MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 5592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010816	ACGC	2	8	294	301	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010816	TGCT	2	8	803	810	0 %	50 %	25 %	25 %	189438865
3	NC_010816	GCTG	2	8	1632	1639	0 %	25 %	50 %	25 %	189438865
4	NC_010816	CCTG	2	8	1941	1948	0 %	25 %	25 %	50 %	189438865
5	NC_010816	GACC	2	8	2007	2014	25 %	0 %	25 %	50 %	189438865
6	NC_010816	AGCG	2	8	2312	2319	25 %	0 %	50 %	25 %	189438866
7	NC_010816	TGGA	2	8	2321	2328	25 %	25 %	50 %	0 %	189438866
8	NC_010816	GCCT	2	8	2456	2463	0 %	25 %	25 %	50 %	189438866
9	NC_010816	GTAT	2	8	2566	2573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010816	TCCA	2	8	4149	4156	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010816	CCTA	2	8	4645	4652	25 %	25 %	0 %	50 %	189438869
12	NC_010816	TTCC	2	8	5105	5112	0 %	50 %	0 %	50 %	189438869
13	NC_010816	GCCA	2	8	5236	5243	25 %	0 %	25 %	50 %	189438869
14	NC_010816	CCAG	2	8	5360	5367	25 %	0 %	25 %	50 %	189438869
15	NC_010816	GCCG	2	8	5712	5719	0 %	0 %	50 %	50 %	189438869
16	NC_010816	AAGG	2	8	6221	6228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010816	CCCG	2	8	6458	6465	0 %	0 %	25 %	75 %	189438870
18	NC_010816	CGGC	2	8	6518	6525	0 %	0 %	50 %	50 %	189438870
19	NC_010816	GCGT	2	8	7898	7905	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010816	TGGC	2	8	8041	8048	0 %	25 %	50 %	25 %	189438872
21	NC_010816	GACC	2	8	8174	8181	25 %	0 %	25 %	50 %	189438872
22	NC_010816	ACCA	2	8	8331	8338	50 %	0 %	0 %	50 %	189438872
23	NC_010816	AGCG	2	8	8542	8549	25 %	0 %	50 %	25 %	189438872
24	NC_010816	AGGA	2	8	9034	9041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010816	ACCG	2	8	9062	9069	25 %	0 %	25 %	50 %	189438873
26	NC_010816	CCTG	2	8	10240	10247	0 %	25 %	25 %	50 %	189438873
27	NC_010816	GAAG	2	8	10447	10454	50 %	0 %	50 %	0 %	189438873
28	NC_010816	GTTC	2	8	10698	10705	0 %	50 %	25 %	25 %	189438873
29	NC_010816	GCCG	2	8	11608	11615	0 %	0 %	50 %	50 %	189438873
30	NC_010816	TAGC	2	8	11672	11679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010816	CTGA	2	8	11724	11731	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010816	CGGC	2	8	11888	11895	0 %	0 %	50 %	50 %	189438874
33	NC_010816	TGGC	2	8	12359	12366	0 %	25 %	50 %	25 %	189438874
34	NC_010816	TCCT	2	8	12580	12587	0 %	50 %	0 %	50 %	189438874
35	NC_010816	GGTC	2	8	12729	12736	0 %	25 %	50 %	25 %	189438874
36	NC_010816	TTTC	2	8	12777	12784	0 %	75 %	0 %	25 %	189438874
37	NC_010816	CGAG	2	8	13411	13418	25 %	0 %	50 %	25 %	189438875
38	NC_010816	CCGG	2	8	13915	13922	0 %	0 %	50 %	50 %	189438875
39	NC_010816	CTTC	2	8	15081	15088	0 %	50 %	0 %	50 %	189438876
40	NC_010816	CTGC	2	8	15337	15344	0 %	25 %	25 %	50 %	189438876
41	NC_010816	CACC	2	8	15462	15469	25 %	0 %	0 %	75 %	189438876
42	NC_010816	ACCT	2	8	15851	15858	25 %	25 %	0 %	50 %	189438876
43	NC_010816	TCTG	2	8	15868	15875	0 %	50 %	25 %	25 %	189438876
44	NC_010816	CCGG	2	8	17118	17125	0 %	0 %	50 %	50 %	189438877
45	NC_010816	GCGT	2	8	17160	17167	0 %	25 %	50 %	25 %	189438877
46	NC_010816	ACGT	2	8	17878	17885	25 %	25 %	25 %	25 %	189438878
47	NC_010816	ACAA	2	8	18493	18500	75 %	0 %	0 %	25 %	189438878
48	NC_010816	CGGT	2	8	18523	18530	0 %	25 %	50 %	25 %	189438878
