MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2 chromosome

Total Repeats: 5487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010830	ATT	2	6	81	86	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010830	AAT	2	6	133	138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010830	CTT	2	6	194	199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010830	TAG	2	6	302	307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010830	ACA	2	6	309	314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010830	ATT	2	6	378	383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010830	GTT	2	6	402	407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010830	AAT	2	6	472	477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010830	TAA	2	6	1963	1968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010830	AAT	2	6	1973	1978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010830	AGT	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010830	CAA	2	6	2180	2185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010830	TGC	2	6	2209	2214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010830	CAA	2	6	2278	2283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010830	ACA	2	6	2289	2294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010830	ATT	2	6	2391	2396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010830	CTT	2	6	3200	3205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010830	CAG	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010830	ATG	2	6	3379	3384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010830	TAA	2	6	3398	3403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010830	ATT	2	6	3404	3409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010830	TAA	2	6	3425	3430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010830	AAT	2	6	3476	3481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010830	ATA	2	6	3487	3492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010830	TAA	2	6	4238	4243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010830	GTA	2	6	4530	4535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010830	TTA	2	6	4565	4570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010830	ACT	2	6	4574	4579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010830	TAA	2	6	4593	4598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010830	AAG	2	6	4623	4628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010830	TAT	2	6	4667	4672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010830	TTA	2	6	4673	4678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010830	AGC	2	6	4681	4686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010830	AAT	2	6	6142	6147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010830	TAT	2	6	6405	6410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010830	ATA	2	6	6434	6439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010830	TTA	2	6	6563	6568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010830	GCA	2	6	6615	6620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010830	ACC	2	6	6627	6632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_010830	AGC	2	6	6637	6642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010830	GAC	2	6	6674	6679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010830	TAA	2	6	6685	6690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010830	CTC	2	6	6865	6870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_010830	TAA	2	6	6922	6927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010830	TCT	2	6	7135	7140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010830	ACA	2	6	7581	7586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010830	GAC	2	6	7667	7672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010830	CCA	2	6	7721	7726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_010830	CAT	2	6	7766	7771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010830	ATT	2	6	8160	8165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010830	TAA	3	9	8215	8223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010830	TTC	2	6	8342	8347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010830	AGA	2	6	8406	8411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010830	TTG	2	6	8446	8451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010830	ATA	2	6	8484	8489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010830	ATA	2	6	8498	8503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010830	TAA	2	6	8531	8536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010830	GCT	2	6	8542	8547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010830	AAC	2	6	8556	8561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010830	ATA	2	6	11505	11510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010830	GCA	2	6	11592	11597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010830	ACA	2	6	11698	11703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010830	TTA	2	6	11727	11732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010830	ATG	2	6	11776	11781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010830	AAG	2	6	11827	11832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010830	TTA	2	6	11888	11893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010830	CTA	2	6	11900	11905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010830	CAA	2	6	13557	13562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010830	GAT	2	6	13583	13588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010830	GAG	2	6	13594	13599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010830	ATT	2	6	13706	13711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010830	AAT	2	6	15454	15459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010830	ATT	2	6	15508	15513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010830	TTA	2	6	15974	15979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010830	TAT	2	6	18196	18201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010830	TTA	2	6	20121	20126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010830	TGG	2	6	20257	20262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010830	GAA	3	9	20269	20277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010830	TAC	2	6	20406	20411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010830	AAT	2	6	20443	20448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010830	GAT	2	6	20449	20454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010830	CAA	2	6	20493	20498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010830	TAT	2	6	20562	20567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010830	CTT	2	6	20585	20590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010830	ACT	2	6	20630	20635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010830	TTA	2	6	20659	20664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010830	AAC	3	9	20681	20689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010830	AGA	2	6	23264	23269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010830	CTT	2	6	24039	24044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010830	CTT	2	6	24145	24150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010830	CAT	2	6	24154	24159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010830	CTA	2	6	24177	24182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010830	GAA	2	6	24202	24207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010830	AAC	2	6	24482	24487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010830	ATT	2	6	24552	24557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010830	ATA	2	6	24576	24581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010830	GTT	2	6	25440	25445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010830	TAA	2	6	25475	25480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010830	TAG	2	6	25532	25537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010830	ATT	2	6	26530	26535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010830	TTG	2	6	26598	26603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010830	TAA	2	6	27501	27506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010830	AAT	2	6	28572	28577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010830	ATT	2	6	28656	28661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010830	TAA	2	6	32370	32375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010830	CAG	2	6	32381	32386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010830	CAA	2	6	32510	32515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010830	CTT	2	6	32525	32530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010830	AGA	2	6	32590	32595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010830	TTG	2	6	32728	32733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010830	TAG	2	6	32736	32741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010830	TAT	2	6	35176	35181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010830	TAT	2	6	35234	35239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010830	ACA	2	6	35314	35319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010830	CAT	2	6	35505	35510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010830	ATT	2	6	36709	36714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010830	AAG	2	6	36740	36745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010830	TTA	2	6	37861	37866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010830	TAA	2	6	40648	40653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010830	TAT	2	6	42862	42867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010830	GAA	2	6	42875	42880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010830	TGC	2	6	42957	42962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010830	ATT	2	6	43054	43059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010830	CTG	2	6	43089	43094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010830	AAG	2	6	43098	43103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010830	TAA	2	6	43265	43270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010830	AGT	2	6	43279	43284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010830	CAA	2	6	43403	43408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010830	TTG	2	6	43462	43467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010830	AAG	3	9	43622	43630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010830	TTC	2	6	43650	43655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010830	CCT	2	6	43846	43851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_010830	ATA	2	6	43894	43899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010830	CTT	2	6	43902	43907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010830	ATA	2	6	44826	44831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010830	ATG	2	6	47355	47360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010830	TGA	2	6	51957	51962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010830	GAT	2	6	51966	51971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010830	ATA	2	6	53973	53978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010830	AAT	2	6	54036	54041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010830	ATA	2	6	54080	54085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010830	CTT	2	6	54096	54101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_010830	TTC	2	6	54129	54134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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