MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 3990

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010816	CGC	2	6	367	372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_010816	CGG	2	6	389	394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010816	GTC	2	6	460	465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010816	GGA	2	6	510	515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010816	GGC	2	6	2574	2579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010816	GGA	2	6	2606	2611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010816	CAA	2	6	2617	2622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010816	AAC	2	6	2642	2647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010816	TGC	2	6	2732	2737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010816	GGC	2	6	4198	4203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010816	CCG	2	6	4207	4212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_010816	AGC	2	6	4213	4218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010816	CGC	2	6	4227	4232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_010816	TCC	2	6	7873	7878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_010816	CCT	2	6	8904	8909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_010816	TCT	2	6	8951	8956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010816	CAC	2	6	14809	14814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_010816	CGA	2	6	14852	14857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010816	CTG	2	6	14915	14920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010816	CAT	2	6	14986	14991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010816	TAC	2	6	15007	15012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010816	CCA	3	9	16425	16433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_010816	CGC	2	6	17297	17302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_010816	CGA	2	6	17348	17353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010816	GAA	2	6	17384	17389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010816	CGG	2	6	17391	17396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010816	TGG	2	6	17455	17460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010816	GAC	2	6	19234	19239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010816	GAC	2	6	19271	19276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010816	TGC	2	6	19322	19327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010816	TAT	2	6	20908	20913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010816	GAG	2	6	22343	22348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010816	CGG	2	6	24223	24228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010816	GAG	2	6	24254	24259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010816	TAG	2	6	24274	24279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010816	AAT	2	6	24297	24302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010816	CTT	2	6	24463	24468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010816	AAC	2	6	24481	24486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010816	TTC	2	6	24552	24557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010816	GCC	2	6	24579	24584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_010816	GAG	2	6	24608	24613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010816	GCG	2	6	25652	25657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010816	GTC	2	6	25720	25725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010816	GCA	2	6	25875	25880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010816	CAG	2	6	25912	25917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010816	ACA	2	6	25923	25928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010816	GCA	2	6	25947	25952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010816	CCA	2	6	25962	25967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_010816	GCA	2	6	25969	25974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010816	CAG	2	6	25988	25993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010816	GCC	2	6	26041	26046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_010816	TCC	2	6	26132	26137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_010816	CAG	2	6	26165	26170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010816	CGC	2	6	29653	29658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_010816	GAA	2	6	29670	29675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010816	GGA	2	6	29718	29723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010816	AAG	2	6	31357	31362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010816	CCG	2	6	34086	34091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010816	ACG	2	6	34095	34100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010816	ATC	2	6	34219	34224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010816	CAA	2	6	34238	34243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010816	TGT	2	6	35033	35038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010816	TGG	2	6	35064	35069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010816	AAC	2	6	38443	38448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010816	TTG	2	6	38857	38862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010816	TCC	2	6	40811	40816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_010816	CAG	2	6	40847	40852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010816	TTC	2	6	41142	41147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010816	CTG	2	6	41196	41201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010816	CTG	2	6	41203	41208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010816	GTG	2	6	41247	41252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010816	CCG	2	6	41317	41322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_010816	CCG	2	6	41478	41483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_010816	CAT	2	6	41489	41494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010816	GCG	2	6	41498	41503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010816	ATG	2	6	45503	45508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010816	CGA	2	6	45510	45515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010816	GAT	2	6	45529	45534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010816	GCA	2	6	45975	45980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010816	TCC	2	6	47495	47500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_010816	GGC	2	6	47579	47584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010816	GCC	2	6	47589	47594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_010816	CAA	2	6	51677	51682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010816	ATA	2	6	55879	55884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010816	TTG	2	6	55892	55897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010816	TAT	2	6	55959	55964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010816	TTA	2	6	56016	56021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010816	ATC	2	6	56132	56137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010816	GAG	3	9	56157	56165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010816	CTG	2	6	57160	57165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010816	GCT	2	6	60997	61002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010816	CAG	2	6	61018	61023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010816	TTC	2	6	61055	61060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010816	TGA	2	6	61138	61143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010816	ACC	2	6	62731	62736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010816	ATA	2	6	62872	62877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010816	GCG	2	6	63907	63912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010816	GGC	2	6	63913	63918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010816	GTT	2	6	63960	63965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010816	AAC	2	6	64516	64521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010816	TTG	2	6	64556	64561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010816	TTA	2	6	64618	64623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010816	CAA	2	6	64725	64730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010816	GAT	2	6	64802	64807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010816	CTT	2	6	65531	65536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010816	CAT	2	6	65552	65557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010816	GCC	2	6	66439	66444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_010816	TTC	2	6	69675	69680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010816	CAA	2	6	69899	69904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010816	GTA	2	6	70929	70934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010816	AGG	2	6	70976	70981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010816	CAA	2	6	72265	72270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010816	ACC	2	6	72316	72321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_010816	CCA	2	6	73191	73196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_010816	CGA	2	6	73287	73292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010816	TGA	2	6	73372	73377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010816	CTG	2	6	74183	74188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010816	GGC	2	6	74330	74335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010816	CAA	2	6	74347	74352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010816	GAC	2	6	74451	74456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010816	TGG	2	6	74496	74501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010816	GGT	2	6	74534	74539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010816	CAC	2	6	75837	75842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_010816	GGC	2	6	75863	75868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010816	CTG	2	6	81019	81024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010816	TGA	2	6	87458	87463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010816	GCC	2	6	87548	87553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_010816	AGG	2	6	87585	87590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010816	GGC	2	6	88742	88747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010816	GCT	2	6	88769	88774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010816	TGG	2	6	88810	88815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010816	ATG	2	6	89831	89836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010816	AGT	2	6	89940	89945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010816	CAT	2	6	89984	89989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010816	ATT	2	6	90062	90067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010816	GTC	2	6	90429	90434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010816	GCC	2	6	91259	91264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_010816	GGC	2	6	91294	91299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010816	ATA	2	6	91335	91340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010816	CTG	2	6	93522	93527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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