49	NC_010816	CCGA	2	8	18956	18963	25 %	0 %	25 %	50 %	189438878
50	NC_010816	CAGC	2	8	19076	19083	25 %	0 %	25 %	50 %	189438878
51	NC_010816	TCAG	2	8	19311	19318	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010816	CGGC	2	8	19859	19866	0 %	0 %	50 %	50 %	189438879
53	NC_010816	GACG	2	8	21486	21493	25 %	0 %	50 %	25 %	189438880
54	NC_010816	GCCT	2	8	21598	21605	0 %	25 %	25 %	50 %	189438880
55	NC_010816	TGCG	2	8	22079	22086	0 %	25 %	50 %	25 %	189438880
56	NC_010816	CACC	2	8	22109	22116	25 %	0 %	0 %	75 %	189438880
57	NC_010816	GCCC	2	8	22536	22543	0 %	0 %	25 %	75 %	189438881
58	NC_010816	CGTG	2	8	23579	23586	0 %	25 %	50 %	25 %	189438881
59	NC_010816	CGTA	2	8	23846	23853	25 %	25 %	25 %	25 %	189438881
60	NC_010816	CAGC	2	8	25198	25205	25 %	0 %	25 %	50 %	189438882
61	NC_010816	ATGC	2	8	25262	25269	25 %	25 %	25 %	25 %	189438882
62	NC_010816	GCCA	2	8	25844	25851	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010816	CAAG	2	8	26201	26208	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010816	GACC	2	8	26940	26947	25 %	0 %	25 %	50 %	189438883
65	NC_010816	GGAA	2	8	27258	27265	50 %	0 %	50 %	0 %	189438884
66	NC_010816	GGCC	2	8	27610	27617	0 %	0 %	50 %	50 %	189438884
67	NC_010816	CTCG	2	8	29069	29076	0 %	25 %	25 %	50 %	189438886
68	NC_010816	GGGC	2	8	30504	30511	0 %	0 %	75 %	25 %	189438887
69	NC_010816	ACGG	2	8	31227	31234	25 %	0 %	50 %	25 %	189438887
70	NC_010816	TCCC	2	8	31331	31338	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_010816	GCTG	2	8	31602	31609	0 %	25 %	50 %	25 %	189438888
72	NC_010816	TGCA	2	8	31866	31873	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010816	CGTC	2	8	32623	32630	0 %	25 %	25 %	50 %	189438889
74	NC_010816	CGCC	2	8	32642	32649	0 %	0 %	25 %	75 %	189438890
75	NC_010816	GTCT	2	8	32882	32889	0 %	50 %	25 %	25 %	189438890
76	NC_010816	GAAC	2	8	33441	33448	50 %	0 %	25 %	25 %	189438891
77	NC_010816	CCGC	2	8	33815	33822	0 %	0 %	25 %	75 %	189438891
78	NC_010816	CGTC	3	12	34297	34308	0 %	25 %	25 %	50 %	189438892
79	NC_010816	TGCT	2	8	34518	34525	0 %	50 %	25 %	25 %	189438892
80	NC_010816	GGGC	2	8	34709	34716	0 %	0 %	75 %	25 %	189438892
81	NC_010816	CGGC	2	8	34924	34931	0 %	0 %	50 %	50 %	189438892
82	NC_010816	GCCG	2	8	35801	35808	0 %	0 %	50 %	50 %	189438893
83	NC_010816	TGCC	2	8	37043	37050	0 %	25 %	25 %	50 %	189438894
84	NC_010816	ATGA	2	8	37361	37368	50 %	25 %	25 %	0 %	189438895
85	NC_010816	ACCG	2	8	37633	37640	25 %	0 %	25 %	50 %	189438895
86	NC_010816	CCCG	2	8	37748	37755	0 %	0 %	25 %	75 %	189438895
87	NC_010816	CTGC	2	8	38115	38122	0 %	25 %	25 %	50 %	189438895
88	NC_010816	TTCG	2	8	38338	38345	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010816	GCCA	2	8	38408	38415	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010816	GCGG	2	8	39053	39060	0 %	0 %	75 %	25 %	189438897
91	NC_010816	ACAG	2	8	39459	39466	50 %	0 %	25 %	25 %	189438897
92	NC_010816	ATGG	2	8	39506	39513	25 %	25 %	50 %	0 %	189438897
93	NC_010816	TGGC	2	8	39516	39523	0 %	25 %	50 %	25 %	189438897
94	NC_010816	TGGA	2	8	39910	39917	25 %	25 %	50 %	0 %	189438897
95	NC_010816	TAGA	2	8	40001	40008	50 %	25 %	25 %	0 %	189438898
96	NC_010816	CATC	2	8	40107	40114	25 %	25 %	0 %	50 %	189438898
