	40 %	40 %	0 %	20 %	189501562
77	NC_010830	TGCTA	2	10	121260	121269	20 %	40 %	20 %	20 %	189501564
78	NC_010830	TTAAA	2	10	123846	123855	60 %	40 %	0 %	0 %	294661103
79	NC_010830	AATTT	2	10	124365	124374	40 %	60 %	0 %	0 %	294661103
80	NC_010830	AACTT	2	10	124803	124812	40 %	40 %	0 %	20 %	294661103
81	NC_010830	GATAG	2	10	125165	125174	40 %	20 %	40 %	0 %	294661103
82	NC_010830	AAGGT	2	10	126272	126281	40 %	20 %	40 %	0 %	189501567
83	NC_010830	TATTG	2	10	127726	127735	20 %	60 %	20 %	0 %	189501570
84	NC_010830	CTGAC	2	10	128401	128410	20 %	20 %	20 %	40 %	189501570
85	NC_010830	ATTAA	2	10	129255	129264	60 %	40 %	0 %	0 %	189501572
86	NC_010830	ATTAA	2	10	129822	129831	60 %	40 %	0 %	0 %	189501572
87	NC_010830	TACCT	2	10	131090	131099	20 %	40 %	0 %	40 %	189501572
88	NC_010830	AATAG	2	10	132216	132225	60 %	20 %	20 %	0 %	189501573
89	NC_010830	AATGT	2	10	135805	135814	40 %	40 %	20 %	0 %	294661104
90	NC_010830	TTCGT	2	10	138251	138260	0 %	60 %	20 %	20 %	189501578
91	NC_010830	ATCTG	2	10	142671	142680	20 %	40 %	20 %	20 %	294661106
92	NC_010830	ATATA	2	10	143529	143538	60 %	40 %	0 %	0 %	294661106
93	NC_010830	TATAA	2	10	143774	143783	60 %	40 %	0 %	0 %	294661106
94	NC_010830	TAATT	2	10	144025	144034	40 %	60 %	0 %	0 %	294661106
95	NC_010830	AATAG	2	10	146156	146165	60 %	20 %	20 %	0 %	189501584
96	NC_010830	AGTAT	2	10	147332	147341	40 %	40 %	20 %	0 %	189501584
97	NC_010830	TGTAG	2	10	147644	147653	20 %	40 %	40 %	0 %	189501585
98	NC_010830	TATTT	2	10	151430	151439	20 %	80 %	0 %	0 %	189501590
99	NC_010830	TTATT	2	10	154806	154815	20 %	80 %	0 %	0 %	294661107
100	NC_010830	AAATA	2	10	156757	156766	80 %	20 %	0 %	0 %	294661108
101	NC_010830	TTAAA	2	10	158467	158476	60 %	40 %	0 %	0 %	189501595
102	NC_010830	TACAG	2	10	164075	164084	40 %	20 %	20 %	20 %	189501600
103	NC_010830	ACTAT	2	10	165259	165268	40 %	40 %	0 %	20 %	189501601
104	NC_010830	ATAAA	2	10	165300	165309	80 %	20 %	0 %	0 %	189501601
105	NC_010830	CATTC	2	10	168212	168221	20 %	40 %	0 %	40 %	189501606
106	NC_010830	TTAGC	2	10	168572	168581	20 %	40 %	20 %	20 %	189501606
107	NC_010830	GACTT	2	10	169222	169231	20 %	40 %	20 %	20 %	189501606
108	NC_010830	TTATT	2	10	178226	178235	20 %	80 %	0 %	0 %	189501614
109	NC_010830	TTATC	2	10	180270	180279	20 %	60 %	0 %	20 %	189501616
110	NC_010830	TCAAA	2	10	185321	185330	60 %	20 %	0 %	20 %	189501617
111	NC_010830	CACTT	2	10	188829	188838	20 %	40 %	0 %	40 %	189501621
112	NC_010830	GTAGC	2	10	190844	190853	20 %	20 %	40 %	20 %	294661111
113	NC_010830	GTAAA	2	10	192635	192644	60 %	20 %	20 %	0 %	189501624
114	NC_010830	GATAA	2	10	193339	193348	60 %	20 %	20 %	0 %	189501624
115	NC_010830	ACTTT	2	10	194145	194154	20 %	60 %	0 %	20 %	189501625
116	NC_010830	ATTTT	2	10	196972	196981	20 %	80 %	0 %	0 %	189501627
117	NC_010830	ATTTT	2	10	197152	197161	20 %	80 %	0 %	0 %	189501627
118	NC_010830	TAAGA	2	10	200023	200032	60 %	20 %	20 %	0 %	189501633
119	NC_010830	ATATC	2	10	200076	200085	40 %	40 %	0 %	20 %	189501633
120	NC_010830	GTACC	2	10	202303	202312	20 %	20 %	20 %	40 %	189501637
121	NC_010830	TAACG	2	10	203446	203455	40 %	20 %	20 %	20 %	189501639
122	NC_010830	GCAAT	2	10	204521	204530	40 %	20 %	20 %	20 %	189501642
123	NC_010830	ATTTA	2	10	205831	205840	40 %	60 %	0 %	0 %	189501646
124	NC_010830	TCTAG	2	10	205866	205875	20 %	40 %	20 %	20 %	189501646
125	NC_010830	GCCTT	2	10	206267	206276	0 %	40 %	20 %	40 %	189501647
126	NC_010830	AGTAA	2	10	208465	208474	60 %	20 %	20 %	0 %	189501651
127	NC_010830	GAGTA	2	10	209133	209142	40 %	20 %	40 %	0 %	189501653
128	NC_010830	AAAAG	2	10	209309	209318	80 %	0 %	20 %	0 %	189501653
129	NC_010830	CCTTT	2	10	209977	209986	0 %	60 %	0 %	40 %	189501654
130	NC_010830	TTTCC	2	10	210061	210070	0 %	60 %	0 %	40 %	189501654
131	NC_010830	CAAAT	2	10	211638	211647	60 %	20 %	0 %	20 %	189501656
132	NC_010830	ATATT	2	10	211668	211677	40 %	60 %	0 %	0 %	189501656
133	NC_010830	AGTAT	2	10	214439	214448	40 %	40 %	20 %	0 %	294661115
134	NC_010830	GGTAC	2	10	217321	217330	20 %	20 %	40 %	20 %	189501660
135	NC_010830	TAATA	2	10	217530	217539	60 %	40 %	0 %	0 %	189501660
136	NC_010830	TAAAA	2	10	218604	218613	80 %	20 %	0 %	0 %	189501661
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138	NC_010830	AATTA	2	10	219259	219268	60 %	40 %	0 %	0 %	189501662
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143	NC_010830	CCATA	2	10	221705	221714	40 %	20 %	0 %	40 %	294661116
144	NC_010830	ATTAT	2	10	225770	225779	40 %	60 %	0 %	0 %	294661118
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149	NC_010830	CTTAG	2	10	228166	228175	20 %	40 %	20 %	20 %	294661118
150	NC_010830	AGTAT	2	10	228949	228958	40 %	40 %	20 %	0 %	189501665
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167	NC_010830	CTTAG	2	10	242676	242685	20 %	40 %	20 %	20 %	294661120
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