MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 1352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010816	GTGGC	2	10	1763	1772	0 %	20 %	60 %	20 %	189438865
2	NC_010816	CGCTC	2	10	2029	2038	0 %	20 %	20 %	60 %	189438865
3	NC_010816	CAAGA	2	10	3682	3691	60 %	0 %	20 %	20 %	189438868
4	NC_010816	GTATC	2	10	4622	4631	20 %	40 %	20 %	20 %	189438869
5	NC_010816	CCGTG	2	10	4899	4908	0 %	20 %	40 %	40 %	189438869
6	NC_010816	CTGAT	2	10	6621	6630	20 %	40 %	20 %	20 %	189438870
7	NC_010816	AGCCA	2	10	7315	7324	40 %	0 %	20 %	40 %	189438871
8	NC_010816	CGGCG	2	10	8162	8171	0 %	0 %	60 %	40 %	189438872
9	NC_010816	CGGCT	2	10	9943	9952	0 %	20 %	40 %	40 %	189438873
10	NC_010816	CCGCC	2	10	10305	10314	0 %	0 %	20 %	80 %	189438873
11	NC_010816	CAACT	2	10	12487	12496	40 %	20 %	0 %	40 %	189438874
12	NC_010816	CACCG	2	10	12886	12895	20 %	0 %	20 %	60 %	189438874
13	NC_010816	GGCAC	2	10	13491	13500	20 %	0 %	40 %	40 %	189438875
14	NC_010816	ACGCA	2	10	13940	13949	40 %	0 %	20 %	40 %	189438875
15	NC_010816	GCTCG	2	10	17948	17957	0 %	20 %	40 %	40 %	189438878
16	NC_010816	TGATC	2	10	19764	19773	20 %	40 %	20 %	20 %	189438879
17	NC_010816	GTGGC	2	10	21267	21276	0 %	20 %	60 %	20 %	189438880
18	NC_010816	GGTTG	2	10	22437	22446	0 %	40 %	60 %	0 %	189438881
19	NC_010816	GTGGC	2	10	22465	22474	0 %	20 %	60 %	20 %	189438881
20	NC_010816	AGGAG	2	10	27841	27850	40 %	0 %	60 %	0 %	189438884
21	NC_010816	CAGCT	2	10	28692	28701	20 %	20 %	20 %	40 %	189438886
22	NC_010816	CCGGA	2	10	31133	31142	20 %	0 %	40 %	40 %	189438887
23	NC_010816	GGTGC	2	10	31742	31751	0 %	20 %	60 %	20 %	189438888
24	NC_010816	CCGCC	2	10	32778	32787	0 %	0 %	20 %	80 %	189438890
25	NC_010816	CTGGC	2	10	33014	33023	0 %	20 %	40 %	40 %	189438890
26	NC_010816	ACGGC	2	10	33989	33998	20 %	0 %	40 %	40 %	189438891
27	NC_010816	CGGGG	2	10	34311	34320	0 %	0 %	80 %	20 %	189438892
28	NC_010816	CCCGT	2	10	34999	35008	0 %	20 %	20 %	60 %	189438892
29	NC_010816	GCTGC	2	10	35981	35990	0 %	20 %	40 %	40 %	189438893
30	NC_010816	CCTTG	2	10	36152	36161	0 %	40 %	20 %	40 %	189438893
31	NC_010816	GCCCG	2	10	36417	36426	0 %	0 %	40 %	60 %	189438894
32	NC_010816	ACGAC	2	10	37871	37880	40 %	0 %	20 %	40 %	189438895
33	NC_010816	GCTGG	2	10	38731	38740	0 %	20 %	60 %	20 %	189438896
34	NC_010816	CGCAA	2	10	39673	39682	40 %	0 %	20 %	40 %	189438897
35	NC_010816	GAACA	2	10	41663	41672	60 %	0 %	20 %	20 %	189438899
36	NC_010816	CGGTG	2	10	44146	44155	0 %	20 %	60 %	20 %	189438899
37	NC_010816	CGCGG	2	10	44471	44480	0 %	0 %	60 %	40 %	189438899
38	NC_010816	CATCA	2	10	44774	44783	40 %	20 %	0 %	40 %	189438899
39	NC_010816	GACGA	2	10	45086	45095	40 %	0 %	40 %	20 %	189438899
40	NC_010816	ATTGG	2	10	46021	46030	20 %	40 %	40 %	0 %	189438901
41	NC_010816	TCGAC	2	10	46269	46278	20 %	20 %	20 %	40 %	189438901
42	NC_010816	AGGTG	2	10	53975	53984	20 %	20 %	60 %	0 %	189438906