97	NC_010816	GGAA	2	8	40614	40621	50 %	0 %	50 %	0 %	189438898
98	NC_010816	GTCC	2	8	40672	40679	0 %	25 %	25 %	50 %	189438898
99	NC_010816	TTTA	2	8	41043	41050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010816	TTGG	2	8	41215	41222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010816	CCAA	2	8	41229	41236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010816	GGGA	2	8	41307	41314	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010816	TTGC	2	8	41431	41438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010816	AGGA	2	8	41514	41521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010816	CAGT	2	8	42064	42071	25 %	25 %	25 %	25 %	189438899
106	NC_010816	TCTG	2	8	42280	42287	0 %	50 %	25 %	25 %	189438899
107	NC_010816	GCAA	2	8	42315	42322	50 %	0 %	25 %	25 %	189438899
108	NC_010816	CATT	2	8	43283	43290	25 %	50 %	0 %	25 %	189438899
109	NC_010816	CCGA	2	8	44074	44081	25 %	0 %	25 %	50 %	189438899
110	NC_010816	GTTC	2	8	44838	44845	0 %	50 %	25 %	25 %	189438899
111	NC_010816	GACG	2	8	45280	45287	25 %	0 %	50 %	25 %	189438899
112	NC_010816	GTTG	2	8	45385	45392	0 %	50 %	50 %	0 %	189438899
113	NC_010816	CGGT	2	8	45521	45528	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010816	CGGG	2	8	45619	45626	0 %	0 %	75 %	25 %	189438900
115	NC_010816	GATG	2	8	45768	45775	25 %	25 %	50 %	0 %	189438900
116	NC_010816	GCAA	2	8	46010	46017	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010816	CCGC	2	8	47543	47550	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
118	NC_010816	ACGA	2	8	47718	47725	50 %	0 %	25 %	25 %	189438903
119	NC_010816	CATC	2	8	48538	48545	25 %	25 %	0 %	50 %	189438903
120	NC_010816	TGAG	2	8	50275	50282	25 %	25 %	50 %	0 %	189438904
121	NC_010816	TTTG	2	8	50288	50295	0 %	75 %	25 %	0 %	189438904
122	NC_010816	GGCC	2	8	50513	50520	0 %	0 %	50 %	50 %	189438904
123	NC_010816	ACGC	2	8	50920	50927	25 %	0 %	25 %	50 %	189438904
124	NC_010816	CAGC	2	8	51593	51600	25 %	0 %	25 %	50 %	189438904
125	NC_010816	CCTG	2	8	51800	51807	0 %	25 %	25 %	50 %	189438905
126	NC_010816	GCCG	2	8	52071	52078	0 %	0 %	50 %	50 %	189438905
127	NC_010816	CTGG	2	8	53102	53109	0 %	25 %	50 %	25 %	189438906
128	NC_010816	GTCA	2	8	53319	53326	25 %	25 %	25 %	25 %	189438906
129	NC_010816	GGCC	2	8	53429	53436	0 %	0 %	50 %	50 %	189438906
130	NC_010816	TCGA	2	8	53803	53810	25 %	25 %	25 %	25 %	189438906
131	NC_010816	GCAA	2	8	54726	54733	50 %	0 %	25 %	25 %	189438907
132	NC_010816	GTTG	2	8	54750	54757	0 %	50 %	50 %	0 %	189438907
133	NC_010816	TGCG	2	8	55209	55216	0 %	25 %	50 %	25 %	189438907
134	NC_010816	CGAT	2	8	55286	55293	25 %	25 %	25 %	25 %	189438907
135	NC_010816	AGTG	2	8	55552	55559	25 %	25 %	50 %	0 %	189438907
136	NC_010816	TTCC	2	8	57218	57225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_010816	TGGC	2	8	58549	58556	0 %	25 %	50 %	25 %	189438909
138	NC_010816	CATT	2	8	58917	58924	25 %	50 %	0 %	25 %	189438910
139	NC_010816	GGCC	2	8	58999	59006	0 %	0 %	50 %	50 %	189438910
140	NC_010816	TCGG	2	8	59096	59103	0 %	25 %	50 %	25 %	189438910
141	NC_010816	TCCT	2	8	59231	59238	0 %	50 %	0 %	50 %	189438910
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143	NC_010816	CAAA	2	8	59921	59928	75 %	0 %	0 %	25 %	189438911
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