MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010816	ACGC	2	8	294	301	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010816	GTAT	2	8	2566	2573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010816	TCCA	2	8	4149	4156	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010816	AAGG	2	8	6221	6228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010816	GCGT	2	8	7898	7905	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010816	AGGA	2	8	9034	9041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010816	TAGC	2	8	11672	11679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010816	CTGA	2	8	11724	11731	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010816	TCAG	2	8	19311	19318	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010816	GCCA	2	8	25844	25851	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010816	CAAG	2	8	26201	26208	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010816	TCCC	2	8	31331	31338	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_010816	TGCA	2	8	31866	31873	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010816	TTCG	2	8	38338	38345	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010816	GCCA	2	8	38408	38415	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010816	TTTA	2	8	41043	41050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010816	TTGG	2	8	41215	41222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010816	CCAA	2	8	41229	41236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010816	GGGA	2	8	41307	41314	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010816	TTGC	2	8	41431	41438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010816	AGGA	2	8	41514	41521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010816	CGGT	2	8	45521	45528	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010816	GCAA	2	8	46010	46017	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010816	CCGC	2	8	47543	47550	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_010816	TTCC	2	8	57218	57225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010816	CTTT	2	8	61041	61048	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010816	TGCG	2	8	62674	62681	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010816	CAAG	2	8	64465	64472	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010816	TGTT	2	8	64704	64711	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010816	CGGC	2	8	64763	64770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010816	GCAT	2	8	73228	73235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010816	AAGG	2	8	73389	73396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010816	AATG	2	8	74399	74406	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010816	CCGG	2	8	78559	78566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010816	GCCG	2	8	84623	84630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010816	CAGG	2	8	89871	89878	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010816	TCAA	2	8	93983	93990	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010816	CGGC	2	8	97356	97363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010816	GCTG	2	8	98676	98683	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010816	AGGA	2	8	113560	113567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010816	CCGC	2	8	118252	118259	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_010816	AAAG	2	8	118346	118353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010816	GCGT	2	8	118639	118646	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010816	ATCG	2	8	118648	118655	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_010816	AGTC	2	8	120137	120144	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010816	CATC	2	8	121620	121627	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010816	GCCG	2	8	126549	126556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010816	TCAA	2	8	133477	133484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010816	CACC	2	8	138157	138164	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_010816	GTTC	2	8	141460	141467	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010816	CCTC	2	8	145303	145310	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_010816	TTGG	2	8	148256	148263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010816	CGCA	2	8	151758	151765	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010816	GATT	2	8	155247	155254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010816	CGAG	2	8	155378	155385	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010816	AAGA	2	8	161193	161200	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010816	CATC	2	8	176339	176346	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010816	GGTG	2	8	177331	177338	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010816	TCCT	2	8	177483	177490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010816	GACC	2	8	177677	177684	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010816	GAGT	2	8	178009	178016	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010816	CGGG	2	8	178175	178182	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010816	GGTG	2	8	179198	179205	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010816	GCCG	2	8	179293	179300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010816	TTGC	2	8	179515	179522	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010816	ACCG	2	8	179641	179648	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010816	GCGA	2	8	179737	179744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010816	GCCG	2	8	179834	179841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010816	GCCG	2	8	181114	181121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010816	TTCC	2	8	183487	183494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010816	TGGT	2	8	183497	183504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010816	CTGG	2	8	183512	183519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010816	TCCT	2	8	183664	183671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010816	GACC	2	8	183858	183865	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010816	GAGT	2	8	184190	184197	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010816	CGGG	2	8	184356	184363	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010816	GGTG	2	8	185380	185387	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010816	GCCG	2	8	185476	185483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010816	TTGC	2	8	185698	185705	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010816	ACCG	2	8	185824	185831	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010816	GCGA	2	8	185920	185927	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010816	GCCG	2	8	186017	186024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_010816	GCCG	2	8	187297	187304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010816	CACG	2	8	191971	191978	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010816	TTTC	2	8	194613	194620	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010816	CCAA	2	8	196080	196087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010816	CGAG	2	8	200739	200746	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010816	CCGG	2	8	200809	200816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010816	TCGG	2	8	201324	201331	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010816	CCAA	2	8	207231	207238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_010816	GTTA	2	8	208877	208884	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010816	CATC	2	8	208928	208935	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010816	ACCT	2	8	209944	209951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010816	GCAT	2	8	212421	212428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010816	TCGG	2	8	216613	216620	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010816	TCGA	2	8	218445	218452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010816	ACCG	2	8	218471	218478	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_010816	AAGA	2	8	223099	223106	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010816	CGGG	2	8	231570	231577	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010816	CTAA	2	8	240224	240231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010816	TCGT	2	8	248026	248033	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_010816	GTAC	2	8	248202	248209	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010816	TGTT	2	8	253624	253631	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010816	ATGC	2	8	253705	253712	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010816	ATGC	2	8	253801	253808	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010816	GGTG	2	8	256408	256415	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010816	GATC	3	12	258536	258547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_010816	ATTG	2	8	261340	261347	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010816	CAAT	2	8	261351	261358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010816	CGGG	2	8	263965	263972	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010816	TGTA	2	8	274429	274436	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010816	TGGC	2	8	276003	276010	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_010816	TCTG	2	8	276012	276019	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010816	GCCA	2	8	276317	276324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_010816	TTCG	2	8	282241	282248	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010816	GCGT	2	8	291578	291585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010816	CAGG	2	8	292519	292526	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010816	AGTA	2	8	309817	309824	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010816	TGCT	2	8	318033	318040	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010816	CTGC	2	8	327875	327882	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_010816	GCCG	2	8	327885	327892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010816	CTGA	2	8	333984	333991	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010816	TCAC	2	8	338437	338444	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_010816	CGAT	2	8	340972	340979	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_010816	TGTC	2	8	342023	342030	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010816	GGCT	2	8	342045	342052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_010816	ACCA	2	8	347406	347413	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_010816	ACTC	2	8	350478	350485	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_010816	TGGT	2	8	352848	352855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010816	CCAT	2	8	354793	354800	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010816	AGCC	2	8	355370	355377	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_010816	CGGT	2	8	355532	355539	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010816	TAGT	2	8	359326	359333	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010816	ACAT	2	8	360531	360538	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_010816	GGAA	2	8	367931	367938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010816	GTTT	2	8	383045	383052	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010816	GAGG	2	8	386557	386564	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010816	TTCG	2	8	392647	392654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_010816	GCCA	2	8	392717	392724	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010816	ATGC	2	8	395405	395412	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010816	CCAT	2	8	398356	398363	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_010816	AGCC	2	8	409973	409980	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_010816	CCGG	2	8	416001	416008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_010816	TCAG	2	8	418823	418830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_010816	TCGC	2	8	421706	421713	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_010816	TCCT	2	8	423548	423555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_010816	GGCC	2	8	426259	426266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010816	TCCA	2	8	426629	426636	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_010816	GCCG	2	8	426639	426646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_010816	GGAA	2	8	426707	426714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010816	CGAA	2	8	426717	426724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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496	NC_010816	GTGA	2	8	1451157	1451164	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
497	NC_010816	CAAT	2	8	1451284	1451291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
498	NC_010816	GGAA	2	8	1452812	1452819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
499	NC_010816	TGCC	2	8	1454469	1454476	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_010816	CGAT	2	8	1454741	1454748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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