43	NC_010816	TTGGC	2	10	55390	55399	0 %	40 %	40 %	20 %	189438907
44	NC_010816	TGACC	2	10	56371	56380	20 %	20 %	20 %	40 %	189438908
45	NC_010816	ACCTG	2	10	58896	58905	20 %	20 %	20 %	40 %	189438910
46	NC_010816	GCCAC	2	10	61925	61934	20 %	0 %	20 %	60 %	189438912
47	NC_010816	TGGTC	2	10	63039	63048	0 %	40 %	40 %	20 %	189438913
48	NC_010816	CACGC	2	10	67342	67351	20 %	0 %	20 %	60 %	189438918
49	NC_010816	CGGGT	2	10	68372	68381	0 %	20 %	60 %	20 %	189438918
50	NC_010816	GCACC	2	10	69199	69208	20 %	0 %	20 %	60 %	189438919
51	NC_010816	TGAAG	2	10	69918	69927	40 %	20 %	40 %	0 %	189438920
52	NC_010816	TTCGA	2	10	70003	70012	20 %	40 %	20 %	20 %	189438920
53	NC_010816	CGGCC	2	10	70434	70443	0 %	0 %	40 %	60 %	189438920
54	NC_010816	GCGAG	2	10	71075	71084	20 %	0 %	60 %	20 %	189438921
55	NC_010816	TGGTC	2	10	73792	73801	0 %	40 %	40 %	20 %	189438923
56	NC_010816	GCCGC	2	10	75345	75354	0 %	0 %	40 %	60 %	189438924
57	NC_010816	CAGAC	2	10	75504	75513	40 %	0 %	20 %	40 %	189438924
58	NC_010816	GCTCG	2	10	77206	77215	0 %	20 %	40 %	40 %	189438926
59	NC_010816	TCGGA	2	10	77361	77370	20 %	20 %	40 %	20 %	189438926
60	NC_010816	CTCGC	2	10	77441	77450	0 %	20 %	20 %	60 %	189438926
61	NC_010816	GTGGC	2	10	79049	79058	0 %	20 %	60 %	20 %	189438927
62	NC_010816	CGAAC	2	10	79268	79277	40 %	0 %	20 %	40 %	189438927
63	NC_010816	CGCGC	2	10	80346	80355	0 %	0 %	40 %	60 %	189438927
64	NC_010816	CGACC	2	10	82935	82944	20 %	0 %	20 %	60 %	189438928
65	NC_010816	ATCGA	2	10	83665	83674	40 %	20 %	20 %	20 %	189438928
66	NC_010816	GGCGC	2	10	87111	87120	0 %	0 %	60 %	40 %	189438929
67	NC_010816	GCGTG	2	10	88446	88455	0 %	20 %	60 %	20 %	189438930
68	NC_010816	ACGCG	2	10	89211	89220	20 %	0 %	40 %	40 %	189438931
69	NC_010816	GCGCA	2	10	90475	90484	20 %	0 %	40 %	40 %	189438933
70	NC_010816	CCGCC	2	10	90492	90501	0 %	0 %	20 %	80 %	189438933
71	NC_010816	TGACG	2	10	91930	91939	20 %	20 %	40 %	20 %	189438934
72	NC_010816	CGCGC	2	10	93351	93360	0 %	0 %	40 %	60 %	189438934
73	NC_010816	TGTGG	2	10	93454	93463	0 %	40 %	60 %	0 %	189438934
74	NC_010816	CGATA	2	10	94207	94216	40 %	20 %	20 %	20 %	189438936
75	NC_010816	ATGGC	2	10	95402	95411	20 %	20 %	40 %	20 %	189438936
76	NC_010816	ATGGA	2	10	97544	97553	40 %	20 %	40 %	0 %	189438939
77	NC_010816	CGGGC	2	10	97933	97942	0 %	0 %	60 %	40 %	189438940
78	NC_010816	CGCAG	2	10	99547	99556	20 %	0 %	40 %	40 %	189438942
79	NC_010816	GATCA	2	10	102164	102173	40 %	20 %	20 %	20 %	189438945
80	NC_010816	CCGCA	2	10	103938	103947	20 %	0 %	20 %	60 %	189438947
81	NC_010816	CGTGG	2	10	105322	105331	0 %	20 %	60 %	20 %	189438948
82	NC_010816	CGCTT	2	10	105583	105592	0 %	40 %	20 %	40 %	189438948
83	NC_010816	AGCCA	2	10	108729	108738	40 %	0 %	20 %	40 %	189438949
84	NC_010816	TACCG	2	10	110507	110516	20 %	20 %	20 %	40 %	189438952
85	NC_010816	GCGAT	2	10	110880	110889	20 %	20 %	40 %	20 %	189438952
86	NC_010816	TCGGC	2	10	111069	111078	0 %	20 %	40 %	40 %	189438952
87	NC_010816	TGTGG	2	10	111763	111772	0 %	40 %	60 %	0 %	189438952
88	NC_010816	AGGCG	2	10	112432	112441	20 %	0 %	60 %	20 %	189438952
89	NC_010816	GCCAT	2	10	112531	112540	20 %	20 %	20 %	40 %	189438952
90	NC_010816	AATGG	2	10	112771	112780	40 %	20 %	40 %	0 %	189438953
91	NC_010816	CGTGC	2	10	112810	112819	0 %	20 %	40 %	40 %	189438953
92	NC_010816	GTCTG	2	10	113686	113695	0 %	40 %	40 %	20 %	189438954
93	NC_010816	AGCGA	2	10	115852	115861	40 %	0 %	40 %	20 %	189438957
94	NC_010816	CCGTG	2	10	118484	118493	0 %	20 %	40 %	40 %	189438959
95	NC_010816	GAATC	2	10	123007	123016	40 %	20 %	20 %	20 %	189438967
96	NC_010816	CGAAT	2	10	123399	123408	40 %	20 %	20 %	20 %	189438967
97	NC_010816	GCCAA	2	10	125114	125123	40 %	0 %	20 %	40 %	189438969
98	NC_010816	TGGCA	2	10	126108	126117	20 %	20 %	40 %	20 %	189438970
99	NC_010816	CGGTC	2	10	127011	127020	0 %	20 %	40 %	40 %	189438972
100	NC_010816	TGGTG	2	10	132173	132182	0 %	40 %	60 %	0 %	189438975
101	NC_010816	TCCAT	2	10	136390	136399	20 %	40 %	0 %	40 %	189438978
102	NC_010816	GAGAT	2	10	139923	139932	40 %	20 %	40 %	0 %	189438981
103	NC_010816	GGTGT	2	10	139952	139961	0 %	40 %	60 %	0 %	189438981
104	NC_010816	GGCCG	2	10	144962	144971	0 %	0 %	60 %	40 %	189438985
105	NC_010816	TGACC	2	10	147116	147125	20 %	20 %	20 %	40 %	189438987
106	NC_010816	GCACC	2	10	149565	149574	20 %	0 %	20 %	60 %	189438989
107	NC_010816	CGGTG	2	10	150700	150709	0 %	20 %	60 %	20 %	189438989
108	NC_010816	CCAAT	2	10	151289	151298	40 %	20 %	0 %	40 %	189438990
109	NC_010816	ACAGC	2	10	152989	152998	40 %	0 %	20 %	40 %	189438992
110	NC_010816	CGATG	2	10	153259	153268	20 %	20 %	40 %	20 %	189438992
111	NC_010816	GTGAT	2	10	156040	156049	20 %	40 %	40 %	0 %	189438995
112	NC_010816	CAGCT	2	10	156535	156544	20 %	20 %	20 %	40 %	189438995
113	NC_010816	GCCTT	2	10	161746	161755	0 %	40 %	20 %	40 %	189438998
114	NC_010816	GATGA	2	10	162235	162244	40 %	20 %	40 %	0 %	189438998
115	NC_010816	ATTTG	2	10	167023	167032	20 %	60 %	20 %	0 %	189439004
116	NC_010816	CGGTC	2	10	167697	167706	0 %	20 %	40 %	40 %	189439004
117	NC_010816	AACTT	2	10	173101	173110	40 %	40 %	0 %	20 %	189439008
118	NC_010816	CCGAA	2	10	174044	174053	40 %	0 %	20 %	40 %	189439009
119	NC_010816	CATGG	2	10	174210	174219	20 %	20 %	40 %	20 %	189439009
120	NC_010816	TCCGA	2	10	175577	175586	20 %	20 %	20 %	40 %	189439010
121	NC_010816	CGCCA	2	10	176462	176471	20 %	0 %	20 %	60 %	189439011
122	NC_010816	GCCGA	2	10	190503	190512	20 %	0 %	40 %	40 %	189439013
123	NC_010816	GCGCC	2	10	192336	192345	0 %	0 %	40 %	60 %	189439015
124	NC_010816	CCGCA	2	10	193781	193790	20 %	0 %	20 %	60 %	189439016
125	NC_010816	CCGAC	2	10	193798	193807	20 %	0 %	20 %	60 %	189439016
126	NC_010816	CGGAC	2	10	194504	194513	20 %	0 %	40 %	40 %	189439016
127	NC_010816	TGCGC	2	10	195222	195231	0 %	20 %	40 %	40 %	189439017
128	NC_010816	ATGGG	2	10	196465	196474	20 %	20 %	60 %	0 %	189439019
129	NC_010816	AATCG	2	10	197795	197804	40 %	20 %	20 %	20 %	189439021
130	NC_010816	CCAAC	2	10	197966	197975	40 %	0 %	0 %	60 %	189439021
131	NC_010816	GGATT	2	10	198333	198342	20 %	40 %	40 %	0 %	189439021
132	NC_010816	TGCGC	2	10	199259	199268	0 %	20 %	40 %	40 %	189439022
133	NC_010816	CACGT	2	10	199558	199567	20 %	20 %	20 %	40 %	189439022
134	NC_010816	GCCAG	2	10	199805	199814	20 %	0 %	40 %	40 %	189439022
135	NC_010816	CGAAC	2	10	201353	201362	40 %	0 %	20 %	40 %	189439024
136	NC_010816	GCACG	2	10	204084	204093	20 %	0 %	40 %	40 %	189439025
137	NC_010816	CTGGC	2	10	205283	205292	0 %	20 %	40 %	40 %	189439025
138	NC_010816	ACCGG	2	10	205711	205720	20 %	0 %	40 %	40 %	189439025
139	NC_010816	ATCGT	2	10	206066	206075	20 %	40 %	20 %	20 %	189439025
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141	NC_010816	ACGTT	2	10	207025	207034	20 %	40 %	20 %	20 %	189439026
142	NC_010816	GCGCC	2	10	208206	208215	0 %	0 %	40 %	60 %	189439027
143	NC_010816	TGATG	2	10	213823	213832	20 %	40 %	40 %	0 %	189439033
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148	NC_010816	ACGGT	2	10	220756	220765	20 %	20 %	40 %	20 %	189439039
149	NC_010816	ACATG	2	10	221392	221401	40 %	20 %	20 %	20 %	189439039
150	NC_010816	GCCGT	2	10	223607	223616	0 %	20 %	40 %	40 %	189439041
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239	NC_010816	ATCGC	2	10	386321	386330	20 %	20 %	20 %	40 %	189439170
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242	NC_010816	CACGC	2	10	387893	387902	20 %	0 %	20 %	60 %	189439171
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244	NC_010816	GCTGC	2	10	390290	390299	0 %	20 %	40 %	40 %	189439173
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248	NC_010816	GCCGT	2	10	393281	393290	0 %	20 %	40 %	40 %	189439177
249	NC_010816	GGCCA	2	10	394255	394264	20 %	0 %	40 %	40 %	189439178
250	NC_010816	GCGCC	2	10	394811	394820	0 %	0 %	40 %	60 %	189439179
251	NC_010816	GCCCC	2	10	396246	396255	0 %	0 %	20 %	80 %	189439181
252	NC_010816	ATCGG	2	10	396468	396477	20 %	20 %	40 %	20 %	189439182
253	NC_010816	TGGTG	2	10	396541	396550	0 %	40 %	60 %	0 %	189439182
254	NC_010816	GCAGC	2	10	399221	399230	20 %	0 %	40 %	40 %	189439185
255	NC_010816	TGATG	2	10	400313	400322	20 %	40 %	40 %	0 %	189439187
256	NC_010816	GCATG	2	10	403543	403552	20 %	20 %	40 %	20 %	189439190
257	NC_010816	CGACC	2	10	406200	406209	20 %	0 %	20 %	60 %	189439191
258	NC_010816	AGCAA	2	10	412383	412392	60 %	0 %	20 %	20 %	189439195
259	NC_010816	CGGGG	2	10	412626	412635	0 %	0 %	80 %	20 %	189439196
260	NC_010816	CAAGG	2	10	415174	415183	40 %	0 %	40 %	20 %	189439199
261	NC_010816	GGTTC	2	10	417744	417753	0 %	40 %	40 %	20 %	189439202
262	NC_010816	GCCAT	2	10	418514	418523	20 %	20 %	20 %	40 %	189439203
263	NC_010816	TCGTT	2	10	423124	423133	0 %	60 %	20 %	20 %	189439209
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